单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 21241 - 21260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21241 | 2024-08-08 |
Simplified, Shear Induced Generation of Double Emulsions for Robust Compartmentalization during Single Genome Analysis
2022-May-11, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.1c22692
PMID:35502700
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研究论文 | 本文展示了双乳液滴（DE）在单基因分析中通过防止内容混合来解决单乳液滴（SE）的不稳定性问题 | 开发了一种简单的一层双乳液滴制造装置，兼容简单的表面处理，使得双乳液滴设备的制造更加容易，促进了其更广泛的应用 | NA | 解决单乳液滴在分析过程中的不稳定性问题，提高多步骤反应在液滴中的可行性 | 双乳液滴的稳定性和其在单基因分析中的应用 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 液滴 | NA |
| 21242 | 2024-08-08 |
scSemiAE: a deep model with semi-supervised learning for single-cell transcriptomics
2022-May-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04703-0
PMID:35513780
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scSemiAE的半监督降维方法，基于自编码器模型，用于单细胞转录组学数据分析 | scSemiAE方法利用带有细胞亚群标签的数据集信息，指导寻找更好的低维表示，从而简化进一步分析 | NA | 开发一种半监督学习方法，用于单细胞RNA测序数据的降维和细胞亚群识别 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 自编码器（Autoencoder） | 转录组数据 | 五个公共数据集 |
| 21243 | 2024-08-08 |
Correction: Single-cell RNA sequencing of cultured human endometrial CD140b+CD146+ perivascular cells highlights the importance of in vivo microenvironment
2022-May-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02872-6
PMID:35513860
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 21244 | 2024-08-08 |
Dual functions of microRNA-17 in maintaining cartilage homeostasis and protection against osteoarthritis
2022-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30119-8
PMID:35508470
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研究论文 | 本文研究了微RNA-17在维持软骨稳态和预防骨关节炎中的双重功能 | 首次报道了微RNA-17在骨关节炎中的保护作用及其通过靶向病理分解代谢因子来预防骨关节炎的机制 | NA | 探讨微RNA-17在维持软骨稳态和预防骨关节炎中的作用 | 微RNA-17在骨关节炎中的表达及其对软骨细胞的影响 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及透明软骨中的两种不同表层软骨细胞群体（C1/C2） |
| 21245 | 2024-08-08 |
Author Correction: scGNN is a novel graph neural network framework for single-cell RNA-Seq analyses
2022-May-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30331-6
PMID:35508488
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 21246 | 2024-08-08 |
Single-cell N6-methyladenosine regulator patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to colorectal cancer progression and immunotherapy
2022-05-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03395-7
PMID:35509079
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，探讨了N6-甲基腺苷（m6A）RNA甲基化调节因子在肿瘤微环境（TME）中的作用，以及其对结直肠癌进展和免疫治疗的影响 | 首次揭示了m6A甲基化介导的肿瘤微环境细胞间通信在调控肿瘤生长和抗肿瘤免疫调节过程中的作用 | NA | 探究m6A RNA甲基化在肿瘤微环境中的功能及其对结直肠癌进展和免疫治疗的影响 | 结直肠癌肿瘤样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 65,362个单细胞来自33个结直肠癌肿瘤样本 |
| 21247 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Distinct Immune Landscape of Myeloid Cells in Coronary Culprit Plaques Causing Acute Coronary Syndrome
2022-05-03, Circulation
IF:35.5Q1
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 21248 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal a unique memory-like NK cell subset that accumulates with ageing and correlates with disease severity in COVID-19
2022-05-03, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01049-3
PMID:35501841
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了一种独特的记忆样NK细胞亚群，该亚群随年龄积累，并与COVID-19疾病严重程度相关 | 发现了一种独特的记忆样NK细胞亚群（NK2.1），该亚群在老年人群中积累，具有促炎特性，并表现出I型干扰素反应状态 | NA | 研究年龄对人类NK细胞的影响，特别是在单细胞水平上，并探讨其在COVID-19疾病中的作用 | 人类淋巴细胞和NK细胞，以及COVID-19患者和健康个体的NK细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 总共124名年轻和老年健康捐赠者，以及56名年轻和老年COVID-19患者 |
| 21249 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the immune heterogeneity and the repopulation of microglia by Hif1α in mice after spinal cord injury
2022-05-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04864-z
PMID:35504882
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠脊髓损伤后免疫细胞的异质性和微胶质细胞的再生过程 | 首次展示了脊髓损伤后微胶质细胞的再生来源及其调控因子Hif1α的作用 | NA | 探究脊髓损伤后微胶质细胞的再生机制及其对功能恢复的影响 | 小鼠脊髓损伤后的免疫细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠脊髓损伤后的早期和晚期阶段的免疫细胞 |
| 21250 | 2024-08-08 |
High-throughput single-сell sequencing in cancer research
2022-05-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-00990-4
PMID:35504878
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综述 | 本文综述了高通量单细胞测序技术在肿瘤细胞演化、肿瘤免疫学和肿瘤免疫治疗领域的临床应用 | 介绍了单细胞测序在评估肿瘤进展、环境扰动响应、肿瘤微环境异质性和细胞间相互作用中的应用 | 讨论了单细胞分析在癌症研究中的局限性 | 总结单细胞测序在肿瘤研究中的临床应用，并分析肿瘤细胞对治疗的响应和免疫检查点免疫治疗的响应或抵抗 | 肿瘤细胞、基质细胞和浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 大量细胞 |
| 21251 | 2024-08-08 |
Ferroptosis-related local immune cytolytic activity in tumor microenvironment of basal cell and squamous cell carcinoma
2022-05-02, Aging
DOI:10.18632/aging.204057
PMID:35501667
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研究论文 | 本研究系统分析了铁死亡相关基因（FRGs）及其在基底细胞癌（BCC）和鳞状细胞癌（SCC）中的局部免疫细胞溶解活性（LICA）和肿瘤微环境（TME）代谢功能差异 | 首次详细揭示了铁死亡在BCC和SCC中的作用，并提出了基于FRGs的NQO1稳态模型 | 仅基于两个bulk RNA-seq数据集和一个单细胞RNA-seq数据集进行分析，可能需要更多数据支持 | 提高对BCC和SCC肿瘤进展及治疗效果差异的理解，寻找潜在的治疗靶点 | 基底细胞癌（BCC）和鳞状细胞癌（SCC） | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两个bulk RNA-seq数据集（GSE7553和GSE125285）和一个单细胞RNA-seq数据集（GSE123813） |
| 21252 | 2024-08-08 |
Expression-based species deconvolution and realignment removes misalignment error in multispecies single-cell data
2022-May-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04676-0
PMID:35501695
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研究论文 | 本文介绍了一种新的生物信息学流程，用于处理多物种单细胞数据中的错配错误，通过基于表达的物种反卷积和重对齐来最小化错误 | 开发了一种新的生物信息学流程，用于处理人和鼠混合单细胞分析中的错配错误和外显子多重映射事件 | NA | 评估错配错误和外显子多重映射事件的影响，并开发新的算法来最小化这些错误 | 人和鼠混合单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 包含乳腺癌异种移植组织的多种物种多样本单细胞文库 |
| 21253 | 2024-08-08 |
The macrophage-associated microRNA-4715-3p / Gasdermin D axis potentially indicates fibrosis progression in nonalcoholic fatty liver disease: evidence from transcriptome and biological data
2022-05, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2072602
PMID:35521691
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研究论文 | 本研究旨在探索非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展中可能指示或介导的新因子，通过使用多个批量和单细胞RNA测序数据集，明确了细胞群体的景观，并发现了NAFLD进展过程中显著高浸润的巨噬细胞（MPs）。 | 本研究通过蛋白质-蛋白质相互作用分析和验证，确定了八个作为有前景目标的枢纽基因，并预测了微小RNA（miR）-蛋白质相互作用，验证了在游离脂肪酸（FFA）诱导的巨噬细胞损伤模型中的作用。 | NA | 探索非酒精性脂肪肝病进展中可能指示或介导的新因子 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的巨噬细胞及相关分子 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个批量和单细胞RNA测序数据集 |
| 21254 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic and chromatin accessibility analyses of dairy cattle peripheral blood mononuclear cells and their responses to lipopolysaccharide
2022-Apr-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08562-0
PMID:35501711
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研究论文 | 本研究首次报道了奶牛外周血单个核细胞（PBMCs）的单细胞转录组和染色质可及性分析及其对脂多糖（LPS）刺激的响应 | 首次进行了奶牛PBMCs的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq），并分析了LPS刺激后的细胞响应 | NA | 研究奶牛PBMCs对LPS刺激的单细胞转录组和染色质可及性响应 | 奶牛外周血单个核细胞（PBMCs）及其对LPS的响应 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 涉及多种细胞类型，包括CD4 T细胞、CD8 T细胞、B细胞、单核细胞、自然杀伤细胞、固有淋巴细胞和树突状细胞 |
| 21255 | 2024-08-08 |
Dissecting Human Gonadal Cell Lineage Specification and Sex Determination Using A Single-cell RNA-seq Approach
2022-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.04.002
PMID:35513251
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类胚胎和胎儿中的胎儿生殖细胞（FGCs）和性腺体细胞，揭示了性腺发育中的细胞亚型和信号通路作用 | 发现了新的细胞亚型，如POU5F1SPARC FGCs和KRT19体细胞，并揭示了BMP信号通路在睾丸发育中的特定作用 | NA | 研究性腺细胞谱系特化和性别决定机制 | 人类胚胎和胎儿中的胎儿生殖细胞和性腺体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 涉及多个胚胎和胎儿样本 |
| 21256 | 2024-08-08 |
Identify the Prognostic and Immune Profile of VSIR in the Tumor Microenvironment: A Pan-Cancer Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.821649
PMID:35493077
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研究论文 | 本研究系统探讨了VSIR在33种癌症肿瘤微环境中的预后和免疫特征 | 首次全面分析了VSIR在多种癌症中的表达模式及其与肿瘤免疫的关系，并预测了针对VSIR的敏感药物和免疫治疗价值 | NA | 探讨VSIR在肿瘤微环境中的预后和免疫特征 | VSIR在33种癌症肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序分析，免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 33种癌症的样本 |
| 21257 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Metastatic Testicular Seminoma Reveals the Cellular and Molecular Characteristics of Metastatic Cell Lineage
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.871489
PMID:35494058
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了转移性睾丸精原细胞瘤的细胞和分子特征 | 首次构建了转移性睾丸精原细胞瘤的单细胞图谱，并发现了特定表达的分子标记 | 研究样本仅来自单一患者，可能限制了结果的普遍性 | 揭示睾丸精原细胞瘤，特别是转移性肿瘤细胞的分子特征 | 转移性睾丸精原细胞瘤的细胞和分子特征 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共18,206个高质量单细胞转录组信息 |
| 21258 | 2024-08-08 |
A Regularized Multi-Task Learning Approach for Cell Type Detection in Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.788832
PMID:35495159
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研究论文 | 本文提出了一种基于正则化多任务学习（RMTL）的框架，用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 该方法通过同时学习与特定细胞类型相关的亚群，简化了在每个集群中寻找潜在标记基因的繁琐过程 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型预测的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 正则化多任务学习 | RNA测序数据 | 使用了从单细胞RNA测序实验构建的参考数据进行训练，并应用于查询数据集 |
| 21259 | 2024-08-08 |
Identification of Neutrophil-Related Factor LCN2 for Predicting Severity of Patients With Influenza A Virus and SARS-CoV-2 Infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.854172
PMID:35495713
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研究论文 | 本研究旨在探索与流感A病毒和SARS-CoV-2感染严重程度相关的免疫相关宿主因子，特别是中性粒细胞相关的LCN2因子 | 发现LCN2在中性粒细胞中显著上调，并与疾病严重程度正相关，为预测和治疗流感A病毒及SARS-CoV-2感染的严重病例提供了新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探索与流感A病毒和SARS-CoV-2感染严重程度相关的免疫相关宿主因子和核心生物标志物 | 流感A病毒和SARS-CoV-2感染患者 | 数字病理学 | 流感 | 酶联免疫吸附试验（ELISA） | NA | 单细胞转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 21260 | 2024-08-08 |
Proximal and Distal Regions of Pathogenic Th17 Related Chromatin Loci Are Sequentially Accessible During Pathogenicity of Th17
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.864314
PMID:35514969
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研究论文 | 本文研究了致病性Th17相关染色质位点的近端和远端区域的染色质可及性，并探讨了其在Th17致病性中的作用 | 首次全面比较了致病性Th17和常规调节性Th17的染色质可及性，并发现致病性Th17特异的染色质可及区域（patho-ChARs）在TSS近端区域有显著分布偏好 | NA | 揭示致病性Th17生成的新调控机制，为自身免疫疾病治疗提供新思路 | 致病性Th17和常规调节性Th17的染色质可及性 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 染色质可及性数据 | NA |