单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 20801 - 20820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20801 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing sheds light on cell-type specific gene expression in immune cells
2022-07, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-022-00802-7
PMID:35689032
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20802 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals differential expression of EGFL7 and VEGF in giant-cell tumor of bone and osteosarcoma
2022-07, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702221088238
PMID:35695550
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了巨细胞瘤骨和骨肉瘤中EGFL7和VEGF的基因表达谱 | 首次揭示了EGFL7和VEGF在巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的细胞类型特异性表达模式 | NA | 探究巨细胞瘤骨和骨肉瘤中促血管生成基因的表达及其作为潜在预后生物标志物和细胞类型靶向治疗的可能性 | 巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的EGFL7和VEGF基因表达 | 数字病理学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的多种细胞类型 |
| 20803 | 2024-08-08 |
Evaluating the performance of dropout imputation and clustering methods for single-cell RNA sequencing data
2022-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105697
PMID:35697529
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研究论文 | 评估了九种流行的dropout插补方法与八种聚类方法在10个不同样本大小的单细胞RNA测序数据集上的组合效果 | 展示了插补算法通常能提高聚类方法的性能，并且特定插补与聚类方法组合的性能随数据集大小而变化 | NA | 探讨如何通过插补方法改善单细胞RNA测序数据的聚类质量 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个不同样本大小的数据集 |
| 20804 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals microglia induced angiogenesis by specific subsets of endothelial cells following spinal cord injury
2022-07, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200337R
PMID:35699080
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了脊髓损伤后特定内皮细胞亚群介导的微胶质细胞诱导的血管生成过程 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了脊髓损伤后血管生成的细胞和分子图谱 | 研究仅限于大鼠模型，未来需在更多物种中验证结果 | 探究脊髓损伤后血管生成的细胞机制 | 脊髓损伤后的血管内皮细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同时间点的脊髓组织样本 |
| 20805 | 2024-08-08 |
Mechanisms of joint destruction in rheumatoid arthritis - immune cell-fibroblast-bone interactions
2022-07, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-022-00793-5
PMID:35705856
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研究论文 | 本文探讨了类风湿性关节炎中关节破坏的机制，特别是免疫细胞、成纤维细胞和骨细胞之间的相互作用。 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了滑膜成纤维细胞和免疫细胞的异质性，并探讨了免疫系统如何促进滑膜成纤维细胞的组织破坏特性。 | NA | 旨在深入理解类风湿性关节炎中关节破坏的免疫机制，以及免疫系统、滑膜成纤维细胞和骨之间的相互作用。 | 类风湿性关节炎中的免疫细胞、成纤维细胞和骨细胞。 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20806 | 2024-08-08 |
A PDX1 cistrome and single-cell transcriptome resource of the developing pancreas
2022-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200432
PMID:35708349
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研究论文 | 本研究通过PDX1 ChIP-seq和单细胞RNA测序技术，分析了人类胎儿胰腺中PDX1结合的动态变化及其在胰腺发育中的作用 | 首次系统地研究了PDX1在人类和鼠类胰腺发育中的动态结合变化，并揭示了其在不同发育阶段的多方面作用 | NA | 探讨PDX1在胰腺发育中的作用及其结合基因的动态变化 | PDX1在人类和鼠类胰腺发育中的结合动态及其相关基因 | NA | NA | ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 人类胎儿胰腺样本 |
| 20807 | 2024-08-08 |
Ly6D+Siglec-H+ precursors contribute to conventional dendritic cells via a Zbtb46+Ly6D+ intermediary stage
2022-06-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31054-4
PMID:35705536
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和高维流式细胞术研究了骨髓中CD11cMHCIISiglec-HCCR9 DC前体细胞的分化和异质性 | 发现了Ly6D+Siglec-H+前体细胞通过Zbtb46+Ly6D+中间阶段贡献于常规树突状细胞(cDC)，并揭示了I型干扰素刺激如何影响pDC和cDC的输出 | NA | 探讨骨髓中树突状细胞前体细胞的分化和异质性 | 骨髓中的CD11cMHCIISiglec-HCCR9 DC前体细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学，高维流式细胞术 | NA | 细胞 | 小鼠骨髓中的DC前体细胞 |
| 20808 | 2024-08-08 |
ID proteins promote the survival and primed-to-naive transition of human embryonic stem cells through TCF3-mediated transcription
2022-06-15, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04958-8
PMID:35701409
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研究论文 | 研究探讨了ID1和ID3蛋白在人类胚胎干细胞（hESCs）中的作用，特别是它们如何通过TCF3介导的转录促进细胞存活和从激活态到原始态的转变 | 首次揭示了ID1和ID3蛋白通过AKT信号通路调节人类胚胎干细胞的存活和多能性，并通过TCF3介导的转录抑制MCL1来促进AKT磷酸化 | NA | 研究ID1和ID3蛋白在人类胚胎干细胞中的具体作用及其对细胞存活和状态转变的影响 | 人类胚胎干细胞（hESCs）中的ID1和ID3蛋白 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | ID1和ID3敲除线（IDs KO）以及过表达ID1的激活态hESCs |
| 20809 | 2024-08-08 |
Cell type matching in single-cell RNA-sequencing data using FR-Match
2022-06-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-14192-z
PMID:35705694
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研究论文 | 本文介绍了FR-Match（v2.0）的显著增强，这是一种用于匹配查询数据集中细胞类型与参考图谱的多变量非参数统计测试方法 | FR-Match v2.0包括一个标准化程序，以促进跨平台集群级别的比较，并扩展了管道以允许细胞级别的匹配 | NA | 开发和验证用于细胞类型匹配的计算算法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型匹配 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数统计测试 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 20810 | 2024-08-08 |
Identification, discrimination and heterogeneity of fibroblasts
2022-06-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30633-9
PMID:35701396
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综述 | 本文综述了近年来在成纤维细胞识别和异质性方面的最新进展，并讨论了它们与其他细胞类型的区别 | 利用单细胞转录组学技术，提供了详细的分子图谱，丰富了传统的组织学和免疫学描述，改进了细胞分类定义 | NA | 总结和讨论成纤维细胞识别和异质性的最新进展 | 成纤维细胞的识别、区分及其异质性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 分子图谱 | NA |
| 20811 | 2024-08-08 |
Genetic encoding of an esophageal motor circuit
2022-06-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110962
PMID:35705034
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了核模糊（nAmb）神经元的三种分子特异性亚型，并探讨了它们在食道肌肉控制中的作用 | 首次通过基因表达谱和轴突投射图揭示了nAmb神经元的分子特异性亚型，并证实了Crhr2神经元在食道肌肉功能控制中的作用 | NA | 阐明食道运动控制的遗传编码电路 | 核模糊（nAmb）神经元的分子特异性亚型及其在食道肌肉控制中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20812 | 2024-08-08 |
Deciphering the origins and fates of steroidogenic lineages in the mouse testis
2022-06-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110935
PMID:35705036
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术揭示了小鼠睾丸中类固醇生成细胞系（包括Leydig细胞和其前体细胞）的起源和分化动态 | 首次详细描述了小鼠睾丸中类固醇生成细胞系的双重起源及其在胚胎发育早期的分化过程 | NA | 探究小鼠睾丸中类固醇生成细胞系的起源和分化机制 | 小鼠睾丸中的Leydig细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多个胚胎发育阶段的样本 |
| 20813 | 2024-08-08 |
Unravelling the sex-specific diversity and functions of adrenal gland macrophages
2022-06-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110949
PMID:35705045
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和遗传模型研究了肾上腺巨噬细胞的异质性及其发育机制 | 首次定义了肾上腺巨噬细胞的异质性，并发现了一种具有低主要组织相容性复合体II类表达的女性特异性亚群 | NA | 揭示肾上腺巨噬细胞的性别特异性多样性和功能 | 肾上腺巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20814 | 2024-08-08 |
Fbxw11 impairs the repopulation capacity of hematopoietic stem/progenitor cells
2022-06-11, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02926-9
PMID:35690796
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研究论文 | 研究探讨了Fbxw11蛋白在造血干细胞/祖细胞（HSPCs）中的作用及其对细胞增殖和分化的影响 | 首次揭示了Fbxw11在HSPCs中的功能，并展示了其对细胞周期分布和转录组变化的影响 | 研究主要集中在体外和体内实验，可能需要更多临床数据来验证这些发现 | 探究Fbxw11在HSPCs中的作用及其对细胞自我更新和分化的影响 | 造血干细胞/祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 实时PCR，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多个造血亚群细胞，具体数量未详细说明 |
| 20815 | 2024-08-08 |
Single_cell_GRN: gene regulatory network identification based on supervised learning method and Single-cell RNA-seq data
2022-Jun-11, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-022-00297-8
PMID:35690842
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研究论文 | 本文研究了七种分类器在单细胞RNA测序数据上推断基因调控网络（GRN）的性能 | 本文首次比较了监督学习方法在单细胞RNA测序数据上推断基因调控网络的性能，并发现支持向量机（SVM）、随机森林（RF）和K-最近邻（KNN）表现最佳 | 研究仅使用了三种真实的单细胞RNA测序数据集，可能需要更多数据集来验证结果的普遍性 | 评估不同分类器在单细胞RNA测序数据上推断基因调控网络的性能 | 七种分类器在单细胞RNA测序数据上的性能 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 支持向量机（SVM）、随机森林（RF）、朴素贝叶斯（NB）、GBDT、逻辑回归（LR）、决策树（DT）和K-最近邻（KNN） | 单细胞RNA测序数据 | 三种真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 20816 | 2024-08-08 |
Exploring the cellular landscape of circular RNAs using full-length single-cell RNA sequencing
2022-06-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30963-8
PMID:35688820
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研究论文 | 本研究利用全长单细胞RNA测序技术探索了环状RNA在人和小鼠组织中的细胞景观 | 首次在单细胞水平上全面表征了环状RNA的细胞架构，并揭示了其在不同细胞类型中的特异性表达模式 | NA | 探索环状RNA在单细胞水平上的表达模式及其在不同细胞类型中的特异性 | 环状RNA在人和小鼠组织中的细胞景观 | 数字病理学 | NA | 全长单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 171个全长单细胞RNA-seq数据集，包含139,643个人和214,747个小鼠环状RNA |
| 20817 | 2024-08-08 |
LSH-GAN enables in-silico generation of cells for small sample high dimensional scRNA-seq data
2022-06-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03473-y
PMID:35688990
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research paper | 本文提出了一种改进的生成对抗网络LSH-GAN，用于生成高质量的细胞样本，以解决scRNA-seq数据下游分析中细胞样本不足的问题 | LSH-GAN通过使用局部敏感哈希更新生成器的训练过程，加快了样本生成速度，并提高了生成细胞样本的质量 | NA | 解决scRNA-seq数据下游分析中细胞样本不足的问题 | scRNA-seq数据中的细胞样本 | machine learning | NA | scRNA-seq | GAN | scRNA-seq数据 | 小样本 |
| 20818 | 2024-08-08 |
Identification of the central intermediate in the extra-embryonic to embryonic endoderm transition through single-cell transcriptomics
2022-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00923-x
PMID:35681011
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研究论文 | 本文利用大规模单细胞RNA测序技术，解析了从胚外到胚胎内胚层过渡过程中的中间细胞类型 | 开发了一种单参数计算方法来关联数据集中的细胞类型，并首次在空间上定位了从胚外身份到胚胎内胚层的中间细胞类型 | 在胚胎干细胞分化过程中，这种细胞类型的证据较少 | 研究胚胎发育过程中细胞身份的获取及其分化路径 | FOXA2报告基因小鼠胚胎和向内胚层分化的胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用FOXA2报告基因小鼠胚胎和胚胎干细胞分化样本 |
| 20819 | 2024-08-08 |
Synaptic Cell Adhesion Molecule 3 (SynCAM3) Deletion Promotes Recovery from Spinal Cord Injury by Limiting Glial Scar Formation
2022-Jun-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23116218
PMID:35682897
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研究论文 | 研究探讨了SynCAM3缺失对脊髓损伤后胶质瘢痕形成的影响及其对功能恢复的作用 | 首次揭示了SynCAM3在脊髓损伤后胶质瘢痕形成中的作用，并提出其作为治疗脊髓损伤的新靶点 | 研究仅在SynCAM3敲除小鼠模型中进行，结果的普遍性和临床应用需进一步验证 | 探究SynCAM3在脊髓损伤后胶质瘢痕形成中的作用及其对功能恢复的影响 | SynCAM3敲除小鼠与野生型小鼠在脊髓损伤后的表现 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序分析、定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR）分析、免疫组织化学（IHC） | NA | NA | SynCAM3敲除小鼠与野生型小鼠作为对照 |
| 20820 | 2024-08-08 |
Optocoder: computational decoding of spatially indexed bead arrays
2022-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac042
PMID:35685220
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Optocoder的计算框架，用于处理显微镜图像以在空间中解码珠子条形码 | Optocoder通过使用监督机器学习显著增加了光学解码和测序条形码之间的匹配数量 | NA | 开发一种高效的计算管道，用于处理显微镜图像并准确地基调用珠子条形码 | 空间转录组学方法中使用的条形码珠子阵列 | 计算机视觉 | NA | 显微镜 | 监督机器学习 | 图像 | 使用自家的空间转录组学平台和Slide-Seq(V2)数据进行了基准测试 |