单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
20981 2024-08-07
Fibroblast subpopulations in Systemic Sclerosis - Functional implications of individual subpopulations and correlations with clinical features
2023-Dec-24, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据以及临床信息,探讨了系统性硬化症(SSc)中个体成纤维细胞亚群的作用及其与临床特征的相关性 本研究首次将成纤维细胞亚群的比例纳入机器学习模型,提高了SSc患者皮肤纤维化进展与稳定性的分类准确性 NA 研究系统性硬化症中成纤维细胞亚群的功能及其与临床特征的相关性 系统性硬化症中的成纤维细胞亚群及其与皮肤纤维化的关系 数字病理学 系统性硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) 机器学习模型 RNA测序数据 PRESS和GENISOS两个队列的样本 NA NA NA NA
20982 2024-08-07
De novo hematopoiesis from the fetal lung
2023-11-28, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本文首次证明胎儿肺是HECs的潜在来源,这些HECs具有进行EHT以产生新生HSPCs及其后代的功能能力 首次描述胎儿肺中的HECs,并证明其能进行EHT产生新生HSPCs,为非骨髓造血提供新视角 NA 探索胎儿肺中HECs的存在及其进行EHT的能力 胎儿肺中的HECs及其进行EHT的能力 生物医学 NA scRNA-seq, 流式细胞术, 小分子调制 NA 细胞 小鼠和人类胎儿肺的组织培养 NA NA NA NA
20983 2024-08-05
Dicoumarol is an effective post-exposure prophylactic for SARS-CoV-2 Omicron infection in human airway epithelium
2023-06-10, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究表明,双香豆素(DCM)对多种Omicron变种的SARS-CoV-2感染具有显著的抗病毒活性 研究揭示了DCM作为一种自然抗凝血剂在抑制SARS-CoV-2的潜在机制,以及其在COVID-19后暴露预防中的有效性 研究未明确DCM对病毒吸收、外排和传播的影响,也未直接消除病毒 探索现有药物在抑制SARS-CoV-2感染中的应用 主要人类气道上皮细胞(AECs) 数字病理学 COVID-19 单细胞测序分析和免疫荧光染色 NA 细胞 77,969个来自10名健康志愿者的细胞 NA NA NA NA
20984 2024-08-05
Spatial transcriptomics in glioblastoma: is knowing the right zip code the key to the next therapeutic breakthrough?
2023, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
review 本文探讨了空间转录组学在胶质母细胞瘤研究中的应用 提出空间转录组学为研究胶质母细胞瘤及其周围脑组织的空间组织提供了新视角 仅讨论了当前的研究现状和未来方向,缺乏实证数据支持 研究空间转录组学在胶质母细胞瘤中的应用以理解其空间组织 胶质母细胞瘤及其与周围脑组织的相互作用 数字病理学 胶质瘤 空间转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
20985 2024-08-07
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-Jan-09, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 研究了蛋白精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)靶向治疗在套细胞淋巴瘤(MCL)中的抗药性问题 发现mTOR信号通路的激活是PRMT5抑制剂抗药性的关键因素,并验证了mTORC1抑制剂temsirolimus在克服PRMT5抑制剂抗药性中的疗效 研究主要基于细胞系和患者来源的异种移植(PDX)模型,需要进一步的临床试验验证 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的抗药性机制及潜在的克服策略 套细胞淋巴瘤细胞系和患者来源的异种移植模型 NA 淋巴瘤 RNA测序 NA RNA 敏感细胞系4个,初级抗性细胞系4个,抗性PDX模型若干 NA NA NA NA
20986 2024-08-07
Enhanced bone regeneration via endochondral ossification using Exendin-4-modified mesenchymal stem cells
2024-Apr, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本文介绍了一种通过Exendin-4修饰的间充质干细胞促进骨再生的策略 提出了过表达Exendin-4的间充质干细胞在骨重塑中的自分泌和旁分泌功能的作用 未提及具体的临床数据支持 研究通过内软骨骨化促进骨再生的潜力 过表达Exendin-4的间充质干细胞 数字病理学 NA NA NA 单细胞测序数据 在大鼠颅骨缺损模型中使用 NA NA NA NA
20987 2024-08-05
Integrated analysis of single-cell sequencing and weighted co-expression network identifies a novel signature based on cellular senescence-related genes to predict prognosis in glioblastoma
2024-Feb, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 该文章探讨了细胞衰老相关基因在预后预测中的应用,特别是在胶质母细胞瘤中 本研究通过整合单细胞测序和加权共同表达网络分析,识别出一种新的与细胞衰老相关的基因签名,用于预测胶质母细胞瘤的预后 研究限制在于样本可能存在的偏倚及未完全考虑的潜在影响因素 本研究旨在揭示细胞衰老对胶质母细胞瘤患者预后的影响 研究对象为胶质母细胞瘤患者的基因表达和临床数据 数字病理学 胶质母细胞瘤 RNA测序 LASSO回归 基因表达数据 总计选取了150个差异表达基因 NA NA NA NA
20988 2024-08-05
Multidimensional progressive single-cell sequencing reveals cell microenvironment composition and cancer heterogeneity in lung cancer
2024-Feb, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 该文章通过多维逐渐单细胞测序揭示了肺癌的细胞微环境成分和肿瘤异质性。 通过单细胞RNA测序区分了八种不同的细胞类型,揭示了肿瘤微环境的显著肿瘤内异质性,并发现了潜在的预测生物标志物。 文章中未提及具体的研究限制。 研究肺癌细胞微环境的组成和肿瘤异质性。 研究对象为19个不同的肺癌肿瘤样本,分析其细胞类型和基因表达模式。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 19个肺癌肿瘤样本 NA NA NA NA
20989 2024-08-07
Single-cell combined with bulk-RNA data reveal a pattern related to angiogenesis in breast cancer patients: Individualized medicine
2024-Feb, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据,揭示了与乳腺癌患者血管生成相关的模式,并构建了个性化治疗模型。 本研究首次综合单细胞和批量RNA测序数据,通过随机森林生存分析构建了预测模型,并在外部验证集中进行了验证。 研究主要集中在三阴性乳腺癌患者,可能不适用于所有乳腺癌亚型。 揭示乳腺癌患者血管生成的相关模式,并构建个性化治疗模型。 乳腺癌患者的RNA测序数据和生存数据。 数字病理学 乳腺癌 RNA测序 随机森林 RNA测序数据 1082名乳腺癌患者 NA NA NA NA
20990 2024-08-07
Transcriptome characteristics of epithelial cells from advanced non-small cell lung cancer were revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Feb, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了晚期非小细胞肺癌上皮细胞的转录组特征 首次发现TPI1作为LUAD的新型生物标志物,并揭示了MXD3和GATA4作为潜在的调控转录因子 NA 探索与LUAD患者免疫浸润和生存时间相关的差异表达基因,并预测转录因子以揭示LUAD的分子机制和个体化治疗 晚期非小细胞肺癌的上皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 16种上皮细胞类型 NA NA NA NA
20991 2024-08-07
The single-cell evolution trajectory presented different hypoxia heterogeneity to reveal the carcinogenesis of genes in clear cell renal cell carcinoma: Based on multiple omics and real experimental verification
2024-Feb, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 本研究首次识别了ccRCC中多个与缺氧相关的肿瘤微环境(TME)亚群,并揭示了ANGPTL4在调控ccRCC增殖中的作用 NA 探讨透明细胞肾细胞癌中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及其相关基因和细胞亚群 数字病理学 肾癌 scRNA-seq UMAP, NMF 单细胞RNA测序数据 使用了来自GSE159115数据集的scRNA-seq数据,以及ccRCC细胞系的786-O和Caki细胞 NA NA NA NA
20992 2024-08-07
Adverse effects of gestational diabetes mellitus on fetal monocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jan-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康母亲和妊娠糖尿病(GDM)母亲胎儿脐带血单核细胞的转录组数据,揭示了GDM对胎儿单核细胞的不良影响。 首次揭示了GDM母亲胎儿脐带血中单核细胞的特征性变化,包括炎症相关通路下调和增殖相关通路上调,以及CXCL8+IL1B+亚群的扩增和功能增强。 研究仅限于脐带血单核细胞的分析,未涉及其他组织或细胞类型,可能需要进一步研究以全面理解GDM对胎儿的影响。 探讨妊娠糖尿病对胎儿单核细胞的影响及其潜在机制。 健康母亲和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞。 数字病理学 妊娠糖尿病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 包括健康和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞,以及儿童和青少年外周血单核细胞和动脉粥样硬化斑块中的髓样细胞。 NA NA NA NA
20993 2024-08-07
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了豌豆芽发育及细胞类型特异性响应硼缺乏的情况 相较于传统的整体组织RNA测序分析,本研究能够捕捉到细胞类型特异性的响应,揭示了硼缺乏对植物生理响应的重要性 NA 旨在理解营养胁迫如何影响植物生长,并探索提高作物在营养限制条件下产量的方法 豌豆芽的发育及对硼缺乏的细胞类型特异性响应 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 豌豆芽的顶端细胞 NA NA NA NA
20994 2024-08-07
Author Correction: Longitudinal scRNA-seq analysis in mouse and human informs optimization of rapid mouse astrocyte differentiation protocols
2024-Jan, Nature neuroscience IF:21.2Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
20995 2024-08-07
Single-cell analysis identifies phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase as a target in ulcerative colitis
2023-Dec-28, World journal of gastroenterology IF:4.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析溃疡性结肠炎患者的细胞互作和分子特征,发现磷赖氨酸磷组氨酸无机焦磷酸磷酸酶(LHPP)在炎症调控中的潜在作用。 本研究首次揭示了LHPP在溃疡性结肠炎中的下调与炎症反应的负相关性,并提出LHPP作为治疗溃疡性结肠炎的潜在靶点。 NA 利用单细胞RNA测序技术解析溃疡性结肠炎病理中的细胞互作和分子特征。 溃疡性结肠炎患者的细胞和分子机制。 数字病理学 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 溃疡性结肠炎患者的组织和血浆样本 NA NA NA NA
20996 2024-08-05
Single-cell Analysis Reveals Inter- and Intratumour Heterogeneity in Metastatic Breast Cancer
2023-12-08, Journal of mammary gland biology and neoplasia IF:3.0Q2
研究论文 本研究揭示了转移性乳腺癌中的肿瘤间和肿瘤内异质性 首次通过单细胞RNA测序识别了与转移相关的分子机制,尤其是在肿瘤和转移细胞状态之间的平衡 未深入探讨所有潜在的分子机制,且样本来源于特定的患者衍生模型 识别转移过程中,特别是在肿瘤细胞群体形成过程中分子机制 乳腺癌患者衍生异种移植物的肿瘤及匹配的肺宏转移 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) NA RNA数据 来源于五种转移性乳腺癌模型的样本 NA NA NA NA
20997 2024-08-07
Regulating the cell shift of endothelial cell-like myofibroblasts in pulmonary fibrosis
2023-06, The European respiratory journal
研究论文 本研究通过创建新的肺纤维化小鼠模型,发现并证实了正常肺组织中存在一种未知的内皮细胞样肌成纤维细胞,并探讨了其在肺纤维化中的作用及机制 首次发现并证实了正常肺组织中的内皮细胞样肌成纤维细胞,并揭示了其在肺纤维化中的作用机制 NA 揭示内皮细胞样肌成纤维细胞在肺纤维化中的分化机制,并探索新的治疗策略 内皮细胞样肌成纤维细胞及其在肺纤维化中的作用 NA 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 转录组 小鼠模型及人类肺纤维化样本 NA NA NA NA
20998 2024-08-05
Retracted: Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
撤回 该文章涉及对肌腱损伤发病机制的单细胞转录组学分析 NA NA 研究肌腱损伤的发病机制 肌腱损伤的单细胞转录组数据 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
20999 2024-08-05
New perspectives on biology, disease progression, and therapy response of head and neck cancer gained from single cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2023, Oncology research IF:2.0Q3
综述 本综述探讨了单细胞RNA测序和空间转录组学在头颈癌中的应用 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法,揭示了肿瘤微环境中不同细胞群体之间的异质性和细胞间通信 未提及特定的实验或临床数据,可能限制了理论与实际的结合 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学对头颈癌的认识 头颈鳞状细胞癌及其微环境中的细胞类型和相互作用 数字病理学 头颈癌 单细胞RNA测序和空间转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
21000 2024-08-07
GAPDH: unveiling its impact as a key hypoxia-related player in head and neck squamous cell carcinoma tumor progression, prognosis, and therapeutic potential
2023, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:38187058
研究论文 本文探讨了糖酵解酶GAPDH在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用,特别是在不同缺氧条件下的功能和治疗潜力 首次详细分析了GAPDH在HNSCC中的表达与患者生存率、免疫细胞浸润及药物疗效的关系 研究主要基于现有数据库和细胞系实验,未涉及临床试验验证 揭示GAPDH在HNSCC中的生物学功能及其对肿瘤进展、预后和治疗潜力的影响 GAPDH在HNSCC中的表达及其与缺氧条件的关系 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 RNA测序 NA 基因表达数据 使用了来自TCGA、GSE29330、GSE41613和GSE139324等多个数据库的数据 NA NA NA NA
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