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当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 2101 - 2120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2101 | 2026-02-22 |
Exploring the key molecular mechanisms and immune microenvironment of oxidative stress-related pathways in pancreatic neuroendocrine tumor combining scRNA-seq and bulk RNA
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04515-1
PMID:41591671
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，系统探索了氧化应激相关通路在胰腺神经内分泌肿瘤中的关键分子机制和免疫微环境 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，系统阐明氧化应激通路通过BCL2L1和PHGDH等关键基因调控pNET进展的分子机制和免疫微环境相互作用 | 研究主要基于公共数据集的分析，缺乏实验验证；单细胞数据样本量相对有限（20个样本） | 阐明氧化应激相关通路如何驱动胰腺神经内分泌肿瘤进展的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胰腺神经内分泌肿瘤（pNET）样本 | 生物信息学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析, PPI网络, CIBERSORTx免疫浸润分析, ceRNA网络构建, 转录因子预测, 药物预测, 分子对接 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 预后列线图模型, ROC分析 | 基因表达数据（RNA-seq） | 批量RNA-seq数据集GSE73338包含63个pNET样本和5个对照样本；单细胞RNA-seq数据集GSE256136包含20个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2102 | 2026-02-22 |
Unveiling the early defense response dynamics in grapevines against Plasmopara viticola by single-cell transcriptomics
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03904-z
PMID:41593733
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术，首次构建了葡萄叶片在霜霉病菌感染期间的单细胞转录组图谱，揭示了植物细胞在感染早期的动态防御响应 | 首次在单细胞水平上解析葡萄对霜霉病菌感染的防御响应，结合scRNA-seq和spRNA-seq技术，发现了保卫细胞转录组被病原体重编程以促进入侵的新机制 | 研究主要关注早期感染阶段，可能未覆盖整个感染过程的动态变化；样本数量虽大，但仅针对特定葡萄品种和感染条件 | 揭示葡萄在单细胞水平上对霜霉病菌感染的早期防御响应动态 | 葡萄叶片细胞在Plasmopara viticola感染下的转录组变化 | 数字病理学 | 植物病害 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约100,000个单个细胞（约89,000个来自scRNA-seq，约11,000个来自spRNA-seq） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2103 | 2026-02-22 |
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03954-x
PMID:41593779
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研究论文 | 本文介绍了SCITO-seq2，一种增强型单细胞转录组和表位测序平台，能够同时量化超过10万个细胞的转录本和表面蛋白 | SCITO-seq2整合了基于探针的RNA检测与超高通量蛋白质分析，采用共享池条形码策略确保分子谱的精确匹配，并兼容细胞哈希技术以实现高效样本多重分析 | NA | 开发一个可扩展、简化且成本效益高的下一代单细胞多组学工作流程 | 自身免疫性疾病，包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 | 单细胞测序 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组测序，表位测序 | NA | RNA序列数据，蛋白质表达数据 | 超过100,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | SCITO-seq2 | 整合探针RNA检测与超高通量蛋白质分析，采用共享池条形码策略和细胞哈希技术 |
| 2104 | 2026-02-22 |
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-03902-2
PMID:41593799
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组分析，揭示了骨肉瘤中基质细胞网络，并识别了CDKN2A和MMP14作为新型诊断标志物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据集，利用hdWGCNA分析基质细胞基因模块，并识别出CDKN2A和MMP14作为骨肉瘤的潜在生物标志物，同时通过分子对接验证了白藜芦醇作为MMP14的候选治疗分子 | 研究主要基于公共数据库（GEO）数据，缺乏大规模临床样本验证，且功能实验仅限于骨肉瘤细胞系，未涉及体内模型 | 解析骨肉瘤中基质细胞相互作用网络，识别新的诊断标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤（OS）及其基质微环境中的细胞亚群，包括巨噬细胞、基质细胞、T细胞等 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、转录组分析、WGCNA、DESeq2差异表达分析、分子对接 | Seurat、CellChat、hdWGCNA | 单细胞转录组数据、转录组数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2105 | 2026-02-22 |
KIF5B-driven unfolded protein response reprograms breast cancer immunosuppressive microenvironment for single-cell guided therapeutic targeting
2026-Jan-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04526-y
PMID:41587002
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据，揭示了KIF5B在乳腺癌中作为预后生物标志物和治疗靶点的作用，并探讨了其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次通过多模态数据分析，将KIF5B与未折叠蛋白反应、免疫浸润和药物敏感性联系起来，为乳腺癌的精准治疗提供了新见解 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；数据来源于多个数据集，可能存在批次效应 | 探究KIF5B在乳腺癌预后、肿瘤微环境和治疗反应中的综合作用 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | hdWGCNA, 共识聚类 | RNA-seq数据 | 多个数据集的样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2106 | 2026-02-22 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过外泌体递送RAB10蛋白，抑制巨噬细胞M1极化并促进其M2极化，从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现外泌体RAB10通过与干扰素受体IFNAR1结合，抑制JAK1/STAT1通路磷酸化，从而调控巨噬细胞极化，并证明联合靶向RAB10和PD-L1具有协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于乳腺癌模型，其他肿瘤类型中的普适性有待验证；临床样本验证相对有限 | 探究外泌体RAB10在调控巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 | 乳腺癌细胞、巨噬细胞、肿瘤微环境、CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、体外实验、动物模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2107 | 2026-02-22 |
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68512-2
PMID:41559043
|
研究论文 | 本研究揭示了间歇性禁食（IF）通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 | 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤（GBM）亚型（Tp53型 vs CDKN2A型）相关，并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人体临床验证尚需开展；对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 | 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 | Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学测序（空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组） | 小鼠肿瘤模型 | 多组学数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 | NA | NA |
| 2108 | 2026-02-22 |
Robust and interpretable prediction of gene markers and cell types from spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68487-0
PMID:41545411
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为STimage的综合模型套件，用于直接从标准H&E图像预测空间基因表达和分类细胞类型 | 通过估计基因表达分布并使用集成方法量化数据驱动和模型不确定性，增强了模型的鲁棒性；通过单细胞分辨率的归因分析结合组织病理学注释、功能基因和潜在表示，提高了可解释性 | NA | 提高空间转录组学数据中基因标记和细胞类型预测的鲁棒性和可解释性 | 空间转录组学数据中的基因表达和细胞类型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习模型，集成方法 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2109 | 2026-02-22 |
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001671
PMID:41525512
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的深度学习模型，用于对肝内胆管癌的淋巴结受累风险进行分层，并评估其对新辅助治疗反应的预测能力 | 整合了基于Swin UNETR的MRI衍生输出与临床放射学特征，构建了可解释的深度学习模型，并探索了模型输出与肿瘤多组学特征的相关性 | 研究涉及多个队列，但外部验证队列样本量相对较小（n=88），且模型性能仍需在更广泛的多中心数据中进一步验证 | 开发一个模型以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层，并为治疗决策提供信息 | 肝内胆管癌患者 | 计算机视觉 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析 | Swin UNETR，SwinU-CliRad框架 | 磁共振成像，临床放射学特征 | 发现队列682例，内部测试队列204例，外部多中心队列88例，新辅助治疗队列145例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2110 | 2026-01-14 |
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-Jan-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07677-2
PMID:41526921
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2111 | 2026-02-22 |
Single-cell multimodal analysis reveals the dynamic immunopathogenesis of HBV-ACLF progression
2026-Jan-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333308
PMID:40841166
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了HBV相关慢加急性肝衰竭（HBV-ACLF）进展中的动态免疫发病机制 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞蛋白质组学，纵向描绘了HBV-ACLF疾病过程中免疫反应的动态轨迹，并识别出与疾病进展相关的关键免疫细胞模块 | 样本量相对有限（45个样本），且主要基于外周血单核细胞，可能未完全反映肝脏局部免疫环境 | 全面描绘HBV-ACLF疾病过程中免疫反应的动态轨迹，以揭示其免疫发病机制 | HBV相关慢加急性肝衰竭（HBV-ACLF）患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 45个样本（来自17名住院患者和15名对照受试者） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2112 | 2026-02-22 |
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag070
PMID:41712686
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研究论文 | 提出了一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN，用于处理不同分辨率和通量的ST数据 | 首次将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成，通过混合编码器结合多头注意力和残差连接，同时捕获局部表达模式和全局信息 | 未明确说明方法对特定组织类型或实验条件的适用性限制 | 开发鲁棒的空间转录组数据分析框架 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 对抗自编码器, 图卷积网络 | 基因表达空间数据 | 多个ST数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2113 | 2026-02-22 |
A cycling, progenitor-like cell population at the base of atypical teratoid rhabdoid tumor subtype differentiation trajectories
2025-Dec-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf179
PMID:40726147
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了非典型畸胎样横纹肌样瘤（ATRT）的亚型特异性分化轨迹及其共同的循环前体细胞群 | 首次构建了ATRT的单核转录组图谱，整合了单核ATAC-seq和空间转录组数据，并发现所有ATRT亚型中均存在共享的循环中间前体细胞群 | 研究主要基于患者来源的肿瘤类器官模型进行验证，仍需在更多临床样本和体内模型中进一步证实 | 深入理解ATRT的细胞异质性和发育起源，为开发亚型特异性治疗策略提供依据 | 非典型畸胎样横纹肌样瘤（ATRT）肿瘤样本和患者来源的肿瘤类器官 | 数字病理学 | 儿科中枢神经系统肿瘤 | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | 多个ATRT患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2114 | 2026-02-22 |
Phase IB study of Avelumab and whole brain radiotherapy in patients with leptomeningeal disease from solid tumors: Results and molecular analyses
2025-Dec-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf183
PMID:40888040
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研究论文 | 本研究评估了Avelumab联合全脑放疗在实体瘤软脑膜转移患者中的安全性和疗效，并进行了分子分析 | 首次在软脑膜转移患者中评估Avelumab联合全脑放疗的联合疗法，并利用单细胞RNA测序分析治疗前后脑脊液中的免疫细胞变化 | 样本量较小（15例患者），且为单臂研究，缺乏对照组 | 评估Avelumab联合全脑放疗在软脑膜转移患者中的安全性和疗效，并探索免疫反应机制 | 实体瘤软脑膜转移患者，包括乳腺癌、肺癌、鼻咽癌、卵巢癌和胰腺癌患者 | 临床肿瘤学 | 实体瘤软脑膜转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2115 | 2026-02-22 |
Intratumour ploidy heterogeneity and clonal evolution in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-24, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.11.015
PMID:41297676
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研究论文 | 本研究开发了一种新的高通量原位定量数字病理学方法，用于评估肝细胞癌（HCC）中的核倍性，并评估其预后相关性 | 开发了一种新的高通量原位定量数字病理学方法，用于评估HCC中的核倍性，并首次通过空间转录组学直接证明超倍体肿瘤肝细胞通过二倍体细胞的全基因组加倍产生 | 研究样本量相对较小（111例HCC样本），且主要基于回顾性分析，需要进一步的前瞻性验证 | 评估肝细胞癌中核倍性的预后价值，并探索超倍体克隆在肿瘤内的克隆进化 | 111例人类肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 全外显子组测序, 批量RNA测序, 3' mRNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据, 基因组数据 | 111例人类肝细胞癌样本 | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2116 | 2026-02-22 |
MAP3K4 signaling regulates HDAC6 and TRAF4 coexpression and stabilization in trophoblast stem cells
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108116
PMID:39710325
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研究论文 | 本研究揭示了MAP3K4信号通过调控HDAC6和TRAF4的共表达与稳定性，在滋养层干细胞中影响胎盘发育的机制 | 首次发现MAP3K4、TRAF4和HDAC6在滋养层干细胞中的共调控机制，以及它们在胎盘迷路分化过程中的表达转换 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类胎盘中的具体机制尚需进一步验证 | 探究MAP3K4信号在胎盘发育中的作用及其与TRAF4和HDAC6的调控关系 | 小鼠滋养层干细胞和胎盘组织 | 发育生物学 | 胎盘功能不全 | 单细胞RNA测序，shRNA敲低，蛋白质复合物分析 | NA | RNA测序数据，蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2117 | 2026-02-22 |
Laser-capture microdissection for spatial transcriptomics of immunohistochemically detected neurons
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108150
PMID:39736395
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研究论文 | 本文开发了一种名为IHC/LCM-Seq的空间转录组学方法，用于对免疫组化检测的神经元进行转录组分析 | 开发了一种创新的IHC/LCM-Seq方法，结合了免疫组化、激光捕获显微切割和RNA测序技术，首次实现了对免疫组化检测的神经元进行高灵敏度空间转录组分析 | 方法基于4%甲醛固定脑组织的游离切片，可能不适用于其他固定条件或组织类型 | 开发并验证一种用于免疫组化检测神经元空间转录组分析的新方法 | 纹状体胆碱能中间神经元和促性腺激素释放激素（GnRH）神经元 | 空间转录组学 | 不孕症 | 激光捕获显微切割，RNA测序，免疫组化 | NA | RNA测序数据 | 成年雄性大鼠和小鼠的GnRH神经元 | Illumina | bulk RNA-seq | NextSeq | Illumina NextSeq平台进行批量测序 |
| 2118 | 2026-02-22 |
Pluripotent stem cell-derived models of neurological diseases reveal early transcriptional heterogeneity
2021-03-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02301-6
PMID:33663567
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研究论文 | 本研究通过分析神经退行性疾病患者的单细胞RNA测序数据，揭示了疾病状态下神经元转录异质性的增加，并利用诱导多能干细胞模型验证了这一早期现象 | 首次在神经退行性疾病模型中系统性地展示了转录异质性在疾病早期阶段的增加，并关联到具体的基因功能类别如自噬和能量代谢 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂的神经退行过程 | 探究神经退行性疾病早期阶段的转录调控变化及其诊断价值 | 阿尔茨海默病和亨廷顿病患者的神经元细胞，以及诱导多能干细胞分化的神经元祖细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2119 | 2026-02-21 |
The shared mechanisms and potential diagnostic markers for IgA nephropathy and celiac disease
2026-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2026.2635179
PMID:41714845
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研究论文 | 本研究通过整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据，识别了共享的生物标志物和致病机制 | 首次系统整合IgA肾病和乳糜泻的转录组数据，利用多组学分析和机器学习方法识别出ITGB2、CD74和KLK1等共享诊断标志物，并构建了转录因子-miRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认这些标志物的功能和临床适用性 | 揭示IgA肾病和乳糜泻的共病分子机制，并寻找潜在的诊断标志物和治疗策略 | IgA肾病和乳糜泻患者 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组测序，单细胞RNA测序，机器学习 | 加权基因共表达网络分析，机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个独立队列的转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2120 | 2026-02-21 |
Aberrant epithelial differentiation may contribute to endometrial polyp formation: insights from single-cell analysis
2026-Dec, Systems biology in reproductive medicine
IF:2.1Q3
DOI:10.1080/19396368.2026.2628916
PMID:41712676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析子宫内膜息肉与邻近子宫内膜的转录组差异，探讨息肉形成的分子机制 | 首次在单细胞水平揭示子宫内膜息肉中上皮细胞分化异常和血管重塑缺陷，通过伪时间分析发现上皮细胞成熟受阻 | 单细胞RNA测序仅局限于增殖期样本，可能限制结果的普适性 | 探究子宫内膜息肉形成和复发的分子机制 | 子宫内膜息肉及邻近子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 伪时间分析 | RNA测序数据 | 12名女性的配对子宫内膜息肉和邻近子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |