单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 21121 - 21140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21121 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals Types of Hepatopancreatic Cells and Haemocytes in Black Tiger Shrimp (Penaeus monodon) and Their Molecular Responses to Ammonia Stress
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.883043
PMID:35603188
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了黑虎虾肝胰腺和血细胞的单细胞转录图谱，并分析了它们对氨氮压力的分子应答机制 | 首次应用10× Genomics的单细胞RNA测序技术于虾类研究，构建了虾类肝胰腺细胞和血细胞在氨氮压力下的单细胞转录图谱 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术分析虾类细胞类型及其对氨氮压力的免疫应答分子机制 | 黑虎虾的肝胰腺细胞和血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 在两种组织（血细胞和肝胰腺）中分别成功识别出七个细胞簇 |
| 21122 | 2024-08-08 |
Single Cell Dissection of Epithelial-Immune Cellular Interplay in Acute Kidney Injury Microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.857025
PMID:35603220
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，系统解析了急性肾损伤（AKI）微环境中上皮细胞与免疫细胞的相互作用 | 发现了三种新的近端小管细胞亚型，并揭示了它们在AKI进展中的分子变化和功能 | NA | 深入理解急性肾损伤的分子变化机制，并开发新的靶向治疗 | 小鼠肾脏组织样本在缺血-再灌注AKI后的不同时间点 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠肾脏组织样本在AKI后的1天、2天和3天以及健康对照组 |
| 21123 | 2024-08-08 |
scEFSC: Accurate single-cell RNA-seq data analysis via ensemble consensus clustering based on multiple feature selections
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.04.023
PMID:35615016
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研究论文 | 本文提出了一种基于多特征选择的集成共识聚类方法scEFSC，用于准确分析单细胞RNA测序数据 | scEFSC算法采用多种无监督特征选择方法去除对单细胞RNA测序数据贡献不大的基因，并通过加权元聚类组合不同聚类算法的结果，提高了聚类性能 | 文章未明确提及现有方法的具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据分析中的数值不稳定、高维度和计算可扩展性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | RNA测序数据 | 14个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 21124 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics unveils ZBTB11 as a regulator of cardiomyocyte degeneration in arrhythmogenic cardiomyopathy
2023-03-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac072
PMID:35576477
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研究论文 | 本研究揭示了ZBTB11作为心肌病变调节因子的作用 | 首次将ZBTB11鉴定为在心肌组织中的新型驱动因子，影响心肌细胞的退化 | 未完全解析心肌细胞退化的所有分子机制 | delineate gene expression changes related to remodelling in arrhythmogenic cardiomyopathy | 心肌病患者的心脏组织样本 | 数字病理学 | 心律失常性心肌病 | Tomo-Seq | NA | 基因表达数据 | 多例心肌病患者的心脏组织 |
| 21125 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis implicates TH17-to-TH2 cell plasticity in the pathogenesis of palmoplantar pustulosis
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.04.027
PMID:35568077
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了掌跖脓疱病（PPP）患者的皮肤活检样本和外周血单个核细胞，揭示了TH17向TH2细胞可塑性在PPP发病机制中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了PPP患者中TH17向TH2细胞的可塑性，并验证了这一发现。 | 研究仅限于皮肤活检样本和外周血单个核细胞的分析，未涉及其他组织或细胞类型。 | 探究掌跖脓疱病（PPP）的免疫途径和发病机制。 | 掌跖脓疱病（PPP）患者的皮肤活检样本和外周血单个核细胞。 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序（RNA-Seq）、流式细胞术、免疫荧光显微镜 | NA | RNA | 涉及健康个体和PPP患者的皮肤活检样本及外周血单个核细胞。 |
| 21126 | 2024-08-08 |
Identification of islet cell characteristics in humans with type 2 diabetes by single-cell sequencing
2022-Oct, Journal of diabetes investigation
IF:3.1Q2
DOI:10.1111/jdi.13833
PMID:35578579
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了2型糖尿病患者胰岛细胞的特征 | 首次通过单细胞测序技术识别了2型糖尿病状态下人类β细胞中调节蛋白活性的改变 | 实验在人体胰腺β细胞中的应用存在困难，限制了治疗选项的开发 | 探索逆转或保护β细胞免于失败的策略 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 21127 | 2024-08-08 |
FIRM: Flexible integration of single-cell RNA-sequencing data for large-scale multi-tissue cell atlas datasets
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac167
PMID:35561293
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FIRM的重新缩放算法，用于跨多种组织类型、平台和实验批次准确整合单细胞RNA测序数据集 | FIRM算法能够准确混合共享的细胞类型身份，并保留原始结构，避免了过度校正，为下游探索和分析生成稳健的整合数据集 | NA | 开发一种算法以解决不同单细胞RNA测序技术平台和批次效应带来的数据整合难题 | 单细胞RNA测序数据集的整合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大规模多组织细胞图谱数据集 |
| 21128 | 2024-08-08 |
Reprogramming of Hepatic Metabolism and Microenvironment in Nonalcoholic Steatohepatitis
2022-08-22, Annual review of nutrition
IF:12.6Q1
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）及其严重形式非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的最新研究进展，特别是遗传、表观遗传和饮食因素以及代谢功能障碍在其他组织中的作用，以及单细胞RNA测序揭示的肝脏细胞异质性和微环境重编程的分子细节。 | 单细胞RNA测序技术揭示了肝脏细胞异质性和微环境的分子细节，为理解NASH的发病机制提供了新的视角。 | NA | 探讨NAFLD/NASH的病理生理机制及潜在的治疗机会。 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）及其严重形式非酒精性脂肪性肝炎（NASH）。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21129 | 2024-08-08 |
Distinct disease-specific Tfh cell populations in 2 different fibrotic diseases: IgG4-related disease and Kimura disease
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.03.034
PMID:35568079
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研究论文 | 本文研究了两种不同纤维化疾病中特定Tfh细胞亚群的特征，包括IgG4相关疾病和Kimura病。 | 发现了IgG4相关疾病患者受累器官中浸润的IL-10+LAG3+ Tfh细胞的新亚群，以及Kimura病患者中IL-13+ Tfh细胞和类型2免疫细胞的浸润。 | NA | 旨在识别次级和三级淋巴器官中表达IL-10或IL-13的疾病特异性Tfh细胞亚群，以识别两种不同类型纤维化疾病的不同细胞驱动因子。 | B细胞、Tfh细胞和浸润的类型2细胞在Kimura病或IgG4相关疾病患者病变组织中的特征。 | 免疫学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、原位测序和多色免疫荧光分析 | NA | 组织样本 | Kimura病和IgG4相关疾病患者的病变组织样本 |
| 21130 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq of UVB-radiated skin reveals landscape of photoaging-related inflammation and protection by vitamin D
2022-Jul-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.146563
PMID:35577040
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探究了紫外线辐射对小鼠皮肤的影响，并发现维生素D对皮肤炎症的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了紫外线辐射引起的皮肤炎症反应及其相关基因表达变化 | NA | 探究紫外线辐射对皮肤的影响及维生素D的保护作用 | 紫外线辐射的小鼠皮肤 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21131 | 2024-08-08 |
The MAP3K1/c-JUN signaling axis regulates glioblastoma stem cell invasion and tumor progression
2022-07-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.04.057
PMID:35567901
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研究论文 | 本研究通过公共单细胞RNA测序数据，发现MAP3K1通过调控c-JUN信号通路在胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）的侵袭和肿瘤进展中起主要作用 | 首次揭示了MAP3K1通过磷酸化下游c-JUN在丝氨酸63和73位点调控GSC侵袭的机制，并证实了MAP3K1/c-JUN信号轴作为侵袭性GBM治疗靶点的潜力 | NA | 研究MAP3K1在胶质母细胞瘤干细胞侵袭和肿瘤进展中的作用机制 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 21132 | 2024-08-08 |
Transcriptional Repression by FoxM1 Suppresses Tumor Differentiation and Promotes Metastasis of Breast Cancer
2022-07-05, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0410
PMID:35583996
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研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9技术生成携带FoxM1点突变的鼠模型，探讨FoxM1与Rb结合对乳腺癌转移的影响 | 首次揭示了FoxM1与Rb结合在乳腺癌转移中的促进作用，并阐明了其通过调控转录组影响癌细胞可塑性的机制 | 研究主要集中在鼠模型上，需要进一步在人类乳腺癌样本中验证结果 | 探讨FoxM1的转录抑制功能在乳腺癌分化和转移中的作用 | FoxM1转录因子及其与Rb的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | 携带FoxM1点突变的鼠模型 |
| 21133 | 2024-08-08 |
DAE-TPGM: A deep autoencoder network based on a two-part-gamma model for analyzing single-cell RNA-seq data
2022-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105578
PMID:35569337
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研究论文 | 本文介绍了一种基于两部分伽马模型的深度自编码器网络(DAE-TPGM)，用于单细胞RNA测序数据的联合降维和插补 | DAE-TPGM利用两部分伽马模型捕捉半连续标准化数据的统计特性，并通过深度自编码器自适应地探索基因间的潜在关系，以促进数据插补 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中细胞表型的识别 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器网络 | 基因表达数据 | 涉及两个真实数据集和合成数据集 |
| 21134 | 2024-08-08 |
Improvements Achieved by Multiple Imputation for Single-Cell RNA-Seq Data in Clustering Analysis and Differential Expression Analysis
2022-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0597
PMID:35575729
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研究论文 | 本文研究了如何有效地将多重填补（MI）方法应用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的聚类分析和差异表达分析 | 提出了针对聚类分析和差异表达分析的MI程序，并展示了MI在scRNA-seq数据分析中的改进效果 | NA | 探讨多重填补方法在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | GAN | 文本 | 分析了三个知名的scRNA-seq数据集 |
| 21135 | 2024-08-08 |
Translator: A Transfer Learning Approach to Facilitate Single-Cell ATAC-Seq Data Analysis from Reference Dataset
2022-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0596
PMID:35584295
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研究论文 | 本研究提出了一种名为Translator的迁移学习方法，用于从高质量的参考scATAC-seq数据中捕获可泛化的染色质相互作用，以在低至中等质量的目标scATAC-seq数据中获得稳健的细胞表征 | Translator通过结合参考数据中的信息，能够学习到比其他方法更具生物学意义的细胞表征，并采用块状深度学习框架处理非线性关系，提高计算效率 | NA | 旨在解决scATAC-seq数据分析中的计算挑战，提高数据处理的准确性和效率 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | 深度学习 | 序列数据 | 涉及多种模拟和真实的scATAC-seq数据集 |
| 21136 | 2024-08-08 |
Controversial molecular functions of CBS versus non-CBS domain variants of PRKAG2 in arrhythmia and cardiomyopathy: A case report and literature review
2022-07, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1962
PMID:35588295
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病例报告和文献综述 | 本文报告了两例PRKAG2基因变异导致的不同心脏表型的病例，并通过外显子测序和变异分析探讨了CBS和非CBS域变异在心律失常和心肌病中的分子功能差异 | 首次描述了PRKAG2 c.425C > T (p.T142I)致病变异在患者中早期发病的DCM表型，并使用scRNA-seq展示了电传导细胞中PRKAG2表达水平高于心肌细胞 | CBS和非CBS域在分子功能上的差异尚未完全解决 | 探讨PRKAG2基因变异在心律失常和心肌病中的分子机制 | PRKAG2基因变异导致的心脏表型 | NA | 心肌病 | 外显子测序 | NA | 基因数据 | 两例病例 |
| 21137 | 2024-08-08 |
Fate mapping of neural stem cell niches reveals distinct origins of human cortical astrocytes
2022-06-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abm5224
PMID:35587512
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研究论文 | 本研究通过在人类初级组织中进行命运图谱绘制，揭示了源自不同神经干细胞龛的人类皮质星形胶质细胞具有不同的发育命运 | 首次展示了源自不同神经干细胞龛的星形胶质细胞在解剖学上的不同分布层，并利用单细胞测序技术识别了成年后这些星形胶质细胞亚型的分子差异 | NA | 探究源自不同神经干细胞龛的人类皮质星形胶质细胞的发育命运 | 人类皮质星形胶质细胞及其源自的神经干细胞龛 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 21138 | 2024-08-08 |
Analyzing single cell transcriptome data from severe COVID-19 patients
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101379
PMID:35582459
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研究论文 | 本文描述了利用单细胞转录组数据识别COVID-19严重程度特异性细胞类型及其调控标记基因的协议 | 构建了COVID-19合并疾病相关基因列表，并通过基因富集分析进一步表征了识别的细胞类型 | NA | 识别COVID-19严重程度特异性细胞类型及其调控标记基因 | COVID-19严重患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21139 | 2024-08-08 |
Embryonic vascular establishment requires protein C receptor-expressing endothelial progenitors
2022-06-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200419
PMID:35587592
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研究论文 | 本研究确定了蛋白C受体（Procr）作为内皮祖细胞的标记物，并探讨了Procr+祖细胞在胚胎血管发育中的作用 | 本研究揭示了Procr表达比先前认知的更早（胚胎第7.5天），并通过单细胞RNA测序分析确定了Procr+细胞在内皮细胞分化和成熟起始阶段的位置 | NA | 阐明内皮祖细胞的分子身份及其在胚胎血管建立中的作用 | 蛋白C受体（Procr）表达的内皮祖细胞及其在胚胎血管发育中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 整个胚胎的Procr+细胞 |
| 21140 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity and intratumoral crosstalk in human endometrial cancer
2022-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13249
PMID:35560676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类子宫内膜癌的异质性和肿瘤内相互作用 | 发现了恶性细胞与免疫细胞及血管相关成纤维细胞的密切相互作用，为治疗提供了潜在靶点 | NA | 探索子宫内膜癌进展的机制并开发新的治疗策略 | 子宫内膜癌及其正常组织样本 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4个子宫内膜癌样本和2个正常子宫内膜样本 |