单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
21101 2024-08-08
α Cell dysfunction in islets from nondiabetic, glutamic acid decarboxylase autoantibody-positive individuals
2022-06-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨了非糖尿病、谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体的胰岛α细胞功能障碍 首次揭示了在胰岛自身免疫早期阶段,尽管β细胞数量正常,但α细胞功能已出现障碍 NA 研究非糖尿病谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体胰岛α细胞的功能障碍及其在1型糖尿病进展中的作用 非糖尿病谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体和1型糖尿病患者的胰岛 NA 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
21102 2024-08-08
Enhanced transcriptional heterogeneity mediated by NF-κB super-enhancers
2022-06, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 研究了NF-κB介导的超级增强子(SE)在抗IgM刺激的B细胞中的活性特征 发现NF-κB超级增强子通过液-液相分离过程调控基因表达,增强细胞间的转录反应异质性 NA 阐明NF-κB超级增强子在基因调控中的生物学功能 NF-κB介导的超级增强子在B细胞中的活性 分子生物学 NA 荧光成像、单细胞转录组分析、染色质可及性分析 NA 图像、转录组数据 抗IgM刺激的B细胞
21103 2024-08-08
Blocking connexin 43 and its promotion of ATP release from renal tubular epithelial cells ameliorates renal fibrosis
2022-05-31, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本文探讨了肾小管上皮细胞损伤后释放的代谢物,特别是通过连接蛋白43(Cx43)促进的三磷酸腺苷(ATP)释放,在肾纤维化中的作用。 首次全面研究了Cx43在肾间质纤维化中的作用,并揭示了Cx43通过促进ATP释放,诱导巨噬细胞焦亡,进而加速肾纤维化的机制。 研究主要基于动物模型和临床样本,需要进一步的临床试验验证其结果的普遍性和有效性。 探讨肾小管上皮细胞损伤后释放的代谢物在肾纤维化中的作用,特别是Cx43和ATP的作用。 肾小管上皮细胞、巨噬细胞、肾纤维化 NA 肾病 转录组学、代谢组学、单细胞测序 NA RNA序列 包括来自阻塞性肾病的患者样本和单侧输尿管阻塞(UUO)的小鼠模型
21104 2024-08-08
Chord: an ensemble machine learning algorithm to identify doublets in single-cell RNA sequencing data
2022-05-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为Chord的集成机器学习算法,用于识别单细胞RNA测序数据中的双细胞 Chord通过集成多种双细胞检测方法,提高了准确性和稳定性,并具有模块化架构,便于新工具的整合 NA 解决单细胞RNA测序数据中双细胞检测的问题 单细胞RNA测序数据中的双细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 集成机器学习算法 RNA测序数据 包含真实和合成数据的不同数据集
21105 2024-08-08
Characteristics of alveolar macrophages in bronchioalveolar lavage fluids from active tuberculosis patients identified by single-cell RNA sequencing
2022-May-28, Journal of biomedical research IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了活动性结核病患者支气管肺泡灌洗液中肺泡巨噬细胞的特征 首次在单细胞分辨率下描述了活动性结核病患者肺泡巨噬细胞的特征,并探讨了其与炎症信号通路及基本巨噬细胞功能的关系 研究样本量较小,仅包括三名活动性结核病患者和三名健康成人作为对照 展示活动性结核病患者支气管肺泡灌洗液中肺泡巨噬细胞的特征 活动性结核病患者的肺泡巨噬细胞 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序 NA 转录组 三名活动性结核病患者和三名健康成人
21106 2024-08-08
Activation-induced pyroptosis contributes to the loss of MAIT cells in chronic HIV-1 infected patients
2022-05-27, Military Medical Research IF:16.7Q1
研究论文 本研究探讨了激活诱导的焦亡在慢性HIV-1感染患者中导致黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞)丢失的机制 首次揭示了激活诱导的MAIT细胞焦亡在HIV-1感染患者中的作用,并关联了系统性T细胞激活、微生物移位和肠道损伤的标志 研究样本仅限于中国北京的一家医院,可能限制了结果的普遍性 识别导致HIV-1感染患者中MAIT细胞丢失的机制 HIV-1感染患者的MAIT细胞及其焦亡特征 免疫学 HIV/AIDS 流式细胞术,单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 NA 单细胞转录组数据 127名HIV-1感染者,包括69名未治疗患者、28名完全应答者、15名免疫非应答者和15名精英控制者
21107 2024-08-08
Toll-like receptor 9 deficiency induces osteoclastic bone loss via gut microbiota-associated systemic chronic inflammation
2022-May-27, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 本研究首次展示了TLR9缺陷小鼠表现出低骨量和低级别系统性慢性炎症,这种炎症由肠道微生物群失调引起,并导致骨丢失。 本研究首次揭示了TLR9信号通过肠道微生物群与免疫系统和骨骼系统的连接,对维持炎症、造血和骨代谢的稳态至关重要。 NA 探讨TLR9在正常骨重塑中的作用及其机制。 TLR9缺陷小鼠的骨量、系统性慢性炎症及肠道微生物群变化。 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA TLR9缺陷小鼠
21108 2024-08-08
Glutamine Metabolism Is Required for Alveolar Regeneration during Lung Injury
2022-05-22, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了谷氨酰胺代谢在肺损伤后肺泡再生的作用,特别是在特发性肺纤维化(IPF)患者和博莱霉素诱导的纤维化小鼠模型中的作用。 首次揭示了谷氨酰胺代谢在肺泡上皮细胞再生中的关键作用,特别是在肺纤维化过程中的作用。 研究主要基于小鼠模型和IPF患者的细胞样本,可能需要进一步的人体临床试验来验证结果。 研究谷氨酰胺代谢在肺泡上皮细胞再生中的作用,特别是在肺损伤和纤维化过程中的作用。 特发性肺纤维化患者和小鼠的肺泡II型细胞(AT2细胞)。 NA 肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组和代谢组分析 NA RNA 包括IPF患者的AT2细胞和小鼠的肺组织样本
21109 2024-08-08
Chemoprevention of Lung Cancer with a Combination of Mitochondria-Targeted Compounds
2022-May-21, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究评估了针对线粒体的化合物组合(Mito-HNK和Mito-LND)在预防小鼠肺癌中的效果 首次探讨了Mito-HNK和Mito-LND组合在肺癌预防中的协同作用,并通过单细胞RNA测序分析了其作用机制 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 探索针对线粒体的化合物组合在肺癌化学预防中的效果 小鼠肺癌模型 NA 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肿瘤样本
21110 2024-08-08
Single-Cell RNA Transcriptomics Reveals the State of Hepatic Lymphatic Endothelial Cells in Hepatitis B Virus-Related Acute-on-Chronic Liver Failure
2022-May-20, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了肝淋巴管和淋巴内皮细胞在乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭中的作用 首次揭示了急性慢性肝衰竭中肝淋巴管和淋巴内皮细胞的功能障碍及其与渗入的单核/巨噬细胞分泌的磷蛋白1的关系 研究仅基于人类肝脏样本,未来需进一步验证动物模型中的发现 探究肝淋巴管和淋巴内皮细胞在急性慢性肝衰竭中的作用及其机制 肝淋巴管、淋巴内皮细胞及急性慢性肝衰竭患者 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序 NA RNA 人类肝脏样本
21111 2024-08-08
Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Lung Epithelial Cell Type-Specific Responses to HDM and Regulation by Tet1
2022-05-14, Genes IF:2.8Q2
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了Tet1在屋尘螨(HDM)诱导的肺部炎症中对不同肺上皮细胞类型的作用 首次揭示了Tet1缺失对肺上皮细胞转录组网络的影响,并探讨了HDM可能促进AP和BAS细胞向AT2细胞分化的机制 研究仅限于小鼠模型,未来需在人体中验证结果 探索Tet1在屋尘螨诱导的肺部炎症中对个体肺上皮细胞类型的作用 肺上皮细胞类型在HDM诱导的炎症中的响应及Tet1的调控作用 数字病理学 过敏性肺病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 Tet1敲除和野生型小鼠的肺上皮细胞
21112 2024-08-08
Chitooligosaccharides Improve the Efficacy of Checkpoint Inhibitors in a Mouse Model of Lung Cancer
2022-May-12, Pharmaceutics IF:4.9Q1
研究论文 研究探讨了壳寡糖(COS)在肺癌小鼠模型中与免疫检查点抑制剂(ICIs)联合使用的效果 首次研究了壳寡糖与免疫检查点抑制剂联合使用对肺癌小鼠模型的影响,发现联合治疗能延缓肿瘤生长 研究未进一步探讨壳寡糖的其他潜在抗肿瘤机制 探究壳寡糖在肺癌治疗中的作用及其与免疫检查点抑制剂的联合应用效果 肺癌小鼠模型及人类肿瘤单细胞RNA测序数据 NA 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 使用Lewis肺癌(LL2)模型进行实验
21113 2024-08-08
Dissecting Human Blood Immune Cells Response to Intracellular Infection Using Single-Cell RNA Sequencing
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文开发了一种使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析体外感染的人外周血单个核细胞(PBMCs)对细胞内病原体反应的协议 利用scRNA-seq技术揭示人体免疫系统对多种细胞内病原体的复杂相互作用 NA 揭示人体免疫系统对细胞内病原体的复杂相互作用 人体外周血单个核细胞(PBMCs)对细胞内病原体的免疫反应 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
21114 2024-08-08
Landscape of Immune Cells Heterogeneity in Liver Transplantation by Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了肝移植中免疫细胞异质性的全景图 首次在人类肝移植中发现CD4+CD8+FOXP3+ T细胞亚群,并识别LDLR作为激活MDSC的新标志物,以防止肝移植排斥反应 NA 揭示肝移植排斥反应的潜在机制 肝移植中的T细胞、NK细胞、B细胞和髓样细胞亚群 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及人类肝和血液中的多种免疫细胞亚群
21115 2024-08-08
Single-Cell RNA Sequencing Profiles Identify Important Pathophysiologic Factors in the Progression of Diabetic Nephropathy
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析糖尿病肾病中的细胞类型和病理生理因子 首次通过单细胞RNA测序技术识别糖尿病肾病中的关键细胞类型和病理生理因子 研究样本量较小,仅包括三个人类糖尿病肾病样本和三个对照样本 旨在识别糖尿病肾病进展中的细胞类型和病理生理因子 人类糖尿病肾病样本和对照样本中的细胞类型及其基因表达 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 三个人类糖尿病肾病样本和三个对照样本
21116 2024-08-08
Intercellular Communication-Related Molecular Subtypes and a Gene Signature Identified by the Single-Cell RNA Sequencing Combined with a Transcriptomic Analysis
2022, Disease markers
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序结合转录组分析,识别了肺腺癌中的细胞类型,并筛选了细胞间通讯相关的基因,进而构建了一个新的预后风险模型。 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了肺腺癌中的细胞类型,并基于细胞间通讯相关基因开发了一个新的预后风险模型。 NA 识别肺腺癌中的细胞类型,并开发基于细胞间通讯相关基因的预后风险模型。 肺腺癌患者的肿瘤微环境中的细胞类型和细胞间通讯相关基因。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 LASSO Cox回归分析 RNA-seq数据 8170个细胞样本
21117 2024-08-08
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Dysregulated Cell-Cell Interactions in a Tumor Microenvironment Related to HCC Development
2022, Disease markers
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境中细胞间相互作用(CCE)的失调情况 本研究构建了肿瘤微环境的CCE景观,并识别了在HCC中失调的细胞类型和改变的分子功能,提取了基于CCE的免疫调节网络,并确定了基于CCE基因的预后标志 NA 揭示从健康供体到HCC的肝脏组织中CCE的差异 健康供体、癌旁非肿瘤组织和HCC的单细胞RNA测序数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 约62000个细胞
21118 2024-08-08
Heterogeneous Skeletal Muscle Cell and Nucleus Populations Identified by Single-Cell and Single-Nucleus Resolution Transcriptome Assays
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文通过单细胞和单核分辨率转录组测定法,研究了骨骼肌细胞和细胞核的异质性 单核RNA测序(snRNA-seq)不仅作为单细胞RNA测序(scRNA-seq)的替代方法,而且作为一种新颖的方法,为多核细胞如肌纤维提供了有价值的见解 NA 探讨单细胞和单核分辨率转录组测定法在骨骼肌研究中的应用 骨骼肌细胞、肌纤维及其细胞核 基因组学 肌肉疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学 NA 转录组数据 涉及卫星细胞、肌母细胞、肌管和肌纤维等多种细胞类型
21119 2024-08-08
Identification of Transcriptional Heterogeneity and Construction of a Prognostic Model for Melanoma Based on Single-Cell and Bulk Transcriptome Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞和批量转录组分析探索黑色素瘤细胞亚群的肿瘤内异质性,并构建了一个预测黑色素瘤患者预后的诺模图工具 首次通过单细胞RNA测序数据分析黑色素瘤细胞亚群的异质性,并开发了一种新的诺模图工具来预测黑色素瘤患者的预后 NA 探索黑色素瘤的转录异质性并构建预后模型 黑色素瘤细胞亚群及其临床预后 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了来自TCGA数据集的黑色素瘤患者样本
21120 2024-08-08
Deciphering Innate Immune Cell-Tumor Microenvironment Crosstalk at a Single-Cell Level
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了基于单细胞技术在肿瘤微环境中对先天免疫细胞亚型及其功能的最新研究进展 利用单细胞RNA测序技术解析肿瘤微环境中先天免疫细胞的转录组,为癌症免疫治疗提供了新的见解 NA 总结先天免疫细胞在肿瘤微环境中的亚型和功能,并探讨如何利用这些细胞进行癌症免疫治疗 肿瘤微环境中的先天免疫细胞,包括树突状细胞、单核细胞/巨噬细胞、自然杀伤细胞和先天淋巴细胞 NA 癌症 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
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