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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21201 | 2024-08-07 | 
         Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data 
        
          2023-Dec, Protist
          
          IF:1.9Q4
          
         
        
          DOI:10.1016/j.protis.2023.125997
          PMID:38039844
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究从公共单细胞转录组数据中鉴定了16个新的家族A DNA聚合酶序列,并讨论了其在Euglenozoa门中的多样性和进化 | 利用单细胞转录组数据填补了Euglenozoa门中深层分支物种的家族A DNA聚合酶数据的空白 | NA | 探讨Euglenozoa门中家族A DNA聚合酶的多样性和进化 | Euglenozoa门中的家族A DNA聚合酶 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 33个吞噬性Euglenozoa和2个共生体 | NA | NA | NA | NA | 
| 21202 | 2024-08-07 | 
         A postmeiotically bifurcated roadmap of honeybee spermatogenesis marked by phylogenetically restricted genes 
        
          2023-Dec, PLoS genetics
          
          IF:4.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1371/journal.pgen.1011081
          PMID:38048317
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过蜜蜂(Apis mellifera)雄性3天和14天龄的睾丸单细胞RNA测序数据,揭示了蜜蜂精子发生过程中转录图谱的后减数分裂分支现象 | 发现了蜜蜂精子发生中后减数分裂的转录分支,以及小精子细胞(sSPT)中表达的膜翅目特异性基因和较高的突变负荷 | NA | 探究蜜蜂精子发生过程中后减数分裂的分子特征 | 蜜蜂的精子发生过程及其分子机制 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3天和14天龄的蜜蜂雄性睾丸样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 21203 | 2024-08-07 | 
         The role of single-cell RNA sequencing in cardiac tumour - a case report 
        
          2023-Dec, JPMA. The Journal of the Pakistan Medical Association
          
         
        
          DOI:10.47391/JPMA.7776
          PMID:38083933
         
       | 
      
      病例报告 | 本文报告了一例65岁女性心脏肿瘤患者的病例,通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析肿瘤性质 | 使用scRNA-seq技术分析心脏肿瘤的生长模式,有助于区分肿瘤的性质 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心脏肿瘤中的应用 | 心脏肿瘤的细胞成分及相关的信号通路 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 一例心脏肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA | 
| 21204 | 2024-08-05 | 
         Isolation, Purification, and Application of Protoplasts and Transient Expression Systems in Plants 
        
          2023-Nov-29, International journal of molecular sciences
          
          IF:4.9Q2
          
         
        
          DOI:10.3390/ijms242316892
          PMID:38069215
         
       | 
      
      综述 | 本文提供了原生质体的分离、纯化及其瞬时表达系统在植物中的应用的全面概述 | 文章创新性地总结了原生质体在多种植物物种中的应用及其分离和瞬时表达系统的建立 | 文章未具体涉及不同植物物种在原生质体应用中的具体差异 | 旨在为植物科学社区提供关于原生质体分离和瞬时表达系统建立的有效资源 | 研究原生质体及其在植物中的应用 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离和瞬时表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 21205 | 2024-08-07 | 
         Integrative Analysis of Machine Learning and Molecule Docking Simulations for Ischemic Stroke Diagnosis and Therapy 
        
          2023-Nov-22, Molecules (Basel, Switzerland)
          
         
        
          DOI:10.3390/molecules28237704
          PMID:38067435
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和maSigPro R包确定与中风相关的基因模块和时间依赖性基因,结合三种机器学习算法识别中风特征基因,并构建诺模图模型评估中风患者。通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析中风中的小胶质细胞亚群,利用RNA速度、伪时间和基因集富集分析(GSEA)研究小胶质细胞亚群的关系,并通过连接图(CMap)分析和分子对接筛选中风的治疗药物。 | 本研究首次结合机器学习算法和分子对接模拟,构建了用于中风诊断的诺模图模型,并筛选出潜在的治疗分子AZ_628。 | NA | 研究中风的诊断和治疗方法 | 中风及其相关基因和小胶质细胞亚群 | 机器学习 | 中风 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 | 诺模图模型 | 基因数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 21206 | 2024-08-05 | 
         The murine meninges acquire lymphoid tissue properties and harbour autoreactive B cells during chronic Trypanosoma brucei infection 
        
          2023-Nov, PLoS biology
          
          IF:7.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1371/journal.pbio.3002389
          PMID:37983289
         
       | 
      
      研究论文 | 这篇文章探讨了慢性锥虫感染对小鼠脑膜免疫环境的影响。 | 文章首次揭示了慢性Trypanosoma brucei感染导致小鼠脑膜内异位淋巴聚合体的形成。 | 研究主要集中在小鼠模型上,临床相关性需要进一步验证。 | 研究慢性感染中脑膜免疫反应的动态变化。 | 小鼠模型和第二阶段人类非洲锥虫病患者的脑脊液样本。 | 数字病理学 | 锥虫病 | 单细胞转录组学和时间飞行质谱细胞术(CyTOF) | NA | 细胞样本和脑脊液样本 | 小鼠样本和人类患者脑脊液样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 21207 | 2024-08-07 | 
         Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy 
        
          2023, PeerJ
          
          IF:2.3Q2
          
         
        
          DOI:10.7717/peerj.16499
          PMID:38077419
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾病患者的肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的基因表达谱,以探索肾病的细胞异质性 | 首次发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在,并提出这些细胞可能作为非侵入性诊断肾病的生物标志物 | 研究样本量较小,仅包括四名肾炎患者 | 探索肾病的病理机制并开发非侵入性诊断方法 | 肾组织、外周血单个核细胞和尿液中的细胞异质性 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名肾炎患者 | NA | NA | NA | NA | 
| 21208 | 2024-08-07 | 
         Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy 
        
          2023, PloS one
          
          IF:2.9Q1
          
         
        
          DOI:10.1371/journal.pone.0295863
          PMID:38096229
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了PD-1阻断疗法对头颈鳞状细胞癌(HNSCC)肿瘤微环境中调节性T细胞(Tregs)的影响 | 研究发现Nivolumab治疗后Treg数量和抑制活性增加,并揭示了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴和KRAS信号通路的变化可能与Treg数量的增加有关 | 需要进一步研究以深入理解患者对免疫疗法反应的限制 | 旨在探讨Nivolumab如何影响HNSCC肿瘤微环境中浸润的Tregs | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的肿瘤微环境和调节性T细胞(Tregs) | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从四名HNSCC供体中分离的八份组织样本,治疗前后各四份 | NA | NA | NA | NA | 
| 21209 | 2024-08-07 | 
         Mapping and Validation of scRNA-Seq-Derived Cell-Cell Communication Networks in the Tumor Microenvironment 
        
          2022, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fimmu.2022.885267
          PMID:35572582
         
       | 
      
      综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术推断细胞间通信网络的方法,并讨论了这些方法如何促进肿瘤微环境(TME)中免疫治疗干预的研究 | 介绍了将scRNA-seq衍生的交互网络与现有实验和计算方法整合的策略,以增强对TME中免疫抑制和免疫治疗改变信号的研究 | 验证假设的细胞间交互作用仍是一个中心挑战 | 探讨scRNA-seq技术在肿瘤微环境中细胞间通信网络的推断及其在免疫治疗中的应用 | 单细胞RNA测序技术及其在肿瘤微环境中细胞间通信的推断 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 21210 | 2024-08-05 | 
         Glycolysis regulation in tumor-associated macrophages: Its role in tumor development and cancer treatment 
        
          2024-Feb-01, International journal of cancer
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1002/ijc.34711
          PMID:37688376
         
       | 
      
      研究论文 | 本文回顾了肿瘤相关巨噬细胞中糖代谢的现状,并总结了不同亚型的代谢特征 | 从单细胞组学的角度对肿瘤相关巨噬细胞的代谢特征进行了综合总结,探讨了糖酵解在肿瘤发展及治疗中的作用 | 对肿瘤相关巨噬细胞代谢特征的总结还不够全面,尚未深入探讨糖流对肿瘤进展的具体影响 | 研究肿瘤相关巨噬细胞中的糖代谢对肿瘤发展及癌症治疗的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞及其不同亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 21211 | 2024-08-07 | 
         Spatial transcriptomics drives a new era in plant research 
        
          2023-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology
          
         
        
          DOI:10.1111/tpj.16437
          PMID:37651723
         
       | 
      
      NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 21212 | 2024-08-07 | 
         Targeted single-cell RNA sequencing analysis reveals metabolic reprogramming and the ferroptosis-resistant state in hematologic malignancies 
        
          2023-Dec, Cell biochemistry and function
          
          IF:2.8Q3
          
         
        
          DOI:10.1002/cbf.3869
          PMID:37823726
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)与靶向致癌基因面板,对急性髓系白血病进行转录组测序,揭示了血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态 | 本研究克服了scRNA-seq在检测致癌突变方面的局限性,通过靶向方法识别了骨髓样本中每种细胞类型的致癌IDH1、IDH2和KRAS突变分布 | NA | 探讨血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态的机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 多个患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 21213 | 2024-08-07 | 
         Decreased oxidative stress response and oxidant detoxification of skin during aging 
        
          2023-Dec, Mechanisms of ageing and development
          
          IF:5.3Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.mad.2023.111878
          PMID:37827221
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和微阵列转录组数据,探讨了皮肤细胞在老化过程中氧化应激反应和抗氧化能力的改变,并寻找可能参与调控皮肤老化的氧化应激相关基因 | 首次详细分析了不同类型皮肤细胞在老化过程中的氧化应激反应和抗氧化能力的改变,并识别了可能的关键氧化应激相关基因 | NA | 探究皮肤细胞在老化过程中的氧化应激反应和抗氧化能力的改变及其相关基因 | 皮肤细胞及其氧化应激反应和抗氧化能力 | NA | 老年病 | 单细胞RNA测序, 微阵列转录组 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 21214 | 2024-08-07 | 
         Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis 
        
          2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
          
         
        
          DOI:10.1111/rda.14493
          PMID:37874861
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析,比较了人类和猪的精子发生过程,特别是精子形成阶段,揭示了物种特异性的基因和分子通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程,识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 | NA | 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 | 人类和猪的精子形成过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 | NA | NA | NA | NA | 
| 21215 | 2024-08-05 | 
         Attention-based deep clustering method for scRNA-seq cell type identification 
        
          2023-Nov, PLoS computational biology
          
          IF:3.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1371/journal.pcbi.1011641
          PMID:37948464
         
       | 
      
      研究论文 | 提出了一种基于注意力机制的scRNA-seq数据聚类方法AttentionAE-sc | 结合了ZINB和GAE两种聚类策略,通过注意力机制进行融合,改善了传统聚类方法的不足 | 未具体提及传统聚类方法的局限性细节 | 开发一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法,以应对高维和稀疏数据的挑战 | 研究对象为单细胞RNA测序数据,特别是在乳腺癌单细胞图谱数据集中的应用 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基于注意力的自动编码器 | 数据集 | 16个真实的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA | 
| 21216 | 2024-08-07 | 
         Distinct mononuclear diploid cardiac subpopulation with minimal cell-cell communications persists in embryonic and adult mammalian heart 
        
          2023-Oct, Frontiers of medicine
          
          IF:3.9Q2
          
         
        
          DOI:10.1007/s11684-023-0987-9
          PMID:37294383
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞(MNDCMs)的异质性及其在发育过程中的变化 | 揭示了一种新的非增殖性MNDCM亚群,该亚群具有最小的细胞间通讯,并强调了微环境对心肌细胞成熟过程中命运的重要性 | NA | 阐明单核二倍体心肌细胞的异质性及其在心脏发育过程中的变化 | 胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12645个心脏细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 21217 | 2024-08-05 | 
         [Advances of spatial omics in the individualized diagnosis and treatment of head and neck cancer] 
        
          2023-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology, head, and neck surgery
          
         
        
       | 
      
      研究论文 | 本文总结了空间组学在头颈癌诊断和治疗中的最新进展 | 介绍了空间组学如何弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷 | NA | 探讨空间组学在头颈癌中的应用进展 | 头颈癌的病理机制、靶点探索和药物开发 | 数字病理学 | 头颈癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 21218 | 2024-08-07 | 
         Multilineage contribution of CD34+ cells in cardiac remodeling after ischemia/reperfusion injury 
        
          2023-05-05, Basic research in cardiology
          
          IF:7.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1007/s00395-023-00981-8
          PMID:37147443
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和可诱导的Cd34谱系追踪小鼠模型,探讨了Cd34细胞在心脏重塑中的生物学功能及其对心脏重塑的净效应 | 本研究首次揭示了Cd34细胞在心脏重塑过程中的多谱系贡献,并阐明了其在心脏纤维化、血管新生和炎症反应中的具体作用 | NA | 旨在阐明异质性Cd34细胞群的生物学功能,并研究Cd34细胞干预对心脏重塑的净效应 | Cd34细胞在心脏重塑中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人和小鼠的缺血心脏样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 21219 | 2024-08-07 | 
         Ploidy-stratified single cardiomyocyte transcriptomics map Zinc Finger E-Box Binding Homeobox 1 to underly cardiomyocyte proliferation before birth 
        
          2023-03-02, Basic research in cardiology
          
          IF:7.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1007/s00395-023-00979-2
          PMID:36862248
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了出生前后心肌细胞的转录组变化,特别是锌指E盒结合同源盒1(ZEB1)在心肌细胞增殖中的作用 | 首次揭示了ZEB1在心肌细胞增殖和内复制中的关键作用,并提供了高分辨率的心肌细胞单细胞转录组图谱 | 研究仅限于小鼠模型,且样本量相对较小 | 识别出生前后心肌细胞增殖和终末分化相关的转录因子 | 心肌细胞的转录组和增殖机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自发育中(E16.5、P1和P5)小鼠心脏的固定心肌细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 21220 | 2024-08-05 | 
         Somatosensory neurons express specific sets of lincRNAs, and lincRNA CLAP promotes itch sensation in mice 
        
          2023-02-06, EMBO reports
          
          IF:6.5Q1
          
         
        
          DOI:10.15252/embr.202154313
          PMID:36524339
         
       | 
      
      研究论文 | 这篇文章探讨了体感神经元中特定类型的长非编码RNA(lincRNAs)的分布及其在痒感中的作用 | 首次揭示了特定类型的lincRNAs在体感神经元中的丰富性及其与痒感的关系 | 对lincRNAs在其他神经元类型中的作用尚未进行探索 | 研究体感神经元中特定lincRNAs的分布及其在感觉传递中的功能 | 小鼠的体感神经元及其特定类型的lincRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和Smart-seq2全长测序 | NA | RNA数据 | 分析了位于背根神经节(DRG)的单个神经元中的200个lincRNAs | NA | NA | NA | NA |