单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20901 - 20920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20901 | 2024-08-08 |
Maternal DDB1 regulates apoptosis and lineage differentiation in porcine preimplantation embryos
2022-Jul, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD22028
PMID:35724990
|
研究论文 | 研究探讨了母源性基因DDB1在猪早期胚胎发育中的表达模式、基因组遗产及其潜在分子机制 | 首次详细研究了DDB1在猪早期胚胎发育中的作用，发现DDB1缺乏会导致胚胎细胞数量减少、细胞凋亡增加及细胞分化异常 | NA | 探索DDB1在猪早期胚胎发育中的表达模式、基因组遗产及其潜在分子机制 | 猪早期胚胎 | NA | NA | RNA干扰、显微注射、RT-qPCR、免疫荧光染色和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及GV和MII卵母细胞及早期胚胎 |
| 20902 | 2024-08-08 |
Hyaluronic acid-GPRC5C signalling promotes dormancy in haematopoietic stem cells
2022-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00931-x
PMID:35725769
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人骨髓造血干细胞（HSCs）的休眠状态，并揭示了透明质酸-GPRC5C信号轴在维持HSC休眠中的作用 | 首次揭示了透明质酸通过GPRC5C受体在人造血干细胞中维持休眠状态的作用机制 | NA | 探讨人造血干细胞的休眠状态及其调控机制 | 人骨髓造血干细胞及其休眠状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20903 | 2024-08-08 |
Identification of early neurodegenerative pathways in progressive multiple sclerosis
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01097-3
PMID:35726057
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术，分析了多发性硬化症（MS）患者脑组织样本，揭示了MS进展中的多细胞机制及其与神经退行性变的空间分布关系 | 通过解析局部微环境中的配体-受体相互作用，发现了早期神经元衰退区域内的失效营养和抗炎细胞间通讯，为MS治疗药物开发提供了新的框架 | NA | 旨在揭示多发性硬化症进展中的复杂发病机制，并为药物开发提供新的策略 | 多发性硬化症患者的脑组织 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学，蛋白质组学 | NA | 组织样本 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20904 | 2024-08-08 |
Deciphering the Spatial Modular Patterns of Tissues by Integrating Spatial and Single-Cell Transcriptomic Data
2022-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0617
PMID:35727094
|
研究论文 | 本文通过结合空间转录组学和单细胞转录组学数据，采用基于偏最小二乘法的方法（SpaMOD）来解析组织的空间模块模式 | 提出了一种新的方法SpaMOD，能够同时整合两种数据模式以及相关的细胞和斑点网络，以识别细胞-斑点共模块 | 新兴的空间转录组技术在单细胞分辨率和读取充分性方面仍存在不足 | 解析组织中细胞的空间组织结构 | 小鼠大脑、肉芽肿和胰腺导管腺癌的组织 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | 偏最小二乘法（PLS） | 转录组数据 | 三组配对的scRNA-seq和ST数据集 |
| 20905 | 2024-08-08 |
The metastatic spread of breast cancer accelerates during sleep
2022-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04875-y
PMID:35732738
|
研究论文 | 本文研究了乳腺癌转移扩散在睡眠期间加速的现象 | 发现大多数自发性循环肿瘤细胞（CTCs）进入血管的事件发生在睡眠期间，且休息阶段的CTCs更易转移 | NA | 探讨乳腺癌转移的时间动态特性 | 乳腺癌患者和鼠模型的循环肿瘤细胞（CTCs） | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及乳腺癌患者和鼠模型 |
| 20906 | 2024-08-08 |
Corrigendum to "Muscle-Derived Beige Adipose Precursors Secrete Promyogenic Exosomes That Treat Rotator Cuff Muscle Degeneration in Mice and Are Identified in Humans by Single-Cell RNA Sequencing"
2022-Jul, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465221111167
PMID:35736510
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20907 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics and surface epitope detection in human brain epileptic lesions identifies pro-inflammatory signaling
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01095-5
PMID:35739273
|
研究论文 | 研究使用单细胞转录组和表面表位检测技术，揭示了人脑癫痫病变中的促炎信号传导机制 | 首次使用单细胞细胞索引转录组和表位测序（CITE-seq）技术，揭示了癫痫病变组织中的免疫转录组特征 | NA | 探究不适当的促炎机制是否在难治性癫痫的发病机制中起作用 | 人脑癫痫病变组织中的免疫微环境 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞细胞索引转录组和表位测序（CITE-seq） | NA | 转录组数据 | 手术切除的癫痫病变组织样本 |
| 20908 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals immune dysregulation mediated by IL-17A in initiation of chronic lung injuries upon real-ambient particulate matter exposure
2022-06-23, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-022-00483-w
PMID:35739565
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了IL-17A介导的免疫失调在真实环境颗粒物暴露下慢性肺损伤启动中的作用 | 首次详细描述了IL-17A信号通路在亚慢性颗粒物暴露下肺纤维化进展中的作用 | NA | 阐明不同细胞集群和关键通路在颗粒物暴露后触发小鼠慢性肺损伤中的相互作用 | C57BL/6J雄性小鼠 | 数字病理学 | 慢性呼吸疾病 | 单细胞转录组学 | IL-17A敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 六周龄C57BL/6J雄性小鼠，暴露于颗粒物或过滤空气16周 |
| 20909 | 2024-08-08 |
Decoding lymphomyeloid divergence and immune hyporesponsiveness in G-CSF-primed human bone marrow by single-cell RNA-seq
2022-Jun-22, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00417-y
PMID:35732626
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了G-CSF处理后人骨髓中造血细胞的转录组变化 | 首次全面、无偏和高分辨率地调查了G-CSF处理后人骨髓的细胞和分子生态系统，揭示了G-CSF诱导的髓系偏向分化和T细胞及自然杀伤细胞的低反应性的细胞和分子基础 | 研究样本仅来自两名健康捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 探究G-CSF处理后人骨髓中淋巴髓系分化和免疫低反应性的机制 | G-CSF处理后人骨髓中的造血细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名健康捐赠者的骨髓样本 |
| 20910 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of subcutaneous adipose tissues identifies therapeutic targets for cancer-associated lymphedema
2022-Jun-21, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00402-5
PMID:35725971
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了淋巴水肿患者皮下脂肪组织的细胞变化，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术深入解析了淋巴水肿患者皮下脂肪组织的细胞变化，并发现了PRG4/CLEC3B ASC亚群c3的显著扩张与脂肪组织纤维化的关联 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，尚未进行临床试验验证 | 旨在发现癌症相关淋巴水肿的有效治疗靶点 | 淋巴水肿患者的皮下脂肪组织 | 数字病理学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 70,209个细胞 |
| 20911 | 2024-08-08 |
Mycobacterium tuberculosis infection drives a type I IFN signature in lung lymphocytes
2022-06-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110983
PMID:35732116
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康和结核分枝杆菌（Mtb）感染小鼠的肺淋巴细胞，发现Mtb感染导致淋巴细胞中I型IFN信号特征的富集 | 首次在单细胞层面揭示了Mtb感染后肺淋巴细胞中I型IFN信号特征的富集，并验证了Ly6A作为淋巴细胞活化标记物的上调 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 旨在深入理解结核分枝杆菌感染后免疫反应的细胞水平动态，以设计更好的结核病控制策略 | 健康和结核分枝杆菌感染小鼠的肺淋巴细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康和结核分枝杆菌感染小鼠的肺淋巴细胞样本 |
| 20912 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq of a soft-tissue sarcoma model reveals the critical role of tumor-expressed MIF in shaping macrophage heterogeneity
2022-06-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110977
PMID:35732118
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究软组织肉瘤模型，揭示肿瘤表达的MIF在塑造巨噬细胞异质性中的关键作用 | 首次详细描述了软组织肉瘤模型中巨噬细胞的不同激活状态，并证明了MIF在调节巨噬细胞激活状态和促肿瘤潜能中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类软组织肉瘤存在差异 | 探讨软组织肉瘤微环境中的免疫成分，特别是巨噬细胞的异质性及其调控机制 | 软组织肉瘤模型中的巨噬细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型中的软组织肉瘤样本 |
| 20913 | 2024-08-08 |
Joint profiling of gene expression and chromatin accessibility during amphioxus development at single-cell resolution
2022-06-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110979
PMID:35732129
|
research paper | 本文通过单细胞核RNA测序（snRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，对文昌鱼的不同发育阶段进行了基因表达和染色质可及性的联合分析 | 首次在文昌鱼中进行基因表达和染色质可及性的单细胞分辨率联合分析，构建了文昌鱼的发育树 | NA | 探索脊椎动物的起源和进化 | 文昌鱼的基因表达和染色质可及性 | digital pathology | NA | 单细胞核RNA测序（snRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达和染色质可及性数据 | 涵盖文昌鱼的胚胎发生和成体组织不同阶段 |
| 20914 | 2024-08-08 |
Identification of prostate cancer subtypes based on immune signature scores in bulk and single-cell transcriptomes
2022-Jun-18, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-022-01719-7
PMID:35716212
|
研究论文 | 本研究基于肿瘤免疫微环境中的28种免疫细胞类型的富集分数，通过无监督聚类方法识别前列腺癌的免疫特异性亚型 | 首次在大量和单细胞转录组数据中识别出前列腺癌的免疫特异性亚型，并探讨了这些亚型与临床特征的关系 | NA | 探索前列腺癌的免疫微环境异质性及其与临床特征的相关性 | 前列腺癌的免疫特异性亚型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 转录组数据 | 十个不同的肿瘤转录组数据集和一个单细胞RNA测序数据集 |
| 20915 | 2024-08-08 |
Comprehensive characterization of the prostate tumor microenvironment identifies CXCR4/CXCL12 crosstalk as a novel antiangiogenic therapeutic target in prostate cancer
2022-06-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01597-7
PMID:35717322
|
研究论文 | 本文详细描述了前列腺癌肿瘤内皮细胞（TEC）的特征，并揭示了CXCR4/CXCL12相互作用作为前列腺癌抗血管生成治疗新靶点的潜力 | 通过单细胞RNA测序和多组学分析，首次在前列腺癌中详细描述了肿瘤内皮细胞的分子特征，并验证了CXCR4/CXCL12相互作用作为治疗靶点 | 研究样本仅来自67例根治性前列腺切除术标本，且主要在体外和小鼠模型中验证，需要进一步在临床试验中验证其疗效 | 揭示前列腺癌肿瘤微环境中细胞间相互作用，寻找新的治疗靶点 | 前列腺癌肿瘤内皮细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 67例新鲜根治性前列腺切除术标本 |
| 20916 | 2024-08-08 |
Comparative parallel multi-omics analysis during the induction of pluripotent and trophectoderm states
2022-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31131-8
PMID:35715410
|
研究论文 | 本文通过比较并行多组学分析（包括bulk RNA-seq、scRNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq、RRBS和CNVs）研究了细胞在体外通过核重编程获得多能性和滋养层细胞状态的过程，揭示了两种状态获取的不同轨迹。 | 本研究首次展示了细胞重编程至多能性和滋养层细胞状态的特定轨迹，提出了‘V’形模型，并详细描述了两种状态获取的不同轨迹和阶段特异性标记物、阻断剂、促进剂及滋养层细胞亚群。 | NA | 探讨细胞在体外通过核重编程获得多能性和滋养层细胞状态的动态过程及其相似性。 | 细胞重编程至多能性和滋养层细胞状态的过程。 | 生物信息学 | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, RRBS, CNVs | NA | 基因组数据 | NA |
| 20917 | 2024-08-08 |
scCAN: single-cell clustering using autoencoder and network fusion
2022-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-14218-6
PMID:35715568
|
研究论文 | 介绍了一种名为scCAN的新方法，该方法利用自动编码器和网络融合技术对单细胞RNA测序数据进行无监督聚类 | scCAN能够准确地分离大型和稀疏的单细胞RNA测序数据中的不同细胞类型，并且在准确性和可扩展性方面优于现有的先进方法 | NA | 开发一种新的方法来克服单细胞RNA测序数据分析中的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 自动编码器和网络融合 | 自动编码器 | 单细胞RNA测序数据 | 28个真实单细胞RNA测序数据集（超过三百万个细胞）和243个模拟数据集 |
| 20918 | 2024-08-08 |
Benchmarking imputation methods for network inference using a novel method of synthetic scRNA-seq data generation
2022-Jun-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04778-9
PMID:35715748
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Biomodelling.jl的工具，用于生成合成scRNA-seq数据，并评估不同插补方法对基因调控网络推断算法性能的影响。 | 开发了一种新的合成scRNA-seq数据生成方法，用于基准测试基因调控网络推断的不同方法。 | NA | 评估插补方法对单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的影响。 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 多尺度模型 | 基因表达数据 | 合成数据 |
| 20919 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of neuroepithelial cells and other cell types of the gills of zebrafish (Danio rerio) exposed to hypoxia
2022-06-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-13693-1
PMID:35710785
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了暴露于低氧环境下的斑马鱼鳃中的神经上皮细胞和其他细胞类型的转录组特征 | 首次全面揭示了斑马鱼鳃中多种细胞类型的转录组图谱，特别是神经上皮细胞在低氧条件下的基因表达变化 | NA | 研究斑马鱼鳃在低氧环境下的细胞转录组变化 | 斑马鱼鳃中的神经上皮细胞和其他细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12,819个细胞 |
| 20920 | 2024-08-08 |
Integrated analysis reveals the pivotal interactions between immune cells in the melanoma tumor microenvironment
2022-06-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-14319-2
PMID:35710862
|
研究论文 | 本研究通过综合分析微阵列数据和单细胞RNA测序数据，揭示了黑色素瘤微环境中免疫细胞间的关键相互作用 | 发现了CCL5-CCR1、SELPLG-SELL、CXCL10-CXCR3和CXCL9-CXCR3通路在肿瘤微环境中免疫细胞间通信的重要作用 | NA | 确定肿瘤与免疫系统相互作用的机制及其分子决定因素，以改善癌症免疫治疗 | 黑色素瘤微环境中免疫细胞间的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 微阵列数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GEO2R获取的正常和恶性组织中的差异表达基因（DEGs），以及GSE123139中的单细胞分析数据 |