单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20861 - 20880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20861 | 2024-08-08 |
[The Expression of RTN1 in Lung Adenocarcinoma and
Its Effect on Immune Microenvironment]
2022-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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研究论文 | 本研究探讨了RTN1在肺腺癌中的表达及其对免疫微环境的影响 | 首次报道了RTN1在肺腺癌患者中的表达及其对免疫微环境的影响 | 相关机制需要进一步研究 | 研究RTN1在肺腺癌中的表达及其与免疫浸润和生存的相关性 | 肺腺癌患者中的RTN1表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | Tumor Immune Estimation Resource 2.0 (TIMER 2.0), Gene Expression Profiling Interactive Analysis 2 (GEPIA 2), 基因集富集分析, 单细胞测序 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用TCGA队列的数据 |
| 20862 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of the Drosophila Leg Disc Identifies a Long Non-Coding RNA in Late Development
2022-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23126796
PMID:35743238
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，探索了一种新型长非编码RNA在果蝇腿部发育中的作用 | 首次在果蝇腿部发育过程中鉴定出一种新型长非编码RNA，并通过单细胞技术验证了其在晚期发育中的高表达 | NA | 研究长非编码RNA在果蝇腿部发育中的作用 | 果蝇第三龄幼虫的腿部盘 | 基因调控 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育时间点的果蝇第三龄幼虫腿部盘细胞 |
| 20863 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis Reveals S100a8/a9 Regulates Autophagy and Apoptosis through the MAPK and PI3K-AKT Signaling Pathway in the Early Stage of Myocardial Infarction
2022-06-13, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11121911
PMID:35741040
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研究论文 | 本研究通过分析心肌梗死早期小鼠的scRNA-seq和mRNA-seq数据，发现S100a8和S100a9的表达先增加后减少，并与中性粒细胞数量变化相关，进一步通过功能富集分析发现S100a8和S100a9通过MAPK或PI3K-AKT信号通路调控心肌细胞的自噬和凋亡 | 本研究首次揭示了S100a8/a9在心肌梗死早期通过MAPK和PI3K-AKT信号通路调控心肌细胞自噬和凋亡的机制 | NA | 阐明心肌梗死早期发病机制并改善其早期治疗 | 心肌梗死早期心肌细胞自噬和凋亡的调控机制 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | scRNA-seq, mRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 |
| 20864 | 2024-08-08 |
Region-Specific Characteristics of Astrocytes and Microglia: A Possible Involvement in Aging and Diseases
2022-06-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11121902
PMID:35741031
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综述 | 本文综述了不同脑区星形胶质细胞和小胶质细胞的异质性及其在衰老和神经退行性疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序等技术发现具有独特分子特征和不同功能的星形胶质细胞和小胶质细胞 | NA | 探讨脑区特异性星形胶质细胞和小胶质细胞在理解大脑整体功能中的重要性 | 星形胶质细胞和小胶质细胞在不同脑区的异质性 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20865 | 2024-08-08 |
Comprehensive Integrated Single-Cell Whole Transcriptome Analysis Revealed the p-EMT Tumor Cells-CAFs Communication in Oral Squamous Cell Carcinoma
2022-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23126470
PMID:35742914
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研究论文 | 本研究通过综合分析口腔鳞状细胞癌（OSCC）的单细胞RNA测序数据，揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）与部分上皮-间质转化（p-EMT）肿瘤细胞之间的相互作用 | 研究发现了四种CAF亚型、一种p-EMT肿瘤细胞群体及肿瘤细胞周期，并揭示了CAFs与p-EMT肿瘤细胞在肿瘤转移过程中的TNFSF12-TNFRSF25/TNFRSF12A相互作用 | NA | 旨在深入分析并整合OSCC的单细胞RNA测序数据，定义OSCC中的CAFs和p-EMT亚群，并揭示其细胞间相互作用网络 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和部分上皮-间质转化（p-EMT）肿瘤细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20866 | 2024-08-08 |
The Landscape of Noncoding RNA in Pulmonary Hypertension
2022-06-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12060796
PMID:35740920
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综述 | 本文综述了非编码RNA在肺动脉高压中的分类、生物发生、生物学功能及分子机制 | 强调了长非编码RNA和环状RNA在肺动脉高压中的重要作用及作为疾病生物标志物和治疗靶点的潜力 | NA | 总结非编码RNA在肺动脉高压中的研究进展，并探讨其作为生物标志物和治疗手段的应用与挑战 | 非编码RNA，特别是长非编码RNA和环状RNA | RNA研究 | 肺动脉高压 | RNA测序，单细胞和空间转录组学，RNA-蛋白质/RNA相互作用 | NA | 转录组 | NA |
| 20867 | 2024-08-08 |
Recommendations of scRNA-seq Differential Gene Expression Analysis Based on Comprehensive Benchmarking
2022-Jun-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12060850
PMID:35743881
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研究论文 | 本文开发了一种新型模拟器，用于指导分析人员在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中选择合适的差异基因表达分析工具和参数 | 开发了一种能够重现实验数据特征的模拟器，并展示了基于负二项混合模型的方法（如glmmTMB和NEBULA-HL）在差异基因表达分析中的优越性 | NA | 指导分析人员选择合适的工具和参数进行单细胞RNA测序数据的差异基因表达分析 | 单细胞RNA测序数据的差异基因表达分析方法 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 负二项混合模型 | scRNA-seq数据 | 多条件、多受试者的模拟数据 |
| 20868 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Mouse Pancreas: Characteristic Features of Pancreatic Ductal Cells in Chronic Pancreatitis
2022-06-05, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13061015
PMID:35741777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了正常小鼠和慢性胰腺炎小鼠胰腺细胞的转录组特征 | 首次详细描述了慢性胰腺炎小鼠胰腺细胞的单细胞转录组特征，并发现了疾病特异性生物标志物和潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探索慢性胰腺炎小鼠胰腺细胞的单细胞转录组特征及其在疾病中的作用 | 正常小鼠和慢性胰腺炎小鼠的胰腺细胞 | 数字病理学 | 慢性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3825个细胞，来自一只正常小鼠和慢性胰腺炎小鼠 |
| 20869 | 2024-08-08 |
Enabling automated and reproducible spatially resolved transcriptomics at scale
2022-Jun, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e09651
PMID:35756107
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研究论文 | 本文介绍了一种在广泛使用的Agilent Bravo液体处理平台上自动化的10x Genomics Visium文库构建方法，以提高空间转录组学分析的效率和重现性 | 提出的自动化方法将手动操作时间减少了80%以上，并提高了通量和稳健性 | NA | 旨在实现大规模空间转录组学分析的自动化和标准化 | 空间转录组学文库的自动化构建 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20870 | 2024-08-08 |
An Integrative Analysis of the Immune Features of Inactivated SARS-CoV-2 Vaccine (CoronaVac)
2022-May-30, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10060878
PMID:35746486
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研究论文 | 本文通过体外免疫细胞反应和大规模多组学分析，详细研究了接种CoronaVac（一种灭活SARS-CoV-2疫苗）后参与者的外周血单个核细胞（PBMCs）的免疫特征 | 首次详细描述了CoronaVac疫苗接种后的体外免疫特征，包括T细胞和B细胞的反应以及多组学分析结果 | NA | 深入理解CoronaVac疫苗的体外免疫特征 | 接种CoronaVac疫苗的参与者和COVID-19康复者的外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 大规模 |
| 20871 | 2024-08-08 |
Exploring the Interplay between Metabolism and Tumor Microenvironment Based on Four Major Metabolism Pathways in Colon Adenocarcinoma
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/2159794
PMID:35747126
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研究论文 | 本研究基于TCGA-COAD数据集，通过无监督共识聚类分析，根据四大代谢途径的富集分数确定了结肠腺癌的三种分子亚型，并利用单细胞RNA测序数据验证了亚型的可靠性及其与肿瘤微环境的关联。 | 本研究首次全面揭示了结肠腺癌中代谢与肿瘤微环境之间的相互作用，构建了一个有效的分子亚型分类系统，用于预测结肠腺癌的预后。 | 研究主要基于TCGA数据集和GSE17536验证集，可能需要更多样化的数据集来进一步验证结果的普遍性。 | 探索结肠腺癌中代谢与肿瘤微环境之间的相互作用，并建立一个有效的分子亚型分类系统以预测预后。 | 结肠腺癌的代谢途径及其与肿瘤微环境的关系。 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 无监督共识聚类分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA-COAD数据集和GSE17536验证集，以及GSE161277单细胞RNA测序数据 |
| 20872 | 2024-08-08 |
The Crosstalk Between Immune Infiltration, Circulating Tumor Cells, and Metastasis in Pancreatic Cancer: Identification of HMGB3 From a Multiple Omics Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.892177
PMID:35754798
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，探讨了胰腺癌中免疫浸润、循环肿瘤细胞与转移之间的关系，并识别出HMGB3作为关键基因 | 首次基于循环肿瘤细胞的bulk RNA测序和单细胞测序数据，揭示了胰腺癌转移的机制，并识别出HMGB3作为与转移相关的重要基因 | 研究依赖于公开数据库中的现有数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨胰腺癌中免疫浸润、循环肿瘤细胞与转移之间的关系，并识别关键基因 | 胰腺癌中的循环肿瘤细胞及其与转移的关系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序 | WGCNA | RNA | 多个数据集中的循环肿瘤细胞样本 |
| 20873 | 2024-08-08 |
Relationship Between CNVs and Immune Cells Infiltration in Gastric Tumor Microenvironment
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.869967
PMID:35754804
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌肿瘤微环境中拷贝数变异（CNVs）与免疫细胞浸润之间的关系 | 首次通过单细胞测序数据分析，识别并验证了胃癌中与CNVs高度相关的基因，并探讨了这些基因与免疫细胞浸润的关联 | NA | 旨在识别和验证胃癌的潜在治疗和预后靶点 | 胃癌中的拷贝数变异（CNVs）与免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | LASSO | RNA-seq数据 | 使用了来自GEO和TCGA的胃癌及正常上皮细胞的RNA-seq数据 |
| 20874 | 2024-08-08 |
Identification of a Recurrence Gene Signature for Ovarian Cancer Prognosis by Integrating Single-Cell RNA Sequencing and Bulk Expression Datasets
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.823082
PMID:35754835
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量表达数据集，识别出卵巢癌复发相关的基因特征，用于预测卵巢癌的预后 | 首次在单细胞水平上探索肿瘤复发的内在生物学机制，并从复发事件中衍生出新的预后标志物 | NA | 识别卵巢癌复发相关的基因特征，以提高对卵巢癌预后的理解并辅助治疗决策 | 卵巢癌患者的单细胞RNA测序和批量表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 基因风险模型 | 基因表达数据 | 524个卵巢癌样本 |
| 20875 | 2024-08-08 |
Aged Callus Skeletal Stem/Progenitor Cells Contain an Inflammatory Osteogenic Population With Increased IRF and NF-κB Pathways and Reduced Osteogenic Potential
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.806528
PMID:35755815
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠骨痂中的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs），揭示了老年骨痂中炎症性成骨细胞群的增加及其成骨潜能的降低 | 首次揭示了老年骨痂中骨骼干细胞/祖细胞的分子特征，特别是炎症性成骨细胞群的增加及其成骨潜能的降低 | NA | 研究老年骨痂中骨骼干细胞/祖细胞的分子特征 | 年轻和老年小鼠骨痂中的骨骼干细胞/祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,957个CD45CD31Ter119骨骼干细胞/祖细胞 |
| 20876 | 2024-08-08 |
Single Cell Meta-Analysis of Endothelial to Mesenchymal Transition (EndMT) in Glucose Metabolism of the Digestive Diseases
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.866408
PMID:35755820
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meta-分析 | 本研究旨在阐明内皮细胞向间质细胞转化（EndMT）在消化系统疾病中的作用及其代谢状态 | 首次发现EndMT在消化系统疾病中的作用及其在葡萄糖代谢中的关键作用 | NA | 阐明EndMT在消化系统疾病中的作用及其代谢状态 | 消化系统疾病中的EndMT及其代谢状态 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 涉及多种消化器官的组织样本，包括胃、肠和胰腺的癌前病变和癌症 |
| 20877 | 2024-08-08 |
Identification of Five Hub Genes Based on Single-Cell RNA Sequencing Data and Network Pharmacology in Patients With Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2022.894129
PMID:35757636
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和网络药理学方法，在急性心肌梗死患者中识别了五个关键基因 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学分析，识别了与急性心肌梗死进展相关的五个关键基因，并预测了一种潜在的抑制剂 | 研究主要基于数据库中的现有数据，未进行实验验证 | 旨在通过单细胞RNA测序和网络药理学方法，识别急性心肌梗死的关键基因及其潜在药物 | 急性心肌梗死患者的单细胞RNA测序数据和相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个细胞集群，标记为5种细胞类型 |
| 20878 | 2024-08-08 |
Single-Cell Landscape of Mouse Islet Allograft and Syngeneic Graft
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.853349
PMID:35757709
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠胰岛移植模型中的免疫异质性 | 首次全面分析了胰岛同种异体移植和同基因移植中免疫微环境的复杂性，并揭示了同种异体胰岛细胞向抗原呈递细胞样细胞的转变 | NA | 研究胰岛移植中的免疫排斥机制及其对移植功能的影响 | 小鼠胰岛同种异体移植和同基因移植中的免疫细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胰岛移植模型 |
| 20879 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of ILC2s in the Lungs
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.918458
PMID:35757740
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综述 | 本文综述了肺部第2组先天淋巴细胞（ILC2s）的异质性及其在免疫学中的新领域 | 探讨了ILC2s在不同组织环境中的多样性及其对免疫记忆和衰竭的影响 | 需要更全面的理解ILC2s的多样性，而不仅仅是单一截面的快照 | 阐明ILC2s如何影响人类疾病 | 肺部的第2组先天淋巴细胞（ILC2s） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | NA |
| 20880 | 2024-08-08 |
Tissue-Specific Diversity of Group 2 Innate Lymphoid Cells in the Skin
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.885642
PMID:35757747
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综述 | 本文综述了皮肤中第2组先天淋巴细胞（ILC2s）的组织特异性特征 | 讨论了皮肤ILC2s在细胞表面标记物表达模式、对组织衍生细胞因子的反应以及在稳态和炎症中的功能方面的不同特点 | NA | 探讨皮肤中ILC2s的表型和功能异质性，并强调ILC生物学领域的未来方向 | 皮肤中的第2组先天淋巴细胞（ILC2s） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | NA |