单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 21361 - 21380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21361 | 2024-08-08 |
The combined prognostic model of copper-dependent to predict the prognosis of pancreatic cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.978988
PMID:36035166
|
研究论文 | 本文通过单细胞分析和CIBERSORT方法，研究了铜依赖基因及相关免疫浸润细胞在胰腺癌中的预后价值 | 本文首次提出了一种基于铜依赖基因及相关免疫浸润细胞的联合预后模型，用于预测胰腺癌的预后 | NA | 评估铜依赖基因及相关免疫浸润细胞在胰腺癌中的预后价值 | 铜依赖基因、相关免疫浸润细胞及胰腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序分析、CIBERSORT | Cox回归、LASSO方法 | 基因表达数据 | 训练队列和测试队列来自TCGA数据库，验证队列来自GSE62452数据集 |
| 21362 | 2024-08-08 |
Identification of novel key genes and potential candidate small molecule drugs in diabetic kidney disease using comprehensive bioinformatics analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.934555
PMID:36035169
|
research paper | 本研究通过综合生物信息学分析，鉴定了糖尿病肾病中的新型关键基因和潜在的小分子候选药物。 | 首次揭示了糖尿病肾病患者肾脏中浸润免疫细胞的比例显著增高，并通过单细胞转录组学探索了免疫景观。 | NA | 旨在揭示糖尿病肾病中的基因表达变化，并发现关键基因，为诊断和治疗提供新的分子标记和治疗靶点。 | 糖尿病肾病患者和健康供体的肾脏样本。 | digital pathology | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学, 加权共表达网络分析 (WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络, 实时定量PCR, 免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据 | 包括健康供体、早期和晚期糖尿病肾病患者的肾脏样本 |
| 21363 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Smooth Muscle Cells Heterogeneity in Experimental Aortic Dissection
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.836593
PMID:36035191
|
研究论文 | 本研究旨在阐明实验性主动脉夹层（AD）中主动脉的细胞景观，并详细阐述不同细胞类型中的平滑肌细胞（SMCs）及其功能 | 本研究首次提供了从老鼠AD组织中完整的细胞景观，并鉴定了七个核心差异表达基因（DEGs）和八种SMCs亚型 | NA | 阐明实验性主动脉夹层中主动脉的细胞景观，并详细阐述不同细胞类型中的平滑肌细胞及其功能 | 实验性主动脉夹层中的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 28周龄的雄性Apolipoprotein缺乏（ApoE）小鼠 |
| 21364 | 2024-08-08 |
Colorectal Cancer Cell Differentiation Trajectory Predicts Patient Immunotherapy Response and Prognosis
2022 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748221121382
PMID:36036380
|
研究论文 | 本研究旨在探讨结直肠癌细胞的分化状态及其临床意义，并基于结直肠癌的分化相关基因预测患者的免疫反应和预后 | 本研究结合单细胞测序数据和转录组数据，开发了一种基于结直肠癌分化相关基因的分子分型和预后模型，以预测患者的免疫反应和预后 | NA | 探讨结直肠癌细胞的分化状态及其临床意义，并预测患者的免疫反应和预后 | 结直肠癌细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 5种不同的细胞分化亚群和620个结直肠癌分化相关基因 |
| 21365 | 2024-08-08 |
AIF1 + CSF1R + MSCs, induced by TNF-α, act to generate an inflammatory microenvironment and promote hepatocarcinogenesis
2023-08-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32738
PMID:35989499
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了一种与炎症相关的特定MSC亚群，即AIF1+ CSF1R+ MSCs，并探讨了其在肝癌发生中的作用 | 首次揭示了AIF1+ CSF1R+ MSCs在肝癌发生前的微环境中存在，并通过TNF-α刺激通过TNFR1/SIRT1途径诱导 | 研究主要基于大鼠模型，未来需在人体中进一步验证 | 探讨炎症环境下内源性MSC的特性及其在肝癌发生中的作用 | AIF1+ CSF1R+ MSCs及其在肝癌发生中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠初级肝癌模型 |
| 21366 | 2024-08-08 |
Epithelial SOX9 drives progression and metastases of gastric adenocarcinoma by promoting immunosuppressive tumour microenvironment
2023-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-326581
PMID:36002248
|
研究论文 | 研究SOX9在胃腺癌中的作用及其对肿瘤微环境免疫抑制的影响 | 首次揭示SOX9通过调控白血病抑制因子（LIF）影响胃腺癌的癌症干细胞特性和免疫抑制微环境 | NA | 探讨SOX9在胃腺癌进展和转移中的作用及其对免疫抑制肿瘤微环境的影响，以发现新的治疗策略 | 胃腺癌中的SOX9表达及其对肿瘤微环境和免疫反应的影响 | NA | 胃癌 | RNA测序 | NA | RNA | 使用患者来源的细胞和模型进行体外和体内研究 |
| 21367 | 2024-08-05 |
Single-cell profiles reveal distinctive immune response in atopic dermatitis in contrast to psoriasis
2023-02, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15486
PMID:35986602
|
研究论文 | 本研究探讨了特应性皮炎和银屑病患者的免疫反应差异 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序揭示特应性皮炎与银屑病在疾病驱动细胞类型及亚型上的不同 | 缺乏对其他类型慢性炎症皮肤疾病的比较分析 | 探讨特应性皮炎与银屑病的炎症特征及其严重程度的关联 | 特应性皮炎和银屑病患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 细胞数据 | 来自特应性皮炎和银屑病患者的皮肤活检和血液样本 |
| 21368 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of Fibroblast Activation Protein Expression in Interstitial Lung Diseases
2023-01-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202110-2414OC
PMID:35984444
|
研究论文 | 本文全面分析了纤维母细胞激活蛋白在间质性肺疾病中的表达。 | 首次揭示了FAP在低剂量促纤维化细胞因子作用下的早期激活阶段显著上调。 | 虽然应用了多种实验方法，但对于FAP在各种间质性肺疾病中表达模式的定义仍然不足。 | 研究FAP的表达强度能否作为间质性肺疾病中活化纤维母细胞的潜在评估指标。 | 人类原代肺纤维母细胞及临床肺标本。 | 数字病理学 | 间质性肺疾病 | 实时定量PCR（qPCR）、西方印迹、免疫荧光染色、深度学习测量全切片免疫组化、单细胞测序等。 | NA | 临床样本数据 | 多种类型的间质性肺疾病患者 |
| 21369 | 2024-08-08 |
Genomic insights into the phylogeny and biomass-degrading enzymes of rumen ciliates
2022-12, The ISME journal
DOI:10.1038/s41396-022-01306-8
PMID:35986094
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和组装识别流程，获得了52个高质量的瘤胃纤毛虫基因组，解析了其分类和系统发育框架，并揭示了瘤胃纤毛虫广泛的碳水化合物活性酶（CAZymes）以降解各种植物和微生物碳水化合物 | 首次大规模分析了瘤胃纤毛虫的基因组，揭示了其通过水平基因转移和基因家族扩张获得广泛的碳水化合物活性酶，特别是Diplodiniinae和Ophryoscolecinae物种编码的CAZymes数量与肠道真菌相当 | NA | 探究瘤胃纤毛虫的基因组多样性和降解酶的遗传基础 | 瘤胃纤毛虫的基因组和碳水化合物活性酶 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 52个高质量的瘤胃纤毛虫基因组 |
| 21370 | 2024-08-08 |
Combined hepatocellular-cholangiocarcinoma derives from liver progenitor cells and depends on senescence and IL-6 trans-signaling
2022-12, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.07.029
PMID:35988690
|
研究论文 | 本研究探讨了肝前体细胞在肝细胞癌（HCC）和混合型肝细胞癌-胆管癌（cHCC-CCA）中的作用，并揭示了IL-6跨信号传导在此过程中的重要性。 | 首次证明cHCC-CCA肿瘤来源于肝前体细胞，并依赖于衰老细胞中的IL-6通过IL-6跨信号传导途径。 | NA | 确定肝前体细胞是否参与HCC、cHCC-CCA或两种肿瘤的发生。 | 肝前体细胞在肝细胞癌和混合型肝细胞癌-胆管癌中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Mdr2-KOFoxl1-CRE;RosaYFP小鼠模型进行研究。 |
| 21371 | 2024-08-08 |
Network analysis reveals different hub genes and molecular pathways for pig in vitro fertilized early embryos and parthenogenotes
2022-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14231
PMID:35997106
|
研究论文 | 本文通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）研究了体外受精早期胚胎和孤雌激活胚胎的母源到合子过渡（MZT）过程中的功能模块和枢纽基因。 | 首次应用WGCNA分析方法揭示了猪体外受精早期胚胎和孤雌激活胚胎在MZT过程中的不同枢纽基因和分子通路。 | NA | 深入研究猪胚胎中母源到合子过渡（MZT）的调控和功能。 | 猪体外受精早期胚胎和孤雌激活胚胎的母源到合子过渡（MZT）过程中的功能模块和枢纽基因。 | 生物信息学 | NA | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 45个单细胞RNA测序数据集 |
| 21372 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing dissects cellular heterogeneity and identifies two tumor-suppressing immune cell subclusters in HPV-related cervical adenosquamous carcinoma
2022-12, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28084
PMID:36000446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人乳头瘤病毒（HPV）相关宫颈腺鳞癌的肿瘤内异质性，识别了七个上皮和十一个免疫亚群 | 首次详细解析了HPV相关宫颈腺鳞癌的细胞异质性，并发现了两个具有肿瘤抑制作用的免疫细胞亚群 | 研究样本仅来自两个HPV相关宫颈腺鳞癌样本，可能影响结果的普遍性 | 探究HPV相关宫颈腺鳞癌的肿瘤内异质性，以改进诊断和治疗策略 | HPV相关宫颈腺鳞癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 18,046个单细胞样本，以及165名HPV相关宫颈癌患者的数据 |
| 21373 | 2024-08-08 |
Uptake of Staphylococcus aureus by keratinocytes is reduced by interferon-fibronectin pathway and filaggrin expression
2022-Nov, The Journal of dermatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1111/1346-8138.16546
PMID:35983802
|
研究论文 | 研究探讨了金黄色葡萄球菌（S. aureus）在特应性皮炎（AD）患者皮肤中的吸收机制，以及干扰素-纤维连接蛋白途径和丝聚合蛋白表达对角质形成细胞吸收金黄色葡萄球菌的影响。 | 首次揭示了干扰素-γ通过调节纤维连接蛋白和丝聚合蛋白表达，影响角质形成细胞对AD型金黄色葡萄球菌的吸收。 | 研究仅限于细胞水平，未涉及体内实验，且样本量较小。 | 阐明金黄色葡萄球菌在特应性皮炎患者皮肤中的吸收机制及其影响因素。 | 金黄色葡萄球菌、角质形成细胞（HaCaT细胞）、干扰素-γ、白细胞介素-4、白细胞介素-13。 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约100个细胞 |
| 21374 | 2024-08-08 |
Construction of the prognostic enhancer RNA regulatory network in osteosarcoma
2022-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101499
PMID:36001923
|
研究论文 | 本文构建了基于增强子RNA的预测骨肉瘤患者预后的模型，并探索了骨肉瘤发病机制的相关调控网络 | 首次构建了基于增强子RNA的骨肉瘤预后预测模型，并整合生物信息学分析探索了骨肉瘤发病机制的潜在调控网络 | NA | 预测骨肉瘤患者的预后并探索骨肉瘤发病机制的调控网络 | 骨肉瘤中的差异表达增强子RNA、转录因子及其靶基因 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | limma包（线性模型用于微阵列分析） | 多元风险预测模型 | RNA | 3,981个差异表达靶基因，468个差异表达增强子RNA，51个差异表达转录因子，27个差异表达标志性基因集 |
| 21375 | 2024-08-08 |
Comprehensive identification of immuno-related transcriptional signature for active pulmonary tuberculosis by integrated analysis of array and single cell RNA-seq
2022-11, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2022.08.017
PMID:36007657
|
研究论文 | 本文通过综合分析阵列和单细胞RNA测序数据，全面识别了活动性肺结核的免疫相关转录特征，并探索了潜在的诊断标记物。 | 本文首次结合阵列和单细胞RNA测序技术，筛选出与结核病高度相关的三个关键免疫相关枢纽基因，并验证了ADM基因在结核病患者中的显著表达增加。 | 研究样本量较小，需要进一步在大规模队列中验证。 | 旨在识别活动性肺结核的免疫相关转录特征，并探索潜在的诊断标记物。 | 研究对象包括结核病、潜伏性结核感染和健康对照的血液样本。 | 数字病理学 | 肺结核 | 阵列和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及成人和儿童的结核病、潜伏性结核感染和健康对照的血液样本 |
| 21376 | 2024-08-08 |
Single-cell mutation calling and phylogenetic tree reconstruction with loss and recurrence
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac577
PMID:36000873
|
研究论文 | 本文介绍了一种方法，通过建模噪声过程并允许突变在肿瘤进化过程中丢失或重新出现，联合调用每个细胞中的突变，重建细胞间的系统发育关系，并确定突变丢失和重新出现的位置 | 提出了一个贝叶斯方法，能够准确调用突变并量化预测的确定性，同时展示了允许突变丢失或重新出现的优势 | NA | 理解每个患者的肿瘤组成和进化历史，为个性化治疗提供关键信息 | 肿瘤细胞的异质性和进化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯模型 | 单细胞测序数据 | NA |
| 21377 | 2024-08-08 |
propeller: testing for differences in cell type proportions in single cell data
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac582
PMID:36005887
|
研究论文 | 本文介绍了propeller方法，用于检测单细胞数据中细胞类型比例在不同实验条件下的差异 | propeller方法利用生物复制来发现细胞类型比例在组间的统计显著差异，并展示了其在多种场景下的良好表现 | NA | 开发一种统计方法来准确识别单细胞RNA测序数据中细胞类型组成的统计显著变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型比例 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据 | 数千到数百万的单细胞 |
| 21378 | 2024-08-08 |
Lymphatic migration of unconventional T cells promotes site-specific immunity in distinct lymph nodes
2022-10-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.07.019
PMID:36002023
|
研究论文 | 本研究通过淋巴结移植、单细胞RNA测序、光谱流式细胞术和转基因小鼠模型，展示了源自组织的非常规T细胞（UTCs）通过淋巴途径迁移到局部引流淋巴结 | 发现每个组织都拥有独特的UTCs谱，这些细胞具有局部适应的分化状态和独特的T细胞受体库，使得每个引流淋巴结都由独特的组织决定性混合淋巴细胞组成 | NA | 研究非常规T细胞在淋巴结中的迁移及其对特定部位免疫反应的影响 | 非常规T细胞（UTCs）及其在淋巴结中的迁移和功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 转基因小鼠模型 |
| 21379 | 2024-08-08 |
Phosphatase control of cytokine-mediated overproduction of galactose-deficient IgA1, the main autoantigen in IgA nephropathy
2022-10, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102883
PMID:35987175
|
研究论文 | 本文研究了磷酸酶在细胞因子介导的过量产生缺乏半乳糖的IgA1（IgA肾病的主要自身抗原）中的调控作用 | 发现了IgA1分泌细胞中C1GALT1表达减少的亚群，这些细胞在细胞因子刺激下表现出异常的细胞因子信号传导调控，可能导致IgA肾病中自身抗原的过量产生 | NA | 探讨IgA肾病中自身抗原过量产生的机制 | IgA肾病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和健康对照者的PBMCs | NA | 肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自IgA肾病患者和健康对照者的PBMCs |
| 21380 | 2024-08-08 |
Intestinal single-cell atlas reveals novel lymphocytes in pigs with similarities to human cells
2022-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201442
PMID:35995567
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在猪的回肠中鉴定了26种细胞类型，并与人和小鼠的回肠细胞进行了比较 | 发现了猪特有的淋巴细胞亚群，并定义了猪的外周和回肠先天淋巴细胞的基因特征，揭示了与人类先天淋巴细胞的相似性 | NA | 深入理解猪的肠道淋巴细胞，以提高其在生物医学模型中的实用性 | 猪的肠道淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 猪的回肠中的26种细胞类型 |