单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 21341 - 21360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21341 | 2024-08-08 |
Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids for personalized congenital and idiopathic nephrotic syndrome modeling
2022-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200198
PMID:35417019
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研究论文 | 本研究利用人多能干细胞衍生的肾脏类器官模型，模拟先天性和特发性肾病综合征的病理过程 | 通过混合培养协议获得的类器官足细胞在单细胞RNA测序、超分辨率成像和电子显微镜下显示出与成人足细胞相似的特征，优于二维培养的足细胞 | NA | 研究先天性和特发性肾病综合征的病理机制 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序, 超分辨率成像, 电子显微镜 | NA | 类器官 | 从携带杂合NPHS2突变的患者细胞中培养的类器官 |
| 21342 | 2024-08-08 |
Suppressed COP9 signalosome 5 promotes hemocyte proliferation through Cyclin E in the early G1 phase to defend against bacterial infection in crab
2022-05, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101710RRRR
PMID:35429011
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研究论文 | 本研究报道了在中华绒螯蟹中，细菌感染诱导血细胞增殖，并通过抑制EsCsn5表达促进细胞周期早期G1阶段的Cyclin E表达，以增强免疫防御 | 首次揭示了EsCsn5在中华绒螯蟹血细胞增殖中的负调控作用，并通过调控Cyclin E的泛素化降解而非转录来影响细胞周期 | 研究主要集中在EsCsn5对血细胞增殖的影响，未涉及其他可能的免疫调控机制 | 探讨细菌感染下中华绒螯蟹血细胞增殖的分子机制 | 中华绒螯蟹的血细胞及EsCsn5和Cyclin E的表达调控 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及不同组织的中华绒螯蟹样本 |
| 21343 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq dataset and bulk RNA-seq dataset constructs a prognostic model for predicting survival in human glioblastoma
2022-05, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.2575
PMID:35429411
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据集和批量RNA测序数据集，构建了一个预测人类胶质母细胞瘤患者生存率的预后模型 | 该研究首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个更为精确的预后模型，能够更准确地反映肿瘤核心和周边区域的差异 | NA | 开发一个可靠的模型来预测新胶质母细胞瘤患者的生存概率 | 人类胶质母细胞瘤患者的生存率 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO Cox惩罚回归分析 | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据集包含2128个差异表达基因，批量RNA测序数据集包含6461个差异表达基因 |
| 21344 | 2024-08-08 |
The macrophage: a key player in the pathophysiology of peripheral neuropathies
2022-Apr-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02454-6
PMID:35429971
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性的最新知识，特别关注了它们在周围神经系统中的作用及其与活性氧物种的相互作用。 | 利用命运图谱和单细胞转录组学等新技术，详细描述了组织驻留巨噬细胞在周围神经系统中的起源和命运，并深入理解了它们在周围神经病变中的功能。 | NA | 总结巨噬细胞在周围神经病变中的作用，并探讨针对特定巨噬细胞以减轻周围神经系统功能缺陷的潜在益处。 | 巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性，以及它们与活性氧物种的相互作用。 | NA | 周围神经病变 | 命运图谱、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 21345 | 2024-08-08 |
Interactive single-cell data analysis using Cellar
2022-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29744-0
PMID:35422041
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cellar的软件工具，用于支持单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较 | Cellar提供交互式支持，能够统一分配细胞类型，并适用于不同的平台和数据类型 | NA | 开发一种软件工具，以改进跨大型联盟、平台和模式的细胞类型分配能力 | 单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，空间蛋白质组学 | NA | 单细胞数据，空间数据 | 多个HuBMAP数据集 |
| 21346 | 2024-08-08 |
Tissue-resident CD8+ T cells drive compartmentalized and chronic autoimmune damage against CNS neurons
2022-04-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl6157
PMID:35417189
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研究论文 | 研究探讨了中枢神经系统（CNS）自身免疫疾病的慢性机制，特别是组织驻留记忆T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用 | 发现了在CNS疾病中，组织驻留的CD8 T细胞通过特定的分化程序，维持局部神经炎症和渐进性神经元损失，这一过程依赖于CD4 T细胞 | NA | 揭示组织驻留CD8 T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用及其机制 | 组织驻留记忆T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用 | 免疫学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学、高维度流式细胞术、组织病理学 | NA | 细胞 | 使用了人类自身免疫性脑炎和鼠模型中的样本 |
| 21347 | 2024-08-08 |
Generation of resolving memory neutrophils through pharmacological training with 4-PBA or genetic deletion of TRAM
2022-04-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04809-6
PMID:35418110
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，发现了一类具有促炎症消退特性的中性粒细胞亚群，并探讨了通过药物4-PBA或遗传删除TRAM分子来训练中性粒细胞进入消退状态的机制。 | 首次发现4-PBA能够有效训练中性粒细胞进入消退状态，并增强其吞噬和杀菌功能，同时揭示了这一过程的分子机制。 | NA | 研究中性粒细胞在促进炎症消退中的作用及其潜在的治疗应用。 | 中性粒细胞及其在炎症消退中的作用。 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21348 | 2024-08-08 |
Distinct phases of adult microglia proliferation: a Myc-mediated early phase and a Tnfaip3-mediated late phase
2022-Apr-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00377-3
PMID:35411038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，揭示了在小鼠脊髓中由坐骨神经损伤诱导的两种不同阶段的微胶质细胞增殖，每种阶段具有不同的基因表达谱 | 首次阐明了成年微胶质细胞增殖的两个不同阶段，分别由Myc和Tnfaip3介导，并揭示了这两个阶段之间的相互作用 | NA | 探讨成年微胶质细胞增殖的机制及其在神经疾病中的作用 | 微胶质细胞在小鼠脊髓中的增殖过程 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脊髓样本 |
| 21349 | 2024-08-08 |
An immune subtype-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing analysis
2022-04-12, Aging
DOI:10.18632/aging.204012
PMID:35413690
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析，将肝细胞癌分为免疫细胞和非免疫细胞亚型，并构建了一个与免疫亚型相关的肝细胞癌预后标志物模型 | 通过单细胞测序分析，发现了两种亚型中的差异表达基因，并利用这些基因构建了一个新的肝细胞癌预后模型 | NA | 探索肝细胞癌的免疫微环境，并构建一个准确的预后评估模型 | 肝细胞癌的免疫亚型及其预后标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | Cox和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库中的GSE146115数据集 |
| 21350 | 2024-08-08 |
Semantic clustering analysis of E3-ubiquitin ligases in gastrointestinal tract defines genes ontology clusters with tissue expression patterns
2022-Apr-12, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-022-02265-2
PMID:35413796
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研究论文 | 本研究使用语义双聚类技术分析小鼠胃肠道中E3泛素连接酶及其相关基因的表达谱，揭示了基因本体簇及其组织表达模式 | 本研究采用优化的语义聚类协议，揭示了胃肠道特异性泛素连接酶及其相关基因的表达谱中的可读性和独特模式，扩展了我们对这些基因本体关系的认识 | NA | 研究旨在通过语义聚类分析改进和扩展泛素连接酶的功能分类 | 小鼠胃肠道中的E3泛素连接酶及其相关基因 | NA | NA | 语义双聚类技术，主成分分析（PCA），均匀流形近似和投影技术（UMAP） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 |
| 21351 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of the retina in a model of retinitis pigmentosa reveals early responses to degeneration in rods and cones
2022-04-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01280-9
PMID:35413909
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在视网膜色素变性模型中分析了杆状和锥状光感受器在早期退化过程中的反应 | 首次在视网膜色素变性模型中使用单细胞RNA测序技术，揭示了杆状和锥状光感受器在早期退化过程中的动态变化 | 由于视网膜的异质性，检测早期锥状光感受器对杆状光感受器死亡的反应特别困难 | 研究视网膜色素变性中杆状和锥状光感受器的退化机制 | 视网膜色素变性模型中的杆状和锥状光感受器 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在视网膜色素变性小鼠模型rd10中进行研究 |
| 21352 | 2024-08-08 |
Progenitor potential of lung epithelial organoid cells in a transplantation model
2022-04-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110662
PMID:35417699
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研究论文 | 本研究探讨了肺上皮类器官细胞在移植模型中的祖细胞潜能 | 首次展示了肺祖细胞在移植后能够功能性植入，并维持其类器官形成能力 | NA | 研究肺祖细胞在移植后的功能性植入和再生能力 | 肺上皮类器官细胞，包括SCA1阴性状态富集的AT2细胞（SNO）和多潜能SCA1阳性祖细胞（SPO） | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 移植到受损小鼠肺部的SNO和SPO细胞 |
| 21353 | 2024-08-08 |
Brown adipose tissue involution associated with progressive restriction in progenitor competence
2022-04-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110575
PMID:35417710
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研究论文 | 本文研究了人类棕色脂肪组织（BAT）的退化过程，发现这一过程与前体细胞的棕色脂肪生成能力丧失有关，并通过单细胞RNA测序揭示了FSTL1基因在BAT退化中的作用。 | 首次在兔子和人类中观察到BAT退化与前体细胞FSTL1表达减少的关系，并证实了FSTL1在维持BAT功能中的作用。 | 研究主要集中在兔子和老鼠模型上，对人类的直接应用可能有限。 | 探讨人类棕色脂肪组织退化的机制及其与前体细胞功能的关系。 | 人类和兔子的棕色脂肪组织及其前体细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21354 | 2024-08-08 |
Repurposing antiparasitic antimonials to noncovalently rescue temperature-sensitive p53 mutations
2022-04-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110622
PMID:35417717
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研究论文 | 本文旨在通过筛选温度敏感的p53突变体，利用抗寄生虫药物钾锑酒石酸盐（PAT）进行药理学救援，以热稳定性作为化合物筛选的指标 | 首次发现抗寄生虫药物PAT能够通过非共价结合稳定代表性的温度敏感突变体p53-V272M，并显示出抗肿瘤活性 | NA | 探索利用抗寄生虫药物治疗特定p53突变型癌症的可能性 | 温度敏感的p53突变体及相关的癌症细胞 | 癌症研究 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 815个常见的p53错义突变中筛选出65个潜在可治疗的突变 |
| 21355 | 2024-08-08 |
Clinicopathological value of the upregulation of cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2 in osteosarcoma
2022-04-11, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01234-8
PMID:35410253
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研究论文 | 本研究探讨了细胞周期依赖性激酶调节亚单位2（CKS2）在骨肉瘤（OS）中的临床病理价值 | 首次通过多种技术手段证实了CKS2在骨肉瘤组织中的上调表达，并分析了其与临床病理参数的关系 | 尽管研究显示CKS2在骨肉瘤中的表达上调，但Kaplan-Meier曲线未显示出高CKS2表达组与低CKS2表达组在总体生存率上的显著差异 | 研究CKS2在骨肉瘤中的表达及其对临床病理参数的影响 | 骨肉瘤组织和非肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 免疫组织化学（IHC） | NA | 组织微阵列数据 | 217例骨肉瘤样本和87例非肿瘤样本 |
| 21356 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing coupled to TCR profiling of large granular lymphocyte leukemia T cells
2022-04-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29175-x
PMID:35411048
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序结合TCR分析，探讨了T细胞大颗粒淋巴细胞白血病（T-LGLL）在阿仑单抗治疗前后的变化 | 首次展示了T-LGLL中效应记忆T细胞的普遍存在以及T细胞受体（TCR）多样性的丧失，并揭示了治疗前后细胞凋亡基因表达的变化 | NA | 探究T-LGLL的病理生理机制及阿仑单抗治疗的效果 | T-LGLL患者的CD3 T细胞 | 数字病理学 | 淋巴增生性疾病 | 单细胞RNA测序，TCR分析 | NA | RNA序列数据 | 13名患者 |
| 21357 | 2024-08-08 |
Tracking down tumor-specific T cells
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.007
PMID:35413268
|
research paper | 本文通过两篇发表在《Cancer Cell》上的论文，展示了如何利用单细胞测序技术定义识别肿瘤特异性T细胞的分子表型 | 利用单细胞测序技术定义肿瘤特异性T细胞的分子表型 | NA | 研究如何通过单细胞测序技术识别肿瘤特异性T细胞 | 肿瘤特异性T细胞 | digital pathology | NA | 单细胞测序 | NA | 分子表型数据 | NA |
| 21358 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiles of neoantigen-reactive T cells in human gastrointestinal cancers
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.005
PMID:35413272
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研究论文 | 本研究通过免疫筛选与单细胞RNA测序相结合的方法，分析了胆管癌和胰腺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞中新生抗原反应性T细胞的转录组特征 | 发现了新生抗原反应性CD8 T细胞和CD4 T细胞在胃肠道癌症中表现出独特的转录组特征，这些特征可能为利用这些细胞进行治疗提供新的机会 | NA | 研究胃肠道癌症中新生抗原反应性T细胞的转录组特征 | 胆管癌和胰腺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞中的新生抗原反应性T细胞 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自胆管癌和胰腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 21359 | 2024-08-08 |
Neoantigen-specific CD4+ T cells in human melanoma have diverse differentiation states and correlate with CD8+ T cell, macrophage, and B cell function
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.006
PMID:35413271
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序和T细胞受体序列，识别了浸润人黑色素瘤的肿瘤特异性CD4 T细胞的特征及其功能相关性 | 首次详细描述了肿瘤特异性CD4 T细胞在人黑色素瘤中的多样分化状态及其与CD8 T细胞、巨噬细胞和B细胞功能的关联 | NA | 探究肿瘤特异性CD4 T细胞在人黑色素瘤中的作用及其与免疫细胞功能的关联 | 人黑色素瘤中的肿瘤特异性CD4 T细胞及其功能相关性 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21360 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Cells from Degenerating and Non-Degenerating Intervertebral Discs from the Same Individual Reveals New Biomarkers for Intervertebral Disc Degeneration
2022-Apr-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23073993
PMID:35409356
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析技术，从同一患者的退变和非退变椎间盘组织中鉴定出新的细胞特异性生物标志物，并定义了不同细胞群 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了退变和非退变椎间盘细胞的功能差异，并发现了与细胞类型和退变状态相关的分子功能、生物过程和转录因子 | NA | 鉴定新的椎间盘退变生物标志物，以改善诊断和治疗选项 | 退变和非退变的人类椎间盘细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自同一患者的退变和非退变椎间盘组织 |