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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21141 | 2024-08-08 |
Esrrb is a cell-cycle-dependent associated factor balancing pluripotency and XEN differentiation
2022-06-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.04.016
PMID:35594859
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研究论文 | 本研究通过结合细胞周期报告系统和单细胞RNA测序技术,探讨了胚胎干细胞在不同细胞周期状态下的转录组特征及其分化机制 | 首次揭示了Esrrb作为细胞周期依赖性因子在平衡多能性和XEN分化中的作用 | NA | 研究细胞周期和分化决策之间的联系 | 胚胎干细胞在不同细胞周期状态下的转录组特征及其分化机制 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型和ESRRB敲除的胚胎干细胞 |
21142 | 2024-08-08 |
Tumor-induced erythroid precursor-differentiated myeloid cells mediate immunosuppression and curtail anti-PD-1/PD-L1 treatment efficacy
2022-06-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.04.018
PMID:35594863
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研究论文 | 本文通过追踪癌症患者和携带肿瘤小鼠的谱系,展示了红细胞前体细胞失去其发育潜力并转向髓系谱系,这些红细胞分化的髓细胞(EDMCs)具有抑制T细胞介导的抗肿瘤反应的能力,从而影响免疫检查点抑制剂的治疗效果。 | 首次揭示了肿瘤利用贫血触发的红细胞生成进行髓系转分化和免疫抑制的正反馈机制。 | NA | 研究免疫检查点抑制剂治疗癌症的潜在机制和药物抵抗性。 | 红细胞前体细胞的转分化及其对免疫治疗效果的影响。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及癌症患者和携带肿瘤的小鼠 |
21143 | 2024-08-08 |
Quantitative single-cell transcriptome-based ranking of engineered AAVs in human retinal explants
2022-Jun-09, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2022.04.014
PMID:35615708
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术评估了18种野生型和工程化AAV衣壳在人视网膜组织中的表现 | 首次在人视网膜组织中使用单细胞RNA测序技术评估AAV衣壳的感染效率和趋向性 | 研究仅限于人视网膜组织,未涉及其他组织类型 | 验证候选AAV载体的有效性,加速视网膜基因疗法的临床转化 | 18种野生型和工程化AAV衣壳在人视网膜组织中的表现 | 基因疗法 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人视网膜组织样本 |
21144 | 2024-08-08 |
A human breast atlas integrating single-cell proteomics and transcriptomics
2022-06-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.05.003
PMID:35617956
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research paper | 本文通过整合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和循环免疫荧光技术,构建了一个高分辨率的人类乳腺图谱,涵盖多种细胞状态 | 首次整合单细胞蛋白质组学和转录组学数据,定义了乳腺中的细胞亚型,并探讨了这些亚型与癌症风险因素的关联 | NA | 旨在揭示乳腺在生理和病理生理条件下对疾病易感性的变化,并详细注释这些临床变量对细胞状态的具体影响 | 人类乳腺中的细胞亚型及其与癌症风险因素的关联 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA-seq, mass cytometry, cyclic immunofluorescence | NA | single-cell RNA-seq data, mass cytometry data, cyclic immunofluorescence data | NA |
21145 | 2024-08-08 |
Cell function and identity revealed by comparative scRNA-seq analysis in human nasal, bronchial and epididymis epithelia
2022 Jun-Aug, European journal of cell biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.ejcb.2022.151231
PMID:35597096
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研究论文 | 本文通过比较单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析,揭示了人类鼻腔、支气管和附睾上皮细胞的功能和身份 | 利用scRNA-seq技术,首次详细比较了不同解剖位置但具有相似功能的细胞的转录组特征 | 研究主要集中在特定的细胞类型和组织,可能无法全面代表所有相关细胞的功能和身份 | 探讨不同解剖位置但具有相似功能的细胞之间的进化关系 | 人类鼻腔、支气管和附睾上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 包括来自健康捐赠者和囊性纤维化(CF)患者的鼻腔、支气管和附睾上皮细胞样本 |
21146 | 2024-08-08 |
Mining cell-cell signaling in single-cell transcriptomics atlases
2022-06, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2022.102101
PMID:35609365
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综述 | 本文综述了从单细胞转录组数据集中挖掘细胞间信号事件的当前策略,并强调了通过进一步研究单细胞图谱中预测的细胞间信号事件来获得生物过程新见解的实例 | NA | NA | 探讨单细胞转录组图谱中细胞间信号事件的挖掘策略及其在生物过程中的应用 | 单细胞转录组数据中的细胞间信号事件 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
21147 | 2024-08-08 |
Targeting SLC7A11 improves efferocytosis by dendritic cells and wound healing in diabetes
2022-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04754-6
PMID:35614212
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研究论文 | 本文揭示了膜转运蛋白SLC7A11在糖尿病伤口愈合中的作用,通过抑制SLC7A11功能加速伤口愈合 | 发现SLC7A11作为分子刹车抑制了树突状细胞的吞噬作用,抑制SLC7A11功能可加速伤口愈合 | NA | 研究SLC7A11在糖尿病伤口愈合中的作用及其机制 | SLC7A11在树突状细胞中的表达及其对吞噬作用和伤口愈合的影响 | NA | 糖尿病 | RNA干扰、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
21148 | 2024-08-08 |
Immune disease risk variants regulate gene expression dynamics during CD4+ T cell activation
2022-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01066-3
PMID:35618845
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法,分析了CD4+ T细胞激活过程中的基因表达变化及其与遗传变异的关系 | 首次在单细胞水平上分析了遗传变异对CD4+ T细胞激活过程中基因表达动态调控的影响 | 研究仅限于健康个体,未涉及疾病状态下的分析 | 探究遗传变异如何影响CD4+ T细胞激活过程中的基因表达,进而解释免疫疾病的风险 | CD4+ T细胞在激活过程中的基因表达变化 | 免疫学 | 免疫介导疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 119名健康个体的655,349个CD4 T细胞 |
21149 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics reveals metabolic changes underly age-dependent declines in digit regeneration
2022-05-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.71542
PMID:35616636
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研究论文 | 本文利用空间转录组学技术研究了老年小鼠远端指尖再生的代谢变化 | 首次揭示了老年小鼠再生过程中的代谢转变,并发现代谢物草酰乙酸的给药可以增强体内骨再生 | NA | 探究骨骼再生的机制,特别是老年小鼠与年轻小鼠在再生能力上的差异 | 老年小鼠和年轻小鼠的远端指尖再生过程 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 老年小鼠和年轻小鼠的远端指尖样本 |
21150 | 2024-08-08 |
Author Correction: scRNA-seq in medulloblastoma shows cellular heterogeneity and lineage expansion support resistance to SHH inhibitor therapy
2022-May-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30824-4
PMID:35618754
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
21151 | 2024-08-08 |
Transcriptomic perspectives of memory-like NK cells and aging
2022-05-25, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01059-1
PMID:35610660
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研究论文 | 本文探讨了记忆样自然杀伤(NK)细胞的转录组特征及其与衰老的关系 | 研究首次强调了记忆样NK细胞亚群的存在,该亚群随年龄增长而积累,并与COVID-19患者的疾病严重程度相关 | 临床上对NK细胞记忆的相关性仍在争论中 | 定义记忆样NK细胞亚群的起源、寿命、功能及与疾病的相关性 | 记忆样NK细胞的分子身份 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
21152 | 2024-08-08 |
Postmortem gene expression profiles in the habenulae of suicides: implication of endothelial dysfunction in the neurovascular system
2022-05-25, Molecular brain
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s13041-022-00934-7
PMID:35614468
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研究论文 | 研究分析了自杀者死后海马旁回的基因表达谱,发现与神经正常个体相比,自杀者海马旁回组织中251个基因表达存在差异,这些差异基因与内皮细胞功能障碍有关 | 首次揭示了自杀者海马旁回组织中内皮细胞相关基因表达的变化,为抑郁症和自杀行为的潜在关联提供了分子层面的证据 | 研究样本数量有限 | 探究抑郁症患者自杀行为与海马旁回分子特征的关系 | 自杀者与神经正常个体的海马旁回组织 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 有限数量的样本 |
21153 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals lineage trajectory of human scalp hair follicle and informs mechanisms of hair graying
2022-May-24, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00394-2
PMID:35606346
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了高度纯化的黑色和早期灰发的人类头皮毛囊,揭示了毛囊的谱系轨迹及其在早期灰发过程中的变化 | 首次详细揭示了人类头皮毛囊的谱系轨迹,并发现了与小鼠毛囊不同的多个意外特征,如生长期内凸状隔室的存在、缺乏离散的伴生层以及毛囊干细胞中EMT特征的富集 | NA | 深入理解人类头皮毛囊在健康和疾病状态下的机制,特别是头发灰化的机制 | 人类头皮毛囊及其在头发灰化过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 多个独立个体的样本 |
21154 | 2024-08-08 |
Mast cell marker gene signature in head and neck squamous cell carcinoma
2022-May-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-09673-3
PMID:35610596
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研究论文 | 本研究旨在识别并建立一个用于评估头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者预后和免疫治疗反应的肥大细胞基因签名(MCS) | 首次生成了包含九个基因的预测性MCS,并验证了其在HNSCC患者中的独立预后价值及对免疫治疗反应的预测能力 | NA | 研究肥大细胞在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的预测作用 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的肥大细胞基因签名(MCS) | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序分析,荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 训练集和测试集的数据来自The Cancer Genome Atlas,具体样本数量未详细说明 |
21155 | 2024-08-08 |
Tumor-associated macrophage heterogeneity is driven by tissue territories in breast cancer
2022-05-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110865
PMID:35613577
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和空间定位成像技术,探讨了肿瘤相关巨噬细胞在乳腺肿瘤中的异质性及其与组织区域的关系 | 发现肿瘤相关巨噬细胞的转录组程序根据其在乳腺导管间质或肿瘤上皮中的定位,遵循两种主要的分化路径,并且这种多样性仅在自发肿瘤模型中检测到 | NA | 探讨环境扰动如何影响肿瘤相关巨噬细胞的身份和功能 | 肿瘤相关巨噬细胞在乳腺肿瘤中的异质性及其与组织区域的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 未具体说明样本数量 |
21156 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling of human Vδ1 T cells reveals a pathogen-driven adaptive differentiation program
2022-05-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110858
PMID:35613583
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学、T细胞受体(TCR)克隆型分配、ATAC-seq和免疫表型分析,探讨了适应性γδ T细胞免疫生物学的转录调控 | 揭示了成人Vδ1 T细胞分为TCF7LEF1Granzyme B(T)或T-betEomesBLIMP-1Granzyme B(T)转录亚型,并发现克隆型扩增的TCR仅在T细胞中检测到 | NA | 理解适应性γδ T细胞免疫生物学的转录调控 | 成人Vδ1 T细胞的转录亚型和克隆型扩增的TCR | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学, TCR克隆型分配, ATAC-seq | NA | 转录组数据 | NA |
21157 | 2024-08-08 |
Cell cycle gene regulation dynamics revealed by RNA velocity and deep-learning
2022-05-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30545-8
PMID:35606383
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术结合深度学习方法,揭示了细胞周期中基因调控动力学的详细定量理解 | 提出了一种名为DeepCycle的深度学习方法,用于分析单细胞RNA测序数据,构建了高分辨率的细胞周期转录组图谱 | NA | 深入理解细胞周期中的基因调控动力学 | 细胞周期相关基因的转录动态 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 深度学习(DeepCycle) | RNA | 不同细胞系统的scRNA-seq文库 |
21158 | 2024-08-08 |
Poly-γ-glutamic acid/Alum adjuvanted pH1N1 vaccine-immunized aged mice exhibit a significant increase in vaccine efficacy with a decrease in age-associated CD8+ T cell proportion in splenocytes
2022-May-23, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-022-00282-z
PMID:35606855
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研究论文 | 本研究探讨了聚γ-谷氨酸和铝(PGA/Alum)佐剂对老年小鼠(18个月)疫苗效力的影响及其机制 | PGA/Alum佐剂提高了老年小鼠的抗原摄取和树突状细胞激活,增加了抗原特异性IFN-γ+CD8+ T淋巴细胞频率,并减少了与年龄相关的CD8+ T细胞比例 | NA | 研究PGA/Alum佐剂对老年小鼠流感疫苗效力的影响及其机制 | 老年小鼠的疫苗效力及免疫机制 | 疫苗学 | 流感 | 流式细胞术,单细胞转录组测序 | NA | 细胞,基因表达 | 老年小鼠(18个月)和年轻小鼠(6周) |
21159 | 2024-08-08 |
New adventures in spatial transcriptomics
2022-05-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.04.021
PMID:35609527
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research paper | 本文介绍了Stereo-seq这一空间转录组学方法,并展示了其在不同生物学背景下的应用 | Stereo-seq作为一种新的空间转录组学方法,能够解析基因调控途径在细胞空间排列中的作用 | NA | 研究基因调控途径在复杂动态过程中的作用 | 基因调控途径及其在细胞空间排列中的作用 | digital pathology | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
21160 | 2024-08-08 |
Expression and function of the luteinizing hormone choriogonadotropin receptor in human endometrial stromal cells
2022-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-12495-9
PMID:35597810
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研究论文 | 研究人类子宫内膜基质细胞中黄体生成激素/绒毛膜促性腺激素受体(LHCGR)的表达与功能 | 发现了一小部分表达LHCGR转录本的子宫内膜基质细胞亚群,这可能解释了文献中关于LHCGR表达的矛盾证据 | 未能重现LHCGR在子宫内膜基质细胞中的功能活性 | 探究LHCGR在人类子宫内膜中的表达及其功能活性 | 人类子宫内膜基质细胞中的LHCGR | NA | NA | 单细胞RNA测序 | G-蛋白偶联受体 | RNA | 包括整个周期的子宫内膜组织和培养的人类子宫内膜基质细胞的批量RNA测序数据,以及单细胞RNA测序数据 |