单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 21381 - 21400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21381 | 2024-08-08 |
scGraph: a graph neural network-based approach to automatically identify cell types
2022-05-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac199
PMID:35394015
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图神经网络的自动细胞类型识别算法scGraph，利用基因相互作用关系提高细胞类型识别的性能 | scGraph通过图神经网络整合相互作用基因的信息，自动学习生物数据中的基因相互作用关系，并在细胞类型识别任务中优于八种比较方法 | NA | 开发一种新的算法用于从单细胞RNA测序数据中自动识别细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 图神经网络 | 基因表达数据 | 数千个细胞 |
| 21382 | 2024-08-08 |
SPCS: a spatial and pattern combined smoothing method for spatial transcriptomic expression
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac116
PMID:35380614
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的双因素平滑技术——空间和模式组合平滑（SPCS），该技术利用k-最近邻（kNN）技术结合转录组和空间关系信息，以提高空间转录组表达数据的可解释性 | SPCS方法创新性地结合了转录组空间和模式信息，相较于传统的单因素平滑方法，能更有效地利用空间转录组数据 | NA | 开发一种新的平滑技术以提高空间转录组表达数据的可解释性 | 胰腺导管腺癌（PDAC）、背外侧前额叶皮层（DLPFC）和模拟的高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）数据集 | 空间转录组学 | 胰腺癌、卵巢癌 | 空间转录组学 | k-最近邻（kNN） | 转录组数据 | 多个空间转录组数据集 |
| 21383 | 2024-08-08 |
MTD: a unique pipeline for host and meta-transcriptome joint and integrative analyses of RNA-seq data
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac111
PMID:35380623
|
研究论文 | 本文开发了一种名为MTD的软件管道，用于全面协同分析和关联单个样本中的宿主和元转录组，使用批量和单细胞RNA-seq数据 | MTD是首个能够系统性分析宿主-微生物相互作用，同时量化宿主和元转录组的工具，适用于组织和单细胞水平 | NA | 开发一种方便的工具，用于系统性分析宿主-微生物相互作用，同时量化宿主和元转录组 | 宿主和元转录组的联合和综合分析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 单个样本 |
| 21384 | 2024-08-08 |
Parkinson's disease motor symptoms rescue by CRISPRa-reprogramming astrocytes into GABAergic neurons
2022-05-09, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202114797
PMID:35373464
|
研究论文 | 本文通过CRISPRa技术将星形胶质细胞重编程为GABA能神经元，以缓解帕金森病的运动症状 | 开发了一种敲入小鼠模型，携带双dCas9转录激活系统，以及一种基于AAV的策略，携带intein-split-dCas9与激活剂结合，成功将纹状体星形胶质细胞重编程为GABA能神经元 | NA | 探索通过基因重编程技术治疗帕金森病的新策略 | 帕金森病的运动症状 | 神经科学 | 帕金森病 | CRISPRa, AAV | NA | 单细胞转录组 | 使用6-OHDA帕金森病模型小鼠进行实验 |
| 21385 | 2024-08-08 |
Uncompensated mitochondrial oxidative stress underlies heart failure in an iPSC-derived model of congenital heart disease
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.03.003
PMID:35395180
|
研究论文 | 本研究使用诱导多能干细胞衍生的心肌细胞模型，探讨了先天性心脏病中的左心发育不良综合征（HLHS）早期心力衰竭的原因 | 首次揭示了HLHS中早期心力衰竭与线粒体氧化应激和内质网应激的关联，并展示了通过药物干预改善这些病理状态的可能性 | 研究主要基于细胞模型，尚未在临床上验证这些发现的有效性 | 探索先天性心脏病中早期心力衰竭的生物学机制，并评估潜在的治疗策略 | 先天性心脏病患者来源的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 来自HLHS患者和非早期心力衰竭患者的iPSC-CM |
| 21386 | 2024-08-08 |
Replicative history marks transcriptional and functional disparity in the CD8+ T cell memory pool
2022-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01171-9
PMID:35393592
|
研究论文 | 本文通过开发一种名为DivisionRecorder的遗传追踪方法，研究了CD8+ T细胞记忆库中复制历史与转录和功能差异之间的关系。 | 首次证明了低度分裂的T细胞表现出与干细胞相关的基因表达丰富，处于相对静止状态，并且在激活后引发增殖回忆反应的能力更强。 | NA | 探讨复制历史与CD8记忆T细胞亚群形成之间的关系。 | CD8+ T细胞记忆库中的复制历史与转录和功能差异。 | 免疫学 | NA | 遗传追踪方法，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同CD8 T细胞群体 |
| 21387 | 2024-08-08 |
Human iPS cell-derived cartilaginous tissue spatially and functionally replaces nucleus pulposus
2022-05, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文展示了人诱导多能干细胞衍生的软骨组织（hiPS-Cart）能够空间上和功能上替代失去的髓核（NP），从而恢复椎间盘的功能 | 首次证明hiPS-Cart能够有效替代失去的NP，并防止椎间盘退化 | 植入后的hiPS-Cart细胞仅发展为软骨样NP细胞，未发展为脊索样NP细胞 | 研究hiPS-Cart在替代失去的NP和防止椎间盘退化中的作用 | 人诱导多能干细胞衍生的软骨组织（hiPS-Cart）及其在椎间盘中的应用 | 再生医学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 在裸鼠中进行了植入实验，具体样本数量未详细说明 |
| 21388 | 2024-08-08 |
Correction to 'STRIDE: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell RNA sequencing'
2022-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac254
PMID:35390158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 21389 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies a migratory keratinocyte subpopulation expressing THBS1 in epidermal wound healing
2022-Apr-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104130
PMID:35391830
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现并验证了在表皮伤口愈合过程中表达THBS1的迁移性角质形成细胞亚群。 | 首次发现LPA通过RHO/ROCK-SRF信号通路诱导表达THBS1的角质形成细胞亚群分化，并揭示了THBS1在角质形成细胞迁移中的作用。 | NA | 探究角质形成细胞分化及其在表皮伤口愈合中的作用机制。 | 人类角质形成细胞及小鼠伤口皮肤中的角质形成细胞亚群。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类角质形成细胞和小鼠伤口皮肤样本 |
| 21390 | 2024-08-08 |
Single cell enhancer activity distinguishes GABAergic and cholinergic lineages in embryonic mouse basal ganglia
2022-04-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2108760119
PMID:35377797
|
研究论文 | 本研究结合增强子标记和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，在胚胎期11.5天的小鼠内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中区分和描绘神经元谱系的特化过程 | 本研究展示了scRNA-seq与基于增强子的标记相结合，解析小鼠大脑发育中复杂的神经元特化路径的能力 | NA | 本研究旨在描绘和区分胚胎期小鼠基底神经节的神经元谱系特化过程 | 研究对象包括小鼠胚胎期的内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中的神经元谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 胚胎期11.5天的小鼠内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中的多个神经元群体 |
| 21391 | 2024-08-08 |
Single-cell eQTL mapping identifies cell type-specific genetic control of autoimmune disease
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf3041
PMID:35389779
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了982名健康个体的1,267,758个外周血单个核细胞，识别了细胞类型特异性的cis-eQTL和trans-eQTL，并探讨了这些eQTL在自身免疫疾病中的作用 | 首次结合遗传流行病学与单细胞RNA测序技术，揭示了免疫系统中个体间变异的主要驱动因素 | NA | 研究细胞类型特异性的遗传调控对自身免疫疾病的影响 | 外周血单个核细胞的基因表达及其在自身免疫疾病中的作用 | 遗传学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 982名健康个体的1,267,758个外周血单个核细胞 |
| 21392 | 2024-08-08 |
Population genetics meets single-cell sequencing
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abq0426
PMID:35389792
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在理解人类疾病遗传基础中的应用 | 结合群体遗传学与单细胞测序技术，探索疾病的遗传机制 | NA | 研究单细胞测序技术在揭示人类疾病遗传基础中的作用 | 人类疾病的遗传基础 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 21393 | 2024-08-08 |
Intranasal delivery of a small-molecule ErbB inhibitor promotes recovery from acute and late-stage CNS inflammation
2022-04-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154824
PMID:35393953
|
研究论文 | 研究通过鼻内递送小分子ErbB抑制剂afatinib，探讨其在急性及晚期中枢神经系统（CNS）炎症中的治疗效果 | 结合CNS单细胞转录组数据和小分子筛选，发现并验证了afatinib通过阻断ErbB信号通路，有效减轻炎症性星形胶质细胞极化并促进组织再生功能 | NA | 探索治疗急性及晚期CNS炎症的新疗法 | 多发性硬化症（MS）及其动物模型中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类原代星形胶质细胞 |
| 21394 | 2024-08-08 |
Stanniocalcin 1 promotes metastasis, lipid metabolism and cisplatin chemoresistance via the FOXC2/ITGB6 signaling axis in ovarian cancer
2022-Apr-07, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02315-3
PMID:35392966
|
研究论文 | 本文研究了抑钙素1（STC1）在卵巢癌中的作用，特别是其在转移、脂质代谢和顺铂（DDP）化疗耐药性中的作用及其机制。 | 首次揭示了STC1通过FOXC2/ITGB6信号轴促进卵巢癌的转移、脂质代谢和顺铂化疗耐药性。 | NA | 探讨STC1在卵巢癌中的功能及其在转移、脂质代谢和顺铂化疗耐药性中的作用机制。 | 卵巢癌组织及其转移组织，以及相关的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序和免疫组化分析 | NA | 组织样本 | 包括卵巢癌组织、邻近癌组织和腹膜转移组织 |
| 21395 | 2024-08-08 |
A universal deep neural network for in-depth cleaning of single-cell RNA-Seq data
2022-04-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29576-y
PMID:35393428
|
research paper | 本文设计并开发了AutoClass模型，集成自编码器和分类器两个深度神经网络组件，用于深度清理单细胞RNA测序数据 | AutoClass模型不依赖特定数据分布假设，能有效清理多种噪声和伪影，且在多个单细胞RNA测序数据分析中表现优于现有方法 | NA | 开发一种通用的深度神经网络模型，用于深度清理单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据中的噪声和伪影 | machine learning | NA | scRNA-Seq | deep neural network | RNA-Seq data | NA |
| 21396 | 2024-08-08 |
Type 2 immune polarization is associated with cardiopulmonary disease in preterm infants
2022-04-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaz8454
PMID:35385341
|
研究论文 | 研究分析了早产儿中2型免疫极化与心肺疾病的关系 | 首次详细描述了2型免疫极化在早产儿心肺疾病中的作用，并探讨了多种治疗干预的可能性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨早产儿中2型免疫极化与心肺疾病的关系，并寻找可能的治疗方法 | 早产儿及其心肺疾病 | 免疫学 | 心肺疾病 | 流式细胞术，单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 51名早产儿，20名健康足月婴儿，5名健康成人 |
| 21397 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of the ventral posterolateral nucleus-enriched thalamic regions from HSV-1-infected mice reveal a novel microglia/microglia-like transcriptional response
2022-Apr-06, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02437-7
PMID:35387656
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了HSV-1感染的小鼠背侧后侧核区域中CD11b+免疫细胞的转录反应，特别是微胶质细胞/类似微胶质细胞的转录反应。 | 发现了一种新的微胶质细胞/类似微胶质细胞的转录反应，这种反应与一个罕见的细胞群体相关，可能揭示了微胶质细胞对HSV-1感染的反应机制。 | NA | 旨在识别不同的微胶质细胞/类似微胶质细胞，并描述在单纯疱疹脑炎期间可能涉及的机制和信号通路。 | HSV-1感染的小鼠背侧后侧核区域中的CD11b+免疫细胞，特别是微胶质细胞/类似微胶质细胞。 | 数字病理学 | 单纯疱疹脑炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从HSV-1感染的C57BL/6 N小鼠的背侧后侧核区域分离的细胞 |
| 21398 | 2024-08-08 |
Elastic dosage compensation by X-chromosome upregulation
2022-04-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29414-1
PMID:35388014
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和染色质可及性分析，详细探讨了X染色体上调在哺乳动物发育过程中的动态及其对RNA水平的影响 | 揭示了X染色体上调在性别和谱系特异性中的弹性调节机制，并阐明了其在X染色体失活过程中的不同程度的作用 | NA | 探讨X染色体上调与X染色体失活之间的调控联系及其在哺乳动物剂量补偿中的作用 | X染色体上调的动态及其对RNA水平的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析 | NA | RNA | NA |
| 21399 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals aberrant stromal cells and heterogeneous endothelial cells in alcohol-induced osteonecrosis of the femoral head
2022-04-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03271-6
PMID:35388143
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探索酒精诱导的股骨头坏死（ONFH）中期的和晚期的转录组图谱 | 发现了ONFH中基质细胞的成骨-脂肪分化紊乱以及MEF2C和JUND调控因子的改变，并报道了表达ACKR1的血管内皮细胞簇具有强烈的趋化性和较弱的血管生成能力 | NA | 揭示酒精诱导的股骨头坏死中单细胞转录组特征，以促进对ONFH发病机制的进一步研究 | 酒精诱导的股骨头坏死中的细胞 | 数字病理学 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 年龄匹配的髋骨关节炎和股骨颈骨折样本作为对照 |
| 21400 | 2024-08-08 |
In vivo base editing rescues cone photoreceptors in a mouse model of early-onset inherited retinal degeneration
2022-04-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29490-3
PMID:35383196
|
研究论文 | 本文研究了通过腺嘌呤碱基编辑器（ABE）在体内修复Rpe65突变，以延长LCA小鼠模型中锥状光感受器的存活时间 | 首次展示了碱基编辑在体内修复Rpe65突变，延长锥状光感受器存活时间，并恢复视觉功能 | NA | 开发一种既能补偿RPE65功能丧失又能保护光感受器免受进一步退化的治疗方法 | LCA小鼠模型中的锥状光感受器 | 遗传学 | 视网膜退化 | 腺嘌呤碱基编辑器（ABE） | NA | 单细胞RNA测序 | LCA小鼠模型 |