单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
20821 2024-08-08
Integrative Analyses Identify Potential Key Genes and Calcium-Signaling Pathway in Familial Atrioventricular Nodal Reentrant Tachycardia Using Whole-Exome Sequencing
2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过全外显子测序技术,分析了家族性房室结折返性心动过速患者的基因突变情况,并识别了潜在的关键基因和钙信号通路 首次报道了家族性房室结折返性心动过速的疾病相关基因,并揭示了钙信号通路在该疾病发生中的核心作用 研究样本仅限于20名患者和100名对照组,可能需要更大样本量以验证结果 探究家族性房室结折返性心动过速的遗传贡献 家族性房室结折返性心动过速患者及其基因突变 遗传学 心血管疾病 全外显子测序 NA 基因序列 20名患者和100名对照组
20822 2024-08-08
FGL2-MCOLN3-Autophagy Axis-Triggered Neutrophil Extracellular Traps Exacerbate Liver Injury in Fulminant Viral Hepatitis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本文研究了中性粒细胞外陷阱(NETs)在暴发性病毒性肝炎(FVH)发病机制中的作用及机制 发现了FGL2-mucolipin 3-自噬轴调控NETs形成,为FVH治疗提供了新策略 NA 探究NETs在FVH发病机制中的作用及调控机制 暴发性病毒性肝炎(FVH) NA 肝病 单细胞RNA测序,全转录组测序 NA RNA 使用了感染或未感染小鼠的肝脏白细胞,以及HBV相关急性肝损伤患者的肝脏、血浆和外周中性粒细胞
20823 2024-08-08
Spatial Transcriptomics as a Novel Approach to Redefine Electrical Stimulation Safety
2022, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术评估大脑对电刺激的生物学反应,并探索其对电刺激安全性的潜在影响 首次使用空间转录组学技术来评估电刺激对大脑的生物学影响,并与传统的组织损伤指标进行直接比较 研究仅限于大鼠视觉皮层,且使用特定的电极类型和刺激参数 探索电刺激对大脑的生理效应,并重新定义电刺激的安全标准 大鼠视觉皮层对电刺激的生物学反应 分子生物学 NA 空间转录组学 NA 基因表达 使用碳纤维超微电极阵列和微线电极阵列进行电刺激,刺激参数在报告的组织损伤阈值之上和之下
20824 2024-08-08
Comprehensive Analysis of the Expression and Prognosis for Tripartite Motif-Containing Genes in Breast Cancer
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究综合分析了三重基序含基因(TRIMs)在乳腺癌中的表达模式及其预后价值 首次全面分析了TRIMs在乳腺癌中的表达及其预后意义,并发现TRIMs在非肿瘤细胞中的表达及其在乳腺癌微环境中的作用 研究主要基于数据集和软件分析,未进行体内外实验验证 探讨TRIMs在乳腺癌中的表达模式及其预后价值 三重基序含基因(TRIMs)在乳腺癌中的表达及其预后影响 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个数据集和独立队列
20825 2024-08-08
Upregulation of CCNB2 and Its Perspective Mechanisms in Cerebral Ischemic Stroke and All Subtypes of Lung Cancer: A Comprehensive Study
2022, Frontiers in integrative neuroscience IF:2.6Q3
研究论文 本研究收集了103个与肺癌症和脑缺血性中风相关的CCNB2表达的高通量数据集,分析了CCNB2在这些疾病中的上调表达及其潜在机制 通过多尺度嵌入基因共表达网络分析(MEGENA)和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,揭示了CCNB2在肺癌症和脑缺血性中风中的关键作用及其参与的生物过程 NA 探讨CCNB2在肺癌症和脑缺血性中风中的上调表达及其潜在机制 肺癌症和脑缺血性中风 数字病理学 肺癌症,脑缺血性中风 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 103个高通量数据集
20826 2024-08-08
Single-Cell Transcriptomics Reveals Killing Mechanisms of Antitumor Cytotoxic CD4+ TCR-T Cells
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了抗肿瘤细胞毒性CD4+ TCR-T细胞的杀伤机制 首次全面揭示了CD4 TCR-T细胞的细胞毒性机制,并发现其与CD8 TCR-T细胞在杀伤途径上的共同点和独特特征 NA 探索CD4 TCR-T细胞的抗肿瘤效果及其杀伤机制 CD4 TCR-T细胞和CD8 TCR-T细胞的杀伤机制 免疫学 肿瘤 单细胞V(D)J测序技术 NA RNA序列 NA
20827 2024-08-08
A Detailed Overview About the Single-Cell Analyses of Solid Tumors Focusing on Colorectal Cancer
2022, Pathology oncology research : POR
综述 本文综述了单细胞分析技术在结直肠癌研究中的应用及其对肿瘤异质性的深入解析 介绍了单细胞测序技术如何实现对肿瘤异质性、肿瘤微环境及其相互作用的详细描述 讨论了传统研究方法的局限性 强调单细胞分析在肿瘤研究中的重要性 结直肠癌的肿瘤异质性及其微环境 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序 NA 单细胞数据 NA
20828 2024-08-08
Manipulation of single cells via a Stereo Acoustic Streaming Tunnel (SteAST)
2022, Microsystems & nanoengineering IF:7.3Q1
研究论文 本文介绍了一种通过立体声学流隧道(SteAST)操纵单细胞的多功能微系统 该系统利用超高频体声波触发并由微通道高度限制的立体声学流,实现了单细胞的3D重建、集群分离、选择性捕获/释放、原位分析及与条形码凝胶珠的配对 NA 开发一种用于观察、预处理和分析单细胞的虚拟隧道,以应用于不同的单细胞研究 单细胞及其集群的异质性和行为 生物技术 NA 立体声学流技术 NA 细胞 未具体说明
20829 2024-08-08
Intrarenal Single-Cell Sequencing of Hepatitis B Virus Associated Membranous Nephropathy
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了乙型肝炎病毒相关膜性肾病患者的肾脏活检样本,揭示了其发病机制 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了乙型肝炎病毒相关膜性肾病患者的肾脏细胞表达谱,揭示了细胞间的相互作用和潜在的治疗靶点 研究样本仅来自一名患者和两名健康个体,可能影响结果的普遍性 解析乙型肝炎病毒相关膜性肾病的发病机制 乙型肝炎病毒相关膜性肾病患者的肾脏细胞 数字病理学 肾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 4,114个肾脏单细胞转录组
20830 2024-08-08
Single-Cell RNA-Sequencing Atlas Reveals the Tumor Microenvironment of Metastatic High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析,揭示了转移性高级别浆液性卵巢癌的肿瘤微环境特征 发现了ERBB2和HOXB-AS3基因在转移性肿瘤中的扩增,以及与上皮-间质转化相关的恶性细胞和癌症相关成纤维细胞的特征 NA 探究转移性高级别浆液性卵巢癌的分子机制和生物学特性 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的原发和转移样本,以及子宫内膜样癌(EC)样本 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括高级别浆液性卵巢癌的原发和转移样本,以及子宫内膜样癌样本
20831 2024-08-08
Receptor-ligand pair typing and prognostic risk model for papillary thyroid carcinoma based on single-cell sequencing
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究基于单细胞测序技术,分析了乳头状甲状腺癌(PTC)微环境中的细胞间通讯网络,并通过配体-受体(LR)对开发了一种新的PTC分子表型,同时建立了一个风险模型来预测患者对PD-1阻断免疫治疗的反应 首次基于单细胞测序数据,通过LR对分析细胞间通讯网络,并开发了新的PTC分子表型和风险模型来预测免疫治疗反应 NA 研究乳头状甲状腺癌的细胞间通讯网络及其对免疫治疗反应的预测 乳头状甲状腺癌的细胞间通讯网络和免疫治疗反应 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Lasso Cox回归 RNA测序数据 使用了来自GSE184362的单细胞测序数据和来自The Cancer Genome Atlas的批量肿瘤RNA测序数据,以及IMvigor210和GSE78220队列作为外部验证
20832 2024-08-08
Comprehensive Network Analysis Reveals the Targets and Potential Multitarget Drugs of Type 2 Diabetes Mellitus
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 本研究通过单细胞RNA表达谱分析、网络药理学和分子对接技术,探索了2型糖尿病的新治疗靶点和候选药物 本研究首次识别CCR5作为2型糖尿病的潜在治疗靶点,并筛选出DB05494作为潜在的多靶点药物 研究主要基于单细胞RNA测序数据和分子对接模拟,未进行临床试验验证 探索2型糖尿病的新治疗靶点和候选药物 2型糖尿病患者的胰岛细胞样本 分子生物学 2型糖尿病 单细胞RNA测序、分子对接 NA RNA表达谱 11个细胞集群,其中3个(C2、C8和C10)在2型糖尿病样本和正常样本间有显著差异
20833 2024-08-08
Full-Length Spatial Transcriptomics Reveals the Unexplored Isoform Diversity of the Myocardium Post-MI
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文介绍了单细胞纳米孔空间转录组学(scNaST)软件套件,用于分析来自第二代和第三代测序的空间基因表达,生成组织微环境的近单细胞转录组全景图。 首次使用scNaST软件套件结合Visium空间平台,成功分析了心肌梗死后小鼠心脏的完整转录组,并识别了未被充分研究的转录本多样性。 NA 探索心肌梗死后心肌组织中未被充分研究的转录本多样性。 心肌梗死后小鼠心脏的四个短轴切片。 数字病理学 心血管疾病 单细胞纳米孔空间转录组学(scNaST) NA 转录组数据 19,794个转录本
20834 2024-08-08
8-Gene signature related to CD8+ T cell infiltration by integrating single-cell and bulk RNA-sequencing in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,在头颈鳞状细胞癌中建立与CD8+ T细胞浸润相关的8基因分子特征 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据的整合,识别出与头颈鳞状细胞癌中CD8+ T细胞浸润相关的8基因特征,为免疫治疗提供了新的生物标志物 NA 旨在为头颈鳞状细胞癌建立与CD8+ T细胞浸润相关的分子特征,以作为癌症免疫治疗的生物标志物 头颈鳞状细胞癌中的CD8+ T细胞浸润及相关基因 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析(WGCNA), LASSO-Cox分析 NA RNA测序数据 215个差异表达的免疫相关基因,其中45个与头颈鳞状细胞癌的总体生存相关,基于8个基因建立风险模型
20835 2024-08-08
Comprehensive Analysis of CRIP1 Expression in Acute Myeloid Leukemia
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和基因表达数据分析了t(8;21)急性髓系白血病患者的免疫和调控网络,并验证了CRIP1表达与甲基化状态的关系 首次全面分析了CRIP1在急性髓系白血病中的表达及其对免疫相关通路的影响 研究仅限于t(8;21)急性髓系白血病患者,可能不适用于所有AML患者 探讨CRIP1在急性髓系白血病中的表达调控及其对治疗策略的影响 急性髓系白血病患者的CRIP1表达及其免疫调控网络 数字病理学 血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两个独立队列,分别来自GSE37642和The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据集
20836 2024-08-08
Single-cell transcriptomics reveals male germ cells and Sertoli cells developmental patterns in dairy goats
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了奶山羊中雄性生殖细胞和Sertoli细胞的发育模式 首次系统地研究了奶山羊中雄性生殖细胞和Sertoli细胞的发育模式,并识别了与关键发育事件相关的基因 NA 旨在识别与奶山羊雄性生殖细胞和Sertoli细胞关键发育事件相关的基因 奶山羊的雄性生殖细胞和Sertoli细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 25,373个细胞来自45天(青春期前)、90天(青春期)和180天(青春期后)的奶山羊睾丸
20837 2024-08-08
Reconstruction of the Global Polarity of an Early Spider Embryo by Single-Cell and Single-Nucleus Transcriptome Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞和单核转录组分析,重建了早期蜘蛛胚胎的全球极性 应用单细胞RNA测序技术,成功检测到与胚层和一些瞬态细胞状态相对应的3种细胞群体,并展示了这些数据资源在全基因组范围内搜索空间调控表达基因的应用潜力 文中未明确提及具体限制 研究早期蜘蛛胚胎中基于极性的细胞状态多样性的生成和发展 早期蜘蛛胚胎的细胞极性和细胞状态 NA NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA 转录组数据 约2000个细胞
20838 2024-08-08
Single-Cell Transcriptomics of Proliferative Phase Endometrium: Systems Analysis of Cell-Cell Communication Network Using CellChat
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 研究使用单细胞转录组学分析人类增殖期子宫内膜细胞间的相互作用网络 首次详细描绘了增殖期子宫内膜细胞间的相互作用网络,并验证了与子宫内膜生长高度相关的信号通路 NA 深入理解子宫内膜细胞间的通信机制 人类增殖期子宫内膜细胞及其相互作用 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组学 CellChat 转录组 33,240个初级子宫内膜细胞
20839 2024-08-08
A single cell survey of the microbial impacts on the mouse small intestinal epithelium
2022 Jan-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了无菌和特定病原体无菌小鼠的小肠上皮细胞,以研究微生物与上皮细胞之间的相互作用。 本研究首次在单细胞水平上揭示了微生物对小肠上皮细胞的转录和细胞影响,特别是微生物如何通过调节代谢基因表达和mTOR信号通路来影响上皮细胞。 研究仅限于无菌和特定病原体无菌小鼠模型,可能无法完全代表所有微生物对小肠上皮细胞的影响。 探讨微生物与小肠上皮细胞之间的动态关系及其对生理炎症和耐受性的影响。 小肠上皮细胞及其与肠道微生物的相互作用。 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 无菌和特定病原体无菌小鼠的小肠上皮细胞
20840 2024-08-08
Preparation of acute midbrain slices containing the superior colliculus and periaqueductal Gray for patch-clamp recordings
2022, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文提供了一种实用的指南,用于制备包含上丘和导水管周围灰质的年轻成年小鼠中脑冠状切片,以进行电生理实验 介绍了两种不同的溶液及其各自的孵育策略,以及两种脑提取的替代程序 NA 研究中脑神经元的电生理特性 年轻成年小鼠的中脑切片 NA NA 膜片钳记录 NA 切片 野生型小鼠以及经过基因修饰或病毒转染的小鼠
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