单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 20961 - 20980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20961 | 2024-08-08 |
Characterization of Immune-Related Molecular Subtypes and a Prognostic Signature Correlating With the Response to Immunotherapy in Patients With Gastric Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.939836
PMID:35898512
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研究论文 | 本研究通过无监督共识聚类定义了两种基于免疫相关失调基因的分子亚型，并建立了与免疫治疗反应相关的免疫相关预后签名 | 首次定义了胃癌的免疫相关分子亚型，并构建了与免疫治疗反应相关的预后签名 | NA | 探索胃癌的肿瘤免疫微环境并定义分子亚型，以增强个性化治疗和临床决策 | 胃癌患者的免疫相关分子亚型及预后签名 | 数字病理学 | 胃癌 | RT-qPCR | LASSO-Cox回归分析 | scRNA-seq数据 | 包括三个独立的外部队列和IMvigor210队列的胃癌样本 |
| 20962 | 2024-08-08 |
Cebpb Regulates Skeletal Stem Cell Osteogenic Differentiation and Fracture Healing via the WNT/β-Catenin Pathway
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/2091615
PMID:35898655
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研究论文 | 研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了Cebpb转录因子通过WNT/β-Catenin信号通路调控骨骼干细胞成骨分化和骨折愈合的机制 | 首次证明Cebpb通过抑制WNT/β-Catenin信号通路促进骨骼干细胞的成骨分化和骨折愈合 | NA | 探讨骨骼干细胞分化和骨折愈合的机制，以开发新的治疗策略 | 骨骼干细胞（SSC）和小鼠成骨前体细胞 | NA | 骨折 | scRNA-seq, FACS, qPCR, 免疫印迹, 碱性磷酸酶测定, 茜素红S染色, 微CT, 力学测试 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨骼干细胞和小鼠成骨前体细胞 |
| 20963 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomics for Tumor Heterogeneity Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.906158
PMID:35899203
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综述 | 本文综述了空间转录组学在肿瘤异质性研究中的应用，包括发现新的空间依赖性机制、肿瘤免疫微环境、基质微环境以及癌症的病理分类和预后 | 空间转录组学通过提供定位索引的基因表达信息，有望解码癌症的复杂异质性 | 讨论了空间转录组学技术在癌症应用中的未来挑战和机遇 | 更好地理解癌症异质性，以促进更精确的诊断和改善患者预后 | 肿瘤异质性、空间依赖性机制、肿瘤免疫微环境、基质微环境以及癌症的病理分类和预后 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20964 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals the Crosstalk Propensity Between the Tumor Intermediate State and the CD8+ T Exhausted State to be Associated with Clinical Benefits in Melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.766852
PMID:35903095
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析了黑色素瘤中肿瘤细胞与CD8+ T细胞之间的交叉对话倾向性，并探讨了这种倾向性对临床结果的影响 | 首次揭示了肿瘤中间状态与CD8+ T细胞耗竭状态之间的交叉对话倾向性，并验证了其在样本层面的临床意义 | NA | 探讨黑色素瘤中肿瘤细胞与CD8+ T细胞之间的交叉对话倾向性及其对临床结果的影响 | 肿瘤细胞与CD8+ T细胞的交叉对话倾向性 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20965 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis of Bulk RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Unveils the Characteristics of the Immune Microenvironment and Prognosis Signature in Prostate Cancer
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/6768139
PMID:35909899
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了前列腺癌中免疫微环境的特征及其预后标志 | 本研究首次通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，识别了前列腺癌中关键的细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 研究主要基于已有的测序数据，未来需要更多的临床样本验证这些发现 | 探讨前列腺癌中免疫微环境的分子机制及其在疾病发生中的作用 | 前列腺癌中的免疫微环境及其预后标志 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络 | RNA测序数据 | 144个自然杀伤细胞相关基因 |
| 20966 | 2024-08-08 |
Enriched circulating and tumor-resident TGF-β+ regulatory B cells in patients with melanoma promote FOXP3+ Tregs
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2104426
PMID:35909944
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研究论文 | 研究探讨了黑色素瘤患者中表达调节性和促炎细胞因子的B细胞，通过多种技术分析发现患者循环中的调节性B细胞增加，而促炎性B细胞减少，这些B细胞在肿瘤微环境中与T细胞相互作用，促进FOXP3+ Treg的分化。 | 首次揭示了黑色素瘤患者中调节性B细胞在循环和肿瘤病变中的分布，以及B细胞与T细胞亚群之间的双向交流具有免疫抑制特性。 | NA | 研究黑色素瘤患者中B细胞的免疫调节作用及其与T细胞的相互作用。 | 黑色素瘤患者中的B细胞及其在免疫反应中的作用。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 流式细胞术、质谱流式细胞术、转录组学、免疫荧光、单细胞RNA测序、B细胞与T细胞共培养分析 | NA | 细胞 | 患者与健康志愿者的B细胞和T细胞样本 |
| 20967 | 2024-08-08 |
Construction and Verification of a Fibroblast-Related Prognostic Signature Model for Colon Cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.908957
PMID:35910200
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建并验证了一个与结肠癌相关的成纤维细胞预后标志物模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据，识别出六种新型成纤维细胞亚型，并构建了与结肠癌预后相关的成纤维细胞标志物模型 | 研究主要基于数据库中的数据，未来需要更多的临床样本验证模型的准确性和实用性 | 探讨成纤维细胞在结肠癌进展中的作用及其预后价值 | 结肠癌患者及其成纤维细胞亚型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归模型 | RNA测序数据 | 23个单细胞RNA测序样本和452个批量RNA测序样本 |
| 20968 | 2024-08-08 |
Missing Value Imputation With Low-Rank Matrix Completion in Single-Cell RNA-Seq Data by Considering Cell Heterogeneity
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.952649
PMID:35910201
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scGNGI的新方法，通过考虑细胞异质性，利用低秩矩阵补全技术对单细胞RNA测序数据中的缺失基因表达值进行插补 | scGNGI方法能更有效地插补单细胞RNA测序数据中的缺失值，并改善下游分析，同时更好地保留细胞间基因表达的变异性 | NA | 探索癌症异质性和精准医学，提高单细胞RNA测序数据分析的精确度 | 单细胞RNA测序数据中的缺失基因表达值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩矩阵补全 | 基因表达矩阵 | 模拟数据集和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 20969 | 2024-08-08 |
Selecting Representative Samples From Complex Biological Datasets Using K-Medoids Clustering
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.954024
PMID:35910222
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cookie的工具包，用于从具有多样性特征的大规模单细胞群体中高效选择最具代表性的样本 | Cookie方法通过量化样本间的曼哈顿距离并使用k-medoids聚类，能够从大规模单细胞群体中选择出代表性样本，相比于传统采样方法具有更高的效能、效率和灵活性 | NA | 开发一种新的方法来从复杂的生物数据集中选择代表性样本 | 大规模单细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | k-medoids聚类 | 单细胞数据 | 从多个候选大小中评估关键属性的覆盖范围来确定适当的样本大小 |
| 20970 | 2024-08-08 |
Neurochemical Signalling Associated With Gill Oxygen Sensing and Ventilation: A Receptor Focused Mini-Review
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.940020
PMID:35910553
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综述 | 本文综述了与鱼类鳃部氧气感知和通气相关的神经化学信号传导中涉及的受体类型 | 近期使用单细胞RNA测序对斑马鱼鳃部的转录组分析开始阐明鳃部特定受体目标 | 鳃部细胞水平上缺乏受体表征是理解缺氧信号传导神经化学控制的主要限制 | 总结迄今为止与鱼类鳃部氧气感知相关的神经传递或神经调节中涉及的受体类型 | 鱼类鳃部氧气感知相关的受体和传入途径 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20971 | 2024-08-08 |
Dedifferentiated Schwann cell-derived TGF-β3 is essential for the neural system to promote wound healing
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72317
PMID:35910794
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研究论文 | 研究探讨了去分化施旺细胞在伤口愈合中的作用及其分泌的TGF-β3对皮肤再生的影响 | 首次揭示了去分化施旺细胞在伤口修复早期上调Wnt信号通路的作用，并发现TGF-β3补充能增强糖尿病小鼠慢性伤口的愈合 | 研究主要基于小鼠模型和糖尿病患者的scRNA-seq分析，可能需要更多临床数据验证 | 探究神经源性细胞在皮肤再生中的作用，并寻找治疗伤口愈合障碍的新策略 | 去分化施旺细胞及其在伤口愈合中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 涉及小鼠和糖尿病患者的样本 |
| 20972 | 2024-08-08 |
Identification of cortical interneuron cell markers in mouse embryos based on machine learning analysis of single-cell transcriptomics
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.841145
PMID:35911980
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和机器学习方法，预测小鼠胚胎中皮层中间神经元的多样性 | 首次使用最小冗余最大相关性方法分析单细胞转录组数据，并通过增量特征选择和两种分类算法提取关键基因，构建强大的分类器 | NA | 预测小鼠胚胎中皮层中间神经元的多样性 | 小鼠胚胎中的皮层中间神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 随机森林和重复增量剪枝产生误差减少 | 转录组数据 | 2669个单细胞 |
| 20973 | 2024-08-08 |
Multimodal Dimension Reduction and Subtype Classification of Head and Neck Squamous Cell Tumors
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.892207
PMID:35912202
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研究论文 | 本文开发了一种计算策略，通过多模态整合与谱聚类及现代降维技术如PHATE，对头颈鳞状细胞肿瘤进行亚型分类 | 本文首次将主要为单细胞测序开发的分析方法应用于大量肿瘤测序数据，并展示了其在捕捉肿瘤动态异质性和识别新亚型方面的有效性 | NA | 开发一种更强大的癌症亚型分类方法 | 头颈鳞状细胞癌（HNSC）肿瘤样本 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 多模态整合、谱聚类、PHATE | NA | 基因表达、DNA甲基化、微生物组数据 | 514个头颈鳞状细胞癌肿瘤样本 |
| 20974 | 2024-08-05 |
Surface Lin28A expression consistent with cellular stress parallels indicators of senescence
2023-05-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac122
PMID:35880724
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研究论文 | 该文章研究了表面Lin28A在心脏间质细胞中应对氧化压力与老化相关的作用 | 首次探讨了Lin28A在心脏间质细胞中的表达与氧化压力及衰老的关系 | 对Lin28A在临床应用中的具体作用尚未进行深入研究 | 研究Lin28A在心脏间质细胞中如何响应环境氧化压力与衰老 | 成年小鼠心脏间质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及5%的新鲜心脏间质细胞 |
| 20975 | 2024-08-05 |
Direct chemical induction of hepatocyte-like cells with capacity for liver repopulation
2023-05-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32686
PMID:35881538
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研究论文 | 该研究展示了将小鼠成纤维细胞直接化学重编程为具有肝再生能力的功能性肝细胞样细胞的可行性 | 首次成功实现了化学诱导生成可再生的肝细胞样细胞，证明了化学重编程在治疗应用中的潜力 | 仅在小鼠模型中进行测试，临床应用的可行性尚需进一步验证 | 研究化学重编程是否能够生成有功能的肝细胞样细胞以应用于肝组织再生 | 小鼠成纤维细胞及其转化为肝细胞样细胞的过程 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用了多个小鼠模型以验证研究结果 |
| 20976 | 2024-08-08 |
Shh activation restores interneurons and cognitive function in newborns with intraventricular haemorrhage
2023-02-13, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awac271
PMID:35867870
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研究论文 | 本文研究了早产儿脑室内出血（IVH）后认知功能障碍的机制，并探讨了Sonic Hedgehog信号通路的激活对神经发生和认知功能的恢复作用。 | 首次揭示了IVH通过下调Sonic Hedgehog信号通路减少内侧豆状核神经元前体细胞的数量，并提出通过激活该信号通路恢复神经发生和认知功能的治疗策略。 | 研究主要基于早产兔模型和人类早产儿尸检样本，需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨IVH对早产儿神经行为功能的影响及其机制，并评估Sonic Hedgehog信号通路激活的治疗潜力。 | 早产儿脑室内出血（IVH）及其对神经行为功能的影响。 | 神经科学 | 新生儿疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 包括早产兔模型和人类早产儿尸检样本 |
| 20977 | 2024-08-08 |
The M3 Muscarinic Acetylcholine Receptor Promotes Epidermal Differentiation
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.06.013
PMID:35870560
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研究论文 | 研究M3毒蕈碱乙酰胆碱受体如何调控表皮结构和功能 | 首次揭示了乙酰胆碱如何控制表皮分化，并为未来在皮肤病学中评估胆碱能药物的治疗潜力奠定了基础 | NA | 研究M3毒蕈碱乙酰胆碱受体在表皮分化中的作用及其细胞和分子机制 | M3毒蕈碱乙酰胆碱受体在表皮细胞中的表达和功能 | NA | 自身免疫性水疱病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Chmr3新生小鼠的表皮细胞 |
| 20978 | 2024-08-08 |
The Value of Single-cell Technologies in Solid Organ Transplantation Studies
2022-12-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004237
PMID:35876376
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综述 | 本文综述了单细胞技术在实体器官移植研究中的应用和价值 | 单细胞技术为实体器官移植后的免疫反应机制提供了深入的见解 | 文章讨论了单细胞技术在实体器官移植研究中面临的挑战 | 探讨单细胞技术在实体器官移植研究中的应用，以更好地理解排斥和耐受的免疫机制 | 单细胞技术在实体器官移植中的应用，包括免疫细胞亚群的特征识别和生物标志物的鉴定 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 20979 | 2024-08-08 |
Identification of an FXR-modulated liver-intestine hybrid state in iPSC-derived hepatocyte-like cells
2022-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.07.009
PMID:35863491
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研究论文 | 本文通过单细胞和批量RNA测序技术，研究了人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的肝细胞样细胞（HLC）的基因表达模式，并探讨了核受体FXR在HLC功能成熟中的作用 | 发现HLC在单细胞层面表现出一种混合状态，同时表达肝细胞相关基因和肠道基因，并通过FXR表达和激动剂暴露增强了HLC与人类原代肝细胞（PHH）的相似性 | 尽管FXR表达和激动剂暴露能够减少非肝脏基因的表达，但这种减少仅是适度的 | 旨在改善HLC的分化，使其更接近PHH，以用于药物筛选、毒理学和细胞替代疗法 | 人诱导多能干细胞衍生的肝细胞样细胞 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20980 | 2024-08-08 |
The kidney matrisome in health, aging, and disease
2022-11, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.06.029
PMID:35870643
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综述 | 本文综述了肾脏基质组在健康、衰老和疾病中的作用 | 通过先进的质谱技术揭示了衰老和疾病中基质组成的分子细节，并探讨了基质变化对物理特性和细胞反应的影响 | 仍存在关于驱动基质组成改变的机制的关键问题 | 理解基质动态过程，以开发对抗基质失调的治疗方法 | 肾脏基质组在健康、衰老和疾病中的作用 | NA | NA | 质谱技术 | NA | 蛋白质组数据 | NA |