单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2081 - 2100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2081 | 2025-10-06 |
Immune signatures of megakaryocytes in persistent inflammation-immunosuppression and catabolism syndrome
2025-May-30, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025087
PMID:40443348
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析持续性炎症-免疫抑制和分解代谢综合征患者中巨核细胞的免疫特征 | 首次在PICS中鉴定出五个巨核细胞亚群并揭示其通过CCL5表达和细胞间相互作用调节免疫稳态的新机制 | 样本量较小(11例患者)，需要更大规模研究验证 | 探究巨核细胞在PICS中的免疫学作用和分子特征 | 巨核细胞 | 单细胞生物学 | 脓毒症相关免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例患者(6例PICS, 5例脓毒症)和5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2082 | 2025-10-06 |
EryDB: A Transcriptomic Profile Database for Erythropoiesis and Erythroid-related Diseases
2025-May-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae029
PMID:39436241
|
研究论文 | 介绍EryDB——一个专门用于红细胞生成和红细胞相关疾病转录组数据收集、整合、分析和可视化的开放数据库 | 开发了首个专门针对红细胞生成和红细胞相关疾病的综合性转录组数据库，整合了跨物种、组织和疾病的大规模数据 | 数据库目前仅包含三个物种的数据，可能无法覆盖所有红细胞相关疾病类型 | 构建一个全面整合的转录组数据库以促进红细胞生成和红细胞相关疾病的研究 | 红细胞生成过程和红细胞相关疾病 | 生物信息学 | 红细胞相关疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3803个样本和1,187,119个单细胞，来自107项公共研究 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2083 | 2025-10-06 |
Systematic reconstruction of molecular pathway signatures using scalable single-cell perturbation screens
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01622-z
PMID:40011560
|
研究论文 | 本研究利用单细胞扰动测序技术系统重建分子通路特征 | 开发了改进的计算框架Mixscale处理扰动效率的细胞变异，并优化了差异表达基因列表和保守分子特征的学习方法 | NA | 系统识别信号调节因子在不同生物环境中的靶标 | 六种细胞系和五种生物信号环境中的1500多个扰动 | 功能基因组学 | NA | Perturb-seq, 组合索引, 下一代测序 | Mixscale计算框架 | 单细胞测序数据 | 超过1500个扰动，涉及六种细胞系 | NA | 单细胞测序, 扰动测序 | NA | NA |
| 2084 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing and Analysis Provide a New Approach for the Treatment of Small Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Cervix
2025, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000542833
PMID:39602898
|
研究论文 | 首次通过单细胞转录组测序揭示宫颈小细胞神经内分泌癌的分子特征和肿瘤微环境 | 首次对宫颈小细胞神经内分泌癌进行单细胞转录组测序，揭示其细胞分子图谱和肿瘤进展途径 | 仅分析单个患者肿瘤样本，样本量较小 | 研究宫颈小细胞神经内分泌癌的分子特征、起源和发病机制 | 宫颈小细胞神经内分泌癌患者肿瘤组织和健康宫颈组织 | 单细胞测序 | 宫颈小细胞神经内分泌癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例SCNECC患者肿瘤样本+1例公共数据库健康宫颈组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2085 | 2025-10-06 |
PD-L2 drives resistance to EGFR-TKIs: dynamic changes of the tumor immune environment and targeted therapy
2024-Sep, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01317-2
PMID:38816578
|
研究论文 | 本研究揭示了PD-L2通过调节肿瘤免疫环境驱动EGFR-TKIs耐药的新机制，并发现天然小分子抑制剂十一烯酸锌可逆转耐药 | 首次发现PD-L2动态变化是EGFR-TKIs获得性耐药的关键驱动因素，并鉴定出天然小分子PD-L2抑制剂十一烯酸锌 | 研究主要基于细胞系和同源肿瘤小鼠模型，尚未在临床患者中验证 | 探索EGFR-TKIs耐药机制并开发克服耐药的新策略 | EGFR突变肿瘤细胞系和同源肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据，实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2086 | 2025-10-06 |
Prominent role of gut dysbiosis in the pathogenesis of cystic fibrosis-related liver disease in mice
2024-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.041
PMID:38554847
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了肠道菌群失调在囊性纤维化相关肝病发病机制中的关键作用 | 首次证明肠道CFTR缺陷通过维持致病性微生物群、创造炎症环境和改变肠道通透性，成为CFLD发展的必要共因子 | 研究基于小鼠模型，需要在人类患者中进行临床验证 | 探究肠-肝轴在囊性纤维化相关肝病发病机制中的作用 | 野生型小鼠、全身性Cftr敲除小鼠和肠道校正小鼠 | NA | 囊性纤维化相关肝病 | 单细胞RNA测序, 16S核糖体RNA测序, 蛋白质组阵列, FITC-葡聚糖检测 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据, 蛋白质组数据 | 三种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 2087 | 2025-10-06 |
Sex-specific effects of injury and beta-adrenergic activation on metabolic and inflammatory mediators in a murine model of post-traumatic osteoarthritis
2024-Sep, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.03.109
PMID:38527663
|
研究论文 | 本研究探讨了在小鼠创伤后骨关节炎模型中，β-肾上腺素能受体激活对代谢和炎症介质的性别特异性影响 | 首次揭示了β-肾上腺素能受体激活在创伤后骨关节炎中具有性别特异性作用，女性小鼠对治疗更敏感 | 研究仅使用小鼠模型，结果需在人类中验证；代谢组学变化未受异丙肾上腺素显著影响 | 研究β-肾上腺素能受体激活对创伤后骨关节炎代谢和炎症过程的调节作用 | 12周龄雄性和雌性小鼠的膝关节组织（髌下脂肪垫和滑膜） | 骨关节炎研究 | 创伤后骨关节炎 | 组织学分析、多重基因表达分析、滑液代谢组学、机械性异常疼痛测试、单细胞RNA-seq数据分析 | 小鼠创伤后骨关节炎模型 | 基因表达数据、代谢组学数据、组织学图像、行为数据 | 12周龄雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2088 | 2025-10-06 |
Inhibition of Renin Expression Is Regulated by an Epigenetic Switch From an Active to a Poised State
2024-Sep, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本研究揭示了肾素表达抑制通过表观遗传开关从活跃状态转变为预备状态的调控机制 | 首次发现肾素表达抑制涉及从活跃状态到预备状态的表观遗传转换，并关联细胞间通讯减少和上皮-间质转化 | 研究仅使用小鼠来源的As4.1肿瘤细胞系，未在原发性细胞或体内模型中验证 | 探究肾素表达抑制的表观遗传调控机制 | 小鼠肾小球旁细胞来源的As4.1肿瘤细胞系 | 表观遗传学 | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序, CUT&Tag, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组学数据, 表观基因组数据, 转录组数据 | As4.1细胞系的生物学重复样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, CUT&Tag | NA | NA |
| 2089 | 2025-10-06 |
Reversal of injury-associated retinal ganglion cell gene expression by a phosphodiesterase anchoring disruptor peptide
2024-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110017
PMID:39097072
|
研究论文 | 本研究探讨了通过干扰磷酸二酯酶锚定来逆转损伤相关视网膜神经节细胞基因表达的机制 | 首次证明通过表达修饰的PDE4D3 N端肽4D3(E)能够逆转视神经损伤诱导的基因表达变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证 | 探索PDE4D3位移促进神经保护作用的分子机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2090 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Flow Cytometry Panel for Analysis of Idiopathic Subglottic Stenosis
2024-Sep, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.754
PMID:38606634
|
研究论文 | 本文提出了一种用于分析特发性声门下狭窄的综合流式细胞术检测方案 | 开发了针对iSGS的全面流式细胞术检测组合，首次系统描述了iSGS瘢痕组织的细胞特征 | 样本量较小（9对样本），单中心研究 | 建立特发性声门下狭窄的流式细胞术检测平台并分析其细胞组成 | 特发性声门下狭窄患者的正常组织和瘢痕组织样本 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 9对正常和瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2091 | 2025-10-06 |
Machine learning-based gene expression biomarkers to distinguish Zika and Dengue virus infections: implications for diagnosis
2024-Sep, Virusdisease
DOI:10.1007/s13337-024-00885-8
PMID:39464736
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别能够区分寨卡病毒和登革热病毒感染的基因表达生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序数据和多种机器学习算法来识别区分寨卡和登革热病毒感染的基因生物标志物 | 仅分析了24小时时间点的数据，且需要进一步的实验验证 | 开发基于基因表达特征的寨卡和登革热病毒感染诊断方法 | 人类肝癌细胞系Huh7感染寨卡病毒和登革热病毒后的基因表达数据 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 逻辑回归，支持向量机，随机森林，决策树 | 基因表达数据 | GSE110496数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2092 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal R-loop accumulation orchestrates microenvironmental remodeling after spinal cord injury
2025-Oct-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107055
PMID:40789519
|
研究论文 | 本研究首次报道了脊髓损伤后R-loop积累通过神经炎症驱动神经退行性变的机制 | 首次发现R-loop在脊髓损伤中的时空积累模式及其通过神经炎症驱动神经退行性变的作用 | 研究样本量有限，仅使用剪切挫伤模型，需要进一步验证其他损伤模型 | 探究R-loop在脊髓损伤进展中的潜在作用机制 | 小鼠脊髓损伤模型中的新鲜脊髓组织 | 空间转录组学 | 脊髓损伤 | 空间转录组学,免疫荧光染色,单细胞分析,HE/LFB染色 | 细胞反卷积计算模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | 损伤腔区50-100mg新鲜脊髓组织，采集时间点为损伤后0,1,3,7,14天 | NA | 空间转录组学,单细胞分析 | NA | NA |
| 2093 | 2025-10-06 |
Unveiling the role of TAM-derived extracellular vesicles in glioma progression through Treg polarization and immune suppression
2025-Sep, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03497-8
PMID:40681801
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞来源的细胞外囊泡通过调节Treg细胞分化和免疫抑制促进胶质瘤进展的机制 | 首次发现TAM来源的EVs通过下调BPI蛋白表达诱导Treg分化，并证实其在胶质瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证尚不充分 | 阐明TAM来源的细胞外囊泡在胶质瘤进展中的作用机制 | 胶质瘤肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞和调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2094 | 2025-10-06 |
Natural small molecule bergapten ameliorates rheumatoid arthritis by targeting STAT3
2025-Sep, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107878
PMID:40714303
|
研究论文 | 研究发现天然小分子佛手柑素通过靶向STAT3改善类风湿关节炎 | 首次发现天然小分子佛手柑素可通过直接结合STAT3抑制其磷酸化和激活，从而发挥抗类风湿关节炎作用 | 仅部分阐明了佛手柑素的抗炎机制，可能还存在其他作用途径 | 探索佛手柑素治疗类风湿关节炎的疗效和分子机制 | 胶原诱导性关节炎大鼠模型、滑膜组织中的成纤维样滑膜细胞和巨噬细胞 | 生物医学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胶原诱导性关节炎大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2095 | 2025-10-06 |
From molecular chaos to precision medicine in the treatment of cardiac hypertrophy: A rational use of natural products by integrating artificial intelligence and multi-omics data
2025-Sep, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107898
PMID:40754044
|
综述 | 本文提出通过整合天然产物、人工智能和多组学技术治疗心脏肥大的创新方法 | 首次将天然产物与人工智能和多组学技术相结合，系统阐述心脏肥大的精准医疗策略 | NA | 探索心脏肥大的精准药物治疗新策略 | 心脏肥大的分子机制和天然产物治疗 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学，多组学技术 | 机器学习算法 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 2096 | 2025-10-06 |
Immunoregulatory Endothelial Cells Interact With T Cells After Myocardial Infarction
2025-Aug-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326145
PMID:40735785
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后心脏内皮细胞通过形成免疫调节表型调控T细胞活化的新机制 | 首次发现心肌梗死后出现的CD45+CD11b+Cdh5+免疫调节内皮细胞表型及其通过MHC-II和细胞因子调控T细胞活化的功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究心肌梗死后内皮细胞的免疫调节功能及其机制 | 小鼠心肌梗死模型中的内皮细胞和T细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 骨髓移植, 谱系追踪 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2097 | 2025-10-06 |
Bacterial Infections Shape Cardiac Macrophages' Response to Ischemia
2025-Aug-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325147
PMID:40735767
|
研究论文 | 本研究探讨细菌感染如何通过改变心脏巨噬细胞的特性来增强后续心肌缺血损伤的炎症反应 | 首次发现细菌感染诱导心脏巨噬细胞形成两个具有不同功能特征的新亚群，并证明这些变化会加剧后续缺血损伤的炎症反应 | 研究主要基于动物模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究细菌感染对心脏先天免疫细胞的长期影响及其在后续心肌缺血中的作用机制 | 心脏髓系细胞、外周白细胞、造血干细胞和祖细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、纳米颗粒介导的RNA干扰 | 遗传命运图谱模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2098 | 2025-10-06 |
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1063
PMID:37953308
|
研究论文 | 介绍了一个专门用于造血干细胞命运决定基因功能注释的综合知识库StemDriver | 整合了42项研究的单细胞RNA测序数据，构建了从胚胎期到成年期的全面造血谱系图谱 | NA | 建立造血干细胞命运决定相关基因功能的知识库 | 人类和小鼠的造血干细胞及其分化谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 整合42项研究数据，涵盖14种组织类型，评估人类23,839个基因和小鼠29,533个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2099 | 2025-10-06 |
Amyloid-beta and tau pathologies act synergistically to induce novel disease stage-specific microglia subtypes
2022-12-17, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00589-x
PMID:36536457
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了淀粉样蛋白-β和tau病理在阿尔茨海默病进展中协同诱导新型疾病阶段特异性小胶质细胞亚型 | 首次发现Aβ和tau病理协同作用在疾病不同阶段诱导特异性小胶质细胞亚型EADAM和LADAM，并鉴定Siglec基因作为AD进展的生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 探究阿尔茨海默病中Aβ和tau病理如何协同调控小胶质细胞亚型 | AD模型小鼠的小胶质细胞及人类颞上回和内嗅皮层组织 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, snRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | AD模型小鼠及不同Braak分期的人类脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2100 | 2025-10-06 |
Spatial isoform sequencing at sub-micrometer single-cell resolution reveals novel patterns of spatial isoform variability in brain cell types
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.25.661563
PMID:40667010
|
研究论文 | 本研究开发了亚微米单细胞分辨率空间异构体测序技术Spl-ISO-Seq2，揭示了小鼠大脑细胞类型中新的空间异构体变异模式 | 开发了220nm点大小和500nm分辨率的Spl-ISO-Seq2技术及配套分析软件，首次在单细胞分辨率实现空间异构体测序 | 技术仍处于发展阶段，仅在小鼠脑组织中进行验证，尚未在其他组织或物种中广泛应用 | 研究大脑细胞类型中空间异构体的变异模式 | 成年小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间长读长测序，异构体测序 | NA | 空间转录组数据，异构体表达数据 | 成年小鼠大脑组织样本 | NA | 空间异构体测序 | Spl-ISO-Seq2 | 220nm点大小，500nm分辨率空间异构体测序平台 |