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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2081 | 2025-10-06 |
PROS1-MERTK Axis Drives Tumor Microenvironment Crosstalk and Progression in Papillary Thyroid Microcarcinoma
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413474
PMID:40433916
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了甲状腺微小乳头状癌进展中PROS1-MERTK信号轴的关键调控作用 | 首次发现PROS1-MERTK信号轴通过旁分泌和自分泌机制驱动甲状腺微小乳头状癌进展,并鉴定NFYB和FOXP2为PROS1转录激活因子 | 样本量相对有限(15例患者19个组织标本),需要更大规模研究验证 | 探索甲状腺微小乳头状癌进展的分子机制和生物标志物 | 甲状腺微小乳头状癌患者手术组织标本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体外实验, 体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 15例患者的19个手术组织标本(4个癌旁组织、4个非进展性PTMC、5个进展性PTMC、6个进展性PTC) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2082 | 2025-10-06 |
Comprehensive Characterization of Bihormonal Cells and Endocrine Cell Lineages in Mammalian Pancreatic Islets
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416326
PMID:40439685
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研究论文 | 本研究通过多技术手段全面表征哺乳动物胰岛中的双激素细胞和内分泌细胞谱系 | 首次系统证明双激素细胞并非独特谱系或过渡状态,并重新定义了内分泌细胞分类体系 | 人类胰岛生物学在小鼠模型中的转化存在挑战,物种间存在特异性差异 | 阐明双激素细胞在胰岛中的作用及其在β细胞恢复中的潜力 | 哺乳动物胰腺胰岛细胞,包括小鼠和人类胰岛 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 成像流式细胞术, 双重组酶谱系追踪, 基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 遗传工程小鼠品系和糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2083 | 2025-10-06 |
HLA-DR⁺ Tumor Cells Show an Association with a Distinct Immune Microenvironment and CD8⁺ T-Cell Exhaustion in HBV-Associated Hepatocellular Carcinoma
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502979
PMID:40464412
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和蛋白质水平验证,发现HLA-DR⁺肿瘤细胞是HBV相关肝细胞癌的独特特征,并与免疫抑制微环境和CD8⁺ T细胞耗竭相关 | 首次在HBV相关肝癌中鉴定出HLA-DR⁺肿瘤细胞这一独特亚群,揭示了其与免疫检查点激活和T细胞耗竭的特异性关联 | 研究主要基于回顾性数据分析,需要进一步功能实验验证HLA-DR⁺肿瘤细胞的具体免疫调节机制 | 探究HBV相关肝细胞癌肿瘤微环境的特异性免疫特征和免疫抑制机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和免疫细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 组织芯片 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 160个样本来自124名患者(scRNA-seq), 198个HCC标本(组织验证) | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
2084 | 2025-10-06 |
Real-Time Evolutionary Landscape of the Bronchial Epithelium and Corresponding Dynamic Immune Cell Alterations in Lung Squamous Cell Carcinogenesis
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413256
PMID:40470646
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺鳞状细胞癌发生过程中支气管上皮细胞的实时进化轨迹及相应免疫微环境的动态变化 | 首次在动物模型中系统描绘了从正常肺上皮到浸润性鳞癌的完整进化路径,并发现典型拷贝数变异在增生/化生阶段就已大量出现 | 研究基于大鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明肺鳞状细胞癌发生过程中肿瘤细胞与微环境的共同进化机制 | 大鼠肺组织样本(包括正常肺上皮、增生、化生、异型增生、原位癌和浸润性鳞癌) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育阶段的肺组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2085 | 2025-10-06 |
Mapping the role of cytokine signaling at single-cell and structural resolution in uveal melanoma
2025-Aug, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00337-3
PMID:40490526
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和结构生物学方法揭示了葡萄膜黑色素瘤中细胞因子信号传导的分子复杂性 | 首次结合单细胞RNA测序与AlphaFold 2结构预测技术,系统分析葡萄膜黑色素瘤中细胞因子信号传导相关基因的作用机制 | 样本量相对有限(8个原发肿瘤和3个转移瘤),需要更大规模验证 | 探索葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的复杂性并识别新的治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, AlphaFold 2结构预测, 分子对接分析 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 结构预测数据 | 8个原发葡萄膜黑色素瘤眼组织 + 3个肝转移瘤 + TCGA-UVM和GSE84976队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
2086 | 2025-10-06 |
DNA damage repair (DDR) related prognostic risk model in multiple myeloma based on single-cell and bulk sequencing
2025-Aug, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2025.103857
PMID:40527059
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研究论文 | 基于单细胞和批量测序构建多发性骨髓瘤DNA损伤修复相关预后风险模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据筛选DDR基因,构建多发性骨髓瘤预后风险模型并验证其预测性能 | 未明确说明样本来源和队列规模,缺乏外部验证数据 | 研究DNA损伤修复基因在多发性骨髓瘤中的预后价值并构建风险预测模型 | 多发性骨髓瘤患者及其基因表达数据 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, 差异表达分析 | 预后风险模型, 列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
2087 | 2025-10-06 |
Morphodynamics of human early brain organoid development
2025-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09151-3
PMID:40533563
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研究论文 | 本研究通过长期活体光片显微镜技术结合单细胞转录组分析,揭示人类早期脑类器官发育过程中的形态动力学特征 | 开发了双通道多蛋白标记策略与计算解复用方法,首次实现脑类器官发育过程中不同亚细胞特征的同步量化跟踪 | 研究基于无引导脑类器官模型,可能与实际体内大脑发育存在差异 | 探索人类大脑发育的形态动力学机制和自组织过程 | 人类诱导多能干细胞衍生的脑类器官 | 发育生物学 | NA | 光片显微镜,单细胞RNA测序,荧光标记 | NA | 图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2088 | 2025-10-06 |
[Research advances in perineural invasion of pancreatic cancer]
2025-Aug-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
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综述 | 系统回顾胰腺癌神经侵袭领域的最新研究进展 | 整合了单细胞空间转录组学手术导航策略和靶向神经丛切除联合分子靶向探针的精准技术 | 未涉及具体临床转化中跨学科技术整合的挑战解决方案 | 探索胰腺癌神经侵袭的多维机制及治疗策略 | 胰腺癌神经侵袭的病理特征和生物学过程 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2089 | 2025-10-06 |
Identifying Causal Brain Structures, Genes, and Proteins for Osteoarthritis: A Large-Scale Genetic Correlation Study Based on Brain Imaging-Derived Phenotypes, Transcriptomes, and Proteomes
2025-Jun-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf083
PMID:40247738
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研究论文 | 通过整合脑影像、转录组和蛋白质组数据,识别与骨关节炎风险相关的因果性脑结构、基因和蛋白质 | 首次大规模整合脑影像表型、转录组和蛋白质组数据,系统研究脑-关节轴在骨关节炎遗传机制中的作用 | 研究基于欧洲人群数据,结果在其他种族中的普适性需要验证 | 验证脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性,识别关键因果基因和蛋白质 | 826,690名参与者的骨关节炎GWAS数据、5,138个脑转录组和152个人脑蛋白质组 | 生物信息学 | 骨关节炎 | LDSC, Mendelian randomization, TWAS, PWAS, 单细胞RNA-seq eQTL分析 | 遗传相关性分析模型 | 基因组、转录组、蛋白质组数据 | 826,690名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 转录组关联分析, 蛋白质组关联分析 | NA | NA |
2090 | 2025-10-06 |
Immune signatures of megakaryocytes in persistent inflammation-immunosuppression and catabolism syndrome
2025-May-30, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025087
PMID:40443348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析持续性炎症-免疫抑制和分解代谢综合征患者中巨核细胞的免疫特征 | 首次在PICS中鉴定出五个巨核细胞亚群并揭示其通过CCL5表达和细胞间相互作用调节免疫稳态的新机制 | 样本量较小(11例患者),需要更大规模研究验证 | 探究巨核细胞在PICS中的免疫学作用和分子特征 | 巨核细胞 | 单细胞生物学 | 脓毒症相关免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例患者(6例PICS, 5例脓毒症)和5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2091 | 2025-10-06 |
EryDB: A Transcriptomic Profile Database for Erythropoiesis and Erythroid-related Diseases
2025-May-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae029
PMID:39436241
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研究论文 | 介绍EryDB——一个专门用于红细胞生成和红细胞相关疾病转录组数据收集、整合、分析和可视化的开放数据库 | 开发了首个专门针对红细胞生成和红细胞相关疾病的综合性转录组数据库,整合了跨物种、组织和疾病的大规模数据 | 数据库目前仅包含三个物种的数据,可能无法覆盖所有红细胞相关疾病类型 | 构建一个全面整合的转录组数据库以促进红细胞生成和红细胞相关疾病的研究 | 红细胞生成过程和红细胞相关疾病 | 生物信息学 | 红细胞相关疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3803个样本和1,187,119个单细胞,来自107项公共研究 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
2092 | 2025-10-06 |
Systematic reconstruction of molecular pathway signatures using scalable single-cell perturbation screens
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01622-z
PMID:40011560
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研究论文 | 本研究利用单细胞扰动测序技术系统重建分子通路特征 | 开发了改进的计算框架Mixscale处理扰动效率的细胞变异,并优化了差异表达基因列表和保守分子特征的学习方法 | NA | 系统识别信号调节因子在不同生物环境中的靶标 | 六种细胞系和五种生物信号环境中的1500多个扰动 | 功能基因组学 | NA | Perturb-seq, 组合索引, 下一代测序 | Mixscale计算框架 | 单细胞测序数据 | 超过1500个扰动,涉及六种细胞系 | NA | 单细胞测序, 扰动测序 | NA | NA |
2093 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing and Analysis Provide a New Approach for the Treatment of Small Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Cervix
2025, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000542833
PMID:39602898
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研究论文 | 首次通过单细胞转录组测序揭示宫颈小细胞神经内分泌癌的分子特征和肿瘤微环境 | 首次对宫颈小细胞神经内分泌癌进行单细胞转录组测序,揭示其细胞分子图谱和肿瘤进展途径 | 仅分析单个患者肿瘤样本,样本量较小 | 研究宫颈小细胞神经内分泌癌的分子特征、起源和发病机制 | 宫颈小细胞神经内分泌癌患者肿瘤组织和健康宫颈组织 | 单细胞测序 | 宫颈小细胞神经内分泌癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例SCNECC患者肿瘤样本+1例公共数据库健康宫颈组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2094 | 2025-10-06 |
PD-L2 drives resistance to EGFR-TKIs: dynamic changes of the tumor immune environment and targeted therapy
2024-Sep, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01317-2
PMID:38816578
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研究论文 | 本研究揭示了PD-L2通过调节肿瘤免疫环境驱动EGFR-TKIs耐药的新机制,并发现天然小分子抑制剂十一烯酸锌可逆转耐药 | 首次发现PD-L2动态变化是EGFR-TKIs获得性耐药的关键驱动因素,并鉴定出天然小分子PD-L2抑制剂十一烯酸锌 | 研究主要基于细胞系和同源肿瘤小鼠模型,尚未在临床患者中验证 | 探索EGFR-TKIs耐药机制并开发克服耐药的新策略 | EGFR突变肿瘤细胞系和同源肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2095 | 2025-10-06 |
Prominent role of gut dysbiosis in the pathogenesis of cystic fibrosis-related liver disease in mice
2024-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.041
PMID:38554847
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了肠道菌群失调在囊性纤维化相关肝病发病机制中的关键作用 | 首次证明肠道CFTR缺陷通过维持致病性微生物群、创造炎症环境和改变肠道通透性,成为CFLD发展的必要共因子 | 研究基于小鼠模型,需要在人类患者中进行临床验证 | 探究肠-肝轴在囊性纤维化相关肝病发病机制中的作用 | 野生型小鼠、全身性Cftr敲除小鼠和肠道校正小鼠 | NA | 囊性纤维化相关肝病 | 单细胞RNA测序, 16S核糖体RNA测序, 蛋白质组阵列, FITC-葡聚糖检测 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据, 蛋白质组数据 | 三种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
2096 | 2025-10-06 |
Sex-specific effects of injury and beta-adrenergic activation on metabolic and inflammatory mediators in a murine model of post-traumatic osteoarthritis
2024-Sep, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.03.109
PMID:38527663
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研究论文 | 本研究探讨了在小鼠创伤后骨关节炎模型中,β-肾上腺素能受体激活对代谢和炎症介质的性别特异性影响 | 首次揭示了β-肾上腺素能受体激活在创伤后骨关节炎中具有性别特异性作用,女性小鼠对治疗更敏感 | 研究仅使用小鼠模型,结果需在人类中验证;代谢组学变化未受异丙肾上腺素显著影响 | 研究β-肾上腺素能受体激活对创伤后骨关节炎代谢和炎症过程的调节作用 | 12周龄雄性和雌性小鼠的膝关节组织(髌下脂肪垫和滑膜) | 骨关节炎研究 | 创伤后骨关节炎 | 组织学分析、多重基因表达分析、滑液代谢组学、机械性异常疼痛测试、单细胞RNA-seq数据分析 | 小鼠创伤后骨关节炎模型 | 基因表达数据、代谢组学数据、组织学图像、行为数据 | 12周龄雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2097 | 2025-10-06 |
Inhibition of Renin Expression Is Regulated by an Epigenetic Switch From an Active to a Poised State
2024-Sep, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究揭示了肾素表达抑制通过表观遗传开关从活跃状态转变为预备状态的调控机制 | 首次发现肾素表达抑制涉及从活跃状态到预备状态的表观遗传转换,并关联细胞间通讯减少和上皮-间质转化 | 研究仅使用小鼠来源的As4.1肿瘤细胞系,未在原发性细胞或体内模型中验证 | 探究肾素表达抑制的表观遗传调控机制 | 小鼠肾小球旁细胞来源的As4.1肿瘤细胞系 | 表观遗传学 | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序, CUT&Tag, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组学数据, 表观基因组数据, 转录组数据 | As4.1细胞系的生物学重复样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, CUT&Tag | NA | NA |
2098 | 2025-10-06 |
Reversal of injury-associated retinal ganglion cell gene expression by a phosphodiesterase anchoring disruptor peptide
2024-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110017
PMID:39097072
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研究论文 | 本研究探讨了通过干扰磷酸二酯酶锚定来逆转损伤相关视网膜神经节细胞基因表达的机制 | 首次证明通过表达修饰的PDE4D3 N端肽4D3(E)能够逆转视神经损伤诱导的基因表达变化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞或临床环境中验证 | 探索PDE4D3位移促进神经保护作用的分子机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2099 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Flow Cytometry Panel for Analysis of Idiopathic Subglottic Stenosis
2024-Sep, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.754
PMID:38606634
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研究论文 | 本文提出了一种用于分析特发性声门下狭窄的综合流式细胞术检测方案 | 开发了针对iSGS的全面流式细胞术检测组合,首次系统描述了iSGS瘢痕组织的细胞特征 | 样本量较小(9对样本),单中心研究 | 建立特发性声门下狭窄的流式细胞术检测平台并分析其细胞组成 | 特发性声门下狭窄患者的正常组织和瘢痕组织样本 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 9对正常和瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2100 | 2025-10-06 |
Machine learning-based gene expression biomarkers to distinguish Zika and Dengue virus infections: implications for diagnosis
2024-Sep, Virusdisease
DOI:10.1007/s13337-024-00885-8
PMID:39464736
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别能够区分寨卡病毒和登革热病毒感染的基因表达生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序数据和多种机器学习算法来识别区分寨卡和登革热病毒感染的基因生物标志物 | 仅分析了24小时时间点的数据,且需要进一步的实验验证 | 开发基于基因表达特征的寨卡和登革热病毒感染诊断方法 | 人类肝癌细胞系Huh7感染寨卡病毒和登革热病毒后的基因表达数据 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 逻辑回归,支持向量机,随机森林,决策树 | 基因表达数据 | GSE110496数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |