单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20881 - 20900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20881 | 2024-08-08 |
Discovering Immune-Mediated Mechanisms of Gastric Carcinogenesis Through Single-Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.902017
PMID:35757757
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胃癌免疫学领域的应用，揭示了免疫细胞在胃癌发生中的作用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的肿瘤内和肿瘤间异质性的免疫学、细胞和分子水平见解 | 当前研究识别了肿瘤微环境中多种巨噬细胞和肥大细胞亚群，但需要进一步研究确定它们促进癌症生长的作用 | 探讨单细胞RNA测序技术在胃癌免疫机制研究中的应用和发现 | 胃癌组织、胃癌患者腹水及实验室胃病模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及胃癌组织、腹水及实验室模型数据 |
| 20882 | 2024-08-08 |
Intestinal accumulation of microbiota-produced succinate caused by loss of microRNAs leads to diarrhea in weanling piglets
2022 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2022.2091369
PMID:35758253
|
研究论文 | 本研究通过猪模型探讨了断奶应激诱导腹泻的机制，发现肠道微生物产生的琥珀酸在微小RNA缺失情况下积累，导致腹泻。 | 首次揭示了微小RNA缺失导致肠道微生物产生的琥珀酸积累，进而引发断奶仔猪腹泻的机制。 | 研究仅限于猪模型，需要进一步在其他动物模型或人类中验证。 | 阐明和丰富断奶应激诱导腹泻的机制基础。 | 断奶仔猪的腹泻及其与肠道微生物和代谢物的关系。 | NA | 腹泻 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及断奶仔猪的粪便微生物组、代谢物和微小RNA水平。 |
| 20883 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis and Multiple Machine Learning Methods Identified G0S2 and HPSE as Novel Biomarkers for Abdominal Aortic Aneurysm
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.907309
PMID:35769488
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、加权共表达网络分析和差异表达分析，结合多种机器学习方法，从公共数据库中识别出腹主动脉瘤的新型生物标志物G0S2和HPSE，并验证了它们在不同数据集中的表现。 | 首次通过单细胞测序和机器学习方法识别出腹主动脉瘤的新型生物标志物G0S2和HPSE，并探讨了它们与免疫细胞浸润的关系。 | 研究主要依赖公共数据库数据，未涉及临床样本的直接验证。 | 识别腹主动脉瘤的新型生物标志物，以促进其病理机制的理解和治疗策略的发展。 | 腹主动脉瘤的生物标志物及其与免疫细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 288个差异表达基因（DEGs）用于腹主动脉瘤和正常样本，17个DEGs用于大和小腹主动脉瘤样本。 |
| 20884 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals that DBI is the Key Gene and Potential Therapeutic Target in Quiescent Bladder Cancer Stem Cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.904536
PMID:35769986
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在肌肉侵袭性膀胱癌（MIBC）中识别癌症干细胞（CSCs），并评估其分子特征，以发现可能的治疗措施 | 本研究首次识别出DBI作为静止期膀胱癌干细胞的关键基因，并预测了乙酰氨基酚作为潜在的治疗药物 | 研究主要基于GEO数据库和TCGA数据集进行分析，未来需要进一步的实验验证 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别膀胱癌干细胞并探索其治疗策略 | 肌肉侵袭性膀胱癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GEO数据集GSE130001和GSE146137以及TCGA数据集 |
| 20885 | 2024-08-05 |
Modulation of Atg genes expression in aged rat liver, brain, and kidney by caloric restriction analyzed via single-nucleus/cell RNA sequencing
2023-02, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2022.2091903
PMID:35737739
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析卡路里限制对老龄大鼠肝脏、大脑和肾脏中自噬相关基因表达的调节 | 首次提供了哺乳动物在衰老过程中不同器官中特定细胞类型中基因表达的综合信息，并提供了自噬和卡路里限制在单细胞分辨率下的保护作用的新见解 | 在单细胞水平尚未阐明衰老过程中自噬相关基因的转录网络 | 探讨卡路里限制如何在衰老过程中调节自噬相关基因的表达 | 老龄大鼠的肝脏、大脑和肾脏中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 大鼠的多个细胞类型 |
| 20886 | 2024-08-08 |
A 3-Gene Random Forest Model to Diagnose Non-obstructive Azoospermia Based on Transcription Factor-Related Henes
2023-01, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-022-01008-8
PMID:35715550
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法，基于转录因子相关基因，建立了一个用于诊断非阻塞性无精症的3基因随机森林模型 | 本研究首次筛选并验证了ETV2、TBX2和ZNF689三个转录因子在非阻塞性无精症诊断中的高诊断能力，并成功建立了随机森林诊断模型 | NA | 旨在通过机器学习算法识别具有高诊断能力的转录因子，用于非阻塞性无精症的诊断 | 非阻塞性无精症的诊断标志物 | 机器学习 | 男性不育症 | RT-qPCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 转录组数据 | 训练数据集包括11个对照组和47个非阻塞性无精症患者，外部验证集包括31个和20个样本，本地验证集包括20个对照组和20个非阻塞性无精症患者，单细胞RNA测序分析基于432个睾丸细胞样本 |
| 20887 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma
2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04073-3
PMID:35713707
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了尤文肉瘤的异质性和发育轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了尤文肉瘤的细胞起源和发育轨迹，并发现了JAK1基因在肿瘤发生中的重要作用 | 研究仅使用了4个尤文肉瘤肿瘤组织样本，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 探究尤文肉瘤的异质性和发育轨迹，并寻找潜在的治疗靶点 | 尤文肉瘤肿瘤细胞的起源和发育过程 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | K-最近邻算法 | 转录组数据 | 4个尤文肉瘤肿瘤组织样本 |
| 20888 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq dissecting heterogeneity of tumor cells and comprehensive dynamics in tumor microenvironment during lymph nodes metastasis in gastric cancer
2022-10-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34172
PMID:35716132
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胃癌原发肿瘤和转移淋巴结中的肿瘤细胞异质性及肿瘤微环境动态变化 | 首次全面揭示了胃癌原发肿瘤和转移淋巴结中肿瘤细胞和肿瘤微环境的异质性，并识别出具有淋巴结转移潜力的胃癌细胞亚型 | NA | 揭示胃癌淋巴结转移过程中肿瘤细胞的动态变化及潜在机制 | 胃癌原发肿瘤和转移淋巴结的肿瘤细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 胃癌原发肿瘤和转移淋巴结的组织样本 |
| 20889 | 2024-08-08 |
A map of the spatial distribution and tumour-associated macrophage states in glioblastoma and grade 4 IDH-mutant astrocytoma
2022-10, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5984
PMID:35723032
|
研究论文 | 本研究旨在解析高级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的转录状态、空间分布及临床病理意义 | 首次揭示了IDH突变型4级星形细胞瘤中TAMs的多样性及其功能状态，并探讨了其在肿瘤微环境中的空间分布和临床相关性 | 研究样本量较小，仅包括四例人类胶质母细胞瘤和三例IDH突变型4级星形细胞瘤 | 探讨高级别胶质瘤中TAMs的多样性及其在肿瘤微环境中的作用和临床意义 | 高级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其在IDH突变型4级星形细胞瘤中的多样性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24,227个髓系细胞 |
| 20890 | 2024-08-08 |
Development of a novel signature derived from single cell RNA-sequencing for preoperative prediction of lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2022-10, Head & neck
DOI:10.1002/hed.27126
PMID:35726502
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发并验证了一种用于头颈部鳞状细胞癌患者术前预测淋巴结转移的LNM特征 | 首次利用单细胞RNA测序数据开发了一种新的LNM特征，用于术前预测头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移 | NA | 开发并验证一种用于术前预测头颈部鳞状细胞癌患者淋巴结转移的LNM特征 | 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | NA |
| 20891 | 2024-08-08 |
Regional and age-related diversity of human mature oligodendrocytes
2022-10, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24230
PMID:35735919
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了人成熟少突胶质细胞（MOLs）在不同脑区和年龄段的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人成熟少突胶质细胞在不同脑区和年龄段的转录异质性 | 研究仅限于特定脑区和脊髓样本，可能无法全面代表所有脑区的少突胶质细胞异质性 | 探讨人成熟少突胶质细胞在不同脑区和年龄段的异质性 | 人成熟少突胶质细胞（MOLs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自皮质/皮质下、室下带脑组织样本和胸腰椎脊髓样本的细胞 |
| 20892 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics identifies enriched gene expression and cell types in human liver fibrosis
2022-09, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.2001
PMID:35726350
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学结合单细胞RNA测序和基因解卷积分析，探索了纤维化肝脏区域中细胞类型的定位。 | 首次使用空间转录组学与单细胞RNA测序相结合的方法，精确地定位了纤维化肝脏中的细胞类型及其基因表达。 | 研究样本量较小，且仅限于特定类型的肝病患者。 | 评估纤维化肝脏区域是否特异性地富集某些细胞类型，并探索这些细胞类型的空间定位。 | 纤维化肝脏组织中的细胞类型及其基因表达。 | 数字病理学 | 肝病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 基因解卷积分析 | 基因表达数据 | 8例终末期肝病患者样本 |
| 20893 | 2024-08-08 |
Isolation of Leydig cells from adult rat testes by magnetic-activated cell sorting protocol based on prolactin receptor expression
2022-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13211
PMID:35735181
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研究论文 | 本文介绍了一种基于催乳素受体表达的磁激活细胞分选方法，用于从成年大鼠睾丸中大量分离高纯度和活性的莱迪细胞。 | 本文提出了一种新的方法，通过磁激活细胞分选技术，基于催乳素受体表达，成功从成年大鼠睾丸中分离出高产量、高纯度和高活性的莱迪细胞。 | NA | 研究莱迪细胞的分离方法，以提高细胞的产量、纯度和活性，进而用于体外研究细胞的生理学、药理学和毒理学。 | 成年大鼠睾丸中的莱迪细胞。 | NA | NA | 磁激活细胞分选（MACS） | NA | 细胞 | 每个睾丸约10^6个细胞 |
| 20894 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies Col1a1 and Col1a2 as hub genes in obesity-induced cardiac fibrosis
2022-08-27, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.06.018
PMID:35714568
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，筛选肥胖诱导的心脏纤维化的关键标志物 | 首次通过单细胞转录组学技术识别出Col1a1和Col1a2作为肥胖诱导心脏纤维化的枢纽基因 | 研究仅在肥胖小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 旨在早期检测和治疗肥胖相关的心脏疾病，以限制其进展 | 肥胖诱导的心脏纤维化及其关键标志物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及15种不同细胞类型，包括纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞，共33个差异表达基因 |
| 20895 | 2024-08-08 |
Accounting for Errors in Data Improves Divergence Time Estimates in Single-cell Cancer Evolution
2022-08-03, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msac143
PMID:35733333
|
研究论文 | 本文提出了一种在单细胞癌症进化分析中考虑数据误差的方法，通过在成熟的贝叶斯框架BEAST2中引入错误和突变模型，提高了相对分歧时间和替代参数的准确性。 | 本文的创新点在于开发了一种能够在单细胞数据进化推断中考虑误差的贝叶斯框架，并展示了这种模型在提高分歧时间估计准确性方面的效果。 | NA | 研究目的是改进单细胞癌症进化分析中分歧时间的估计，通过考虑数据误差来提高分析的准确性。 | 研究对象包括单细胞DNA测序数据，特别是结直肠癌患者和健康患者的细胞进化历史。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 贝叶斯框架 | DNA序列数据 | 包括结直肠癌患者和健康患者的单细胞DNA测序数据 |
| 20896 | 2024-08-08 |
Astrocyte ethanol exposure reveals persistent and defined calcium response subtypes and associated gene signatures
2022-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102147
PMID:35716779
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研究论文 | 本研究结合钙信号测量和基因表达分析，定义了乙醇诱导的星形胶质细胞亚型 | 首次揭示了乙醇诱导的星形胶质细胞钙响应的亚型及其相关的基因特征 | NA | 研究乙醇暴露下星形胶质细胞的功能及其对大脑生理和病理的影响 | 星形胶质细胞在乙醇暴露下的钙信号响应和基因表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 钙信号数据和基因表达数据 | 不同响应类型的星形胶质细胞 |
| 20897 | 2024-08-08 |
Dichotomous Roles of Smooth Muscle Cell-Derived MCP1 (Monocyte Chemoattractant Protein 1) in Development of Atherosclerosis
2022-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.317882
PMID:35735018
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研究论文 | 本研究探讨了平滑肌细胞衍生的MCP1在动脉粥样硬化发展中的双重作用 | 首次确定了Lgals3过渡型炎症性平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的功能 | NA | 探索平滑肌细胞在动脉粥样硬化斑块稳定性中的作用机制 | 平滑肌细胞衍生的MCP1在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | 使用平滑肌细胞系追踪小鼠和双系追踪系统进行研究 |
| 20898 | 2024-08-08 |
Very-low-density lipoprotein receptor-enhanced lipid metabolism in pancreatic stellate cells promotes pancreatic fibrosis
2022-07-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.06.001
PMID:35738281
|
研究论文 | 研究探讨了低密度脂蛋白受体增强的脂质代谢在胰腺星状细胞中促进胰腺纤维化的发生和机制 | 首次揭示了低密度脂蛋白受体在胰腺星状细胞中的脂质代谢增强与胰腺纤维化的关系，并强调了IL-33在此过程中的主导作用 | NA | 研究脂蛋白代谢紊乱与胰腺纤维化环境之间的关系 | 胰腺星状细胞的激活机制及其在慢性胰腺炎中纤维化加剧的作用 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20899 | 2024-08-08 |
Lymphatics act as a signaling hub to regulate intestinal stem cell activity
2022-07-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.05.007
PMID:35728595
|
研究论文 | 本文报道了小肠和大肠的隐窝基部存在一个淋巴网络，该网络与肠道干细胞（ISCs）紧密相关，并通过体内功能丧失和淋巴器官共培养实验，揭示了淋巴系统维持ISCs并抑制其过早分化的作用。 | 首次揭示了淋巴系统在小肠和大肠隐窝中作为信号中枢，直接影响ISCs的再生能力，并通过单细胞和空间转录组学技术，使用BayesPrism和SpaceFold工具，高分辨率地绘制了隐窝微环境的信号图谱。 | NA | 研究淋巴系统在肠道干细胞微环境中的作用及其对干细胞行为的调控机制。 | 肠道干细胞（ISCs）及其微环境中的淋巴系统。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20900 | 2024-08-08 |
A probabilistic Boolean model on hair follicle cell fate regulation by TGF-β
2022-07-05, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2022.05.035
PMID:35714600
|
研究论文 | 本文开发了一种新的概率布尔网络（pBN）模型，用于理解头发 follicle（HF）细胞命运调控的机制，特别是TGF-β在HF细胞命运调控中的双重作用 | 首次采用概率布尔网络模型来模拟HF上皮细胞基因调控动力学，并结合单细胞RNA测序数据进行模型优化 | 模型主要基于文献和单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的实验验证 | 理解HF细胞命运调控的机制，特别是TGF-β的双重作用 | 头发 follicle（HF）细胞命运调控 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率布尔网络（pBN） | 基因调控网络 | NA |