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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2081 | 2026-03-07 |
Unveiling prognostic genes and regulatory mechanisms of stress granules in gastric cancers: an integrated analysis of bulk transcriptomics and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1750088
PMID:41789004
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组学和单细胞RNA测序数据,揭示了应激颗粒相关基因在胃癌中的预后价值,并构建了一个预测模型 | 首次整合批量转录组学和单细胞RNA测序数据,系统性地识别了胃癌中与应激颗粒相关的预后基因,并构建了具有临床潜力的风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且分子机制尚未通过实验完全阐明 | 识别胃癌中与应激颗粒相关的预后基因,阐明其临床和生物学意义,并验证其作为患者总体生存预测指标的潜力 | 胃癌患者及其转录组和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,批量转录组学分析 | Cox回归风险评分模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,数据来源于公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2082 | 2026-03-07 |
Multi-dimensional evidence establishing the causal association between metabolic syndrome and gout and the molecular mechanisms of comorbidity
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769138
PMID:41789074
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研究论文 | 本研究通过多维方法系统评估了代谢综合征及其组分与痛风的因果关系,并揭示了共病的遗传基础和转录组特征 | 采用三阶段研究设计整合临床队列、孟德尔随机化和转录组数据,首次系统建立了代谢综合征与痛风的因果关联,并提出了TAP2-UPR-Th17病理轴 | 研究主要基于观察性数据和遗传学证据,需要进一步实验验证分子机制 | 评估代谢综合征与痛风的因果关系并揭示其分子机制 | 代谢综合征患者和痛风患者 | 生物信息学 | 痛风 | 单细胞RNA测序,转录组分析,孟德尔随机化 | 倾向评分匹配,限制性立方样条,潜在类别轨迹模型 | 临床数据,遗传数据,转录组数据 | 临床队列8,853例,转录组数据集GSE160170、GSE98895,单细胞RNA测序数据集GSE217561 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2083 | 2026-03-07 |
Bronchoalveolar lavage fluid in immune checkpoint inhibitor-related pneumonitis: from pathophysiological window to a precision diagnostic tool
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1788186
PMID:41789086
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综述 | 本文探讨了支气管肺泡灌洗液在免疫检查点抑制剂相关肺炎中的诊断价值,从病理生理窗口到精准诊断工具 | 提出将BALF分析整合到人工智能框架中以提升诊断精度和指导个性化治疗 | 缺乏标准化的采样和解读方法限制了结果的可重复性和BALF分析在临床实践中的广泛应用 | 改善免疫检查点抑制剂相关肺炎的临床管理,通过理解其生物学基础 | 支气管肺泡灌洗液 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞学、分子和多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2084 | 2026-03-07 |
ScRNA-seq reveals dynamic macrophage heterogeneity in chronic liver disease progression and prognostic biomarkers KLF2/SPP1 in HCC
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1766301
PMID:41789089
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了慢性肝病进展中巨噬细胞的动态异质性,并鉴定出KLF2和SPP1作为肝细胞癌的预后生物标志物 | 构建了阶段解析的细胞图谱,识别了MASH和HCC中特定的巨噬细胞亚型及其转录特征,并开发了基因集富集评分方法来检测预后标志物 | 未直接证明SPP1+巨噬细胞对细胞毒性T细胞的功能抑制或耗竭作用 | 解析慢性肝病过程中的阶段特异性免疫和转录特征,并鉴定预后生物标志物 | 健康肝脏、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎、肝硬化和肝细胞癌的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 整合了健康肝脏、MASH、肝硬化和HCC的单细胞RNA测序数据集,以及TCGA-LIHC临床数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2085 | 2026-03-07 |
Identification of MTURN as a trained immunity-related biomarker for heart failure via integrative transcriptomic machine learning analysis and experimental validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739660
PMID:41789108
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学数据和机器学习算法,识别出MTURN作为与训练免疫相关的心力衰竭生物标志物,并通过实验验证了其与PIEZO1介导的心脏重构的潜在关联 | 首次将训练免疫概念与心力衰竭生物标志物发现相结合,并利用多队列转录组数据整合、机器学习筛选及单细胞RNA-seq分析,系统性地鉴定出MTURN这一新型生物标志物 | 研究主要基于转录组数据,功能机制验证仍需进一步深入;临床样本的异质性可能影响结果的普适性 | 发现可靠的心力衰竭分子生物标志物以促进个性化治疗 | 心力衰竭患者转录组数据、THP-1来源的巨噬细胞训练免疫模型、AC16心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 六种机器学习算法(未具体说明) | 转录组数据 | 五个独立的心力衰竭队列和一个巨噬细胞训练免疫模型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2086 | 2026-03-07 |
[FPCAM: a weighted dictionary-based single-cell annotation model for pulmonary fibrosis]
2025-Jul-23, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250198
PMID:41755618
|
研究论文 | 本文开发了一种名为FPCAM的基于加权字典的单细胞注释模型,专门用于肺纤维化研究,旨在提高细胞类型注释的效率和准确性 | FPCAM整合了多源标记基因数据库与动态更新策略,并采用创新的加权注释算法,实现了高效、灵活且精确的细胞类型识别,克服了现有工具对参考数据集的依赖、标记基因多态性及人工干预引入的主观偏差等限制 | 模型性能评估主要基于与现有工具的比较,可能未涵盖所有复杂细胞亚群或跨平台数据集的全面测试,且依赖于手动整理的肺纤维化相关细胞-基因关联字典,可能引入特定疾病背景的偏差 | 开发一个全自动的单细胞注释工具,以提升肺纤维化等疾病中细胞类型注释的效率和准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 基于Seurat框架的加权字典模型 | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2087 | 2026-03-06 |
A 4-guanidinobutanoic acid-SLC36A1 axis drives a microbiota‒host feedback loop to regulate intestinal homeostasis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2639216
PMID:41782409
|
研究论文 | 本研究揭示了一种由肠道微生物代谢物4-胍基丁酸(4-GBA)驱动的微生物群-宿主反馈环路,该环路通过上调转运蛋白SLC36A1和激活Hedgehog信号通路来调节肠道干细胞功能和杯状细胞分化,从而维持肠道稳态,并为溃疡性结肠炎提供了潜在的治疗靶点 | 首次发现并阐明了一种由特定微生物代谢物(4-GBA)驱动的微生物群-宿主反馈环路,该环路通过SLC36A1转运蛋白和Hedgehog信号通路调节肠道上皮功能与微生物生态,为溃疡性结肠炎提供了新的诊断和治疗靶点 | NA | 探究肠道微生物衍生代谢物在调节肠道黏膜屏障和稳态中的作用机制 | 肠道微生物代谢物4-胍基丁酸(4-GBA)、转运蛋白SLC36A1、肠道干细胞、杯状细胞、小鼠模型、人类溃疡性结肠炎样本 | 单细胞组学 | 溃疡性结肠炎 | 非靶向代谢组学、类器官共培养、单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2088 | 2026-03-06 |
Tumor cell derived CCL20 exacerbates the immunosuppressive microenvironment by recruiting CCR6+ Tregs in pancreatic cancer
2026-Apr-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218290
PMID:41643988
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中肿瘤细胞来源的CCL20通过招募CCR6+ Tregs塑造免疫抑制微环境,并探讨了靶向CCL20-CCR6轴联合免疫检查点阻断的治疗潜力 | 首次在胰腺癌中证实肿瘤细胞来源的CCL20通过招募CCR6+ Tregs驱动免疫抑制,并发现CCR6抑制可增强抗PD1疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;未详细探讨CCL20表达调控的其他机制 | 解析胰腺癌免疫抑制微环境的形成机制,开发新的治疗策略 | 胰腺癌肿瘤微环境中的CCL20-CCR6轴及免疫细胞(Tregs、CD8 T细胞) | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲除小鼠模型 | 基因敲除小鼠模型(CCL20 KO、Treg特异性CCR6 KO) | 基因表达数据、免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2089 | 2026-03-06 |
Kupffer Cell-Derived Interleukin-6 Aggravates Radiation-Induced Liver Disease by Activating Hepatocyte STAT3 to Promote Ccng1 Transcription
2026-Apr, Advances in radiation oncology
IF:2.2Q2
DOI:10.1016/j.adro.2026.102003
PMID:41783157
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了Kupffer细胞来源的IL-6通过激活肝细胞STAT3促进Ccng1转录,从而加剧辐射诱导的肝病 | 首次在单细胞水平上揭示了Kupffer细胞通过IL-6/STAT3/Ccng1轴在辐射诱导肝病中的关键作用机制 | 研究主要基于大鼠模型和细胞系,尚未在人体组织或临床样本中进行验证 | 阐明辐射诱导肝病的细胞和分子机制 | 大鼠肝组织、BRL-3A肝细胞系 | 单细胞组学 | 肝病 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 大鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2090 | 2026-01-17 |
Altered trophoblasts, macrophages, and immunologic microenvironment in the placenta: Implications of poorly controlled type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell transcriptomics
2026-Mar-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003853
PMID:41537453
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2091 | 2026-03-06 |
High MAP3K6 Expression in Spinal Cord Injury Tissues Enhances Neuronal Apoptosis: Insights from Multi-Omics Data Integrating WGCNA, Machine Learning, and Experimental Validation
2026-Mar-05, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2639364
PMID:41782555
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据分析与实验验证,揭示了MAP3K6在脊髓损伤中作为关键调控因子,促进神经元凋亡,并具有作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 | 结合WGCNA、机器学习(随机森林)和单细胞RNA测序等多组学方法,首次系统性地鉴定出MAP3K6在脊髓损伤中的核心作用,并通过体外实验验证其功能 | 研究主要基于公共数据集(GSE226238和GSE151371)和体外细胞实验,缺乏在体动物模型验证,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索脊髓损伤的分子机制,识别关键生物标志物和治疗靶点 | 脊髓损伤组织中的差异表达基因,特别是MAP3K6及其在神经元凋亡中的作用 | 生物信息学与计算生物学 | 脊髓损伤 | 多组学数据分析(包括WGCNA、机器学习、单细胞RNA测序)、体外细胞实验(基因敲低、凋亡检测) | 随机森林(机器学习模型) | 基因表达数据(RNA-seq)、单细胞RNA测序数据 | 基于GEO数据库中的GSE226238和GSE151371数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2092 | 2026-03-06 |
Locus-specific human endogenous retrovirus ERVK18 expression indicates an inflamed microenvironment and favorable immunotherapy outcome in small cell lung cancer
2026-Mar-05, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3302
PMID:41784525
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研究论文 | 本研究通过分析小细胞肺癌中位点特异性内源性逆转录病毒ERVK18的表达,揭示了其与炎症性肿瘤微环境及免疫治疗良好预后的关联 | 首次在小细胞肺癌中鉴定出位点特异性HERV-K转录本ERVK18作为免疫治疗的双重预后和预测生物标志物,并利用单细胞和空间分析技术验证了其与免疫细胞活化和空间邻近性的关系 | 研究样本量相对有限,且主要基于回顾性队列分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索小细胞肺癌中内源性逆转录病毒表达与免疫治疗反应及肿瘤微环境的关系 | 小细胞肺癌患者肿瘤组织及免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,RNA荧光原位杂交 | NA | RNA测序数据,组织微阵列图像,单细胞转录组数据 | IMpower133队列271例,PKUPH队列40例,组织微阵列48例 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | PhenoCycler-Fusion用于多重免疫组织化学分析 |
| 2093 | 2026-03-06 |
Dynamic Reprogramming of PDGFRA-Expressing Stromal Cells Facilitates WNT-Driven Transformation by Promoting a Fetal-Like State in the Intestinal Epithelium
2026-Mar-05, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0101
PMID:41784677
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研究论文 | 本研究揭示了PDGFRA+成纤维细胞在WNT驱动的肿瘤发生早期通过分泌配体促进肠道黏膜呈现胎儿样状态,从而促进肿瘤形成 | 首次发现PDGFRA+基质细胞在WNT介导的肿瘤发生过程中发生动态重编程,并通过TGFβ信号传导促进上皮细胞呈现胎儿样状态 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;机制细节如具体配体身份需进一步阐明 | 探究WNT驱动肿瘤发生过程中基质细胞与上皮细胞相互作用的分子机制 | 小鼠肠道PDGFRA+成纤维细胞与β-catenin突变肠道上皮细胞 | 单细胞组学 | 肠道肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2094 | 2026-03-06 |
Pyroptosis Modulates Multiple Immune Cell Populations in Targeted Therapy-Treated Melanoma
2026-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0444
PMID:41296494
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研究论文 | 本研究探讨了GSDME介导的细胞焦亡在BRAF抑制剂联合MEK抑制剂治疗黑色素瘤中对肿瘤内免疫细胞(如T细胞、NK细胞和调节性T细胞)浸润和功能的影响 | 揭示了GSDME在靶向治疗诱导的免疫反应中的关键作用,特别是通过单细胞RNA测序和流式细胞术展示了GSDME缺失如何影响免疫细胞浸润和Treg功能 | 研究主要基于小鼠模型和工程化肿瘤细胞,可能不完全反映人类黑色素瘤的复杂性,且未详细探讨其他免疫细胞类型或长期治疗效果 | 阐明GSDME在BRAFi + MEKi治疗黑色素瘤中调节肿瘤内免疫细胞的作用机制 | 黑色素瘤肿瘤模型、GSDME基因敲除或突变的小鼠肿瘤细胞、免疫细胞(T细胞、NK细胞、Treg) | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2095 | 2026-03-06 |
Immunomodulatory strategies and targeted delivery systems in atherosclerosis therapy
2026-Mar-04, Expert opinion on drug delivery
IF:5.0Q1
DOI:10.1080/17425247.2026.2636761
PMID:41729255
|
综述 | 本文综述了动脉粥样硬化免疫病理学及靶向纳米药物递送系统的研究进展 | 从广谱免疫抑制转向亚群特异性精准干预,并发展出智能仿生纳米递送平台 | 存在斑块渗透不足、纳米载体肝内蓄积及系统性免疫抑制风险等挑战 | 探讨动脉粥样硬化的免疫调节策略与靶向递送系统 | 动脉粥样硬化的免疫病理机制及纳米药物递送技术 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2096 | 2026-03-06 |
Spatial Transcriptomics Reveals Location-Specific Tumor Cell Subtypes and Signaling within Multifocal Small Intestinal Neuroendocrine Tumors
2026-Mar-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2854
PMID:41779010
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,揭示了多灶性小肠神经内分泌肿瘤中基于解剖位置的肿瘤细胞亚型及其信号网络 | 首次在多灶性SI-NETs中应用空间转录组学,识别出四种基于解剖位置的肿瘤细胞亚型,并揭示了其独特的配体-受体相互作用网络 | 需要进一步验证,样本量较小(仅4名患者),且为初步发现 | 表征多灶性小肠神经内分泌肿瘤患者不同解剖部位的肿瘤细胞表型,并识别影响肿瘤发展的局部微环境因素 | 多灶性小肠神经内分泌肿瘤患者的肿瘤和非肿瘤组织,包括小肠各解剖层及区域转移部位 | 空间转录组学 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 空间转录组学,免疫组织化学,免疫荧光 | 无监督聚类,过表达分析,配体-受体对分析 | 空间转录组数据,蛋白质表达数据 | 72个组织微阵列核心,来自4名多灶性SI-NETs患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2097 | 2026-03-06 |
Topological Data Analysis for Unsupervised Feature Selection in Large Scale Spatial Omics Data Sets
2026-Mar-04, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-026-01618-2
PMID:41779089
|
研究论文 | 本文提出了一种基于拓扑数据分析的持续同调方法,用于大规模空间组学数据的无监督特征选择 | 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间组学数据,提供基因表达空间结构的连续量化,并展示其在空间可变基因识别等下游任务中的应用 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率,也未与其他先进空间分析方法进行系统性比较 | 开发适用于大规模空间组学数据的无监督特征选择方法 | 空间转录组数据和空间代谢组学数据 | 空间组学 | 肾脏疾病,心肌梗死 | 持续同调 | 拓扑数据分析 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
| 2098 | 2026-03-06 |
Spatial transcriptomics and artificial intelligence: a scoping review of emerging applications in head and neck pathology
2026-Mar-04, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01876-x
PMID:41779110
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2099 | 2026-03-06 |
SCGB1A1 suppresses prostate cancer proliferation and metastasis by modulating the MAPK signaling pathway
2026-Mar-04, International urology and nephrology
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11255-026-05076-6
PMID:41779253
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SCGB1A1在抑制前列腺癌细胞增殖和转移中的作用,并揭示其通过调控MAPK信号通路发挥肿瘤抑制功能 | 首次通过单细胞转录组学分析发现SCGB1A1⁺上皮细胞在前列腺癌组织中显著减少,并揭示SCGB1A1通过负调控MAPK信号通路抑制肿瘤细胞增殖、迁移和上皮-间质转化 | 研究主要基于体外细胞实验和公共数据库分析,缺乏大规模临床样本验证和体内动物模型实验 | 探究SCGB1A1在前列腺癌发生发展中的分子机制及其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 前列腺癌细胞系、前列腺组织样本、公共数据库中的前列腺癌单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、细胞实验数据 | 未明确具体样本数量,包括前列腺癌细胞系和组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2100 | 2026-03-06 |
Low-dose chemotherapy remodels hepatic immune landscape and potentiates anti-tumor response to immune checkpoint blockade in cholangiocarcinoma
2026-Mar-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001735
PMID:41779955
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研究论文 | 本研究探讨低剂量吉西他滨/顺铂联合抗PD-L1治疗在肝内胆管癌中的抗肿瘤效果及机制 | 首次揭示低剂量化疗通过重塑肝脏免疫景观,特别是减少SPP1+肿瘤相关巨噬细胞并增强CD8⁺ T细胞功能,从而增强免疫检查点阻断疗效 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本量较小,需更大规模临床试验验证 | 优化晚期肝内胆管癌的治疗策略,减少毒性并提高免疫治疗效果 | 肝内胆管癌小鼠模型、患者来源肿瘤组织及ICC患者 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体内外功能实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多个临床前小鼠模型、患者来源肿瘤片段及初步临床试验患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |