单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
20801 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing data analysis suggests the cell-cell interaction patterns of the pituitary-kidney axis
2022-07-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序数据分析了垂体-肾脏轴的细胞间相互作用模式 首次详细描述了垂体和肾脏细胞类型间的配体-受体对相互作用模式 NA 深入了解垂体-肾脏轴的连接机制 垂体和肾脏的细胞类型及其相互作用 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 使用了来自GEO数据库的小鼠垂体和肾脏的单细胞转录组数据
20802 2024-08-08
[Heterogeneity and function of uterine NK cells: A review]
2022-Jul, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:35786459
综述 本文综述了子宫自然杀伤(NK)细胞的异质性和功能 通过单细胞测序技术,研究人员在人类子宫中发现了三种具有不同表型和功能的子宫NK细胞 NA 探讨子宫NK细胞在妊娠早期的异质性和功能 子宫NK细胞及其在妊娠中的作用 免疫学 NA 单细胞测序 NA 细胞 NA
20803 2024-08-08
In vivo transcriptional analysis of mice infected with Leishmania major unveils cellular heterogeneity and altered transcriptomic profiling at single-cell resolution
2022-07, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1
研究论文 本文通过结合批量RNA测序(RNA-Seq)和单细胞RNA测序(scRNA-Seq),对感染利什曼原虫L. major的小鼠进行体内转录组分析,揭示了感染后的细胞异质性和转录组变化。 首次进行了L. major感染小鼠的体内全局转录组分析,结合了批量和单细胞RNA测序技术,揭示了感染后的细胞异质性和转录组变化。 NA 研究L. major感染小鼠后的体内转录组变化,特别是免疫反应和细胞异质性。 感染利什曼原虫L. major的小鼠及其免疫细胞。 数字病理学 皮肤利什曼病 RNA测序(RNA-Seq),单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组数据 感染L. major的小鼠样本
20804 2024-08-08
Natural high-avidity T-cell receptor efficiently mediates regression of cancer/testis antigen 83 positive common solid cancers
2022-07, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本文研究了从年轻健康捐赠者中分离出的高亲和力T细胞受体(TCR)对CT83阳性常见实体癌的疗效 本文首次从年轻健康捐赠者中分离出针对常见实体癌中频繁表达的CTA的高亲和力TCR,并展示了其在体外和体内的抗肿瘤活性 NA 研究高亲和力TCR对CT83阳性常见实体癌的疗效 CT83蛋白和其特异性TCR 免疫学 实体癌 单细胞测序 NA 蛋白质 来自年轻健康捐赠者的T细胞
20805 2024-08-08
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus IF:2.2Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术研究了2,3,7,8-四氯二苯并-对二恶英(TCDD)对斑马鱼精子发生的影响 利用单细胞RNA测序技术详细分析了TCDD暴露后斑马鱼睾丸中不同细胞类型的基因表达变化 NA 探讨TCDD暴露对斑马鱼精子发生的影响及其分子机制 斑马鱼精子发生过程中的细胞类型及其基因表达 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 成年斑马鱼睾丸中的多种细胞类型
20806 2024-08-08
Integration and Reanalysis of Four RNA-Seq Datasets Including BALF, Nasopharyngeal Swabs, Lung Biopsy, and Mouse Models Reveals Common Immune Features of COVID-19
2022-Jun, Immune network IF:4.3Q2
研究论文 本研究重新分析了四个COVID-19的RNA测序数据集,包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠,揭示了COVID-19的共同免疫特征。 使用统一的标准化方法重新分析多个RNA测序数据集,揭示了COVID-19的共同免疫特征,与单细胞RNA测序研究结果一致。 NA 理解COVID-19的发病机制,并开发更好的治疗策略。 COVID-19患者的免疫反应。 数字病理学 COVID-19 RNA测序 NA RNA测序数据 包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠的四个数据集
20807 2024-08-08
Human obstructive (postvasectomy) and nonobstructive azoospermia - Insights from scRNA-Seq and transcriptome analysis
2022-May, Genes & diseases IF:6.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析阻塞性和非阻塞性无精症患者的睾丸活检样本,探索其分子基础和转录调控机制 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了阻塞性和非阻塞性无精症患者的转录组变化,特别是在Sertoli细胞和生殖细胞的相互作用方面的发现 研究样本量较小,仅包括两名患者,可能影响结果的普遍性 揭示无精症的分子病因和转录调控机制 阻塞性和非阻塞性无精症患者的睾丸组织 数字病理学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 两名患者
20808 2024-08-08
ASCL2 Affects the Efficacy of Immunotherapy in Colon Adenocarcinoma Based on Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了ASCL2在结肠腺癌中对免疫治疗效果的影响及其潜在机制 首次揭示了ASCL2与癌症干细胞的正相关性,并通过负调控DUSP4间接影响肿瘤免疫细胞浸润,进而影响免疫治疗效果 研究主要集中在ASCL2与DUSP4的关系及其对免疫治疗的影响,未涉及其他可能的调控机制 探讨ASCL2在结肠腺癌中的生物学功能及其对免疫治疗效果的影响 结肠腺癌中的ASCL2表达及其与癌症干细胞和肿瘤免疫细胞浸润的关系 数字病理学 结肠腺癌 单细胞RNA测序 WGCNA RNA NA
20809 2024-08-08
Direct FACS Isolation of Neural Stem/Progenitor Lineages from the Adult Brain
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文提供了一种简化的协议,用于直接从鼠脑中收获和分离神经干细胞谱系,以便为单细胞RNA测序提供输入材料 该方法能够在神经干细胞谱系的 niche 环境中阐明真实的转录特征和激活的通路 主要挑战是成年神经干细胞数量有限,以及体外培养和扩增对其特性的显著改变 理解调节神经干细胞/祖细胞在脑内功能的机制,为维持或增强神经功能的发展再生策略提供关键步骤 成年脑中的神经干细胞和祖细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 鼠脑样本
20810 2024-08-08
Hydrogels for Single-Cell Microgel Production: Recent Advances and Applications
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
综述 本文综述了水凝胶在单细胞微凝胶生产中的最新进展和应用 介绍了水凝胶在微流控液滴生产中的应用,提供了新颖且更稳健的分析和筛选应用 NA 探讨水凝胶在单细胞微凝胶生产中的应用及其在细胞生物学研究中的潜力 单细胞技术及其在细胞生物学研究中的应用 生物技术 NA 微流控技术 NA 液滴 NA
20811 2024-08-08
MarkerCount: A stable, count-based cell type identifier for single-cell RNA-seq experiments
2022, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本文介绍了一种名为MarkerCount的细胞类型识别工具,该工具基于单细胞RNA测序实验中表达标记的数量进行细胞类型识别 MarkerCount不仅能够识别已知细胞群体,还能识别可能代表已知细胞类型未知亚群或未知表型肿瘤细胞的未知集群 NA 开发一种稳定的细胞类型识别工具,用于单细胞RNA测序实验的下游分析 单细胞RNA测序实验中的细胞类型识别 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用公开可用的数据集和标记数据库进行评估
20812 2024-08-08
Bridging Glycomics and Genomics: New Uses of Functional Genetics in the Study of Cellular Glycosylation
2022, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
综述 本文综述了功能基因组学技术在细胞糖基化研究中的应用 介绍了ChIP-seq、RNA-seq、CRISPR基因组筛选和scRNA-seq等新技术在糖基化状态基因组基础研究中的应用 NA 深入理解糖基化调控机制及其在疾病中的变化 细胞表面的糖蛋白和糖脂抗原 基因组学 NA ChIP-seq, RNA-seq, CRISPR, scRNA-seq NA 基因组数据 NA
20813 2024-08-08
Holliday Cross-Recognition Protein HJURP: Association With the Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma and With Patient Prognosis
2022, Pathology oncology research : POR
研究论文 本文探讨了Holliday交叉识别蛋白HJURP与肝细胞癌肿瘤微环境及患者预后的关系 使用单细胞RNA测序和IOBR软件包分析HJURP在肿瘤微环境中的潜在作用,并建立了基于HJURP表达的预后预测模型 NA 研究HJURP与肝细胞癌肿瘤微环境的关系及对患者预后的影响 HJURP蛋白及其在肝细胞癌中的表达与作用 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及正常肝脏组织和肝细胞癌组织的单细胞RNA测序数据
20814 2024-08-08
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本文报道了一例通过恢复期血浆输注实现严重COVID-19完全缓解的病例,并通过纵向无偏蛋白组学和单细胞转录组学分析,揭示了从严重疾病到无病状态转变的关键生物学过程。 首次通过纵向无偏蛋白组学和单细胞转录组学分析,揭示了COVID-19恢复过程中的关键生物学动态变化。 仅基于单一病例的研究,可能缺乏更广泛的适用性和代表性。 探讨COVID-19恢复过程中的生物标志物和关键生物学动态。 严重COVID-19患者的恢复过程及其生物学机制。 NA COVID-19 蛋白组学分析、单细胞转录组学 NA 蛋白质、RNA 单一病例
20815 2024-08-08
Dynamic Changes in Uterine NK Cell Subset Frequency and Function Over the Menstrual Cycle and Pregnancy
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过整合先前发表的单细胞RNA测序数据和新的流式细胞术数据,研究了子宫自然杀伤细胞(uNK)在月经周期和妊娠不同阶段的频率、表型和功能变化 首次揭示了uNK细胞在健康生殖周期中频率和功能的动态变化,为研究不孕、反复流产、先兆子痫和早产等问题提供了平台 NA 探讨uNK细胞在月经周期和妊娠中的动态变化及其对妊娠成功的影响 子宫自然杀伤细胞(uNK)及其在不同生殖周期阶段的频率和功能 NA NA 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA RNA 七个生殖周期阶段的数据
20816 2024-08-08
Identification of Genes Related to 5-Fluorouracil Based Chemotherapy for Colorectal Cancer
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究旨在识别与结直肠癌5-氟尿嘧啶(5-FU)化疗相关的基因,以预测化疗反应和改善患者预后 本研究首次识别出与5-FU化疗抵抗相关的免疫相关基因,并开发了预测模型 研究依赖于公共数据库的数据,可能存在样本选择偏倚 识别新的生物标志物以预测结直肠癌患者对5-FU化疗的反应 结直肠癌样本及5-FU化疗抵抗相关基因 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 CRC样本来自GEO和TCGA数据库,具体数量未详述
20817 2024-08-08
Subsets of Tissue CD4 T Cells Display Different Susceptibilities to HIV Infection and Death: Analysis by CyTOF and Single Cell RNA-seq
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
research paper 本研究通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析了人类扁桃体淋巴细胞中不同CD4 T细胞亚群对HIV感染和死亡的敏感性差异 研究发现,被HIV优先杀死的CD4 T细胞亚群在表型上与对HIV相关细胞死亡有抵抗力的亚群不同,且这种差异不完全由其对生产性感染的敏感性解释 NA 旨在定义不同CD4 T淋巴细胞亚群对HIV相关杀伤的敏感性或抵抗力 人类扁桃体中的淋巴细胞 NA HIV感染 质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
20818 2024-08-08
Long Intergenic Noncoding RNA MIAT as a Regulator of Human Th17 Cell Differentiation
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究了长链非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化中的调控作用 首次详细描述了MIAT在早期人类Th17细胞分化中的作用及其对关键Th17基因表达的调控机制 NA 探究长链非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化中的功能 长链非编码RNA MIAT及其在Th17细胞分化中的作用 NA 自身免疫病 单细胞RNA测序 NA RNA 来自类风湿性关节炎患者滑膜的T细胞
20819 2024-08-08
Comprehensive Evaluation of the m6A Regulator Prognostic Risk Score in the Prediction of Immunotherapy Response in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过综合分析m6A修饰,构建了一个m6A调控因子预后风险评分(MRPRS),用于预测透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者的生存和免疫治疗反应 本研究构建的MRPRS与免疫治疗反应呈正相关,并能区分高风险和低风险组的临床病理特征和免疫浸润特征 NA 旨在开发一种新的生物标志物,用于预测ccRCC患者的临床结果和治疗反应 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者的m6A修饰和免疫治疗反应 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA RNA测序数据 TCGA-ccRC队列及13个外部验证队列的数据
20820 2024-08-08
A Single-Cell Characterization of Human Post-implantation Embryos Cultured In Vitro Delineates Morphogenesis in Primary Syncytialization
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析了体外培养的人类植入后胚胎,建立了分层模型,并详细描述了滋养层细胞的形态发生和功能。 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类植入后胚胎中滋养层细胞的形态发生和功能,为理解早期妊娠中的病理过程提供了宝贵的资源。 NA 研究人类植入后胚胎中滋养层细胞的形态发生和功能,以及其在早期妊娠病理中的作用。 人类植入后胚胎的滋养层细胞。 数字病理学 妊娠疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 分层模型 RNA 具体样本数量未在摘要中提及
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