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当前共找到 34287 篇文献，本页显示第 2101 - 2120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2101 | 2025-11-23 |
The Integrated Stress Response Pathway Improves Aged Murine Muscle Stem Cell Activation and in vivo Regeneration
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.26.678822
PMID:41256688
|
研究论文 | 本研究揭示整合应激反应通路在调控衰老肌肉干细胞激活和再生功能中的关键作用 | 首次发现整合应激反应通路是调控肌肉干细胞状态转变的关键分子调节器，并证明其药理激活可改善衰老肌肉干细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类肌肉干细胞中的适用性仍需验证 | 探究衰老过程中肌肉干细胞激活和再生功能的分子调控机制 | 成年和衰老小鼠的肌肉干细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关肌肉疾病 | 单细胞RNA测序, Cell Painting, 异质运动性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 表型数据 | 成年和衰老小鼠肌肉干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2102 | 2025-11-23 |
Single Cell Spatial Transcriptomics Reveals Immunotherapy-Driven Bone Marrow Niche Remodeling in AML
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634753
PMID:39975227
|
研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示了免疫治疗对急性髓系白血病患者骨髓微环境的重塑作用 | 整合单细胞RNA测序与单细胞分辨率空间转录组数据，通过深度学习细胞分割模型实现精确的转录本定位和细胞间距离分析 | 存在测序深度限制，需要通过数据整合来克服 | 研究免疫治疗对急性髓系白血病患者骨髓微环境中白血病细胞与免疫细胞时空相互作用的影响 | 难治性或复发性急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 深度学习图像分析 | 细胞分割模型, 深度学习 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2103 | 2025-11-23 |
Comparison of imaging-based single-cell resolution spatial transcriptomics profiling platforms using formalin-fixed, paraffin-embedded tumor samples
2025-Jan-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5656204/v1
PMID:39877088
|
研究论文 | 本研究使用福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本系统比较了三种成像型单细胞分辨率空间转录组学平台的性能 | 首次使用严格对照实验系统评估商业空间转录组平台的性能，并引入像素级手动评估方法进行病理学意义比较 | 研究仅使用肺癌和胸膜间皮瘤样本，样本类型相对有限 | 比较不同空间转录组学平台在肿瘤研究中的性能差异 | 福尔马林固定石蜡包埋的肺腺癌和胸膜间皮瘤手术切除样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学，RNA测序，多重免疫荧光，HE染色 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 肺腺癌和胸膜间皮瘤组织芯片样本 | Nanostring, Vizgen, 10x Genomics | 单细胞空间转录组学，空间多组学 | CosMx, MERFISH, Xenium, GeoMx Digital Spatial Profiler | CosMx空间分子成像平台，MERFISH多重误差鲁棒荧光原位杂交，Xenium单细胞/多模态空间分析平台 |
| 2104 | 2025-11-23 |
Deciphering oligomeric proanthocyanidins' dual osteoprotective mechanisms at single-cell resolution: NR4A1-mediated PTGS2 suppression and β-catenin-Runx2 activation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1679987
PMID:41262236
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示寡聚原花青素治疗骨质疏松的双重机制 | 首次在单细胞分辨率下发现C2 NR4A1+ MSCs亚型，并阐明OPC通过NR4A1介导的PTGS2抑制和β-catenin-Runx2激活的双重机制治疗骨质疏松 | NA | 阐明寡聚原花青素治疗骨质疏松的多靶点作用机制 | 骨质疏松小鼠模型中的间充质干细胞亚型 | 单细胞转录组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,网络药理学,细胞实验,动物模型 | Seurat,Monocle,Slingshot,CellChat | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2105 | 2025-11-23 |
Athero-oncology perspective: identifying hub genes for atherosclerosis diagnosis using machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616096
PMID:41262249
|
研究论文 | 本研究通过整合癌症基因集和机器学习方法识别与动脉粥样硬化相关的关键枢纽基因，并构建诊断模型 | 首次从动脉粥样硬化-肿瘤学角度整合癌症基因集识别动脉粥样硬化关键基因，并构建基于IRF7、FHOD1和TNF的诊断列线图 | 分子机制仍需进一步深入研究 | 识别动脉粥样硬化诊断相关的关键枢纽基因并探索其免疫分子机制 | 平滑肌细胞、人类和小鼠模型的动脉粥样硬化样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | SVM-RFE、LASSO回归、随机森林 | 基因表达数据 | GEO数据库数据集、人类颈动脉斑块和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2106 | 2025-11-23 |
Cellf-deception: human microglia clone 3 (HMC3) cells exhibit more astrocyte-like than microglia-like gene expression
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1681811
PMID:41262332
|
研究论文 | 本研究通过基因表达分析发现HMC3细胞系更类似星形胶质细胞而非小胶质细胞 | 首次使用基因对比例方法揭示HMC3细胞系的真实细胞类型特征 | 研究基于基因表达数据，未进行功能验证实验 | 评估HMC3细胞系作为人类小胶质细胞模型的可靠性 | 人类小胶质细胞克隆3（HMC3）细胞系 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | 预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2107 | 2025-11-23 |
Neutrophil-Fibroblast Crosstalk Drives Immunofibrosis in Sequelae of Pelvic Inflammatory Disease Through Neutrophil Extracellular Traps
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3113542
PMID:41262541
|
研究论文 | 本研究探讨中性粒细胞与子宫成纤维细胞通过中性粒细胞胞外诱捕网在盆腔炎性疾病后遗症免疫纤维化中的相互作用机制 | 首次揭示自噬促进NETs生成并通过NETs-成纤维细胞相互作用驱动盆腔组织纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，临床样本验证不足 | 阐明盆腔炎性疾病后遗症组织纤维化的发病机制 | SPID大鼠模型、HL-60来源的中性粒细胞样细胞、子宫成纤维细胞 | 单细胞测序 | 盆腔炎性疾病 | 单细胞RNA测序、细胞共培养、动物模型构建 | 大鼠疾病模型、dHL-60细胞模型 | 单细胞测序数据、体外实验数据 | 公共数据库GSE223639单细胞数据、实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2108 | 2025-11-23 |
Single-Cell Transcriptomics Uncover EEF1A1-Driven Ubiquitination Dysregulation in T Cell Exhaustion and SLE Pathogenesis via STAT1-Mediated Th1/Th2 Imbalance
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3708640
PMID:41262540
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了EEF1A1通过STAT1介导的Th1/Th2失衡在T细胞耗竭和系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | 首次发现EEF1A1作为泛素化相关枢纽基因通过STAT1磷酸化调控T细胞功能失调和Th1/Th2失衡 | 研究主要基于GSE135779数据集和MRL/lpr小鼠模型，需要更多临床样本验证 | 探究EEF1A1在系统性红斑狼疮发病机制中的作用机制 | 系统性红斑狼疮患者T细胞和MRL/lpr小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, hdWGCNA, LASSO回归, 功能验证实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | GSE135779数据集中的SLE样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2109 | 2025-11-23 |
BCL6, DUSP3, and IL6R Are Identified as Shared Druggable Immune-Regulatory Axis in Atrial Fibrillation and Atherosclerosis Through Integrative In Silico and In Vitro Analysis
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7388320
PMID:41262879
|
研究论文 | 通过整合计算分析和体外实验鉴定BCL6、DUSP3和IL6R作为心房颤动和动脉粥样硬化共有的免疫调节枢纽基因 | 首次通过多平台转录组学分析识别出AF和ATH共有的免疫调节枢纽基因，并通过体外实验验证其致病机制 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞模型，缺乏体内实验验证 | 探索心房颤动和动脉粥样硬化的共同免疫炎症分子机制 | 心房颤动和动脉粥样硬化患者转录组数据、小鼠心脏成纤维细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 微阵列转录组分析、单细胞RNA测序、siRNA基因敲降、RT-qPCR、蛋白质印迹 | LASSO回归、转录调控网络建模、细胞通讯分析 | 转录组数据、基因表达数据 | 来自公共数据库的多个微阵列数据集 | Thermo Fisher | 单细胞RNA-seq | NA | Thermo Fisher验证的试剂盒和试剂 |
| 2110 | 2025-11-23 |
Single-cell spatial transcriptomics of fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.11.623014
PMID:39605355
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研究论文 | 开发基于FFPE活检样本的单细胞空间转录组学框架，揭示结肠炎相关细胞网络 | 首次在存档FFPE活检样本中建立优化的单细胞空间转录组学分析框架，能够识别结肠炎相关的成纤维细胞-单核细胞空间邻域 | 样本量相对有限（n=57），且仅分析了最长5年存档的FFPE样本 | 开发适用于存档FFPE活检样本的单细胞空间转录组学分析方法 | 炎症性肠病患者和非IBD对照者的FFPE黏膜活检样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 57例FFPE黏膜活检样本（9例非IBD对照，11例溃疡性结肠炎患者） | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | Xenium | 定制290个基因panel的Xenium平台 |
| 2111 | 2025-11-22 |
Epigenomics-guided precision oncology: Chromatin variants in prostate tumor evolution
2026-Jan-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35327
PMID:39853587
|
综述 | 探讨表观基因组异质性在前列腺癌中的作用，重点关注染色质变异如何促进肿瘤进化和治疗耐药性 | 提出染色质变异作为表观基因组异质性的基本单位，强调其在细胞可塑性和治疗耐药性中的关键作用 | NA | 支持精准肿瘤学新时代，利用表观基因组学见解改善前列腺癌患者预后 | 前列腺癌及其染色质变异 | 表观基因组学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、液体活检表观基因组分析 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2112 | 2025-11-22 |
Mechanisms underlying the therapeutic effects of Amygdalin in treating Cervical Cancer based on multi-omics analysis
2026-Jan-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2025.117232
PMID:41202397
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析系统验证了苦杏仁苷通过靶向CA9和HK2调控多通路发挥抗宫颈癌作用的机制 | 首次结合WGCNA、PPI网络、单细胞RNA测序、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统揭示苦杏仁苷抗宫颈癌的分子机制 | 研究主要基于细胞实验和计算分析，缺乏动物模型验证 | 探究苦杏仁苷治疗宫颈癌的作用机制 | 宫颈癌HeLa和SiHa细胞系 | 多组学分析 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,RNA-seq转录组学,分子对接,分子动力学模拟,酶活性检测 | WGCNA,PPI网络,MCODE算法 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,RNA-seq | NA | NA |
| 2113 | 2025-11-22 |
A 30-gene classifier distinguishes low-risk MDS HSPCs from healthy HSPCs
2025-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105252
PMID:40972808
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研究论文 | 本研究开发了一个30基因分类器，用于区分低风险骨髓增生异常综合征的造血干细胞与健康造血干细胞 | 利用单细胞转录组学首次在低风险MDS的HSPC-髓系分化谱系中开发了30基因评分系统，并揭示了囊泡运输通路的功能障碍 | 研究主要关注低风险MDS，结果可能不适用于高风险MDS患者 | 阐明低风险骨髓增生异常综合征的病理生理学机制并发现潜在治疗靶点 | 低风险骨髓增生异常综合征患者的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞转录组学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞转录组测序 | 基因分类器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2114 | 2025-11-22 |
Integrating Bulk RNA-Seq and Spatial Transcriptomics Data to Reveal Distinct Immune Escape Mechanism and Immunotherapy Based on Post-Translational Modification in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-24, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000588
PMID:41268854
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和空间转录组学数据，开发了基于翻译后修饰的预后评分系统，用于评估头颈部鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次系统研究21种翻译后修饰在头颈部鳞癌中的预后意义，开发了PTM评分系统，并通过空间转录组学验证了其在肿瘤细胞中的特异性表达 | 研究基于多个公共数据库的整合分析，需要进一步实验验证PTM评分的生物学机制 | 探索翻译后修饰在头颈部鳞状细胞癌中的预后价值并开发免疫治疗反应预测工具 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 批量RNA测序, 空间转录组学, 机器学习, WGCNA | 机器学习, 共识聚类 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA-HNSCC、GSE41613、GSE42743、GSE65858等多个队列的整合数据及内部验证队列 | NA | 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2115 | 2025-11-22 |
Spatial transcriptomics: challenges and future directions in musculoskeletal diseases
2025-Nov-21, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001140
PMID:41263435
|
综述 | 探讨空间转录组学在肌肉骨骼疾病研究中的最新进展、挑战和未来发展方向 | 总结了空间转录组学在揭示肌肉骨骼疾病分子机制方面的革命性作用，并分析了阻碍其广泛应用的挑战及解决方案 | 讨论了空间转录组学在肌肉骨骼组织应用中面临的技术挑战和限制因素 | 推进空间转录组学在肌肉骨骼疾病研究中的应用，为未来治疗发展铺平道路 | 肌肉骨骼系统和相关疾病 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 空间转录组学，下一代测序 | NA | 基因表达数据，组织切片 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2116 | 2025-11-22 |
Sabotaged Integral HSC Heterogeneity Underlies Essential Thrombocythemia Development
2025-Nov-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505249
PMID:41268701
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究原发性血小板增多症中不同驱动突变对造血干细胞异质性的影响 | 首次在单细胞水平揭示不同ET驱动突变亚型的HSC分子特征，发现TN ET中存在转录特征类似驱动突变HSC的亚群，并鉴定CXCR4 HSC亚群在ET发病中的关键作用 | NA | 阐明特定驱动突变如何影响造血干细胞异质性及其与ET发病机制的关系 | 原发性血小板增多症患者的造血干细胞 | 单细胞组学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2117 | 2025-11-22 |
Single-cell RNA sequencing analysis combined with bulk RNA sequencing revealed changes in the micro-environment of bone marrow aging
2025-Nov-21, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf261
PMID:41269108
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序分析骨髓微环境在衰老过程中的变化 | 结合单细胞和bulk RNA测序技术系统分析骨髓衰老微环境，并筛选出关键抗衰老药物 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明骨髓微环境在衰老过程中的变化机制 | 年轻和年老小鼠的骨髓细胞 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,分子对接 | 机器学习 | RNA测序数据 | 年轻和年老小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2118 | 2025-11-22 |
Upregulation of TNFR2 Precedes TOX Expression by Exhausted T cells and Restricts Antitumor and Antiviral Immunity
2025-Nov-21, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3455
PMID:41269210
|
研究论文 | 本研究揭示了TNFR2上调在T细胞耗竭过程中先于TOX表达，并限制抗肿瘤和抗病毒免疫的机制 | 首次发现TNFR2信号是TOX表达的上游调控因子，并提出TNFR2拮抗作为新型免疫治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探索T细胞耗竭过程中TNFR2的作用机制及其免疫治疗潜力 | 人和小鼠肿瘤浸润CD8+ T细胞 | 免疫学 | 肿瘤和病毒感染 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，bulk RNA测序 | TNFR2 KO小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2119 | 2025-11-22 |
Unveiling macrophage-fibroblast-driven inflammatory networks mediated pan-cancer immune features by integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Nov-20, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004102
PMID:41263399
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示了巨噬细胞-成纤维细胞驱动的炎症网络在泛癌免疫特征中的作用，并开发了用于预测免疫检查点抑制剂反应和生存预后的基因标记 | 首次在单细胞分辨率下识别巨噬细胞和成纤维细胞亚型中的炎症相关基因特征，构建了少于10个基因的预测模型，并在体内模型中验证了靶向这些特征可增强PD-1抑制剂疗效 | 研究主要基于回顾性数据分析，体内验证仅针对卵巢癌这一种冷肿瘤类型 | 构建能够预测泛癌生存和免疫检查点抑制剂反应的基因标记模型 | 17种癌症类型的单细胞和bulk RNA测序数据，卵巢癌体内模型 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，机器学习，多重免疫组织化学，体内模型 | 机器学习模型 | RNA测序数据，图像数据 | 17种癌症类型，34个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2120 | 2025-11-22 |
Bioinformatics analysis of macrophage-associated genes reveals prognostic signatures and immune landscape in gastric cancer
2025-Nov-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04019-4
PMID:41264178
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定胃癌中巨噬细胞相关预后基因并构建风险预测模型 | 首次整合多组学数据识别GPX3、SERPINE1和SPARC三个巨噬细胞相关基因构建胃癌预后模型 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证和前瞻性研究确认 | 探索巨噬细胞相关基因在胃癌预后预测和免疫调控中的作用 | 胃癌患者肿瘤样本和正常对照组织 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，差异表达分析，加权基因共表达网络分析 | Cox-LASSO回归模型，风险评分模型，诺莫图 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA数据库350例肿瘤和31例对照，GEO数据库483例样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |