单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 20961 - 20980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20961 | 2024-08-08 |
Lessons From Transcriptome Analysis of Autoimmune Diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.857269
PMID:35663941
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综述 | 本文综述了转录组分析如何增进我们对自身免疫疾病中免疫细胞病理作用的认识，特别关注了ImmuNexUT数据库 | 介绍了单细胞RNA测序在识别各种自身免疫疾病病变中浸润免疫细胞的作用，以及eQTL分析在识别候选因果基因和免疫细胞中的应用 | NA | 总结转录组分析在自身免疫疾病中免疫细胞病理作用的理解上的进展 | 自身免疫疾病中的免疫细胞及其在疾病中的作用 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20962 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Cellular Functional Heterogeneity in Dermis Between Fibrotic and Regenerative Wound Healing Fates
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.875407
PMID:35664010
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的类型和功能差异 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类伤口愈合的情况 | 旨在揭示纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的功能异质性 | 纤维化和再生性伤口愈合过程中的真皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 纤维化和再生性伤口的真皮细胞 |
| 20963 | 2024-08-08 |
Lactate metabolism coordinates macrophage response and regeneration in zebrafish
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.65235
PMID:35664055
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研究论文 | 本研究使用斑马鱼模型和尾鳍切除作为强健的再生系统，通过单细胞RNA测序分析和全组织转录组分析，探索了组织截肢后基因表达的特定变化，并证实了乳酸途径在巨噬细胞反应和鳍再生中的作用 | 首次在体内解码了巨噬细胞微环境对代谢重编程的控制，并揭示了乳酸在巨噬细胞分化为促炎表型中的关键作用 | NA | 探索巨噬细胞在组织损伤和再生过程中的代谢适应和变化 | 斑马鱼的巨噬细胞和尾鳍再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20964 | 2024-08-08 |
Single-cell landscape reveals active cell subtypes and their interaction in the tumor microenvironment of gastric cancer
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.71833
PMID:35664061
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了九名未转移的胃癌患者的肿瘤微环境，揭示了胃癌中的活跃细胞亚型及其相互作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胃癌肿瘤微环境中的细胞异质性，并发现了与免疫抑制和肿瘤血管生成相关的新分子标志物。 | 研究样本仅限于九名未转移的胃癌患者，可能限制了结果的普遍性。 | 深入理解胃癌的肿瘤细胞及其微环境，为开发新的治疗策略提供依据。 | 胃癌患者的肿瘤微环境中的单个细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 47,304个细胞来自九名患者 |
| 20965 | 2024-08-08 |
New insights empowered by single-cell sequencing: From neural crest to enteric nervous system
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.025
PMID:35664232
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综述 | 本文综述了单细胞多模态测序技术在肠神经系统（ENS）研究中的最新发现，特别是基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类和小鼠的ENS细胞中的应用 | 利用单细胞多模态测序技术探索染色质可及性、基因表达和空间转录组，为构建新的肠神经病变诊断框架提供了前所未有的资源 | NA | 总结单细胞多模态测序技术在肠神经系统研究中的应用，并讨论其在生物医学研究领域的潜在影响 | 肠神经系统细胞，包括前体细胞、神经嵴（NC）细胞和成熟的ENS电路 | 生物技术 | 肠神经病变 | 单细胞多模态测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类和小鼠的ENS细胞 |
| 20966 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance of Lineage Diversity in Bladder Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.862634
PMID:35664301
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，探讨了膀胱癌中细胞谱系的临床意义 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中细胞谱系多样性与患者预后的关联 | NA | 探讨膀胱癌中细胞谱系多样性对患者预后的影响 | 膀胱癌患者的细胞谱系多样性及其临床意义 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 12,424个细胞 |
| 20967 | 2024-08-08 |
Development of a Chemoresistant Risk Scoring Model for Prechemotherapy Osteosarcoma Using Single-Cell Sequencing
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.893282
PMID:35664733
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术，为化疗前骨肉瘤建立了一个有效的化疗耐药风险评分模型 | 本研究首次利用单细胞测序技术构建化疗耐药风险评分模型，相较于传统的基于大量RNA的模型，在验证环境中表现出更强的性能 | NA | 旨在理解和评估化疗前骨肉瘤的化疗耐药性 | 化疗前骨肉瘤的化疗耐药性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归模型 | RNA数据 | 使用了TARGET-OS数据集作为训练组，GSE33382数据集作为验证组 |
| 20968 | 2024-08-08 |
Using Single Cell Transcriptomics to Elucidate the Myeloid Compartment in Pancreatic Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.881871
PMID:35664793
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术解析胰腺癌中髓系细胞分化的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术定义人类胰腺导管腺癌中的髓系细胞区室，并阐明髓系细胞与其他肿瘤免疫微环境成分之间的相互作用 | 目前对胰腺导管腺癌中髓系细胞亚群的了解有限，尤其是在人类研究中 | 探讨调节髓系细胞功能的疗法可能增强胰腺导管腺癌标准治疗效果的可能性 | 胰腺导管腺癌中的髓系细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20969 | 2024-08-08 |
The Development of Mechanical Allodynia in Diabetic Rats Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.856299
PMID:35668789
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了糖尿病大鼠模型中机械性痛觉过敏（MA）相关的背根神经节（DRG）神经元的转录组变化 | 发现了在痛性糖尿病周围神经病变（PDPN）中的一种新型神经元类型MAAC，并揭示了其基因调控网络和细胞间通信机制 | NA | 探究糖尿病周围神经病变中神经转录变化，以深入理解其复杂的发病机制 | 糖尿病大鼠模型的背根神经节神经元 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20970 | 2024-08-08 |
Digital Cell Atlas of Mouse Uterus: From Regenerative Stage to Maturational Stage
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.847646
PMID:35669188
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据构建了从小鼠再生期到成熟期的子宫细胞图谱，详细描述了动情周期中上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的转变 | 首次在单细胞水平上构建了从小鼠再生期到成熟期的子宫细胞图谱，提供了基于细胞学的更精确的子宫内膜变化阐释 | 研究结论可能受到参与研究的小鼠数量有限的限制 | 旨在提高我们对从小鼠再生期到成熟期子宫内膜转变的理解 | 小鼠子宫内膜在动情周期中的细胞转变 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠子宫样本 |
| 20971 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics-Based Study of Transcriptional Regulatory Features in the Non-Obstructive Azoospermia Testis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.875762
PMID:35669193
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建转录调控网络，探讨非阻塞性无精症睾丸中转录因子的相互调控关系及因果关系 | 首次在非阻塞性无精症睾丸中发现特定的转录因子，并揭示这些因子在细胞命运、功能及微环境稳态中的重要作用 | NA | 探究非阻塞性无精症的转录调控特征 | 非阻塞性无精症睾丸中的转录因子及其调控网络 | 基因表达 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE149512数据集 |
| 20972 | 2024-08-08 |
Prostaglandin E2 Exerts Biphasic Dose Response on the PreBötzinger Complex Respiratory-Related Rhythm
2022, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2022.826497
PMID:35669453
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研究论文 | 研究前列腺素E2（PGE2）对preBötzinger复合体呼吸相关节律的双相剂量反应 | 首次揭示了PGE2在不同浓度下对呼吸节律的双相影响，并阐明了EP2和EP3受体在其中的作用机制 | 研究主要基于离体脑片实验，未来需在活体模型中验证结果 | 探讨PGE2在炎症过程中对呼吸功能的影响及其分子机制 | PGE2对preBötzinger复合体呼吸节律的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 20973 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed Subtype-Specific Tumor Immune Microenvironments in Human Glioblastomas
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.914236
PMID:35669791
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了7名人类胶质母细胞瘤患者的手术切除肿瘤样本，揭示了肿瘤亚型特异性的免疫微环境 | 首次系统性地描述了不同肿瘤亚型与非恶性细胞之间的相互作用，以及它们如何共同塑造肿瘤微环境 | 研究样本仅限于7名患者，可能不足以代表所有胶质母细胞瘤的情况 | 探究人类胶质母细胞瘤中肿瘤亚型特异性的免疫微环境 | 人类胶质母细胞瘤的肿瘤亚型及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 7名胶质母细胞瘤患者 |
| 20974 | 2024-08-08 |
APOBEC-mediated mutagenesis is a favorable predictor of prognosis and immunotherapy for bladder cancer patients: evidence from pan-cancer analysis and multiple databases
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.73235
PMID:35673559
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研究论文 | 本研究通过一系列生物信息学和统计学方法，全面分析了包括全外显子测序、靶向下一代测序、转录组（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq）、免疫特征、免疫检查点阻断潜力、患者生存和药物敏感性等多层次数据，揭示了APOBEC及其突变在泛癌尤其是膀胱癌中的分布特征和临床意义。 | 本研究首次在泛癌背景下探讨了APOBEC突变与膀胱癌患者预后和免疫治疗反应的关系，并利用机器学习方法建立了与APOBEC突变相关的预后模型。 | 研究主要基于数据库和现有数据进行分析，未来需要更多的临床试验和前瞻性研究来验证这些发现。 | 探讨APOBEC介导的突变在泛癌尤其是膀胱癌中的生物学特征和临床相关性。 | APOBEC家族介导的突变在膀胱癌中的分布特征和临床意义。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 全外显子测序(WES)、靶向下一代测序(NGS)、RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 多个膀胱癌队列 |
| 20975 | 2024-08-08 |
Spatial maps of hepatocellular carcinoma transcriptomes reveal spatial expression patterns in tumor immune microenvironment
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.71873
PMID:35673582
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研究论文 | 本研究利用空间转录组测序技术分析肝细胞癌样本，揭示了肿瘤免疫微环境中免疫细胞的空间表达模式 | 首次揭示了肝细胞癌中免疫细胞在肿瘤微环境中的空间表达模式，并验证了关键分子如CCL15、CCL19和CCL21的功能机制 | 研究仅基于两个肝细胞癌样本，可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 探索肝细胞癌中肿瘤免疫微环境的空间表达模式及其临床意义 | 肝细胞癌样本中的免疫细胞及其空间表达模式 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组测序(ST) | NA | 转录组数据 | 7553个spots，分为15个亚群 |
| 20976 | 2024-08-08 |
Flexible copula model for integrating correlated multi-omics data from single-cell experiments
2023-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13701
PMID:35622236
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研究论文 | 本文提出了一种基于copula的灵活框架，用于整合来自单细胞实验的相关多组学数据，并研究其相关性 | 提出的方法能够独立于边际分布建模协变量依赖的相关结构，并能联合多种单变量边际分布 | NA | 研究多组学数据中不同数据类型之间的关联及其随其他因素（如细胞类型和基因调控元件）的变化 | 单细胞RNA测序、染色质可及性和DNA甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析、DNA甲基化分析 | copula模型 | 多组学数据 | NA |
| 20977 | 2024-08-05 |
Revealing cell vulnerability in Alzheimer's disease by single-cell transcriptomics
2023-04, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2022.05.007
PMID:35623983
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综述 | 本篇文章回顾了成功应用单细胞转录组学研究阿尔茨海默病中细胞特异性的基因表达程序和途径 | 通过整合分子分析，揭示了阿尔茨海默病大脑中的细胞特异性转录组和生物网络 | 在更大的人类阿尔茨海默病队列中实施标准化协议仍是一个挑战 | 深入理解阿尔茨海默病的致病机制 | 阿尔茨海默病患者大脑的细胞特异性转录组 | 数字病理学 | 老年痴呆症 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20978 | 2024-08-05 |
AP-1 activation mediates post-natal cardiomyocyte maturation
2023-03-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac088
PMID:35640820
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研究论文 | 本研究表明AP-1转录因子在出生后心肌细胞成熟中的作用 | 首次提供证据表明AP-1转录因子在出生后心肌细胞成熟中发挥功能 | 研究主要基于大鼠模型，可能对人类心肌细胞的适用性有限 | 探讨调控心肌细胞成熟的关键分子机制 | 新生大鼠心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 大鼠心脏样本，出生后第1天和第7天 |
| 20979 | 2024-08-08 |
Comparative single-cell RNA-sequencing profiling of BMP4-treated primary glioma cultures reveals therapeutic markers
2022-12-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac143
PMID:35639831
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了BMP4处理后的原代胶质瘤细胞培养物，揭示了治疗相关的标记物 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，分析了BMP4处理后胶质母细胞瘤细胞的反应，并提出了预测性的正向和早期反应标记物 | NA | 研究BMP4处理后胶质母细胞瘤细胞的反应，并寻找治疗相关的标记物 | BMP4处理后的原代胶质瘤细胞培养物 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 17个BMP4处理的病人来源的胶质母细胞瘤培养物 |
| 20980 | 2024-08-08 |
Dissecting B/Plasma Cells in Periodontitis at Single-Cell/Bulk Resolution
2022-10, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221099442
PMID:35620808
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研究论文 | 本研究通过单细胞和整体组织水平分析，揭示了牙周炎中B/浆细胞的浸润过程及其在分子诊断中的潜在应用 | 首次在单细胞水平上对牙周炎中的15种免疫细胞类型进行分类，并进行了细胞间通信分析，揭示了B/浆细胞在牙周炎中的两种不同细胞命运 | 研究主要集中在免疫细胞和分子水平，对牙周炎的宏观和组织学层面的理解仍有待深入 | 探讨牙周炎中B/浆细胞的浸润过程及其在分子诊断中的应用 | 牙周炎中的B/浆细胞及其与其他免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞转录组分析 | 机器学习 | 转录组数据 | 68名健康个体与235名牙周炎患者的大规模公共队列，以及12名健康个体与7名牙周炎患者的独立验证队列 |