单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
20821 2024-08-08
Research Progress of Cell Lineage Tracing and Single-Cell Sequencing Technology in Malignant Skin Tumors
2022, Frontiers in surgery IF:1.6Q2
综述 本文综述了细胞谱系追踪和单细胞测序技术在恶性皮肤肿瘤研究中的进展 提供了深入理解肿瘤起源、肿瘤细胞异质性和肿瘤耐药机制的新方法 NA 总结细胞谱系追踪和单细胞测序技术在恶性黑色素瘤和皮肤鳞状细胞癌研究中的进展,激发皮肤肿瘤进一步研究的新思路 恶性黑色素瘤和皮肤鳞状细胞癌 数字病理学 皮肤癌 单细胞测序 NA NA NA
20822 2024-08-08
Integrated Single-Cell RNA-Sequencing Analysis of Gastric Cancer Identifies FABP1 as a Novel Prognostic Biomarker
2022, Journal of oncology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌样本,发现并验证了脂肪酸结合蛋白1(FABP1)作为胃癌的新型预后生物标志物 首次通过单细胞RNA测序数据识别出FABP1作为胃癌进展的关键调控基因,并验证了其在胃癌预后评估中的作用 研究仅基于TCGA数据库和有限的组织微阵列样本进行验证,需要更多临床样本进一步验证FABP1的预后价值 开发具有高敏感性和特异性的新型生物标志物,以准确评估胃癌患者的预后 胃癌样本中的单细胞RNA测序数据和FABP1的表达水平 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 3385个差异表达基因,胃癌组织微阵列样本
20823 2024-08-08
Gpx3 and Egr1 Are Involved in Regulating the Differentiation Fate of Cardiac Fibroblasts under Pressure Overload
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析心脏压力超载模型中成纤维细胞的分化命运和基因表达动态变化 首次揭示了Gpx3和Egr1在心脏压力超载条件下调控成纤维细胞分化命运中的作用 研究基于小鼠模型和公共数据集,未来需在人类样本中验证 阐明心脏压力超载下成纤维细胞的分化命运及其分子调控机制 心脏成纤维细胞及其在压力超载条件下的分化命运 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用来自GEO数据库的GSE155882数据集,涉及小鼠横膈膜主动脉缩窄模型
20824 2024-08-08
Single-cell analysis reveals immune cellular components in odontogenic keratocysts
2023-Nov, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了牙源性角化囊肿中的免疫细胞成分及其潜在的趋化作用 首次详细描述了牙源性角化囊肿中的免疫细胞类型,并揭示了化学因子富集的肌成纤维细胞在免疫细胞迁移中的潜在作用 研究样本数量有限,可能影响结果的普遍性 旨在表征牙源性角化囊肿的免疫生态系统,并理解囊肿成纤维细胞在免疫细胞迁移中的潜在趋化作用 牙源性角化囊肿中的细胞类型及其相互作用 数字病理学 口腔疾病 单细胞RNA测序 NA 细胞 6个牙源性角化囊肿样本
20825 2024-08-08
Dynamic immune ecosystem of dengue infection revealed by single-cell sequencing
2022-12, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序技术分析了登革热感染患者的免疫细胞类型及其动态变化 首次揭示了登革热感染过程中免疫生态系统的动态变化,并发现了关键的转录因子和信号通路 NA 深入理解登革热感染的发病机制并开发有效的治疗策略 登革热感染患者的免疫细胞及其动态变化 数字病理学 登革热 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序数据 13127个细胞,来自10名登革热感染患者
20826 2024-08-08
Soluble TREM2 levels reflect the recruitment and expansion of TREM2+ macrophages that localize to fibrotic areas and limit NASH
2022-11, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究探讨了骨髓来源的TREM2表达巨噬细胞在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)中的功能作用 发现系统性可溶性TREM2水平在NASH中的临床相关性,并揭示了TREM2+巨噬细胞在肝纤维化区域的定位及其对NASH的限制作用 NA 功能性地表征骨髓来源的TREM2表达巨噬细胞在NASH中的作用 TREM2表达的巨噬细胞及其在NASH中的功能 数字病理学 非酒精性脂肪性肝炎 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及小鼠和人类临床队列
20827 2024-08-08
Complement C1QC as a potential prognostic marker and therapeutic target in colon carcinoma based on single-cell RNA sequencing and immunohistochemical analysis
2022-Oct-23, Bosnian journal of basic medical sciences IF:3.1Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组化分析,探讨了C1QC作为结肠癌的潜在预后标志物和治疗靶点 首次揭示了C1QC在结肠癌中的关键调控作用,并验证了其作为潜在免疫治疗靶点的可能性 研究主要基于数据库数据和分子对接分析,需要进一步的临床试验验证 探索结肠癌中免疫细胞浸润及其基因调控,为诊断和治疗提供新视角 结肠癌中的免疫细胞浸润及其基因调控 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 使用了来自GEO数据库的单细胞RNA测序表达谱和TCGA结肠癌数据集
20828 2024-08-08
Distinct Transcriptional Programs in Ascitic and Solid Cancer Cells Induce Different Responses to Chemotherapy in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2022-10-04, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)患者在不同疾病阶段的细胞,揭示了腹水和实体癌细胞在转录组水平上的显著差异及其对化疗的不同反应 发现了新的癌症相关成纤维细胞亚型,该亚型在化疗后显著富集,并提出了基于肿瘤异质性的新型治疗策略 NA 探究高级别浆液性卵巢癌治疗抵抗的机制,并寻找新的治疗策略 高级别浆液性卵巢癌患者的腹水和实体癌细胞及其对化疗的反应 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 超过十万细胞
20829 2024-08-08
Immune mechanisms linking metabolic injury to inflammation and fibrosis in fatty liver disease - novel insights into cellular communication circuits
2022-10, Journal of hepatology IF:26.8Q1
综述 本文综述了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中免疫机制与代谢损伤、炎症和纤维化的关联,并探讨了细胞通信电路的新见解。 近年来,单细胞RNA测序和高维多组学(蛋白质组学、脂质组学)以及空间转录组学的应用,极大地推进了对健康和疾病中肝脏免疫细胞亚群复杂异质性的理解。 NA 旨在强调NAFLD中与炎症相关的最新发现,讨论免疫细胞亚群在疾病不同阶段(包括疾病消退期)的作用,并整合驱动炎症的多系统。 NAFLD中的免疫机制和细胞通信电路。 NA 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序、高维多组学(蛋白质组学、脂质组学)、空间转录组学 NA RNA NA
20830 2024-08-08
A Survey of the Metabolic Landscape of the Developing Cerebellum at Single-Cell Resolution
2022-Oct, Cerebellum (London, England)
综述 本文探讨并比较了从发育中的人类小脑及其体外合成对应物(干细胞衍生的cerebellar organoids)获得的单细胞RNA测序数据,重点关注关键代谢途径基因的表达 利用单细胞RNA测序技术,可视化组织中亚群的关键转录特征,并比较了体外模型与原生组织的代谢状态 体外模型与原生组织之间存在差异,这些差异可能影响对分化后代谢状态的理解 理解体外小脑模型的状态,这对于模拟各种细胞类型对小脑疾病的易感性至关重要 发育中的人类小脑及其体外合成对应物(干细胞衍生的cerebellar organoids) 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 未具体说明样本数量
20831 2024-08-08
Processing human skin samples for single-cell assays
2022-09-16, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文描述了一种优化的协议,用于从6毫米皮肤穿刺活检中快速分离出可存活的细胞,并结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)来研究皮肤常驻和外周循环记忆及效应T细胞的转录组和克隆型 该协议基于Saluzzo等人(2021)的改进,提供了更快速的皮肤细胞分离方法 NA 研究皮肤常驻免疫细胞在感染、炎症和癌症中的作用 人类皮肤样本中的单细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq) NA 细胞 6毫米皮肤穿刺活检样本
20832 2024-08-08
Single-Cell RNA-Seq Reveals Heterogeneity of Cell Communications between Schwann Cells and Fibroblasts within Vestibular Schwannoma Microenvironment
2022-09, The American journal of pathology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了前庭神经鞘瘤中的细胞组成和细胞间通信的异质性 首次揭示了前庭神经鞘瘤微环境中施万细胞和成纤维细胞之间通过整合素和生长因子信号的紧密细胞间通信 NA 探讨前庭神经鞘瘤肿瘤进展的细胞成分和机制 前庭神经鞘瘤样本中的施万细胞和成纤维细胞 数字病理学 前庭神经鞘瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 临床手术分离的前庭神经鞘瘤样本
20833 2024-08-08
A single-cell survey unveils cellular heterogeneity and sensitive responses in mouse cortices induced by oral exposure to triphenyl phosphate
2022-09, Archives of toxicology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了三苯基磷酸酯(TPhP)对小鼠皮质细胞异质性和敏感反应的影响 首次揭示了TPhP暴露下神经发育毒性的特异性细胞过程,并发现神经发生障碍、血管屏障破坏和伴随的神经炎症是其敏感反应 NA 研究TPhP暴露对小鼠皮质细胞的影响及其机制 小鼠皮质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 共检测了17,229个细胞和26,338个基因
20834 2024-08-08
Regulatory Programs of B-cell Activation and Germinal Center Reaction Allow B-ALL Escape from CD19 CAR T-cell Therapy
2022-09-01, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本文研究了B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)细胞如何通过减少CD19表达来逃避CD19 CAR T细胞疗法 首次揭示了B-ALL细胞通过转录重编程和生理性B细胞激活及生发中心反应维持低水平CD19表达的机制 NA 探讨B-ALL细胞逃避CD19 CAR T细胞疗法的机制 B细胞急性淋巴细胞白血病细胞及CD19 CAR T细胞 NA 白血病 单细胞RNA测序,单细胞转座酶可及染色质测序 NA RNA NA
20835 2024-08-08
Machine-learning-optimized Cas12a barcoding enables the recovery of single-cell lineages and transcriptional profiles
2022-08-18, Molecular cell IF:14.5Q1
研究论文 本文介绍了一种名为DAISY的高容量Cas12a条形码系统,结合高通量筛选和机器学习优化条形码序列,用于恢复单细胞谱系和转录组信息 DAISY条形码系统具有高容量和可靠性,能够在小尺寸下实现高效条形码生成,并成功应用于单细胞RNA测序 NA 开发一种高效的CRISPR-based条形码方法,以理解细胞谱系和转录组信息 人类黑色素瘤细胞的单细胞谱系和基因表达谱 机器学习 NA CRISPR-based条形码技术 机器学习模型 文本 约47,000个人类黑色素瘤细胞
20836 2024-08-08
Transcriptional profiling reveals roles of intercellular Fgf9 signaling in astrocyte maturation and synaptic refinement during brainstem development
2022-08, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术研究了脑干中斜方体内侧核(MNTB)细胞类型的转录组特征,并探讨了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路在星形胶质细胞成熟和突触细化中的作用 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了MNTB中主要细胞类型的转录组特征,并阐明了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路的功能 NA 研究神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路在脑干发育中的作用 脑干中斜方体内侧核(MNTB)的细胞类型及其转录组特征 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
20837 2024-08-08
The role of specialized cell cycles during erythroid lineage development: insights from single-cell RNA sequencing
2022-Aug, International journal of hematology IF:1.7Q3
综述 本文综述了通过流式细胞术和单细胞RNA测序研究,对红细胞系发育中CFU-e到红细胞终末分化(ETD)过渡的调控机制的新见解 发现CFU-e/ETD过渡是一个快速依赖于S期的转录开关,且与细胞周期和S期重塑事件直接相关 NA 探讨红细胞系发育中细胞周期在CFU-e到ETD过渡中的调控作用 红细胞系发育中的CFU-e细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
20838 2024-08-08
Single-cell sequencing: expansion, integration and translation
2022-07-27, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
研究论文 本文探讨了单细胞测序技术的发展及其在多组学研究中的应用 单细胞RNA测序技术已扩展到基因组学、蛋白质组学和代谢组学等领域,并与其他技术如空间数据和CRISPR筛选技术集成,以增强对复杂细胞行为的理解 NA 旨在全面理解复杂的细胞行为,并通过集成多组学数据和其他技术层信息来获得新的知识或功能 单细胞测序技术及其在多组学研究中的应用 基因组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 多组学数据 NA
20839 2024-08-08
Identification of Pathogenic Immune Cell Subsets Associated With Checkpoint Inhibitor-Induced Myocarditis
2022-07-26, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过时间飞行质谱技术和多组学单细胞技术,识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 发现了一种在免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者中显著增加的克隆性细胞毒性Temra CD8+细胞,并揭示了其独特的转录变化 NA 识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者的外周血单个核细胞和Pdcd1-/-小鼠 免疫学 心肌炎 时间飞行质谱技术,单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序,细胞转录组和表位索引测序 NA 细胞 52名个体(29名患者和23名健康对照),30名患者/对照,Pdcd1-/-小鼠
20840 2024-08-08
Mapping developmental paths of monkey primordial germ-like cells differentiation from pluripotent stem cells by single cell ribonucleic acid sequencing analysis†
2022-07-25, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了猕猴多能干细胞向原始生殖样细胞的分化路径 首次在猕猴中利用胚胎体分化系统诱导原始生殖样细胞的形成,并揭示了关键生长因子在分化过程中的作用 研究仅限于猕猴,尚未扩展到其他非人类灵长类动物 探讨多能干细胞向原始生殖样细胞分化的细胞和分子机制 猕猴的多能干细胞及其分化形成的原始生殖样细胞 干细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 约40,000个多能干细胞及胚胎体内的细胞
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