单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28877 篇文献，本页显示第 21161 - 21180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21161 | 2024-08-08 |
ScRNA-seq and bulk RNA-seq reveal the characteristics of ferroptosis and establish a risk signature in cholangiocarcinoma
2022-Dec-15, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2022.09.008
PMID:36284715
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序技术，揭示了胆管癌中铁死亡的特征，并建立了一个风险标志物 | 首次通过scRNA-seq技术分析胆管癌中的免疫微环境和细胞异质性，并发现了与铁死亡相关的细胞间通信 | 研究依赖于公共数据库中的scRNA-seq数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探索胆管癌中铁死亡的特征及其与免疫细胞的关系，并建立一个预测胆管癌预后的风险标志物 | 胆管癌中的铁死亡特征及免疫细胞的浸润情况 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 21个细胞集群 |
| 21162 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analyses reveal microglia types associated with proliferative retinopathy
2022-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.160940
PMID:36264636
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示了与增生性视网膜病变相关的微胶质细胞类型及其特征 | 首次全面绘制了正常和氧诱导的增生性视网膜病变小鼠视网膜中所有微胶质细胞群体的图谱，并揭示了几种独特的与增生性视网膜病变相关的微胶质细胞类型及其相关标记物、信号通路和调控元件 | 研究仅限于小鼠模型，未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于人类 | 探究与新生血管化相关的微胶质细胞的异质性，并描述其转录组特征和代谢途径 | 微胶质细胞及其在增生性视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 正常空气和氧诱导的增生性视网膜病变小鼠的视网膜样本 |
| 21163 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis dissected the osteo-immunology microenvironment and revealed key regulators in osteoporosis
2022-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109302
PMID:36257255
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松症中的骨免疫微环境，并揭示了关键的调控因子 | 发现了新的巨噬细胞亚型和差异表达基因，并识别了与骨代谢相关的新基因ZFP36L1和DEFA3，以及RETN-CAP1在骨免疫细胞相互作用中的新作用 | NA | 揭示骨质疏松症中骨免疫微环境的关键调控因子和可能的基因靶点及信号通路 | 骨质疏松症中的骨免疫微环境 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 19,102个细胞和4097个动态基因 |
| 21164 | 2024-08-08 |
The role of lung macrophages in acute respiratory distress syndrome
2022-Dec, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-022-01645-4
PMID:36264361
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综述 | 本文综述了肺泡巨噬细胞在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的作用，从解剖位置和细胞起源两个维度进行探讨 | 利用单细胞RNA测序、命运图谱、代谢组学等新技术，更深入地理解肺部巨噬细胞的发展过程、分类和功能 | 不同研究组对治疗反应的差异性和单核/巨噬细胞基因表达的巨大动态变化 | 探讨肺泡巨噬细胞在ARDS中的功能及治疗靶点 | 肺泡巨噬细胞及其在ARDS中的作用 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、命运图谱、代谢组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21165 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes from turtle livers reveal sensitivity of hepatic immune cells to bacteria-infection
2022-Dec, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2022.10.033
PMID:36273515
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了中国软壳龟肝脏的细胞组成，并探讨了细菌感染对肝脏免疫细胞的影响 | 首次在单细胞分辨率下全面展示了软壳龟肝脏的免疫景观，并揭示了细菌感染对肝脏免疫细胞数量的影响 | NA | 研究肝脏免疫细胞对细菌感染的响应 | 中国软壳龟的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9938个细胞，来自两个个体（未感染和细菌感染）的肝脏组织 |
| 21166 | 2024-08-08 |
Screening target genes for the treatment of PCOS via analysis of single-cell sequencing data
2022-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2022.2136401
PMID:36286390
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞测序数据，筛选出治疗多囊卵巢综合征（PCOS）的目标基因 | 采用新的生物信息学方法，通过单细胞测序数据分析，筛选出可能的PCOS治疗目标基因 | NA | 识别与PCOS发病机制相关的目标基因，并开发有效的治疗药物 | 多囊卵巢综合征（PCOS）及其相关基因和治疗药物 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 34个卵母细胞 |
| 21167 | 2024-08-08 |
Consecutive BNT162b2 mRNA vaccination induces short-term epigenetic memory in innate immune cells
2022-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163347
PMID:36282593
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研究论文 | 本研究探讨了BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫细胞的表观遗传记忆效应 | 首次揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫细胞的表观遗传变化及其短暂性 | 研究仅关注了接种后4周内的表观遗传变化，未探讨更长时间的影响 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫反应的表观遗传调控及其持久性 | 先天免疫细胞，特别是单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 质谱流式细胞术、RNA-Seq、ATAC-Seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 21168 | 2024-08-08 |
Genome-wide Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing analyses identify the causal effects of COVID-19 on 41 cytokines
2022-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac033
PMID:36281737
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研究论文 | 本研究通过整合COVID-19和41种细胞因子的全基因组关联研究数据，采用孟德尔随机化分析方法，确定了COVID-19对某些细胞因子的因果效应，并利用单细胞RNA测序数据探讨了潜在的分子机制 | 本研究首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，揭示了COVID-19对特定细胞因子的因果效应及其分子机制 | 研究仅分析了41种细胞因子，可能未涵盖所有与COVID-19相关的细胞因子 | 探讨COVID-19对细胞因子的因果效应及其分子机制 | COVID-19患者中的41种细胞因子及其分子机制 | 基因组学 | COVID-19 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞RNA数据 | 涉及COVID-19患者和41种细胞因子的样本 |
| 21169 | 2024-08-08 |
Histone Lactylation Boosts Reparative Gene Activation Post-Myocardial Infarction
2022-11-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.320488
PMID:36268709
|
研究论文 | 本研究探讨了心肌梗死后组蛋白乳酸化在修复基因表达中的作用 | 首次揭示了组蛋白乳酸化在心肌梗死后早期和远程激活修复基因表达中的作用 | NA | 研究组蛋白乳酸化在心肌梗死后修复反应中的作用 | 心肌梗死后的单核细胞和巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、Western blotting、免疫荧光染色、CUT&Tag、RNA-seq、染色质免疫沉淀-qPCR、逆转录-qPCR | NA | 转录组数据 | NA |
| 21170 | 2024-08-08 |
Deciphering the roadmap of in vivo reprogramming toward pluripotency
2022-11-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.009
PMID:36270281
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺细胞在重编程过程中的标记物，揭示了从腺泡细胞到多能性的轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了胰腺细胞重编程过程中的中间状态标记物，并发现这些标记物在胃、结肠和培养的成纤维细胞中也存在 | NA | 揭示体内重编程向多能性转变的路径 | 胰腺细胞重编程过程中的细胞状态和标记物 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 21171 | 2024-08-08 |
Profiling transcriptional heterogeneity of epithelium, fibroblasts, and immune cells in esophageal squamous cell carcinoma by single-cell RNA sequencing
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200898R
PMID:36260317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞的转录异质性 | 揭示了肿瘤内和肿瘤间上皮细胞的异质性，以及成纤维细胞亚型在食管鳞状细胞癌进展中的重要作用 | NA | 深入理解食管鳞状细胞癌的复杂肿瘤微环境和细胞异质性 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25,796个免疫细胞和8,197个非免疫细胞来自三个原发性肿瘤和配对正常样本 |
| 21172 | 2024-08-08 |
Shared and distinct biological circuits in effector, memory and exhausted CD8+ T cells revealed by temporal single-cell transcriptomics and epigenetics
2022-11, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01338-4
PMID:36271148
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研究论文 | 本文通过时间序列单细胞转录组学和表观遗传学分析，揭示了效应性、记忆性和耗竭性CD8+ T细胞中的共享和独特生物电路 | 发现了新的T细胞亚群，包括表达自然杀伤细胞相关基因的亚群和多个独特的TCF-1干细胞/祖细胞样亚群，并揭示了PD-1通路阻断后T细胞亚群的重塑 | NA | 阐明CD8+ T细胞发育路径中的分子电路及其异质性 | 效应性、记忆性和耗竭性CD8+ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 21173 | 2024-08-08 |
Geometric engineering of organoid culture for enhanced organogenesis in a dish
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01643-8
PMID:36280722
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research paper | 本文介绍了一种简便且可扩展的工程方法，用于促进长期器官发生和器官成熟。 | 重新设计了传统的器官培养配置，开发了一个平台，可以将单次注射的干细胞悬液转化为可以长期维持的放射状器官阵列，无需传代。 | NA | 开发一种平台技术，用于在体外工程化更真实的类器官结构。 | 肠道器官、炎症性肠病（IBD）患者来源的器官模型、血管化可灌注的人体肠样。 | digital pathology | inflammatory bowel disease | single-cell RNA sequencing | NA | organoid | NA |
| 21174 | 2024-08-08 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
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研究论文 | 本文介绍了一种名为clampFISH 2.0的方法，该方法通过倒置的padlock设计，能够高效检测多种RNA种类并同时指数级放大其信号，同时减少了时间成本 | clampFISH 2.0方法通过倒置的padlock设计，实现了对多种RNA种类的高效检测和信号指数级放大，同时减少了时间和成本 | NA | 开发一种能够快速、可扩展地检测RNA并放大信号的新方法 | 多种RNA种类及其在单细胞中的表达水平 | NA | NA | clampFISH 2.0 | NA | RNA | 超过100万细胞 |
| 21175 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics in planaria: new tools allow new insights into cellular and evolutionary features
2022-10-31, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210825
PMID:36281987
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在淡水涡虫中的应用，以及这些新技术如何帮助我们深入理解细胞和进化特征 | 介绍了单细胞转录组学在淡水涡虫中的最新进展和应用，包括板式方法、纳米滴方法和原位条形码方法 | NA | 回顾单细胞转录组学在淡水涡虫中的应用，并展望未来的研究方向 | 淡水涡虫的细胞类型及其分化轨迹 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21176 | 2024-08-08 |
Treatment with an antigen-specific dual microparticle system reverses advanced multiple sclerosis in mice
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2205417119
PMID:36256820
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研究论文 | 本研究使用特定抗原的双尺寸微粒（dMP）治疗系统，成功逆转了小鼠晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的后肢瘫痪 | 该治疗方法通过影响树突状细胞、巨噬细胞、B细胞和微胶质细胞中的MHC II抗原呈递途径，减少了中枢神经系统（CNS）的免疫细胞浸润、脱髓鞘和炎症细胞因子水平 | 当B细胞缺失时，治疗效果减弱，表明B细胞在此疗法中的重要作用 | 探索特定抗原疗法在治疗多发性硬化症等自身免疫性疾病中的应用 | 小鼠晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE） | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 21177 | 2024-08-08 |
An asparagine metabolism-based classification reveals the metabolic and immune heterogeneity of hepatocellular carcinoma
2022-10-25, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01380-z
PMID:36284275
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研究论文 | 本研究基于天冬酰胺代谢水平对肝细胞癌（HCC）患者进行分类，并探讨其代谢和免疫异质性 | 首次详细探讨了天冬酰胺代谢在HCC中的状态及其相关机制，并发现GOT2作为潜在的预后标志物和治疗靶点 | NA | 探讨肝细胞癌中天冬酰胺代谢的状态及其相关机制，并寻找潜在的预后标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌患者及其天冬酰胺代谢水平 | 数字病理学 | 肝癌 | 共识聚类、最小绝对收缩与选择算子回归、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析、基因集富集分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | UMAP | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 来自三个队列的HCC样本 |
| 21178 | 2024-08-08 |
Combining denoising of RNA-seq data and flux balance analysis for cluster analysis of single cells
2022-Oct-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04967-6
PMID:36284276
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研究论文 | 本文研究了去噪策略在单细胞RNA测序数据预处理中的作用，并将其应用于代谢网络分析和单细胞聚类分析 | 首次探讨了去噪策略在整合单细胞RNA测序数据到代谢网络分析中的应用，并展示了去噪对恢复重要代谢特性的效果 | NA | 研究去噪策略在单细胞RNA测序数据预处理中的作用，并探讨其对代谢表型聚类分析的影响 | 单细胞RNA测序数据的去噪处理及其在代谢网络分析中的应用 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个公共单细胞RNA测序数据集 |
| 21179 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic inventory of murine smooth muscle cells
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.015
PMID:36283392
|
研究论文 | 本文通过深度单细胞RNA测序结合原位基因和蛋白表达分析，研究了小鼠心脏、主动脉、肺和结肠中平滑肌细胞的分子基础 | 首次揭示了血管、内脏和气道平滑肌细胞之间的高水平差异，以及弹性动脉和肌性动脉平滑肌细胞之间的细微差异 | NA | 探索平滑肌细胞在不同器官系统中的分子差异 | 小鼠的平滑肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及心脏、主动脉、肺和结肠四个器官 |
| 21180 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights origin and pathological process of human endometrioid endometrial carcinoma
2022-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33982-7
PMID:36273006
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生和子宫内膜样子宫内膜癌的细胞，揭示了子宫内膜癌的起源和病理过程 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了子宫内膜样子宫内膜癌起源于子宫内膜上皮细胞而非基质细胞，并识别了LCN2+/SAA1/2+细胞作为子宫内膜癌变的一个特征性亚群 | NA | 阐明子宫内膜样子宫内膜癌发展过程中细胞群体的演变 | 正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生和子宫内膜样子宫内膜癌的细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |