单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32070 篇文献，本页显示第 20881 - 20900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20881 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomic reconstruction of the mouse olfactory glomerular map suggests principles of odor processing
2022-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01030-8
PMID:35314823
|
research paper | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术，生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的地图 | 本研究首次生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的详细地图，并提出了可能的组织原则，有助于大脑进行气味解码 | 研究仅限于小鼠嗅球中的glomeruli位置，未涉及其他物种或更广泛的嗅觉系统功能 | 探究小鼠嗅球中glomeruli位置与气味辨别之间的关系 | 小鼠嗅球中的glomeruli位置及其在气味处理中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 20882 | 2024-08-05 |
Update on Biomarkers in Renal Cell Carcinoma
2024-Jan, American Society of Clinical Oncology educational book. American Society of Clinical Oncology. Annual Meeting
DOI:10.1200/EDBK_430734
PMID:38207251
|
研究论文 | 该文章更新了肾细胞癌生物标志物的相关进展 | 本文创新性地探索了宿主因素及其对免疫系统的深入特征化，并提出了新技术以克服现有技术面临的挑战 | 尽管对肿瘤内在特征进行了广泛研究，但尚未提供明确和可靠的预测生物标志物 | 本文旨在识别能够预测治疗反应和耐药性的生物标志物 | 研究对象主要是肾细胞癌及其相关的生物标志物 | 肿瘤病理学 | 肾癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20883 | 2024-08-07 |
A proteome-wide screen identifies the calcium binding proteins, S100A8/S100A9, as clinically relevant therapeutic targets in aortic dissection
2024-Jan, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.107029
PMID:38056513
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析，发现钙结合蛋白S100A8/S100A9在主动脉夹层中作为新的治疗靶点 | 首次确定S100A8/S100A9作为主动脉夹层的治疗靶点，并通过药物ABR-25757验证其安全性和有效性 | NA | 发现主动脉夹层的新治疗靶点 | 主动脉夹层患者和对照组的升主动脉样本 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20884 | 2024-08-05 |
Neural tube-associated boundary caps are a major source of mural cells in the skin
2023-Dec-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.69413
PMID:38095361
|
研究论文 | 本文研究了神经管相关的边界帽细胞在皮肤血管中作为重要的壁细胞来源的作用 | 揭示了边界帽细胞衍生物的多样性及其在小鼠皮肤中的壁细胞来源的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，结果的普遍适用性仍需进一步验证 | 探讨边界帽细胞在皮肤血管发育中的作用 | 小鼠中的边界帽细胞衍生物 | NA | NA | Cre基础报告细胞追踪和单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠模型中涉及的数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 20885 | 2024-08-07 |
Multimodal single-cell datasets characterize antigen-specific CD8+ T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01608-9
PMID:37735591
|
研究论文 | 本研究利用多模态测序技术对mRNA疫苗BNT162b2接种前后循环人白细胞进行纵向分析，以表征和量化T细胞反应 | 本研究定义了CD8 T细胞的转录组、可及染色质景观和免疫表型，并识别了每种模态中的独特生物标志物 | NA | 研究SARS-CoV-2感染或疫苗接种后抗原特异性CD8+ T细胞的特征 | SARS-CoV-2疫苗接种和感染后的抗原特异性CD8+ T细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 多模态测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 接种mRNA疫苗BNT162b2前后收集的循环人白细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20886 | 2024-08-05 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551188
PMID:37577612
|
研究论文 | 本文探讨了如何通过常规染色法推断空间转录组学信息，以增强皮肤光老化的大规模分子评估 | 提出了一种利用常规H&E染色切片推断空间转录组学信息的新方法，以提高评估光老化的可靠性 | 使用最先进的空间转录组学技术成本高，且不同患者间存在变异性，限制了大规模分子流行病学研究的范围 | 研究空间转录组学在皮肤光老化评估中的应用潜力 | 分析261个皮肤标本中4位患者的基底细胞和鳞状细胞肿瘤切片 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 261个皮肤标本，分析4位患者的切片 | NA | NA | NA | NA |
| 20887 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics uncovers cellular architecture and developmental trajectories in hepatoblastoma
2023-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32775
PMID:36059151
|
研究论文 | 本研究揭示了肝母细胞瘤的细胞结构和发育轨迹 | 利用单细胞转录组分析，建立了肝母细胞瘤的细胞层级和亚型分类方法 | 基于仅五名患者的样本，样本量较小 | 探讨肝母细胞瘤的肿瘤发生机制及其异质性 | 肝母细胞瘤患者的肿瘤及配对远端肝组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 五名肝母细胞瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20888 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2023-May-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2880248/v1
PMID:37293022
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了肾纤维化中活化成纤维细胞的转录特征，并识别了新的持久远端小管损伤模式 | 首次确定了三种具有特定转录特征的成纤维细胞簇，并识别了肾小管损伤的新空间模式 | 研究未提及样本数量及其具体来源 | 深入理解肾纤维化的分子机制和促进靶向策略的开发 | 分析了两种与临床相关的肾纤维化模型中的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20889 | 2024-08-07 |
RhoA GEF Mcf2lb regulates rosette integrity during collective cell migration
2023-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537573
PMID:37131612
|
研究论文 | 本文研究了RhoA GEF Mcf2lb在多细胞迁移过程中对花环结构完整性的调控作用 | 首次揭示了Mcf2lb通过激活RhoA调控细胞顶端收缩，从而影响花环结构的形成和维持 | NA | 探究花环结构形成和维持的分子机制 | RhoA GEF Mcf2lb在多细胞花环结构中的作用 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 图像 | 约150个细胞组成的斑马鱼后侧线原基(pLLP) | NA | NA | NA | NA |
| 20890 | 2024-08-07 |
Self-organized BMP signaling dynamics underlie the development and evolution of digit segmentation patterns in birds and mammals
2024-Jan-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2304470121
PMID:38175868
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间基因表达分析，结合数学模型，研究了鸟类和哺乳动物趾部分节模式的发育和进化机制 | 首次揭示了BMP信号通路中的自组织Turing系统如何形成周期性的关节模式，并能重现体内观察到的时空基因表达动态 | NA | 探讨BMP信号通路在鸟类和哺乳动物趾部分节模式发育中的作用 | 鸟类和哺乳动物的趾部分节模式 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20891 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Pancreatic Islets From Early Diabetic Mice Identifies Anxa10 for Ca2+ Allostasis Toward β-Cell Failure
2024-Jan-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0212
PMID:37871012
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了早期糖尿病小鼠胰腺胰岛的转录组，发现Anxa10基因在钙离子异稳态中的作用及其与β细胞功能障碍的关系 | 发现了糖尿病特异性的内分泌和非内分泌细胞类型的转录组景观，并识别了一个新的前糖尿病基因Anxa10，该基因在代谢应激下诱导并调节钙离子流入 | NA | 揭示2型糖尿病中β细胞功能障碍的全面机制 | 早期糖尿病小鼠的胰腺胰岛 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 糖尿病db/db小鼠的胰腺胰岛 | NA | NA | NA | NA |
| 20892 | 2024-08-07 |
Phospholipase A2 Group IIA Is Associated with Inflammatory Hepatocellular Adenoma
2023-Dec-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010159
PMID:38201587
|
研究论文 | 本研究旨在全面调查肝细胞腺瘤（HCA）的亚型分类，并比较分析HCA和肝细胞癌（HCC）组织之间的基因表达谱 | 发现磷脂酶A2组IIA（PLA2G2A）mRNA在炎症性HCA中特异性表达，这可能有助于炎症性HCA的新定义 | 研究结果需要通过其他新鲜HCA样本进行验证 | 研究HCA的亚型分类及其与HCC的基因表达差异 | 炎症性HCA、非B非C HCC、乙型肝炎病毒相关HCC及正常肝组织 | NA | 肝细胞腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 1个炎症性HCA，3个非B非C HCC，2个乙型肝炎病毒相关HCC，1个正常肝组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20893 | 2024-08-07 |
A new insight of immunosuppressive microenvironment in osteosarcoma lung metastasis
2023-06, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702231171900
PMID:37439349
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析单细胞RNA测序数据，揭示了骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境的复杂性 | 首次详细分类了骨肉瘤肺转移中的17个细胞集群，并发现CD63在决定T细胞和恶性细胞浸润中的关键作用 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境，为精准治疗提供依据 | 骨肉瘤肺转移的细胞集群及其免疫特性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 75,317个细胞，来自两个骨肉瘤肺转移和五个正常肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 20894 | 2024-08-07 |
Uncovering cell identity through differential stability with Cepo
2021-Dec, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-021-00172-2
PMID:38217190
|
研究论文 | 本文介绍了Cepo方法，通过分析单细胞RNA测序数据中的差异稳定基因来定义细胞身份 | Cepo方法在多个数据集上表现优于现有方法，提高了细胞身份分配和相关应用的准确性 | NA | 探索细胞身份的定义 | 单细胞RNA测序数据中的差异稳定基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 20895 | 2024-08-07 |
Modeling gene regulatory networks using neural network architectures
2021-Jul, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-021-00099-8
PMID:38217125
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DeepSEM的深度生成模型，用于联合推断基因调控网络（GRN）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的生物学意义表示 | 开发了一种神经网络版本的结构方程模型（SEM），明确模拟基因间的调控关系 | NA | 研究目的是开发一种新方法来分析单细胞RNA测序数据并推断基因调控网络 | 基因调控网络和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20896 | 2024-08-07 |
Enabling single-cell trajectory network enrichment
2021-Feb, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-021-00025-y
PMID:38217228
|
研究论文 | 本文开发了一种名为Scellnetor的网络约束时间序列聚类算法，用于单细胞测序数据分析，以揭示细胞分化过程中的基因表达网络模式 | Scellnetor算法能够提取解释两个发育轨迹调控差异的时间差异基因表达网络模式，将单细胞测序数据分析提升到系统生物学水平 | NA | 开发新的工具以增强单细胞测序数据在系统生物学层面的分析能力 | 单细胞测序数据中的细胞分化过程及其基因表达网络模式 | 系统生物学 | NA | scRNA-seq | 网络约束时间序列聚类算法 | 基因表达数据 | 使用已知特征的实验模型系统进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 20897 | 2024-08-07 |
HAMSAB diet ameliorates dysfunctional signaling in pancreatic islets in autoimmune diabetes
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108694
PMID:38213620
|
研究论文 | 本文研究了HAMSAB饮食对自身免疫性糖尿病中胰腺胰岛功能障碍信号的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了HAMSAB饮食对胰腺胰岛细胞基因表达的影响 | 研究主要在NOD小鼠模型中进行，需要进一步在人类患者中验证 | 探讨HAMSAB饮食对改善1型糖尿病血糖控制的作用机制 | 胰腺胰岛细胞及其中免疫细胞的基因表达 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NOD小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 20898 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data revealed T cell marker genes based molecular sub-types and a prognostic signature in lung adenocarcinoma
2024-01-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50787-w
PMID:38200058
|
研究论文 | 本研究揭示了基于T细胞标记基因的肺腺癌分子亚型和预后特征 | 提出了一种基于T细胞标记基因的预后签名，具有预测肺腺癌患者免疫治疗结果的潜力 | 该研究的特定T细胞贡献尚未得到充分探讨 | 旨在基于T细胞标记基因 delineate 分子亚型和预后指标 | 研究肺腺癌（LUAD）中T细胞的作用及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Cox分析 | 单细胞数据和批量RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20899 | 2024-08-07 |
Identification of CD8+ T-cell exhaustion signatures for prognosis in HBV-related hepatocellular carcinoma patients by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-Jan-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11804-3
PMID:38200408
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别了与HBV相关肝细胞癌患者预后相关的CD8+ T细胞耗竭特征。 | 建立了新的CD8+ T细胞耗竭指数（TEI）模型，该模型有望预测HBV相关肝细胞癌患者的临床预后和潜在的免疫治疗效果。 | NA | 研究CD8+ T细胞耗竭特征在HBV相关肝细胞癌患者中的预后价值及免疫治疗反应。 | HBV相关肝细胞癌患者的CD8+ T细胞耗竭特征。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20900 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Sequence Profiling on the Morphogenesis of Secondary Hair Follicles in Ordos Fine-Wool Sheep
2024-Jan-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010584
PMID:38203755
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序分析了Ordos细毛羊次级毛囊形态发生过程中的分子机制 | 首次揭示了Ordos细毛羊次级毛囊形态发生的分子机制，并通过伪时间分析构建了真皮系细胞和表皮系细胞的分化轨迹 | NA | 旨在分析Ordos细毛羊毛囊形成过程中的分子机制，以改善其纤维直径和羊毛产量 | Ordos细毛羊的次级毛囊形态发生 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |