单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28647 篇文献，本页显示第 21021 - 21040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21021 | 2024-08-08 |
Mechanistic target of rapamycin signaling in human nervous system development and disease
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1005631
PMID:36226315
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综述 | 本文综述了mTOR信号通路在人类神经系统发育和疾病中的关键作用 | 利用单细胞转录组学和大脑类器官技术揭示了mTOR信号在人类皮质发育中的特定作用 | NA | 探讨mTOR信号通路在人类神经系统发育和疾病中的作用 | mTOR信号通路及其在神经系统发育和疾病中的影响 | NA | 神经发育疾病 | 单细胞转录组学，大脑类器官技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21022 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing and establishment of an 8-gene prognostic model for pancreatic cancer patients
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1000447
PMID:36237305
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析胰腺癌中的基因结构和表达数据，并建立了一个包含8个基因的胰腺癌预后模型 | 首次在胰腺癌中应用单细胞测序技术进行深入分析，并成功建立了一个新的胰腺癌预后模型 | 需要进一步的临床验证来确认该模型的准确性和广泛适用性 | 通过单细胞测序技术分析胰腺癌的基因表达，并建立预后模型以预测患者的预后和治疗反应 | 胰腺癌患者的单细胞测序数据和基因表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序（SCS） | LASSO回归 | 基因表达数据 | 涉及多个数据库的胰腺癌单细胞测序数据，包括15个细胞亚群和10种细胞类型 |
| 21023 | 2024-08-08 |
CEP192 is a novel prognostic marker and correlates with the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950884
PMID:36238304
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验方法评估CEP192蛋白在肝细胞癌中的预后和治疗潜力 | 发现CEP192与免疫微环境密切相关，可能作为免疫检查点抑制剂反应的预测因子 | NA | 探索CEP192作为肝细胞癌的新治疗靶点和预后标志物 | CEP192蛋白在肝细胞癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21024 | 2024-08-08 |
The impact of single-cell genomics on the field of mycobacterial infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.989464
PMID:36246265
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学在分枝杆菌感染研究领域的应用及其最新进展 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）及其变体提供了大量个体细胞的无偏转录组测序，超越了传统的“批量”方法，深化了对细胞异质性和动态转录状态的理解 | 尽管单细胞基因组学在生命科学和生物医学研究中应用广泛，但在分枝杆菌感染领域的进展相对有限 | 旨在总结单细胞基因组学在分枝杆菌感染研究中的重要发现，强调不同和最新的单细胞方法，并探讨当前的研究空白和未来的发展潜力 | 研究对象为感染分枝杆菌的宿主细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 大量个体细胞 |
| 21025 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Active Involvement of Macrophage Polarizations in Pulmonary Hypertension
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/5398157
PMID:36246557
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了肺动脉高压中巨噬细胞极化的状态及其在疾病发展中的作用 | 首次揭示了在肺动脉高压早期阶段，巨噬细胞向M2型极化的现象，并验证了其在患者中的存在 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，需要更多临床数据支持 | 探究肺动脉高压中巨噬细胞极化的状态及其在疾病发展中的作用 | 肺动脉高压中的巨噬细胞极化 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型及肺动脉高压患者的肺组织样本 |
| 21026 | 2024-08-08 |
A novel risk score model based on fourteen chromatin regulators-based genes for predicting overall survival of patients with lower-grade gliomas
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.957059
PMID:36246611
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研究论文 | 本文构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型，用于预测低级别胶质瘤患者的总体生存率 | 首次构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型，用于预测低级别胶质瘤患者的预后 | NA | 揭示染色质调控因子在低级别胶质瘤患者中的功能和价值 | 低级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 870个染色质调控因子 |
| 21027 | 2024-08-08 |
Critical role of guanylate binding protein 5 in tumor immune microenvironment and predictive value of immunotherapy response
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.984615
PMID:36246628
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研究论文 | 本研究探讨了鸟苷酸结合蛋白5（GBP5）在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | 首次详细分析了GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境（TME）的关系，并构建了基于GBP5表达的预后模型 | 研究主要基于公开的基因表达数据，可能存在样本选择偏倚；预后模型的外部验证有限 | 探索GBP5在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的33种癌症的RNA测序数据，以及来自Gene Expression Omnibus数据库的单细胞转录组数据 |
| 21028 | 2024-08-08 |
The soldiers needed to be awakened: Tumor-infiltrating immune cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.988703
PMID:36246629
|
研究论文 | 本文综述了肿瘤浸润性免疫细胞（TIICs）在肿瘤微环境中的作用及其在不同肿瘤中的免疫治疗策略 | 介绍了基于TIICs功能开发的各种抗肿瘤策略，如免疫检查点阻断（ICB）、过继细胞疗法（ACT）等，并探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究肿瘤特异性免疫细胞特征中的应用 | NA | 探讨肿瘤浸润性免疫细胞的功能、预后价值及针对不同肿瘤的免疫治疗策略 | 肿瘤浸润性免疫细胞（TIICs）及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 21029 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of immune ferroptosis gene in renal clear cell carcinoma: prognosis and influence of tumor microenvironment
2022, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:36247256
|
研究论文 | 本研究深入探讨了免疫系统与铁死亡在肾透明细胞癌中的作用，识别了预测性生物标志物和治疗靶点。 | 构建了一个新的与免疫铁死亡相关基因的预测模型，该模型在免疫浸润、微环境和免疫逃逸中起重要作用。 | NA | 识别肾透明细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点。 | 肾透明细胞癌患者的预后和肿瘤微环境影响。 | 数字病理学 | 肾癌 | lasso-Cox风险评分模型 | lasso-Cox | 基因表达数据 | 103个免疫铁死亡相关差异表达基因 |
| 21030 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of AIM2 inflammasomes with potential implications for immunotherapy in human cancer: A bulk omics research and single cell sequencing validation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.998266
PMID:36248785
|
研究论文 | 本研究通过大规模组学研究和单细胞测序验证，分析了AIM2炎症小体在泛癌中的作用，并探讨了其对人类癌症免疫治疗的潜在影响。 | 首次在泛癌背景下全面分析AIM2炎症小体，并通过单细胞转录组测序技术验证其在肿瘤微环境中的激活状态。 | 研究主要依赖于公共数据库和单细胞测序数据，可能存在样本选择偏倚和数据解释的局限性。 | 探讨AIM2炎症小体在泛癌中的表达模式、预后意义及其与免疫治疗的相关性。 | AIM2炎症小体及其相关基因在不同癌症中的表达和功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas (TCGA)和The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库中的数据，具体样本数量未详细说明。 |
| 21031 | 2024-08-08 |
Single cell meta-analysis of EndMT and EMT state in COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.976512
PMID:36248845
|
meta-分析 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组，以探究COVID-19中的间质过渡状态 | 首次通过分析公共数据库的单细胞测序数据，识别了早期和晚期的内皮间质过渡（EndMT）和上皮-间质过渡（EMT） | NA | 探究COVID-19患者肺部间质过渡状态及其与纤维化的关系 | 健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体45例，COVID-19患者58例，特发性肺纤维化患者64例 |
| 21032 | 2024-08-08 |
Transcriptional states of CAR-T infusion relate to neurotoxicity - lessons from high-resolution single-cell SOM expression portraying
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.994885
PMID:36248848
|
研究论文 | 本文通过重新分析24名患者的单细胞RNA测序数据，探讨了CAR-T细胞免疫疗法中细胞状态与神经毒性的关系 | 开发了一种单细胞数据描绘工作流程，用于解析单细胞分辨率的转录状态空间，并通过直观的可视化、功能挖掘、分子细胞分层和变异性分析展示了单细胞数据描绘的能力 | NA | 研究CAR-T细胞免疫疗法中的细胞状态与神经毒性的关系 | 24名患者的单细胞RNA测序数据 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 24名患者，超过130,000个细胞 |
| 21033 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals effects of chemotherapy on the immune landscape and TCR/BCR clonal expansion in a relapsed ovarian cancer patient
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.985187
PMID:36248860
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，揭示了化疗对复发性卵巢癌患者免疫景观及TCR/BCR克隆扩增的影响 | 首次在单细胞分辨率下，全面描述了化疗耐药患者在不同治疗阶段肿瘤、腹水和外周血中的多维细胞和免疫学图谱 | 研究仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探讨化疗对复发性卵巢癌患者免疫环境的具体影响，并提出改善化疗引起的免疫损伤的策略 | 复发性化疗耐药的卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 单一患者 |
| 21034 | 2024-08-08 |
Evaluating the role of IDO1 macrophages in immunotherapy using scRNA-seq and bulk-seq in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1006501
PMID:36248886
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序（bulk-seq）分析结直肠癌（CRC）患者，以评估IDO1巨噬细胞在免疫治疗中的作用 | 首次详细分类了结直肠癌中的巨噬细胞亚群，并揭示了IDO1巨噬细胞在不同亚群中的浸润程度差异 | NA | 研究IDO1巨噬细胞在结直肠癌免疫治疗中的作用 | 结直肠癌患者及其巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序（bulk-seq） | NA | RNA序列数据 | 多个结直肠癌患者样本 |
| 21035 | 2024-08-08 |
Metabolic-related gene pairs signature analysis identifies ABCA1 expression levels on tumor-associated macrophages as a prognostic biomarker in primary IDHWT glioblastoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.869061
PMID:36248907
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研究论文 | 本研究通过分析代谢相关基因对签名，确定了肿瘤相关巨噬细胞中ABCA1表达水平作为原发性IDHWT胶质母细胞瘤的预后生物标志物。 | 开发了一种基于代谢相关基因对的预后签名，用于原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的个性化管理。 | NA | 开发一种针对IDHWT胶质母细胞瘤患者的稳健预后签名。 | 原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织和临床数据。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了377个样本，包括204个训练集样本和173个验证集样本。 |
| 21036 | 2024-08-08 |
Expression Analysis of Ligand-Receptor Pairs Identifies Cell-to-Cell Crosstalk between Macrophages and Tumor Cells in Lung Adenocarcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/9589895
PMID:36249427
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了肺腺癌中的配体-受体对表达，揭示了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间对话。 | 首次在肺腺癌中详细分析了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的自分泌和旁分泌网络，并构建了基于细胞间相互作用的机器学习预测模型。 | 研究依赖于已发表文献和公开数据库中的样本，可能存在数据来源的局限性。 | 探索肺腺癌中巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间通信，并识别与患者预后相关的关键基因对。 | 肺腺癌患者的单细胞和批量RNA测序样本，以及巨噬细胞和肿瘤细胞的细胞亚型。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 159,219个单细胞（包括18,248个肿瘤细胞和29,520个巨噬细胞） |
| 21037 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and immunogenicity of chondrocytes via single-cell RNA sequencing technique in human osteoarthritis
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1004766
PMID:36249797
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人骨关节炎中软骨细胞的异质性和免疫原性 | 首次定义了八种具有不同生物学功能的软骨细胞亚型，并发现效应软骨细胞和纤维软骨细胞可能促进骨关节炎的发展 | NA | 探索软骨细胞的生物学功能和标志物，以促进骨关节炎的准确诊断和靶向治疗 | 人骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21038 | 2024-08-08 |
SCAN-IT: Domain segmentation of spatial transcriptomics images by graph neural network
2021-Nov, BMVC : proceedings of the British Machine Vision Conference. British Machine Vision Conference
PMID:36227018
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的方法SCAN-IT，通过将空间域识别问题转化为图像分割问题，利用图神经网络对空间转录组图像进行域分割 | SCAN-IT方法结合了几何建模、图神经网络和DeepGraphInfomax信息学方法，能够处理来自不同空间转录组技术的数据，包括高空间分辨率低基因覆盖率和低空间分辨率高基因覆盖率的数据 | NA | 开发一种新的方法用于空间转录组图像的域分割，以更好地理解和控制生物功能 | 复杂生物组织的空间和功能域分割 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组技术 | 图神经网络 | 图像 | NA |
| 21039 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomic analysis delineates epithelial and mesenchymal subpopulations and transition stages in childhood ependymoma
2023-04-06, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac219
PMID:36215273
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研究论文 | 利用空间转录组学分析了儿童脑肿瘤神经上皮瘤的细胞亚群和转变阶段 | 揭示了儿童神经上皮瘤的细胞组成及其在肿瘤进展中的相互作用 | 研究未说明样本的具体数量和来源 | 加深对儿童神经上皮瘤微环境的理解 | 儿童神经上皮瘤后脑室亚组A（PFA） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21040 | 2024-08-05 |
The heterogeneity of cancer-associated fibroblast subpopulations: Their origins, biomarkers, and roles in the tumor microenvironment
2023-Jan, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15609
PMID:36197901
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研究论文 | 本文探讨了癌症相关成纤维细胞亚群体的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 本研究通过单细胞转录组学策略分析CAFs的不同亚群体及其来源和生物标志物 | 未提及具体的实验数据和样本规模，可能影响结论的普适性 | 旨在深入探讨癌症相关成纤维细胞在不同肿瘤中的角色 | 研究癌症相关成纤维细胞的不同亚群体及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胃癌，结直肠癌，胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |