单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 21041 - 21060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21041 | 2024-08-08 |
Prostaglandin E2 Exerts Biphasic Dose Response on the PreBötzinger Complex Respiratory-Related Rhythm
2022, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2022.826497
PMID:35669453
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研究论文 | 研究前列腺素E2（PGE2）对preBötzinger复合体呼吸相关节律的双相剂量反应 | 首次揭示了PGE2在不同浓度下对呼吸节律的双相影响，并阐明了EP2和EP3受体在其中的作用机制 | 研究主要基于离体脑片实验，未来需在活体模型中验证结果 | 探讨PGE2在炎症过程中对呼吸功能的影响及其分子机制 | PGE2对preBötzinger复合体呼吸节律的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 21042 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed Subtype-Specific Tumor Immune Microenvironments in Human Glioblastomas
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.914236
PMID:35669791
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了7名人类胶质母细胞瘤患者的手术切除肿瘤样本，揭示了肿瘤亚型特异性的免疫微环境 | 首次系统性地描述了不同肿瘤亚型与非恶性细胞之间的相互作用，以及它们如何共同塑造肿瘤微环境 | 研究样本仅限于7名患者，可能不足以代表所有胶质母细胞瘤的情况 | 探究人类胶质母细胞瘤中肿瘤亚型特异性的免疫微环境 | 人类胶质母细胞瘤的肿瘤亚型及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 7名胶质母细胞瘤患者 |
| 21043 | 2024-08-08 |
APOBEC-mediated mutagenesis is a favorable predictor of prognosis and immunotherapy for bladder cancer patients: evidence from pan-cancer analysis and multiple databases
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.73235
PMID:35673559
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研究论文 | 本研究通过一系列生物信息学和统计学方法，全面分析了包括全外显子测序、靶向下一代测序、转录组（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq）、免疫特征、免疫检查点阻断潜力、患者生存和药物敏感性等多层次数据，揭示了APOBEC及其突变在泛癌尤其是膀胱癌中的分布特征和临床意义。 | 本研究首次在泛癌背景下探讨了APOBEC突变与膀胱癌患者预后和免疫治疗反应的关系，并利用机器学习方法建立了与APOBEC突变相关的预后模型。 | 研究主要基于数据库和现有数据进行分析，未来需要更多的临床试验和前瞻性研究来验证这些发现。 | 探讨APOBEC介导的突变在泛癌尤其是膀胱癌中的生物学特征和临床相关性。 | APOBEC家族介导的突变在膀胱癌中的分布特征和临床意义。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 全外显子测序(WES)、靶向下一代测序(NGS)、RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 多个膀胱癌队列 |
| 21044 | 2024-08-08 |
Spatial maps of hepatocellular carcinoma transcriptomes reveal spatial expression patterns in tumor immune microenvironment
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.71873
PMID:35673582
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研究论文 | 本研究利用空间转录组测序技术分析肝细胞癌样本，揭示了肿瘤免疫微环境中免疫细胞的空间表达模式 | 首次揭示了肝细胞癌中免疫细胞在肿瘤微环境中的空间表达模式，并验证了关键分子如CCL15、CCL19和CCL21的功能机制 | 研究仅基于两个肝细胞癌样本，可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 探索肝细胞癌中肿瘤免疫微环境的空间表达模式及其临床意义 | 肝细胞癌样本中的免疫细胞及其空间表达模式 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组测序(ST) | NA | 转录组数据 | 7553个spots，分为15个亚群 |
| 21045 | 2024-08-08 |
Flexible copula model for integrating correlated multi-omics data from single-cell experiments
2023-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13701
PMID:35622236
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研究论文 | 本文提出了一种基于copula的灵活框架，用于整合来自单细胞实验的相关多组学数据，并研究其相关性 | 提出的方法能够独立于边际分布建模协变量依赖的相关结构，并能联合多种单变量边际分布 | NA | 研究多组学数据中不同数据类型之间的关联及其随其他因素（如细胞类型和基因调控元件）的变化 | 单细胞RNA测序、染色质可及性和DNA甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析、DNA甲基化分析 | copula模型 | 多组学数据 | NA |
| 21046 | 2024-08-05 |
Revealing cell vulnerability in Alzheimer's disease by single-cell transcriptomics
2023-04, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2022.05.007
PMID:35623983
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综述 | 本篇文章回顾了成功应用单细胞转录组学研究阿尔茨海默病中细胞特异性的基因表达程序和途径 | 通过整合分子分析，揭示了阿尔茨海默病大脑中的细胞特异性转录组和生物网络 | 在更大的人类阿尔茨海默病队列中实施标准化协议仍是一个挑战 | 深入理解阿尔茨海默病的致病机制 | 阿尔茨海默病患者大脑的细胞特异性转录组 | 数字病理学 | 老年痴呆症 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21047 | 2024-08-05 |
AP-1 activation mediates post-natal cardiomyocyte maturation
2023-03-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac088
PMID:35640820
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研究论文 | 本研究表明AP-1转录因子在出生后心肌细胞成熟中的作用 | 首次提供证据表明AP-1转录因子在出生后心肌细胞成熟中发挥功能 | 研究主要基于大鼠模型，可能对人类心肌细胞的适用性有限 | 探讨调控心肌细胞成熟的关键分子机制 | 新生大鼠心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 大鼠心脏样本，出生后第1天和第7天 |
| 21048 | 2024-08-08 |
Comparative single-cell RNA-sequencing profiling of BMP4-treated primary glioma cultures reveals therapeutic markers
2022-12-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac143
PMID:35639831
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了BMP4处理后的原代胶质瘤细胞培养物，揭示了治疗相关的标记物 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，分析了BMP4处理后胶质母细胞瘤细胞的反应，并提出了预测性的正向和早期反应标记物 | NA | 研究BMP4处理后胶质母细胞瘤细胞的反应，并寻找治疗相关的标记物 | BMP4处理后的原代胶质瘤细胞培养物 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 17个BMP4处理的病人来源的胶质母细胞瘤培养物 |
| 21049 | 2024-08-08 |
Dissecting B/Plasma Cells in Periodontitis at Single-Cell/Bulk Resolution
2022-10, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221099442
PMID:35620808
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研究论文 | 本研究通过单细胞和整体组织水平分析，揭示了牙周炎中B/浆细胞的浸润过程及其在分子诊断中的潜在应用 | 首次在单细胞水平上对牙周炎中的15种免疫细胞类型进行分类，并进行了细胞间通信分析，揭示了B/浆细胞在牙周炎中的两种不同细胞命运 | 研究主要集中在免疫细胞和分子水平，对牙周炎的宏观和组织学层面的理解仍有待深入 | 探讨牙周炎中B/浆细胞的浸润过程及其在分子诊断中的应用 | 牙周炎中的B/浆细胞及其与其他免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞转录组分析 | 机器学习 | 转录组数据 | 68名健康个体与235名牙周炎患者的大规模公共队列，以及12名健康个体与7名牙周炎患者的独立验证队列 |
| 21050 | 2024-08-08 |
Scalable single-cell RNA sequencing from full transcripts with Smart-seq3xpress
2022-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01311-4
PMID:35637418
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研究论文 | 本文介绍了Smart-seq3xpress方法，该方法通过简化Smart-seq3协议，减少了试剂使用并提高了细胞通量，实现了高细胞通量的单细胞RNA测序，同时保持了全转录本覆盖。 | Smart-seq3xpress方法在保持高细胞通量的同时，提供了全转录本覆盖，揭示了细胞类型相关的异构体变异。 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，以提高细胞通量并保持全转录本覆盖。 | 外周血单个核细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 外周血单个核细胞 |
| 21051 | 2024-08-08 |
Inference of cell state transitions and cell fate plasticity from single-cell with MARGARET
2022-08-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac412
PMID:35639499
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研究论文 | 本文介绍了MARGARET方法，用于从单细胞RNA-seq数据中推断细胞状态转换和细胞命运可塑性 | MARGARET使用深度无监督度量学习和图划分方法，基于一种新的连接性度量，重建复杂的轨迹拓扑结构，自动检测终端细胞状态，并推广了复杂拓扑中命运可塑性的量化 | NA | 开发一种新的方法来准确重建细胞状态流形和细胞命运可塑性，特别是在复杂拓扑结构中 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞状态转换和细胞命运可塑性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | 包括合成和真实数据集，以及包含约百万个细胞的大规模scRNA-seq数据集 |
| 21052 | 2024-08-08 |
KIF2C affects sperm cell differentiation in patients with Klinefelter syndrome, as revealed by RNA-Seq and scRNA-Seq data
2022-08, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13446
PMID:35622500
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研究论文 | 本研究利用RNA测序和单细胞RNA测序数据，分析了Klinefelter综合征患者与正常人群的转录组差异，以识别与Klinefelter综合征发生相关的基因生物标志物。 | 首次发现KIF2C基因在Klinefelter综合征患者的精子细胞分化和发育中起关键作用。 | 研究仅基于公开数据库中的数据，未进行体内实验验证。 | 揭示Klinefelter综合征的分子机制。 | Klinefelter综合征患者的精子细胞分化和发育。 | 基因组学 | 生殖系统疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 700个差异表达基因 |
| 21053 | 2024-08-08 |
Single cell versus single nucleus: transcriptome differences in the murine kidney after ischemia-reperfusion injury
2022-08-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00453.2021
PMID:35635323
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研究论文 | 本文系统评估了单细胞RNA测序（scRNAseq）和单核RNA测序（snRNAseq）在小鼠肾脏缺血再灌注损伤后转录组分析中的差异 | 首次系统比较了scRNAseq和snRNAseq在研究小鼠肾脏缺血再灌注损伤后细胞类型发现中的方法学差异 | 研究仅限于小鼠肾脏组织，且未探讨两种技术在其他器官或疾病中的应用 | 探讨单细胞和单核RNA测序技术在研究小鼠肾脏缺血再灌注损伤后的差异 | 小鼠肾脏组织在缺血再灌注损伤后的细胞类型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）和单核RNA测序（snRNAseq） | NA | 转录组数据 | 包括对照组肾脏组织和轻度（17分钟夹闭时间）及重度（27分钟夹闭时间）单侧短暂缺血后1周的肾脏组织 |
| 21054 | 2024-08-08 |
Cellular responses in the FGF10-mediated improvement of hindlimb regenerative capacity in Xenopus laevis revealed by single-cell transcriptomics
2022-Aug, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12795
PMID:35642106
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序探索了FGF10处理后非洲爪蟾后肢芽的细胞反应，以改善其再生能力 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析FGF10处理后的非洲爪蟾后肢芽细胞，发现了新的steap4表达细胞簇和其他细胞类型的基因表达差异 | NA | 研究FGF10如何通过细胞反应改善非洲爪蟾后肢的再生能力 | 非洲爪蟾后肢芽的细胞反应 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21055 | 2024-08-08 |
Multiomics analysis of male infertility†
2022-07-25, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac109
PMID:35639635
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综述 | 本文综述了利用多组学方法研究男性不育症的最新进展 | 采用全基因组亚硫酸氢盐测序、单细胞RNA测序、全外显子测序和转座酶可及染色质测序等先进技术，对正常与阻塞性和非阻塞性无精症男性进行比较 | 男性不育症的病因和发病机制仍大部分未知 | 总结并批判性地评估基于先进技术对男性不育症的研究成果 | 男性不育症的生物学机制 | NA | 男性不育症 | 全基因组亚硫酸氢盐测序、单细胞RNA测序、全外显子测序、转座酶可及染色质测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 涉及正常、阻塞性和非阻塞性无精症男性样本 |
| 21056 | 2024-08-08 |
Mouse oocytes develop in cysts with the help of nurse cells
2022-07-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.05.001
PMID:35623357
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研究论文 | 本文研究了小鼠卵母细胞在护理细胞的帮助下在囊泡中发育的过程 | 首次展示了护理细胞在小鼠卵母细胞发育过程中的周期性激活及其对细胞质和细胞器的转移作用 | NA | 探讨小鼠卵母细胞发育过程中护理细胞的作用机制 | 小鼠卵母细胞及其护理细胞 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 涉及24个护理细胞和6个卵母细胞 |
| 21057 | 2024-08-08 |
PCGA: a comprehensive web server for phenotype-cell-gene association analysis
2022-07-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac425
PMID:35639771
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研究论文 | 本文介绍了PCGA，一个综合性的网络服务器，用于通过GWAS汇总统计数据联合估计复杂表型的相关组织/细胞类型和易感基因 | PCGA整合了GWAS汇总统计数据和转录组数据，通过收集和处理大量bulk和单细胞RNA测序数据，提供了54个人体组织、2,214个人类细胞类型和4,384个鼠类细胞类型的表达谱，为估计相关组织/细胞类型和基因提供了基础 | NA | 开发一个框架来顺序估计复杂表型的相关组织和细胞类型，并构建一个表型-细胞-基因关联图谱 | 复杂表型的相关组织/细胞类型和易感基因 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个人体组织，2,214个人类细胞类型，4,384个鼠类细胞类型 |
| 21058 | 2024-08-08 |
Up-regulation of cell division cycle 20 expression alters the morphology of neuronal dendritic spines in the nucleus accumbens by promoting FMRP ubiquitination
2022-07, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15649
PMID:35621027
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了成年大鼠伏隔核中由细胞分裂周期20（Cdc20）mRNA表达特征的GABA能神经元亚群，并探讨了Cdc20表达对神经元树突棘形态及大鼠行为的影响。 | 首次揭示了Cdc20在伏隔核GABA能神经元中的表达及其通过促进FMRP泛素化影响树突棘密度和行为表现的机制。 | 研究主要集中在体外和体内实验，未来需进一步验证Cdc20调控FMRP泛素化的具体分子机制及其在神经精神疾病中的潜在作用。 | 探讨Cdc20在伏隔核神经元中的表达及其对神经元形态和行为的影响。 | 成年大鼠伏隔核中的GABA能神经元及Cdc20的表达。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 成年大鼠的伏隔核神经元及发育中的大鼠样本 |
| 21059 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics profiling the compatibility mechanism of As2O3-indigo naturalis formula based on bone marrow stroma cells
2022-Jul, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113182
PMID:35643069
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了雄黄-青黛复方在骨髓基质细胞中的兼容机制及其对急性早幼粒细胞白血病（APL）的治疗效果 | 首次在骨髓基质细胞中研究了雄黄-青黛复方的兼容机制，并通过单细胞RNA测序技术揭示了ATI组合在调节骨髓基质细胞和维持造血微环境稳定中的潜在机制 | NA | 探讨雄黄-青黛复方在骨髓基质细胞中的兼容机制及其对急性早幼粒细胞白血病的治疗效果 | 骨髓基质细胞（BMSCs）和急性早幼粒细胞白血病（APL）模型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21060 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Association Between a Novel GJA5 Variant and Trifascicular Block
2022-07, JACC. Clinical electrophysiology
DOI:10.1016/j.jacep.2022.04.002
PMID:35643807
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |