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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2121 | 2025-10-06 |
Semaglutide ameliorates retinal vascular permeability destruction in diabetic retinopathy by AnxA2-mediated MMP-9 activation and basement membrane remodeling
2025-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118409
PMID:40749340
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研究论文 | 本研究揭示索马鲁肽通过上调AnxA2激活MMP-9改善糖尿病视网膜病变中基底膜增厚和血管通透性破坏的分子机制 | 首次发现索马鲁肽通过AnxA2-MMP-9信号轴改善糖尿病视网膜病变,揭示了其不依赖血糖控制的血管保护作用 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究索马鲁肽在糖尿病视网膜病变中的治疗机制 | 2型糖尿病小鼠模型的视网膜组织 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,免疫荧光,免疫组化,Western blot,透射电镜 | NA | 图像,文本 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2122 | 2025-10-06 |
Multi-omics identification of circulating protein biomarkers for intervertebral disc degeneration using Mendelian randomization and scRNA-seq
2025-Sep, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-025-07606-6
PMID:40745068
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法识别与椎间盘退变相关的循环蛋白生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序识别椎间盘退变的因果循环蛋白标志物 | 需要进一步的体内验证研究来确认临床相关性和治疗适用性 | 识别与椎间盘退变因果相关的循环蛋白生物标志物 | 椎间盘退变患者和健康个体的循环蛋白及椎间盘组织 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 机器学习分类模型 | 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 | 4907个循环蛋白的蛋白质组数据, FinnGen队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2123 | 2025-10-06 |
NFATC3 enhances osteosarcoma progression by increasing PD-L1 and CXCL2 levels
2025-Jul-29, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02850-x
PMID:40728758
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研究论文 | 本研究探讨了NFATC3基因通过增加PD-L1和CXCL2表达促进骨肉瘤进展的机制 | 首次揭示NFATC3通过调控PD-L1配体和炎症因子表达促进骨肉瘤进展,并发现其在肿瘤微环境T细胞和巨噬细胞中的高表达 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究NFATC3基因在骨肉瘤中的表达及其对肿瘤进展的影响机制 | 骨肉瘤细胞系(143B、SJSA、HOS、MG63、MNNG)和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | qRT-PCR、单细胞测序、肿瘤细胞与巨噬细胞共培养系统 | 细胞系模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 5种骨肉瘤细胞系和多个骨肉瘤测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2124 | 2025-10-06 |
Spatially resolved transcriptomics reveals a unique disease signature and potential biomarkers for chronic traumatic encephalopathy
2025-Jul-18, Journal of neuropathology and experimental neurology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jnen/nlaf078
PMID:40680295
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研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示慢性创伤性脑病的独特疾病特征和潜在生物标志物 | 首次通过空间转录组学在CTE病变原位绘制基因表达图谱,并鉴定出21个基因的CTE特征 | 仅分析死后组织样本,无法进行纵向研究 | 理解CTE病理生理学机制并寻找生物标志物 | 慢性创伤性脑病(CTE)病变组织和匹配的正常组织 | 空间转录组学 | 慢性创伤性脑病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 来自同一患者个体的CTE病变和正常组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
2125 | 2025-10-06 |
Generating and characterizing human telencephalic brain organoids from stem cell-derived single neural rosettes
2025-Jun-27, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01197-x
PMID:40579542
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研究论文 | 开发了一种从干细胞来源的单个神经玫瑰花结生成人端脑类器官的方法 | 使用单个神经玫瑰花结生成类器官,模拟体内单一神经管发育过程,具有一致的细胞组成和可预测的神经细胞组织结构 | 完成整个方案需要5-6个月时间,且需要具备细胞培养经验 | 研究人端脑中不同神经细胞的规范和组织,以及模拟与神经网络破坏相关的神经发育障碍 | 人端脑类器官 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、切片膜片钳电生理学、CRISPR-Cas9基因编辑 | 类器官模型 | 基因表达数据、电生理数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2126 | 2025-10-06 |
Dissecting the immune landscape in pediatric high-grade glioma reveals cell state changes under therapeutic pressure
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102095
PMID:40315846
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析儿童高级别胶质瘤免疫景观 | 首次全面揭示儿童高级别胶质瘤免疫微环境在治疗压力下的细胞状态变化,并与成人胶质瘤进行对比 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 解析儿童高级别胶质瘤免疫微环境特征及其在治疗过程中的变化 | 儿童弥漫性高级别胶质瘤和高级别室管膜瘤患者的恶性细胞、髓系细胞和T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2127 | 2025-10-06 |
Central control of dynamic gene circuits governs T cell rest and activation
2025-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08314-y
PMID:39663454
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研究论文 | 通过CRISPR筛选和单细胞转录组学揭示MED12调控T细胞静息与激活状态转换的动态基因回路 | 发现约90%的IL-2Rα调控因子在不同细胞类型和刺激状态下具有可变效应,其中MED12作为动态协调者通过COMPASS复合物控制组蛋白甲基化 | 研究主要聚焦于CD4 T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 | 阐明T细胞在不同状态下维持身份和响应环境信号的动态基因调控机制 | 原代人CD4 T细胞 | 基因调控网络 | 免疫相关疾病 | CRISPR筛选, 单细胞转录组学, 免疫沉淀-质谱分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 多种原代人CD4 T细胞环境 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2128 | 2025-10-06 |
Decoding the mosaic of inflammatory bowel disease: Illuminating insights with single-cell RNA technology
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.07.011
PMID:39421242
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的最新进展与应用 | 系统整合单细胞转录组、蛋白质组、T细胞受体谱和表观遗传分析,提供IBD发病机制的全面视角 | 缺乏纵向研究数据,需要整合多种单细胞和空间转录组技术 | 探索单细胞测序技术在炎症性肠病研究中的应用价值 | 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病)患者细胞 | 数字病理 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组分析, T细胞受体谱分析, 表观遗传分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
2129 | 2025-10-06 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-May-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
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研究论文 | 开发了一种用于骨组织空间转录组学分析的方法,能够有效处理新鲜骨组织和存档样本 | 解决了硬组织样本在空间转录组学分析中的技术难题,特别是骨组织的脱钙处理与RNA保存的平衡 | 方法主要针对骨组织,对其他硬组织的适用性需要进一步验证 | 开发适用于骨组织的空间转录组学分析方法 | 骨组织样本,包括新鲜骨组织和组织库中的存档样本 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据,组织形态学数据 | 骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2130 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and spatial analysis reveals MUC1-mediated cellular crosstalk in mucinous colorectal adenocarcinoma
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1701
PMID:38778448
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,系统分析黏液性结直肠腺癌的肿瘤微环境,揭示MUC1介导的细胞间相互作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析MCA肿瘤微环境,发现MUC1+肿瘤细胞与ZEB1+内皮细胞的关键相互作用 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证发现 | 深入理解黏液性结直肠腺癌肿瘤微环境的细胞间相互作用机制 | 黏液性结直肠腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 三维生物打印, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2131 | 2025-10-06 |
Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1720
PMID:38778457
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综述 | 本文全面概述皮肤黑色素细胞干细胞的起源、生物学特性、稳态维持及治疗潜力 | 重点强调单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实用模型在黑色素细胞干细胞研究中的重要意义 | NA | 探讨黑色素细胞干细胞在皮肤组织稳态维持和疾病治疗中的潜在应用价值 | 哺乳动物毛囊、表皮或汗腺中的黑色素细胞干细胞 | 再生医学 | 皮肤色素障碍疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2132 | 2025-10-06 |
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1699
PMID:38783408
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析HIV感染者肠道黏膜免疫细胞,揭示免疫无应答者B细胞向浆细胞分化存在缺陷 | 首次在单细胞水平描绘HIV感染者肠道黏膜免疫细胞图谱,发现免疫无应答者滤泡/记忆B细胞向浆细胞分化存在障碍 | 样本量较小(仅17名参与者),需要更大规模研究验证 | 探究HIV感染者肠道黏膜免疫细胞在免疫恢复中的作用机制 | HIV感染者肠道黏膜免疫细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,免疫组化,16S rRNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,微生物组数据,流式细胞数据 | 17名参与者(5名HIV阴性对照,9名免疫应答者,3名免疫无应答者),54,475个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序,16S rRNA测序 | NA | NA |
2133 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2134 | 2025-10-06 |
Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche
2024-01-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152
PMID:38181095
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研究论文 | 本研究揭示了皮肤中调节性T细胞通过IL-2信号通路保护毛囊干细胞生态位的免疫豁免机制 | 开发了皮肤特异性Treg细胞基因重组技术,首次证明非淋巴器官中存在局部免疫耐受机制 | 研究主要依赖基因工程小鼠模型,人类疾病验证仅限于罕见脱发类型 | 探究皮肤局部调节性T细胞维持自身免疫耐受的生物学机制 | 皮肤调节性T细胞、毛囊干细胞生态位、脱发疾病模型 | 免疫学 | 脱发症 | 空间转录组学、遗传重组技术 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2135 | 2025-10-06 |
Denoising sparse microbial signals from single-cell sequencing of mammalian host tissues
2023-Sep, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00507-1
PMID:37946872
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研究论文 | 开发SAHMI计算方法从哺乳动物组织单细胞测序数据中识别真实存在的微生物核酸并过滤污染物 | 首次提出专门针对单细胞和空间基因组数据中稀疏微生物信号去噪的计算方法 | NA | 解决宿主-微生物组生态系统研究中微生物信号与污染物区分的技术难题 | 哺乳动物组织中的微生物核酸 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序, 空间基因组测序, 转录组测序 | NA | 基因组测序数据, 转录组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
2136 | 2025-10-06 |
Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains
2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0142-20.2020
PMID:32928889
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研究论文 | 本研究通过标记果蝇中唯一的电压门控钠通道Para,揭示了其在神经元中的表达模式和亚细胞定位 | 首次发现果蝇钠通道仅表达于活跃神经元,并定位于轴突远端起始段样结构 | 研究主要聚焦果蝇模型,在其它无脊椎动物中的普适性需要进一步验证 | 探究无脊椎神经元中动作电位的起始位置和钠通道的表达特征 | 果蝇胚胎期、幼虫期和成年期中枢神经系统神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 全细胞膜片钳电生理记录, 基因标记技术 | NA | 基因表达数据, 电生理记录数据, 转录组数据 | 果蝇第三龄幼虫全脑单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2137 | 2025-10-06 |
A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes
2018-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0393-7
PMID:30069044
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,重新定义了小鼠气管上皮细胞的组成和层级结构,发现表达CFTR的离子细胞在囊性纤维化中的关键作用 | 识别出新型Foxi1肺离子细胞、定位依赖的功能性club细胞变异、高周转鳞状上皮结构中的'hillocks'细胞,并开发了结合单细胞测序和谱系追踪的'pulse-seq'技术 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证数据有限 | 探索气道上皮细胞的组成、层级结构及其在呼吸系统疾病中的作用 | 小鼠气管上皮细胞 | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序, 体内谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2138 | 2025-10-06 |
Lamin A/C Expression in Hematopoietic Cells Declines During Human Aging and Constrains Atherosclerosis in Mice
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322893
PMID:40605747
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研究论文 | 本研究探讨了人类衰老过程中造血细胞Lamin A/C表达下降对动脉粥样硬化的影响机制 | 首次发现人类衰老与血液白细胞Lamin A/C表达下降相关,并创建了首个体内Lamin A功能获得性模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的直接验证有限 | 研究衰老过程中Lamin A/C表达变化对动脉粥样硬化发展的影响 | 人类循环白细胞、Ldlr-/-缺陷小鼠、Lmna-null小鼠和Lmnatg转基因小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、骨髓移植、活体显微镜检查、油红O染色 | NA | 基因表达数据、图像数据、测序数据 | 人类白细胞样本和多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2139 | 2025-10-06 |
Tricuspid Aortic Valve Regurgitation Associates With Ascending Aortic Aneurysm Through Endothelial Activation and Lipoprotein Infiltration
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323112
PMID:40740135
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研究论文 | 本研究探讨了三尖瓣主动脉瓣反流通过内皮细胞间质激活和脂蛋白浸润与升主动脉瘤形成的关联机制 | 首次揭示了主动脉瓣反流通过双向血流介导的内皮细胞间质激活和载脂蛋白B脂蛋白浸润在升主动脉瘤形成中的独特病理作用 | 研究样本仅限于三尖瓣主动脉瓣患者,未包含其他类型主动脉瓣病变患者 | 研究主动脉瓣反流与血管激活和炎症的关系,探索升主动脉瘤的发病机制 | 接受择期开胸手术的三尖瓣主动脉瓣患者和器官捐献者的主动脉标本 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,免疫组织化学,超声心动图 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,影像数据 | 未明确具体样本数量,包括患者和器官捐献者标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2140 | 2025-10-06 |
Integrated multi-omics analysis reveals diagnostic biomarkers and therapeutic targets for systemic lupus erythematosus
2025-Aug-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042290
PMID:40826785
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研究论文 | 通过整合多组学分析识别系统性红斑狼疮的诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次通过双样本孟德尔随机化分析揭示血浆蛋白与SLE的因果关系,并构建高精度诊断列线图模型 | 未提及样本量大小和研究人群特征 | 探索系统性红斑狼疮的分子机制并发现新的诊断和治疗靶点 | 系统性红斑狼疮相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 分子对接模拟 | 列线图模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |