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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2121 | 2025-11-22 |
Integrated bioinformatics analysis to elucidate cellular communication in the microenvironment of breast cancer
2025-Nov-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03859-4
PMID:41264182
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析揭示乳腺癌微环境中细胞通讯机制 | 首次结合单细胞mRNA测序和批量mRNA测序系统分析乳腺癌微环境中的细胞通讯,并发现CXCL12-CXCR4和FGF7-FGFR1是最重要的细胞通讯对 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 阐明乳腺癌肿瘤微环境中的细胞通讯机制 | 乳腺癌肿瘤微环境中的细胞通讯 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞mRNA测序, 批量mRNA测序, qPCR | 相关性分析 | 基因表达数据 | 临床样本(未指定具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2122 | 2025-11-22 |
Periostin promotes sarcoma growth by promoting tumor-associated macrophage migration and differentiation
2025-Nov-20, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0301
PMID:41264337
|
研究论文 | 本研究揭示了细胞外基质蛋白Periostin通过促进肿瘤相关巨噬细胞的迁移和分化来驱动肉瘤生长的机制 | 首次在肉瘤中系统阐明Periostin通过调控肿瘤免疫微环境促进肿瘤进展的非细胞自主机制 | POSTN治疗性中和作为单一疗法不足以减轻肿瘤负荷 | 探究Periostin在肉瘤进展和肿瘤免疫微环境调控中的功能作用 | 软组织肉瘤、肿瘤相关巨噬细胞、单核细胞 | 肿瘤免疫学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序、基因沉默、体外迁移实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 人类肉瘤数据集、小鼠遗传模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2123 | 2025-11-22 |
Advances in single-cell transcriptomics: unraveling the pathogenesis of calcific aortic valve disease
2025-Nov-20, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf255
PMID:41264422
|
综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在钙化性主动脉瓣疾病研究中的应用进展 | 首次系统总结单细胞转录组学在揭示CAVD细胞异质性、谱系分化和细胞间通讯方面的新视角 | 未涉及具体实验数据,主要基于现有文献的归纳分析 | 探讨单细胞转录组技术在CAVD发病机制研究和治疗靶点发现中的应用 | 钙化性主动脉瓣疾病相关的瓣膜细胞群体 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2124 | 2025-11-22 |
ChemR23 prevents phenotypic switching of vascular smooth muscle cells into macrophage like foam cells in atherosclerosis
2025-Nov-20, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf258
PMID:41264461
|
研究论文 | 本研究探讨ChemR23在血管平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化中的作用机制 | 首次揭示ChemR23通过调控VSMC表型转换影响动脉粥样硬化进程,并发现其配体C9和抑制剂α-NETA的不同治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类样本验证相对有限 | 研究ChemR23在血管平滑肌细胞中对动脉粥样硬化的特异性作用 | 小鼠模型、人类主动脉平滑肌细胞、人类动脉粥样硬化斑块样本 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 骨髓移植、bulk RNA测序、单细胞转录组测序、细胞培养 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、转录组数据、细胞功能数据 | Apoe-/-小鼠模型、人类动脉粥样硬化斑块单细胞数据、人类主动脉平滑肌细胞体外实验 | NA | bulk RNA测序,单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 2125 | 2025-11-22 |
A global screen for magnetically induced neuronal activity in the pigeon brain
2025-Nov-20, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aea6425
PMID:41264677
|
研究论文 | 通过全脑活动图谱和单细胞RNA测序技术研究鸽子大脑中对磁刺激产生反应的神经元群体 | 首次在全脑范围内系统筛选磁刺激激活的神经元,并发现前庭-中脑皮层回路参与磁感应 | 研究仅针对鸽子特定脑区,磁感应机制在其他物种中的普适性仍需验证 | 探索动物感知地球磁场的神经环路和分子机制 | 鸽子大脑神经元和前庭器官毛细胞 | 神经科学 | NA | 全脑活动图谱,组织透明化,光片显微镜,单细胞RNA测序 | NA | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2126 | 2025-11-22 |
Claudin 18.2 as a Biomarker for Imaging and Radiopharmaceutical Therapy in Gastric and Pancreatic Tumors
2025-Nov-20, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.125.270568
PMID:41266253
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研究论文 | 本研究探索了Claudin 18.2作为胃癌和胰腺癌分子成像及靶向放射性药物治疗生物标志物的潜力 | 首次系统评估CLDN18.2作为放射性诊疗生物标志物在胃癌和胰腺癌模型中的应用价值 | 研究基于动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对CLDN182阳性肿瘤的精准成像和治疗方法 | 胃癌和胰腺导管腺癌模型 | 分子影像学 | 胃癌,胰腺癌 | RNA测序,PET成像,生物分布分析 | NA | 基因表达数据,影像数据,生物分布数据 | 31例PDAC患者样本,多种癌细胞系移植瘤小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq,single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2127 | 2025-11-22 |
A pan-cancer analysis of CTSC as a candidate prognostic and immune-related biomarker
2025-Nov-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04124-4
PMID:41266623
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示CTSC在泛癌中的预后价值和免疫相关功能 | 首次对CTSC进行系统性泛癌分析,整合多组学数据揭示其与肿瘤免疫微环境的复杂关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证和前瞻性临床研究 | 评估CTSC作为泛癌预后生物标志物和免疫相关靶点的潜力 | 多种癌症类型的肿瘤样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 多组学分析,单细胞测序,生存分析,功能富集分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观遗传数据,临床数据 | 来自TCGA、GTEx、CPTAC等多个公共数据库的多种癌症样本 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 2128 | 2025-11-22 |
Denoising single-cell RNA-seq data with a deep learning-embedded statistical framework
2025-Nov-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06296-w
PMID:41257571
|
研究论文 | 提出一种结合深度学习和统计框架的ZILLNB方法,用于单细胞RNA测序数据的去噪和插补 | 将零膨胀负二项回归与深度生成模型集成,通过变分自编码器和生成对抗网络学习细胞和基因层面的潜在表示 | 在样本量有限的情况下可能存在过拟合风险,方法缺乏机制可解释性 | 解决单细胞RNA测序数据中的技术噪声和零计数问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | InfoVAE, GAN, ZINB回归 | 基因表达数据 | 多个数据集(小鼠皮层、人类PBMC、IPF数据集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2129 | 2025-11-22 |
Nitidine chloride inhibits colorectal cancer by targeting BUB1: mechanistic insights from molecular dynamics simulation, spatial transcriptomics, and single-cell RNA sequencing
2025-Nov-19, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-04423-8
PMID:41257608
|
研究论文 | 研究白屈菜红碱通过靶向BUB1抑制结直肠癌的作用机制 | 结合分子动力学模拟、空间转录组学和单细胞RNA测序多组学技术揭示NC-BUB1-RAD21轴在结直肠癌中的调控机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限 | 探究白屈菜红碱在结直肠癌中的抗肿瘤作用机制 | 结直肠癌细胞系HCT116和异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子动力学模拟,RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | 1293个结直肠癌样本与2299个对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2130 | 2025-11-20 |
Single-cell transcriptomics uncovering a critical AKT-LONP1-STAR axis in ovarian hyperandrogenism of PCOS
2025-Nov-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01837-6
PMID:41257877
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2131 | 2025-11-22 |
Decoding intratumoral cyclooxygenase-2 signaling through multi-omics: insights from esophageal cancer and beyond
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01919-1
PMID:41249574
|
研究论文 | 通过多组学方法研究环氧合酶-2在食管癌等肿瘤中的信号传导机制及其治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质对接分析和实验验证,系统揭示COX-2在肿瘤微环境中的调控作用 | NA | 探究COX-2在癌症进展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 食管癌及其他多种癌症类型 | 多组学分析 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质对接分析, 功能验证实验 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2132 | 2025-11-22 |
Single-cell transcriptomics identifies SOCS3+ exhausted T cells as a biomarker facilitating clear cell renal cell carcinoma progression
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01894-7
PMID:41249578
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析鉴定SOCS3+耗竭T细胞作为促进透明细胞肾细胞癌进展的生物标志物 | 首次发现SOCS3+耗竭T细胞在ccRCC中的关键作用,并构建了包含SOCS3和N4BP1的预后预测模型 | 基于现有数据集的重新分析,需要进一步实验验证 | 研究耗竭T细胞如何驱动透明细胞肾细胞癌进展 | 透明细胞肾细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析, Kaplan-Meier生存分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2133 | 2025-11-22 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomic profiling reveals NECTIN-TIGIT interaction underlies T cell exhaustion in papillary thyroid carcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01937-z
PMID:41249602
|
研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组数据,揭示NECTIN-TIGIT相互作用是甲状腺乳头状癌中T细胞耗竭的潜在驱动机制 | 首次在甲状腺乳头状癌中系统阐明NECTIN-TIGIT轴通过抑制CD226共刺激信号促进T细胞耗竭的免疫调控机制 | 需要未来湿实验室验证和临床研究来确认该轴在甲状腺癌管理中的转化相关性 | 阐明甲状腺乳头状癌中T细胞耗竭的免疫学机制 | 甲状腺乳头状癌肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析,细胞类型注释,配体-受体相互作用分析 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的公共数据集 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2134 | 2025-11-22 |
Comprehensive analysis reveals prognostic gene set that could impacts the response to chemotherapy and immunotherapy outcomes in malignant pleural mesothelioma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01949-9
PMID:41249691
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据开发了一个恶性胸膜间皮瘤的预后基因集模型,用于预测患者生存和治疗反应 | 首次整合转录组、DNA甲基化和SNP数据构建MPM预后模型,并验证其在化疗、放疗和免疫治疗反应预测中的价值 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发可靠的恶性胸膜间皮瘤预后评估工具,改善临床治疗效果 | 恶性胸膜间皮瘤患者 | 生物信息学 | 恶性胸膜间皮瘤 | 多组学整合分析,LASSO-Cox回归,单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据,DNA甲基化数据,SNP数据,单细胞RNA-seq数据 | TCGA和GEO数据库中的恶性胸膜间皮瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2135 | 2025-11-22 |
CDKN1A and cellular senescence are associated with immune resistance in advanced lung adenocarcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01926-2
PMID:41249682
|
研究论文 | 本研究探讨CDKN1A和细胞衰老在晚期肺腺癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次在晚期肺腺癌中系统揭示CDKN1A通过促进细胞衰老和免疫抑制微环境导致免疫治疗耐药的机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探究CDKN1A在晚期肺腺癌免疫治疗疗效中的影响和作用机制 | 晚期肺腺癌患者和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 多变量Cox回归模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和SU2C-MARK队列的晚期肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE148071数据集 |
| 2136 | 2025-11-22 |
Integrated machine learning and single-cell analysis identify chromatin-remodeling gene signature for diagnosis and prognosis in nasopharyngeal carcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01953-z
PMID:41249704
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析,识别染色质重塑基因特征用于鼻咽癌的诊断和预后 | 首次整合机器学习与单细胞RNA测序分析染色质重塑基因在鼻咽癌中的作用,并开发了六基因诊断预后特征 | 研究依赖于公共数据集,需要进一步实验验证和临床前瞻性研究 | 探索染色质重塑基因在鼻咽癌中的诊断和预后价值 | 鼻咽癌患者基因表达数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,差异表达分析,加权基因共表达网络分析,功能富集分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个数据集(GSE12452, GSE53819, GSE61218, GSE102349)的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2137 | 2025-11-22 |
Adenylosuccinate lyase (ADSL) is a pan-cancer prognostic and immune biomarker with distinct roles in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03749-9
PMID:41251948
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析探讨ADSL基因作为预后和免疫生物标志物的潜力,特别聚焦于肝细胞癌 | 首次全面揭示ADSL在多种癌症中的过表达特征及其与预后的关联,并在单细胞水平分析ADSL高表达对细胞通讯网络的影响 | 需要进一步研究验证这些发现并阐明ADSL影响癌症发展的具体机制 | 探索ADSL基因在恶性肿瘤中的生物学作用及其作为广谱预测标志物的可行性 | 多种癌症类型,特别关注肝细胞癌(HCC) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组分析,甲基化评估,免疫浸润评估,细胞通讯分析,诺莫图建模 | 诺莫图模型 | 转录组数据,甲基化数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2138 | 2025-11-22 |
Utilizing a novel mitochondrial-related gene signature for predicting the prognosis and immunological impact in bladder cancer
2025-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03927-9
PMID:41252049
|
研究论文 | 本研究构建并验证了一个基于线粒体相关基因的膀胱癌预后特征模型 | 首次将线粒体相关基因特征与膀胱癌预后和免疫治疗疗效进行系统性关联分析 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证 | 探索线粒体相关基因在膀胱癌中的作用并构建预后预测模型 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO回归,Cox回归,非负矩阵分解 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA-BLCA队列和GEO数据集的多中心膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 2139 | 2025-11-22 |
Transcription factor 4 regulates the interhemispheric midline remodeling through neuron-astroglia communications during corpus callosum formation
2025-Nov-18, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03696-7
PMID:41253748
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子TCF4通过神经元-星形胶质细胞通讯调控大脑半球间中线重塑及胼胝体形成的关键机制 | 首次发现TCF4介导的神经元-星形胶质细胞通讯对胼胝体形成的调控作用,并鉴定Sema7a为关键介质 | NA | 探究TCF4在胼胝体形成过程中的分子机制 | 小鼠大脑半球间中线组织 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,体外移植实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2140 | 2025-11-22 |
UHRF1 restricts HCoV-229E infection through epigenetic silencing of the viral receptor APN
2025-Nov-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64977-9
PMID:41253770
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研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR筛选发现UHRF1通过表观遗传沉默病毒受体APN抑制HCoV-229E感染 | 首次揭示UHRF1通过启动子超甲基化下调APN表达限制冠状病毒感染的年龄相关宿主防御机制 | 研究主要聚焦HCoV-229E,未验证其他冠状病毒的普适性 | 探索冠状病毒与宿主相互作用机制及年龄相关易感性因素 | HCoV-229E冠状病毒及其宿主细胞 | 病毒学 | 冠状病毒感染 | 全基因组CRISPR敲除筛选,CRISPR激活筛选,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 来自年轻和老年个体的原代肺泡巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |