单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
20821 2024-08-08
Single-cell transcriptomic analysis of the tumor ecosystem of adenoid cystic carcinoma
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了腺样囊性癌(ACC)肿瘤生态系统的转录组特征 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ACC中不同类型上皮细胞的转录组特征,并识别出具有特殊拷贝数变异的癌前细胞 研究样本仅限于三位患者,可能影响结果的普遍性 探究腺样囊性癌的肿瘤生态系统及其生物学行为 腺样囊性癌的肿瘤组织和癌旁组织中的细胞 数字病理学 腺样囊性癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 49,948个细胞来自三位患者的癌旁组织和肿瘤组织
20822 2024-08-08
SERPINB9 is commonly amplified and high expression in cancer cells correlates with poor immune checkpoint blockade response
2022, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 研究探讨了SERPINB9基因在癌症细胞中的高表达与免疫检查点阻断(ICB)反应不良之间的关系 首次揭示了SERPINB9基因在癌症细胞中的高表达与ICB反应不良的相关性,并探讨了其在免疫治疗抵抗中的潜在作用 研究主要集中在非小细胞肺癌(NSCLC)和黑色素瘤,可能不适用于所有癌症类型 探索SERPINB9基因在癌症细胞中的作用及其对免疫治疗反应的影响 SERPINB9基因在癌症细胞中的表达及其对免疫检查点阻断反应的影响 数字病理学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 包括NSCLC和黑色素瘤的多个细胞系
20823 2024-08-08
A spatiotemporal steroidogenic regulatory network in human fetal adrenal glands and gonads
2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
research paper 本研究通过10× Genomics单细胞转录组技术和空间转录组学技术,对7至14周孕周的人类胎儿肾上腺和性腺进行了测序,重建了它们的位置信息,并探讨了性激素合成过程中的细胞协调机制。 首次揭示了人类胎儿肾上腺和性腺中脱氢表雄酮(DHEA)合成的重要酶基因表达变化,以及这一变化在性别分化窗口期对DHEA和皮质醇合成的加速作用。 NA 探讨人类胎儿肾上腺和性腺中性激素合成的主要前体脱氢表雄酮(DHEA)的生物学机制。 人类胎儿肾上腺和性腺。 NA NA 10× Genomics单细胞转录组技术,空间转录组学 NA 转录组 7至14周孕周的人类胎儿肾上腺和性腺样本
20824 2024-08-08
An Oxidative Stress-Related Gene Signature in Granulosa Cells Is Associated with Ovarian Aging
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 本文研究了颗粒细胞中与氧化应激相关的基因特征与卵巢衰老的关系 首次在非人灵长类和人类数据集中验证了与卵巢衰老相关的颗粒细胞氧化应激基因特征 NA 探讨颗粒细胞中氧化应激相关基因特征与卵巢衰老的关联 颗粒细胞中的氧化应激相关基因 NA 卵巢衰老 单细胞转录组测序, qPCR NA 转录组数据 非人灵长类和人类样本, 以及人卵巢颗粒细胞瘤细胞系KGN和小鼠颗粒细胞
20825 2024-08-08
Single-cell transcriptome sequencing revealing the difference in photosynthesis and carbohydrate metabolism between epidermal cells and non-epidermal cells of Gracilariopsis lemaneiformis (Rhodophyta)
2022, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了Gracilariopsis lemaneiformis(红藻)的表皮细胞和非表皮细胞在正常光照条件下的光合作用和碳水化合物代谢差异 首次揭示了表皮细胞和非表皮细胞在光合作用和碳水化合物代谢方面的差异,并发现了光合产物在细胞间的运输 NA 探究不同细胞类型在光合作用和碳水化合物代谢方面的差异及其碳分配机制 Gracilariopsis lemaneiformis的表皮细胞和非表皮细胞 NA NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 3436个差异表达基因
20826 2024-08-08
Single-cell sequencing reveals the landscape of the tumor microenvironment in a skeletal undifferentiated pleomorphic sarcoma patient
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了一名骨骼未分化多形性肉瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织,揭示了肿瘤微环境的细胞组成和相关标志基因 首次利用单细胞RNA测序技术详细解析了骨骼未分化多形性肉瘤的肿瘤微环境,并识别了潜在的治疗靶点 研究仅基于单一病例,结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 探讨骨骼未分化多形性肉瘤的肿瘤微环境及其潜在治疗策略 骨骼未分化多形性肉瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织 数字病理学 软组织肉瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 单一病例
20827 2024-08-08
Combined bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq identifies a necroptosis-related prognostic signature associated with inhibitory immune microenvironment in glioma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术,识别出与胶质瘤抑制性免疫微环境相关的坏死性凋亡相关预后标志物 首次构建了基于18个坏死性凋亡相关基因的预后标志物,并验证了其在不同数据集中的预测能力 NA 探讨坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的预后价值及其与免疫微环境的关系 胶质瘤患者的预后及免疫微环境 数字病理学 脑瘤 RNA-seq NA 基因表达数据 159个坏死性凋亡相关基因,TCGA数据集及两个外部CGGA数据集
20828 2024-08-08
Heterogeneity of neutrophils and inflammatory responses in patients with COVID-19 and healthy controls
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者和健康对照者的外周血中性粒细胞,揭示了与疾病严重程度相关的不同成熟中性粒细胞亚群 首次详细分析了COVID-19患者中性粒细胞的异质性及其在炎症反应中的作用 由于技术挑战,对中性粒细胞的深入分析有限 探究COVID-19患者与健康对照者中性粒细胞反应的差异 COVID-19患者和健康对照者的中性粒细胞 NA COVID-19 单细胞RNA测序 NA RNA 包括轻度和重度COVID-19患者及健康对照者的外周血中性粒细胞
20829 2024-08-08
Single cell sequencing revealed the mechanism of PD-1 resistance affected by the expression profile of peripheral blood immune cells in ESCC
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术揭示了食管鳞状细胞癌(ESCC)患者外周血免疫细胞表达谱对PD-1抗体耐药性的影响机制 首次深入分析了ESCC患者外周血免疫细胞的转录组特征及其对PD-1单抗疗效的影响 NA 探讨食管鳞状细胞癌患者免疫微环境转录组特征对免疫抑制剂疗效的影响 食管鳞状细胞癌患者的外周血免疫细胞 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 PD-1单抗敏感和耐药的食管癌患者的外周血免疫细胞
20830 2024-08-08
Rapid identification of CMV-specific TCRs via reverse TCR cloning system based on bulk TCR repertoire data
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文开发了一种基于批量TCR组库数据的反向TCR克隆系统,用于快速鉴定CMV特异性TCR 该系统无需单细胞水平即可有效克隆抗原特异性TCR,并能通过NGS直接获得功能性TCR NA 开发一种新的TCR克隆系统,用于从激活标志物阳性的CD8 T细胞中克隆抗原特异性TCR CMV pp65特异性T细胞反应及其TCR NA NA NGS NA TCR组库数据 从HLA-A*02:01、HLA-A*02:06、HLA-B*07:02和HLA-B*40:06限制的4-1BB阳性CD8 T细胞中成功扩增了15条TCRα和14条TCRβ链
20831 2024-08-08
Integrated multi-omics analysis identifies CD73 as a prognostic biomarker and immunotherapy response predictor in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过综合多组学分析,探讨了CD73在头颈鳞状细胞癌中的作用,发现CD73可作为预后标志物和免疫治疗反应预测因子 首次详细分析了CD73在头颈鳞状细胞癌中的表达及其与免疫治疗反应的关系 研究主要基于TCGA数据库和公共数据集,需要进一步的临床验证 探索CD73在头颈鳞状细胞癌中的功能及其作为预后标志物和免疫治疗反应预测因子的潜力 头颈鳞状细胞癌患者 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 RNA测序, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 临床数据 数据来自TCGA-HNSC项目和多个公共数据库
20832 2024-08-08
Transcriptome profiling of abdominal aortic tissues reveals alterations in mRNAs of Takayasu arteritis
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过批量RNA测序分析了Takayasu动脉炎患者腹主动脉组织的转录组变化 首次对Takayasu动脉炎患者的腹主动脉组织进行批量RNA测序,揭示了该疾病中mRNA表达的显著变化 样本量相对较小,且仅包括手术获取的组织样本 探索Takayasu动脉炎中mRNA表达的改变 Takayasu动脉炎患者的腹主动脉组织 数字病理学 Takayasu动脉炎 批量RNA测序 NA 转录组数据 14个腹主动脉组织,其中8个来自肾移植,6个来自Takayasu动脉炎患者
20833 2024-08-05
CD226 knockout reduces the development of CD8+ T by impairing the TCR sensitivity of double-positive thymocytes
2023-05, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 此研究探讨了CD226在胸腺T细胞发育中的作用。 揭示了CD226缺失对CD8+ T细胞发育和TCR敏感性的影响,特别是在双阳性胸腺细胞中的作用。 未能完全清楚CD226在胸腺内的复杂作用机制。 旨在研究CD226在胸腺T细胞发育中的角色及其机制。 使用CD226缺失小鼠模型和单细胞测序技术研究胸腺细胞的发育。 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 细胞 使用CD226缺失小鼠的胸腺细胞
20834 2024-08-05
Single-cell-resolution transcriptome map revealed novel genes involved in testicular germ cell progression and somatic cells specification in Chinese tongue sole with sex reversal
2023-05, Science China. Life sciences
研究论文 本文揭示了与中国舌鳎性别逆转相关的新基因,并描绘了其睾丸中的单细胞转录组图谱 首次描绘了中国舌鳎在性别逆转过程中不同生殖细胞和体细胞类型的动态基因表达变化 对性别逆转过程中调控机制的解析仍然不够全面 研究中国舌鳎性别逆转后生殖细胞发育的调控机制 中国舌鳎的生殖细胞和体细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自基因型雄性和伪雄性睾丸的细胞样本
20835 2024-08-08
Decoding Single-cell Landscape and Intercellular Crosstalk in the Transplanted Liver
2023-04-01, Transplantation IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过建立免疫耐受的原位肝移植小鼠模型,利用单细胞RNA测序和时间飞行流式细胞术,揭示了移植肝的细胞景观和细胞间对话 本研究首次详细注释了移植肝的细胞景观,并确定了这些细胞在肝移植过程中的动态变化 NA 理解移植肝的生理恢复过程和细胞间对话 移植肝的细胞复杂性和细胞间对话 NA NA 单细胞RNA测序,时间飞行流式细胞术 NA 细胞 NA
20836 2024-08-05
Identification of chondrocyte subpopulations in osteoarthritis using single-cell sequencing analysis
2023-Feb-05, Gene IF:2.6Q2
研究论文 本研究利用单细胞测序分析鉴定了骨关节炎中的软骨细胞亚群 研究揭示了骨关节炎中软骨细胞亚群的异质性,并识别出不同亚群的潜在功能 未提及具体的样本数量和临床信息 研究软骨细胞在骨关节炎中异质性的存在及其功能 骨关节炎患者的软骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞测序 K-均值聚类 细胞数据 NA
20837 2024-08-05
Transcriptional glucocorticoid effects in the brain: Finding the relevant target genes
2023-02, Journal of neuroendocrinology IF:3.3Q2
研究论文 本文讨论了糖皮质激素在大脑中的转录效应及其相关靶基因 探讨了MR和GR受体特异性及确定转录结果的上下文因素 未提供有关样本大小和具体实验条件的详细信息 阐明糖皮质激素在大脑中的跨细胞类型转录效应 涉及矿物皮质激素和糖皮质激素受体的靶基因 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 NA
20838 2024-08-05
Oligodendrocyte lineage cells: Advances in development, disease, and heterogeneity
2023-02, Journal of neurochemistry IF:4.2Q2
综述 本综述探讨了寡突胶质细胞前体细胞的不同亚群体、其发育轨迹及在相关疾病中的应用 使用单细胞测序技术研究寡突胶质细胞谱系的异质性 未提及具体的实验数据和样本规模 研究寡突胶质细胞谱系细胞的发育和异质性及其在疾病中的应用 寡突胶质细胞谱系的不同亚群体及其发育轨迹 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单细胞核测序 (snRNA-seq) NA NA NA
20839 2024-08-08
The dynamic cellular landscape of grafts with acute rejection after heart transplantation
2023-02, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞动态景观 揭示了一个新的心脏成纤维细胞亚群,该亚群可能在急性心脏排斥反应中起中介作用 NA 探讨心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞动态景观 心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 细胞 小鼠心脏移植样本
20840 2024-08-08
B lymphocytes ameliorate Alzheimer's disease-like neuropathology via interleukin-35
2023-Feb, Brain, behavior, and immunity
研究论文 本研究探讨了B淋巴细胞通过产生白细胞介素-35(IL-35)减轻阿尔茨海默病(AD)样神经病理学的作用 首次揭示了B淋巴细胞衍生的IL-35通过抑制前额叶皮质中的Aβ产生,对AD具有潜在治疗作用 NA 研究B淋巴细胞在AD病理过程中的作用及其机制 B淋巴细胞、IL-35、Aβ病理、记忆障碍 NA 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA RNA序列 5×FAD小鼠模型及AD患者血液样本
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