单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2121 - 2140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2121 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblast-derived fibulin-5 promotes radioresistance in non-small-cell lung cancer
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116018
PMID:40711881
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的Fibulin-5通过整合素αVβ5受体激活Src-STAT3通路并抑制铁死亡，从而促进非小细胞肺癌放疗抵抗的机制 | 首次发现CAF来源的Fibulin-5在放疗抵抗中的关键作用，并阐明其通过整合素αVβ5-Src-STAT3-ACSL4轴抑制铁死亡的新机制 | NA | 鉴定预测放疗疗效的CAF表达分子并阐明非小细胞肺癌放疗抵抗机制 | 非小细胞肺癌患者组织样本和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 基因敲低 | NA | 转录组数据, 临床组织数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2122 | 2025-10-06 |
Gut commensal microbiota drive tailored macrophage responses
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116157
PMID:40828655
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类巨噬细胞对不同肠道共生菌的响应模式 | 首次在单细胞水平系统评估人类巨噬细胞对15种主要共生菌的异质性响应，发现特定菌种驱动不同免疫反应 | 研究基于体外单核细胞来源的巨噬细胞模型，可能与体内组织驻留巨噬细胞存在差异 | 探究肠道共生菌如何调控巨噬细胞的免疫反应特性 | 人类单核细胞来源的巨噬细胞和15种主要肠道共生菌 | 免疫学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 74,476个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多重单细胞RNA测序 |
| 2123 | 2025-10-06 |
Biallelic BRF2 mutations disrupt redox homeostasis as etiological factors in syndromic immunodeficiency and developmental disorders
2025-Aug-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.006
PMID:40781771
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研究论文 | 本研究通过鉴定双等位BRF2基因突变，揭示了其通过破坏RNA聚合酶III转录活性导致氧化还原稳态失衡的分子机制 | 首次建立BRF2功能障碍与氧化还原稳态失衡之间的致病联系，并阐明其在血液免疫和发育异常中的分子机制 | 仅基于单个家系病例研究，样本量有限 | 探究BRF2基因突变导致综合征性免疫缺陷和发育障碍的分子病因学 | 携带双等位BRF2突变的多系统异常患者 | 遗传学 | 免疫缺陷病 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 1个家系病例 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 2124 | 2025-10-06 |
Deciphering the tumor immune microenvironment: single-cell and spatial transcriptomic insights into cervical cancer fibroblasts
2025-Jul-05, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03432-5
PMID:40616092
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和反卷积分析，揭示宫颈癌肿瘤免疫微环境中成纤维细胞亚型的作用机制 | 首次系统鉴定宫颈癌中六种成纤维细胞亚型，发现C0 MYH11⁺成纤维细胞通过MDK-SDC1信号轴在肿瘤-成纤维细胞相互作用中的核心作用 | 研究结果仅部分揭示了CAFs在宫颈癌TIME中的免疫调节和肿瘤支持作用，机制研究仍需深入 | 探索宫颈癌肿瘤免疫微环境中成纤维细胞亚型的特征及其在肿瘤进展中的作用 | 宫颈癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 反卷积分析, 伪时间轨迹映射, 荧光激活细胞分选, 多重免疫荧光, 免疫组织化学 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 图像数据 | 人类宫颈癌组织样本和培养细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2125 | 2025-10-06 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2025-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09002-1
PMID:40369080
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研究论文 | 本研究揭示了人类特异性增强子HARE5通过调控神经祖细胞增殖和神经发生能力来精细调节大脑皮层发育和连接 | 首次证明人类特异性增强子HARE5通过放大经典WNT信号通路调控神经祖细胞行为，促进大脑皮层扩张 | 研究主要依赖基因编辑动物模型和类器官，与真实人类大脑发育存在差异 | 探索人类加速区域HARs在物种特异性大脑皮层发育中的功能作用 | 基因编辑小鼠模型、灵长类模型、人类和黑猩猩神经祖细胞、皮层类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、基因组编辑、活体成像、谱系分析 | NA | 基因表达数据、成像数据、电生理数据 | 多种基因编辑动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2126 | 2025-10-06 |
Setdb1 ablation in macrophages attenuates fibrosis in heart allografts
2025-Jul, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424534122
PMID:40553495
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Setdb1通过调控巨噬细胞重编程在心脏移植物纤维化和肿瘤组织免疫排斥中的作用机制 | 首次发现Setdb1介导的组蛋白甲基化调控巨噬细胞重编程在纤维化形成中的关键作用，并揭示CCR2-Creb/Setdb1-FN1信号轴机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究巨噬细胞中Setdb1在纤维化形成中的作用机制及其治疗潜力 | 人类和小鼠心脏移植物、肿瘤组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠心脏移植物样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2127 | 2025-10-06 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.19.604364
PMID:39071335
|
研究论文 | 开发了lr-kallisto工具用于长读长测序数据的转录本定量分析 | 将kallisto批量与单细胞RNA-seq定量方法适配于长读长测序技术，并证明外显子捕获可提高定量准确性 | NA | 实现长读长测序数据的快速准确转录本定量 | 转录本异构体 | 生物信息学 | NA | 长读长测序，外显子捕获 | kallisto算法 | RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 长读长测序 | ONT | Oxford Nanopore长读长测序平台 |
| 2128 | 2025-10-06 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
|
研究论文 | 开发了一种整合细胞形态和空间转录组学的肿瘤生态系统深度分析框架METI | 首次将空间转录组学、细胞形态学和基因特征整合到端到端分析框架中，无需匹配单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本量的具体数量和研究设计的局限性 | 开发能够增强肿瘤微环境中细胞相互作用理解的分析工具 | 胃癌、肺癌、膀胱癌肿瘤组织及癌前组织 | 数字病理学 | 多癌种肿瘤 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 空间转录组数据、细胞形态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2129 | 2025-10-06 |
Single-cell Mayo Map (scMayoMap): an easy-to-use tool for cell type annotation in single-cell RNA-sequencing data analysis
2023-10-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01728-6
PMID:37858214
|
研究论文 | 开发了一个名为scMayoMap的易于使用的单细胞RNA测序数据细胞类型注释工具及其配套数据库 | 构建了全面的细胞标记物数据库scMayoMapDatabase，并开发了无需标记训练数据集或预定义细胞亚群标记物的用户友好注释工具 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 开发准确且用户友好的单细胞RNA测序数据细胞类型注释工具 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 48个独立的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2130 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and cell-specific proteomics reveals molecular signatures of sleep
2022-08-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03800-3
PMID:35986171
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和细胞特异性蛋白质组学揭示睡眠的分子特征 | 首次结合单细胞RNA测序和细胞类型特异性蛋白质组学技术系统研究睡眠分子机制 | 仅研究了三个脑区，未覆盖全脑所有区域；样本量未明确说明 | 探索睡眠调控的分子机制 | 脑干、皮层和下丘脑中的不同细胞类型（星形胶质细胞和神经元） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 磷酸化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2131 | 2025-10-06 |
Single-cell immunomics reveals the immunological hallmarks about the onset and different outcomes for ankylosing spondylitis patients
2025-Sep, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-025-07549-y
PMID:40665054
|
研究论文 | 通过单细胞免疫组学揭示强直性脊柱炎发病和不同预后的免疫学特征 | 首次通过单细胞RNA测序结合TCR/BCR分析系统揭示AS不同病程阶段的免疫细胞克隆扩增模式和V(D)J基因使用特征 | 样本量有限，未包含其他免疫细胞类型的深入分析 | 探索强直性脊柱炎发生发展和不同预后的免疫学机制 | 健康供者和不同病程阶段AS患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析，B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 健康供者和不同病程阶段AS患者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2132 | 2025-10-06 |
Semaglutide ameliorates retinal vascular permeability destruction in diabetic retinopathy by AnxA2-mediated MMP-9 activation and basement membrane remodeling
2025-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118409
PMID:40749340
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研究论文 | 本研究揭示索马鲁肽通过上调AnxA2激活MMP-9改善糖尿病视网膜病变中基底膜增厚和血管通透性破坏的分子机制 | 首次发现索马鲁肽通过AnxA2-MMP-9信号轴改善糖尿病视网膜病变，揭示了其不依赖血糖控制的血管保护作用 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究索马鲁肽在糖尿病视网膜病变中的治疗机制 | 2型糖尿病小鼠模型的视网膜组织 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,免疫荧光,免疫组化,Western blot,透射电镜 | NA | 图像,文本 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2133 | 2025-10-06 |
Multi-omics identification of circulating protein biomarkers for intervertebral disc degeneration using Mendelian randomization and scRNA-seq
2025-Sep, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-025-07606-6
PMID:40745068
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法识别与椎间盘退变相关的循环蛋白生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序识别椎间盘退变的因果循环蛋白标志物 | 需要进一步的体内验证研究来确认临床相关性和治疗适用性 | 识别与椎间盘退变因果相关的循环蛋白生物标志物 | 椎间盘退变患者和健康个体的循环蛋白及椎间盘组织 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 机器学习分类模型 | 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 | 4907个循环蛋白的蛋白质组数据, FinnGen队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2134 | 2025-10-06 |
NFATC3 enhances osteosarcoma progression by increasing PD-L1 and CXCL2 levels
2025-Jul-29, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02850-x
PMID:40728758
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研究论文 | 本研究探讨了NFATC3基因通过增加PD-L1和CXCL2表达促进骨肉瘤进展的机制 | 首次揭示NFATC3通过调控PD-L1配体和炎症因子表达促进骨肉瘤进展，并发现其在肿瘤微环境T细胞和巨噬细胞中的高表达 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究NFATC3基因在骨肉瘤中的表达及其对肿瘤进展的影响机制 | 骨肉瘤细胞系(143B、SJSA、HOS、MG63、MNNG)和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | qRT-PCR、单细胞测序、肿瘤细胞与巨噬细胞共培养系统 | 细胞系模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 5种骨肉瘤细胞系和多个骨肉瘤测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2135 | 2025-10-06 |
Spatially resolved transcriptomics reveals a unique disease signature and potential biomarkers for chronic traumatic encephalopathy
2025-Jul-18, Journal of neuropathology and experimental neurology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jnen/nlaf078
PMID:40680295
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研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示慢性创伤性脑病的独特疾病特征和潜在生物标志物 | 首次通过空间转录组学在CTE病变原位绘制基因表达图谱，并鉴定出21个基因的CTE特征 | 仅分析死后组织样本，无法进行纵向研究 | 理解CTE病理生理学机制并寻找生物标志物 | 慢性创伤性脑病(CTE)病变组织和匹配的正常组织 | 空间转录组学 | 慢性创伤性脑病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 来自同一患者个体的CTE病变和正常组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 2136 | 2025-10-06 |
Generating and characterizing human telencephalic brain organoids from stem cell-derived single neural rosettes
2025-Jun-27, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01197-x
PMID:40579542
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研究论文 | 开发了一种从干细胞来源的单个神经玫瑰花结生成人端脑类器官的方法 | 使用单个神经玫瑰花结生成类器官，模拟体内单一神经管发育过程，具有一致的细胞组成和可预测的神经细胞组织结构 | 完成整个方案需要5-6个月时间，且需要具备细胞培养经验 | 研究人端脑中不同神经细胞的规范和组织，以及模拟与神经网络破坏相关的神经发育障碍 | 人端脑类器官 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、切片膜片钳电生理学、CRISPR-Cas9基因编辑 | 类器官模型 | 基因表达数据、电生理数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2137 | 2025-10-06 |
Dissecting the immune landscape in pediatric high-grade glioma reveals cell state changes under therapeutic pressure
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102095
PMID:40315846
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析儿童高级别胶质瘤免疫景观 | 首次全面揭示儿童高级别胶质瘤免疫微环境在治疗压力下的细胞状态变化，并与成人胶质瘤进行对比 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 解析儿童高级别胶质瘤免疫微环境特征及其在治疗过程中的变化 | 儿童弥漫性高级别胶质瘤和高级别室管膜瘤患者的恶性细胞、髓系细胞和T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2138 | 2025-10-06 |
Central control of dynamic gene circuits governs T cell rest and activation
2025-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08314-y
PMID:39663454
|
研究论文 | 通过CRISPR筛选和单细胞转录组学揭示MED12调控T细胞静息与激活状态转换的动态基因回路 | 发现约90%的IL-2Rα调控因子在不同细胞类型和刺激状态下具有可变效应，其中MED12作为动态协调者通过COMPASS复合物控制组蛋白甲基化 | 研究主要聚焦于CD4 T细胞，未涵盖其他免疫细胞类型 | 阐明T细胞在不同状态下维持身份和响应环境信号的动态基因调控机制 | 原代人CD4 T细胞 | 基因调控网络 | 免疫相关疾病 | CRISPR筛选, 单细胞转录组学, 免疫沉淀-质谱分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 多种原代人CD4 T细胞环境 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2139 | 2025-10-06 |
Decoding the mosaic of inflammatory bowel disease: Illuminating insights with single-cell RNA technology
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.07.011
PMID:39421242
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的最新进展与应用 | 系统整合单细胞转录组、蛋白质组、T细胞受体谱和表观遗传分析，提供IBD发病机制的全面视角 | 缺乏纵向研究数据，需要整合多种单细胞和空间转录组技术 | 探索单细胞测序技术在炎症性肠病研究中的应用价值 | 炎症性肠病（包括溃疡性结肠炎和克罗恩病）患者细胞 | 数字病理 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组分析, T细胞受体谱分析, 表观遗传分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2140 | 2025-10-06 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-May-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
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研究论文 | 开发了一种用于骨组织空间转录组学分析的方法，能够有效处理新鲜骨组织和存档样本 | 解决了硬组织样本在空间转录组学分析中的技术难题，特别是骨组织的脱钙处理与RNA保存的平衡 | 方法主要针对骨组织，对其他硬组织的适用性需要进一步验证 | 开发适用于骨组织的空间转录组学分析方法 | 骨组织样本，包括新鲜骨组织和组织库中的存档样本 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，组织形态学数据 | 骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |