单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 21121 - 21140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21121 | 2024-08-05 |
Dysfunctional dendritic cells limit antigen-specific T cell response in glioma
2023-02-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac138
PMID:35609569
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研究论文 | 该文章探讨了胶质瘤中功能失调的树突状细胞如何限制抗原特异性T细胞反应。 | 揭示了IDH突变胶质瘤中树突状细胞的独特教育机制及其功能失调的影响。 | 尚未充分阐明树突状细胞在IDH突变肿瘤微环境中的完全功能。 | 研究树突状细胞在胶质瘤微环境中的作用及其对抗肿瘤免疫反应的影响。 | 人类高等级胶质瘤中的树突状细胞及其功能。 | 数字病理 | 胶质瘤 | 单细胞测序，转录组和蛋白质组分析 | 小鼠胶质母细胞瘤 | 生物样本（组织样本） | 人类IDH野生型和突变高等级胶质瘤样本 |
| 21122 | 2024-08-08 |
Characterization and role of collagen gene expressing hepatic cells following partial hepatectomy in mice
2023-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32586
PMID:35603471
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研究论文 | 研究部分肝切除后小鼠肝脏中表达胶原基因的肝细胞的特征及其在肝脏再生中的作用 | 首次发现部分肝切除后肝脏中存在异质性的肝星状细胞簇，其中包括一个独特的增殖簇，这些胶原基因表达细胞包括肝星状细胞，促进肝脏再生 | NA | 阐明部分肝切除后肝脏再生的机制，并研究表达胶原基因的肝细胞在其中的作用 | 小鼠肝脏中表达胶原基因的肝细胞及其在肝脏再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用了Col-GFP、Col-ER Cre/RFP和Col-ER Cre/DTA小鼠模型进行研究 |
| 21123 | 2024-08-08 |
Periodontal tissue stem cells and mesenchymal stem cells in the periodontal ligament
2022-Nov, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2022.04.001
PMID:35607404
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综述 | 本文综述了牙周韧带中牙周组织干细胞和间充质干细胞的最新发现，并讨论了未来牙周再生治疗的研究方向 | 利用遗传谱系追踪、标记保留细胞鉴定和单细胞转录组分析等干细胞生物学进展，分析牙周韧带中的组织干细胞 | 牙周韧带中的组织干细胞尚未得到充分研究，可能与间充质干细胞不同 | 总结牙周韧带中干细胞群体的最新发现，并探讨牙周再生治疗的未来研究方向 | 牙周组织干细胞和牙周韧带中的间充质干细胞 | NA | NA | 遗传谱系追踪、标记保留细胞鉴定、单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 21124 | 2024-08-08 |
scCODE: an R package for data-specific differentially expressed gene detection on single-cell RNA-sequencing data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac180
PMID:35598331
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scCODE的R包，用于在单细胞RNA测序数据中进行数据特异性的差异表达基因检测 | 提出了基于两个新指标的单细胞共识优化差异表达基因检测方法，能够自动优化每个实验单细胞RNA测序数据的差异表达基因检测 | 未明确说明基因过滤对差异表达方法性能的影响 | 旨在改进单细胞RNA测序数据中差异表达基因检测的方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 21125 | 2024-08-08 |
Breaking through the Poisson Distribution: A compact high-efficiency droplet microfluidic system for single-bead encapsulation and digital immunoassay detection
2022-Sep-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2022.114384
PMID:35609455
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研究论文 | 本文提出了一种名为BOAD的微流控系统，通过结合鞘流、Dean涡流和压缩流道，实现了粒子的有序排列，从而突破了泊松分布对单粒子封装效率的限制 | BOAD系统首次实现了粒子的有序排列，并将单珠封装效率提高至86% | NA | 提高微流控系统中单粒子封装的效率 | 微流控系统中的单珠封装 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 微滴 | NA |
| 21126 | 2024-08-08 |
Calcium-dependent transcriptional changes in human pancreatic islet cells reveal functional diversity in islet cell subtypes
2022-09, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-022-05718-1
PMID:35616696
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研究论文 | 本文研究了人类胰腺胰岛细胞在钙离子依赖性条件下转录变化，揭示了胰岛细胞亚型的功能多样性 | 首次尝试在所有胰岛细胞类型中分析钙离子调节的基因表达 | NA | 构建一个大规模的单细胞转录组数据集，以研究在诱导或抑制细胞内钙信号传导条件下的人类胰岛细胞 | 人类胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 68,650个细胞，其中59,373个表达INS、GCG、SST或PPY的内分泌细胞 |
| 21127 | 2024-08-08 |
Mogroside V ameliorates the oxidative stress-induced meiotic defects in porcine oocytes in vitro
2022-08, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2022.05.008
PMID:35597324
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研究论文 | 研究探讨了Mogroside V（MV）如何改善由氧化应激引起的猪卵母细胞减数分裂缺陷 | 首次揭示了MV通过恢复线粒体完整性来减轻氧化应激引起的减数分裂缺陷的机制 | NA | 探索MV改善氧化应激引起的猪卵母细胞减数分裂缺陷的机制 | 猪卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21128 | 2024-08-08 |
Transcriptional landscapes of de novo root regeneration from detached Arabidopsis leaves revealed by time-lapse and single-cell RNA sequencing analyses
2022-07-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2022.100306
PMID:35605192
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研究论文 | 研究通过时间序列和单细胞RNA测序分析，揭示了从离体拟南芥叶片再生新根的转录组重编程过程 | 首次提供了从伤口反应到根器官发生的高分辨率转录组重编程图谱，并揭示了参与新根再生的关键因子 | NA | 研究离体拟南芥叶片新根再生的转录调控框架 | 拟南芥离体叶片的新根再生过程 | 分子生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 整个叶片在叶片脱离后12小时和5天内的样本 |
| 21129 | 2024-08-08 |
scCloudMine: A cloud-based app for visualization, comparison, and exploration of single-cell transcriptomic data
2022-07-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2022.100302
PMID:35605202
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研究论文 | scCloudMine是一款基于云的应用程序，用于单细胞转录组数据的可视化、比较和探索 | scCloudMine不需要现场的高性能计算服务器、安装或相关专业知识和费用，用户可以通过网页浏览器上传预处理后的scRNA-seq数据进行可视化 | NA | 开发一个云基础的应用程序，用于单细胞转录组数据的可视化、比较和探索 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 21130 | 2024-08-08 |
WebCSEA: web-based cell-type-specific enrichment analysis of genes
2022-07-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac392
PMID:35610053
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研究论文 | 介绍了一个名为WebCSEA的基于网络的应用程序，用于快速评估基因的细胞类型特异性 | 首次开发了一个基于网络的应用程序WebCSEA，用于评估基因在人类组织细胞类型中的特异性，并采用了改进的deTS算法和基于排列的方法来准确估计细胞类型特异性 | NA | 旨在利用单细胞RNA测序技术揭示人类组织中的细胞异质性，并理解复杂性状相关基因在人类组织细胞类型中的特定表达 | 人类组织细胞类型中的基因特异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | deTS算法 | 基因列表 | 111个scRNA-seq面板，涵盖11个人体器官系统的61种不同组织中的1,355个组织细胞类型 |
| 21131 | 2024-08-08 |
Distinguishing cell-cell complexes from dual lineage cells using single-cell transcriptomics is not trivial
2022-07, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24656
PMID:35594038
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研究论文 | 本文回应了Jie等人的观点，通过单细胞转录组数据分析，探讨了DE细胞群是否为双系共表达细胞或B细胞与T细胞的复合体 | 本文通过分析DE细胞的基因特征和转录组特征，提出了DE细胞可能是三系共表达细胞或三组分细胞聚集体的可能性 | 仅基于单细胞转录组数据，无法完全确定DE细胞的性质 | 探讨单细胞转录组数据中DE细胞群的性质 | DE细胞群的性质及其与B细胞和T细胞复合体的关系 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21132 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Demonstrates the Regulation of Peach Polysaccharides on Circadian Rhythm Disturbance
2022-07, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202101170
PMID:35598297
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型评估了桃多糖（PPS）对由持续黑暗引起的昼夜节律紊乱的调节作用 | 首次通过单细胞转录组学分析了PPS对昼夜节律紊乱小鼠肠道微生物群结构和下丘脑细胞类型及时钟基因表达的影响 | NA | 评估桃多糖对昼夜节律紊乱的调节作用 | 桃多糖、昼夜节律紊乱的小鼠 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 21133 | 2024-08-08 |
Bisphenol analogues induced metabolic effects through eliciting intestinal cell heterogeneous response
2022-07, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2022.107287
PMID:35598417
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研究论文 | 研究双酚类似物如何通过引发肠道细胞异质性反应诱导代谢效应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了双酚类似物在肠道细胞中诱导的细胞异质性变化，并阐明了其对脂质和碳水化合物代谢的分子和细胞机制 | NA | 探讨双酚类似物如何诱导代谢效应 | 双酚A、双酚F和双酚AF对斑马鱼的代谢影响 | NA | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼从胚胎阶段开始持续暴露于环境水平的双酚A、双酚F和双酚AF，60天后进行分析 |
| 21134 | 2024-08-08 |
Molecular Subgroups of Intrahepatic Cholangiocarcinoma Discovered by Single-Cell RNA Sequencing-Assisted Multiomics Analysis
2022-07-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-1101
PMID:35604302
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序辅助的多组学分析，揭示了肝内胆管癌（ICC）的新分子亚型 | 首次通过单细胞RNA测序辅助的多组学分析，识别出ICC的三种分子亚型，并验证了APOE+C1QB+肿瘤相关巨噬细胞作为潜在的免疫治疗靶点 | NA | 旨在通过多组学分析揭示肝内胆管癌的新分子亚型，以开发新的治疗方法 | 肝内胆管癌（ICC）及其分子亚型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林算法 | 蛋白质组学、全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | 训练组110例，验证组41例 |
| 21135 | 2024-08-08 |
Muscle-Derived Beige Adipose Precursors Secrete Promyogenic Exosomes That Treat Rotator Cuff Muscle Degeneration in Mice and Are Identified in Humans by Single-Cell RNA Sequencing
2022-07, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465221095568
PMID:35604307
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研究论文 | 研究肌肉来源的米色脂肪前体细胞分泌的促肌生成外泌体，这些外泌体能够治疗小鼠肩袖肌肉退化，并在人类中通过单细胞RNA测序被识别 | 首次发现肌肉来源的米色脂肪前体细胞（FAP-BAT）通过分泌外泌体促进肌生成，并在人类中通过单细胞RNA测序识别出类似的前体细胞亚群 | NA | 研究小鼠FAP-BAT亚群的特征，确定其促肌生成效果是否通过外泌体介导，并分析人类FAPs中是否存在类似的促肌生成外泌体丰富的亚群 | 小鼠和人类的肌肉来源的米色脂肪前体细胞（FAP-BAT）及其分泌的外泌体 | 数字病理学 | 运动相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类的肌肉样本 |
| 21136 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing and binary hierarchical clustering define lung interstitial macrophage heterogeneity in response to hypoxia
2022-07-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00104.2022
PMID:35608266
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和二元层次聚类分析了低氧条件下肺间质巨噬细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上研究了低氧暴露后肺间质巨噬细胞的分子表型，并发现了一种潜在的驻留训练先天性巨噬细胞 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 确定肺间质巨噬细胞的多样性及其与低氧诱导的肺动脉高压的关联 | 肺间质巨噬细胞在低氧条件下的分子表型和异质性 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | 二元层次聚类 | RNA | 共分析了374个常氧条件下的巨噬细胞，2526个低氧1天后的巨噬细胞和1211个低氧7天后的巨噬细胞 |
| 21137 | 2024-08-08 |
Insights gained in the pathology of lung disease through single-cell transcriptomics
2022-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5971
PMID:35608561
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研究论文 | 本文总结了通过单细胞转录组学研究获得的关于人类肺上皮细胞分子表型在疾病相关变化方面的最新进展 | 利用单细胞转录组学技术，首次详细描述了慢性肺疾病中肺上皮细胞的过渡状态 | 研究结果需要进一步的验证研究来加深对疾病机制的理解 | 深入理解肺疾病中的病理重塑过程 | 人类肺上皮细胞在慢性肺疾病中的分子表型变化 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 21138 | 2024-08-08 |
webSCST: an interactive web application for single-cell RNA-sequencing data and spatial transcriptomic data integration
2022-06-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac350
PMID:35604082
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research paper | 本文介绍了一种名为webSCST的基于网络的单细胞RNA测序数据与空间转录组数据整合工具 | webSCST整合了按物种和器官分类的良好组织的空间转录组测序数据集，并提供了一个用户友好的界面，支持流行的整合方法，允许用户提交原始单细胞数据以获取每个细胞类型的预测空间位置 | NA | 开发一种工具，用于整合单细胞RNA测序数据与空间数据，以促进生物学研究 | 单细胞RNA测序数据与空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 按物种和器官分类的多个数据集 |
| 21139 | 2024-08-08 |
Bisphenol F Impaired Zebrafish Cognitive Ability through Inducing Neural Cell Heterogeneous Responses
2022-06-21, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.2c01531
PMID:35616434
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研究论文 | 研究探讨了双酚F（BPF）对斑马鱼认知能力的影响及其神经细胞异质性反应的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了BPF暴露后斑马鱼大脑神经细胞组成的改变，并验证了微胶质细胞在其中的主导作用 | NA | 探究BPF如何影响神经系统和认知能力 | 斑马鱼的认知能力和神经细胞反应 | 神经科学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 斑马鱼从胚胎阶段持续暴露于环境相关浓度的BPF（0.5和5.0 μg/L） |
| 21140 | 2024-08-08 |
FGFR3 is expressed by human primordial germ cells and is repressed after meiotic initiation to form primordial oocytes
2022-06-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.04.015
PMID:35594860
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研究论文 | 本文研究了人类原始生殖细胞（PGCs）中成纤维细胞生长因子受体3（FGFR3）的表达及其在PGCs向原始卵母细胞分化过程中的抑制作用 | 首次展示了FGFR3在人类PGCs中的表达及其在分化过程中的抑制作用，并利用荧光激活细胞分选（FACS）和单细胞RNA测序技术，证明了FGFR3阳性细胞富集了人类PGCs | NA | 探讨FGFR3在人类生殖细胞发育中的作用及其作为识别成熟PGCs的潜在策略 | 人类原始生殖细胞（PGCs）及其向原始卵母细胞的分化过程 | NA | NA | 荧光激活细胞分选（FACS），单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |