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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2061 | 2025-11-23 |
NOTCH gene pattern predicts prognosis, immune infiltration, and drug response in Head and Neck squamous cell carcinoma
2025-Dec, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
DOI:10.1016/j.jormas.2025.102582
PMID:41022354
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研究论文 | 本研究开发并验证了基于NOTCH相关基因的头颈鳞状细胞癌预后风险模型 | 首次构建NOTCH评分系统用于HNSCC预后预测,并揭示其与肿瘤免疫微环境和治疗反应的关联 | 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发头颈鳞状细胞癌的预后预测模型并探索其临床意义 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,LASSO回归,ROC分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据,临床数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2062 | 2025-11-23 |
Macrophages mediate acute kidney allograft rejection via a toll-like receptor 4-dependent mechanism
2025-Dec, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.09.014
PMID:41033459
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞通过TLR4/HIF1α依赖机制介导急性肾移植排斥反应 | 首次证明髓系细胞特异性TLR4缺失可显著抑制急性肾移植排斥,并发现HIF1α是TLR4下游关键靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究巨噬细胞在急性肾移植排斥反应中的作用机制 | 髓系细胞特异性TLR4基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 肾移植排斥 | 单细胞RNA测序,免疫分型,药理学抑制 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据,免疫细胞表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2063 | 2025-11-23 |
Gαi1/3 Regulates Wnt/β-Catenin Signaling to Promote Osteogenesis and Bone Formation
2025-Nov-22, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf143
PMID:41273070
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研究论文 | 本研究揭示Gαi1/3通过调控Wnt/β-catenin信号通路促进成骨分化和骨形成的新机制 | 首次发现Gαi1/3而非Gαi2介导Wnt/β-catenin信号通路,阐明其通过与Axin1相互作用破坏β-catenin降解复合物的分子机制 | 研究主要使用小鼠胚胎成骨前体细胞系,人体组织验证不足 | 探究Gαi1/3蛋白在Wnt/β-catenin信号通路和骨形成中的作用机制 | 小鼠胚胎成骨前体细胞MC3T3-E1和小鼠模型 | 分子生物学 | 骨质疏松症 | 单细胞测序分析、病毒转染、基因编辑、免疫共沉淀、共聚焦显微镜、Western blot、ALP染色、茜素红染色、micro-CT | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、影像数据 | 细胞系实验和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2064 | 2025-11-23 |
TrajLens: Visual Analysis for Constructing Cell Developmental Trajectories in Cross-Sample Exploration
2025-Nov-21, IEEE transactions on visualization and computer graphics
IF:4.7Q1
DOI:10.1109/TVCG.2025.3634875
PMID:41269813
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研究论文 | 开发了一个名为TrajLens的可视分析系统,用于构建跨样本细胞发育轨迹 | 提出了基于GNN的跨样本细胞发育轨迹预测模型,并开发了集成细胞分布和发育方向特征的可视分析系统 | 需要人工参与轨迹精炼过程,系统性能仅通过两个案例研究和专家访谈验证 | 解决单细胞RNA测序分析中跨样本细胞发育轨迹构建的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GNN | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2065 | 2025-11-23 |
Can LLMs Bridge Domain and Visualization? A Case Study on High-Dimension Data Visualization in Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-21, IEEE transactions on visualization and computer graphics
IF:4.7Q1
DOI:10.1109/TVCG.2025.3633869
PMID:41269823
|
研究论文 | 本研究探索使用大型语言模型分析单细胞转录组学领域文献中高维数据可视化的应用情况 | 提出了一种人机协作的LLM工作流程,能够分析大量专业文献并将领域特定术语转化为标准化的数据和任务抽象 | 研究依赖于LLM的分析能力,可能受到模型理解专业术语准确性的限制 | 探索LLM在弥合可视化设计与领域特定应用之间差距的潜力 | 单细胞转录组学领域文献中的高维数据可视化 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型、图像处理、传统NLP方法 | LLM | 文本、图像 | 1,203篇论文,包含2,056个高维可视化 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2066 | 2025-11-23 |
BMAL1 insufficiency increases the risk of thoracic aortic aneurysm and dissection
2025-Nov-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf259
PMID:41270048
|
研究论文 | 本研究探讨BMAL1表达不足通过诱导血管平滑肌细胞凋亡增加胸主动脉瘤和夹层风险的机制 | 首次揭示BMAL1/REV-ERBα/c-MYC信号轴在TAAD发病中的关键作用,并发现BMAL1激活剂ISX-9和REV-ERBα激动剂SR9009的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明BMAL1在胸主动脉瘤和夹层发病机制中的作用 | TAAD患者组织样本、BAPN诱导的TAAD小鼠模型、血管平滑肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 转录组分析、空间转录组学、分子检测、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织学图像、分子互作数据 | TAAD患者和BAPN诱导的小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2067 | 2025-11-23 |
Cancer-Associated Fibroblasts Promote Imatinib Resistance in Gastrointestinal Stromal Tumors through PGK1-Mediated Metabolic Reprogramming
2025-Nov-21, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1404
PMID:41270149
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过PGK1介导的代谢重编程促进胃肠道间质瘤对伊马替尼耐药的新机制 | 首次发现CAF通过TGF-β1/CCN2/Rack1/PGK1信号轴介导代谢重编程驱动伊马替尼耐药,突破了既往主要关注遗传驱动因素的研究局限 | 研究主要基于共培养模型和单细胞测序,尚未在更大规模的临床队列中验证该机制 | 探索胃肠道间质瘤中肿瘤微环境介导的伊马替尼耐药机制 | 胃肠道间质瘤细胞和癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序, 共培养模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2068 | 2025-11-23 |
GPR25 promotes the formation of lung and liver tissue-resident memory CD8 T cells
2025-Nov-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adu2089
PMID:41270189
|
研究论文 | 本研究鉴定GPR25作为TGF-β信号诱导的G蛋白偶联受体,调控组织驻留记忆CD8 T细胞的形成 | 首次发现GPR25通过增强TGF-β信号通路促进组织驻留记忆CD8 T细胞发育的新机制 | 未明确GPR25在人类免疫系统中的具体作用机制 | 探索组织驻留记忆CD8 T细胞发育的分子调控通路 | 小鼠模型中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染和肿瘤 | 单细胞转录组测序,过继转移,肿瘤攻击模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2069 | 2025-11-23 |
Realgar-Induced CNS Toxicity: Exploring OTC-Mediated Ornithine Regulation of ZBTB7A Inhibits Astrocyte Glycolysis Based on the Liver-Brain Axis
2025-Nov-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502591
PMID:41270212
|
研究论文 | 本研究通过肝脑轴探讨OTC介导的鸟氨酸调控ZBTB7A抑制星形胶质细胞糖酵解在雄黄诱导中枢神经系统毒性中的作用机制 | 首次揭示雄黄通过肝脑轴调控星形胶质细胞能量代谢的新机制,发现OTC-鸟氨酸-ZBTB7A信号通路在雄黄神经毒性中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和细胞系实验,临床转化价值需进一步验证 | 阐明雄黄诱导中枢神经系统毒性的分子机制 | 条件干预动物模型(Zbtb7a敲低/Otc过表达/大黄酚干预)和C8-D1A星形胶质细胞系 | 神经毒理学 | 神经系统毒性 | 单细胞转录组测序,代谢组学分析,神经行为学实验,分子生物学实验,组织病理学实验 | 动物模型,细胞模型 | 基因表达数据,代谢物数据,行为数据,病理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2070 | 2025-11-23 |
Targeting the SOX9/TIMP1 Axis with iRGD-Conjugated Nanoplatform Enhances Dendritic Cell Function and Photodynamic Immunotherapy in Gastric Cancer
2025-Nov-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510500
PMID:41270217
|
研究论文 | 本研究开发了一种iRGD偶联的纳米平台,通过靶向SOX9/TIMP1轴增强树突状细胞功能并改善胃癌的光动力免疫治疗效果 | 首次揭示SOX9/TIMP1/FAK/PI3K轴在胃癌免疫抑制中的作用,并开发了能够同时实现基因沉默和光动力治疗的多功能纳米颗粒 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体中进行验证 | 开发针对胃癌免疫抑制微环境的联合治疗策略 | 胃癌细胞、树突状细胞、CD8⁺ T细胞 | 生物医学工程 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,光动力治疗,纳米技术 | NA | 基因表达数据,细胞功能数据,动物模型数据 | 胃癌异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2071 | 2025-11-23 |
Phenotypic characterization and prognostic impact of CD103+ tissue-resident memory T cells in diffuse large B cell lymphoma
2025-Nov-21, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0445
PMID:41270222
|
研究论文 | 本研究通过免疫荧光、流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤中CD103+组织驻留记忆T细胞的表型特征及其与良好预后的关联 | 首次在DLBCL中系统表征CD103+ TRM细胞的表型、转录组特征和功能活性,并证实其预后价值 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证结果 | 探究CD103+组织驻留记忆T细胞在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的表型特征和预后意义 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者组织样本 | 免疫肿瘤学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 免疫荧光染色, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITEseq, 共培养实验 | NA | 组织图像, 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 两个患者队列的DLBCL样本 | NA | 单细胞RNA测序, CITEseq | NA | NA |
| 2072 | 2025-11-23 |
Efferocytosis-Driven Polyamine Metabolism in Macrophages Enhances Cancer Stem Cell Enrichment after Chemotherapy in Ovarian Cancer
2025-Nov-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512508
PMID:41271556
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研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞通过胞葬作用驱动的多胺代谢促进卵巢癌化疗后癌症干细胞富集的新机制 | 首次发现胞葬作用通过ODC1介导的多胺代谢重编程促进癌症干细胞富集,为克服化疗耐药提供了新靶点 | 研究机制尚未在更广泛的癌症类型中验证,临床转化潜力需进一步评估 | 探究化疗后肿瘤微环境变化如何促进卵巢癌癌症干细胞富集及化疗耐药 | 卵巢癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和癌症干细胞 | 单细胞测序 | 卵巢癌 | 单细胞测序,多重免疫组化分析,代谢组学,转录组学 | NA | 单细胞测序数据,代谢组数据,转录组数据,免疫组化图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2073 | 2025-11-23 |
HNRNPA2B1 confers immune escape of non-small cell lung cancer through targeting lactate/ferroptosis
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08232-5
PMID:41271615
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研究论文 | 本研究揭示了HNRNPA2B1通过调控乳酸代谢和铁死亡促进非小细胞肺癌免疫逃逸的分子机制 | 首次发现m6A阅读器HNRNPA2B1通过增强LDHA mRNA稳定性和乳酸积累,介导非小细胞肺癌的免疫逃逸和铁死亡抵抗 | NA | 探究HNRNPA2B1在非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗中的作用机制 | 非小细胞肺癌细胞系和CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2074 | 2025-11-23 |
LMNA-PRKDC axis enhances DNA repair and promotes chemoresistance in glioblastoma
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08226-3
PMID:41271669
|
研究论文 | 本研究揭示了LMNA-PRKDC轴通过增强DNA修复能力驱动胶质母细胞瘤对替莫唑胺化疗耐药的机制 | 首次发现LMNA-PRKDC轴在胶质母细胞瘤化疗耐药中的作用机制,并证明PRKDC抑制剂可逆转耐药 | NA | 探索胶质母细胞瘤化疗耐药机制并寻找逆转耐药的策略 | 胶质母细胞瘤患者来源的异种移植模型、原发和复发胶质母细胞瘤标本 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、靶向免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 患者来源的异种移植模型和患者队列标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2075 | 2025-11-23 |
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and molecular features during postnatal pig testis development
2025-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12280-8
PMID:41272432
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统分析猪出生后睾丸发育过程中的细胞异质性和分子特征 | 首次在猪睾丸发育过程中识别出三种罕见细胞群体(周细胞、平滑肌细胞和中性粒细胞),并揭示了PRDX5和LUZP2的阶段特异性表达模式 | 研究仅基于8头猪的样本,样本量相对有限 | 揭示猪出生后睾丸发育过程中的细胞异质性和分子调控机制 | 猪睾丸细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、RNA速率建模 | 单细胞转录组数据 | 8头猪的115,248个睾丸细胞,采样时间点为0、2、5、24和48个月 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2076 | 2025-11-23 |
Spatial Location of SPP1+TAMs and Mutually Exclusive Subsets Based on Single-Cell and Transcriptome Data
2025-Nov-21, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70247
PMID:41273053
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组数据分析揭示了SPP1+TAMs在肺腺癌中的空间定位和互斥细胞亚群特征 | 首次系统阐明SPP1+TAMs和MARCO+M2巨噬细胞在肺腺癌不同发展阶段形成互斥细胞亚群,并揭示其空间分布特征与肿瘤侵袭性的关系 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 阐明SPP1+TAMs在肺腺癌中的空间定位和细胞亚群特征,为精准治疗提供科学依据 | 肺腺癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组,免疫组化 | UMAP | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化数据 | TCGA、GTEx、GEO和HPA数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2077 | 2025-11-23 |
Single-cell activation screen identifies hepatic maturation regulators with zonal resolution
2025-Nov-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.10.014
PMID:41270741
|
研究论文 | 通过单细胞激活筛选鉴定具有区域分辨率的肝脏成熟调控因子 | 结合发育参考图谱和dCas9激活筛选与单细胞转录组学,首次在单细胞水平对胚胎肝细胞进行功能筛选并识别关键转录调控因子 | 研究仅使用小鼠胚胎肝细胞,尚未在人类细胞或体内模型中验证 | 揭示肝脏成熟过程中的基因调控网络重编程机制 | 小鼠胚胎肝细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,dCas9激活筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2078 | 2025-11-23 |
Deciphering the role of RGS1-overexpressing CD8+T cells in immune evasion of bone metastatic cancer in the urinary system via single-cell sequencing analysis
2025-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152893
PMID:41176933
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示RGS1过表达的CD8+T细胞在泌尿系统骨转移癌免疫逃逸中的作用机制 | 首次阐明RGS1在骨转移癌免疫微环境中对CD8+T细胞功能的调控作用,并发现其与T细胞耗竭表型的关联 | 样本量相对有限(17例患者),需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明RGS1在肿瘤骨转移免疫微环境中的调控机制及CD8+T细胞功能 | 肾细胞癌和前列腺癌患者的骨转移病灶组织及小鼠骨转移模型 | 单细胞测序分析 | 肾细胞癌,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨转移模型 | 单细胞RNA测序数据 | 8例肾细胞癌患者和9例前列腺癌患者的骨转移病灶,共215,864个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2079 | 2025-11-23 |
Loss of Actrt1 in non-hematopoietic stroma suppresses pathological angiogenesis and tumor progression
2025-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152916
PMID:41197408
|
研究论文 | 本研究揭示了Actrt1蛋白通过非造血基质细胞促进肿瘤血管生成和肿瘤进展的新机制 | 首次发现Actrt1在肿瘤微环境非造血内皮细胞中的关键作用,并证明其特异性调控病理性血管生成而不影响发育性血管生成 | 研究主要使用小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究Actrt1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤血管生成的影响 | 小鼠肿瘤模型(B16F1和MC38肿瘤细胞)、血管内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,骨髓嵌合体实验,主动脉环分析,后肢缺血模型 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | Actrt1敲除小鼠和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2080 | 2025-11-23 |
scCausalVI disentangles single-cell perturbation responses with causality-aware generative model
2025-Nov-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101443
PMID:41197632
|
研究论文 | 提出了一种因果关系感知的生成模型scCausalVI,用于解耦单细胞RNA测序数据中的内在细胞状态和外部刺激效应 | 通过深度结构因果网络显式建模细胞状态特异性对外部扰动的响应机制,整合结构因果建模与跨条件计算机预测 | NA | 区分单细胞数据中固有细胞变异与外部刺激诱导的外在效应 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 生成模型, 深度结构因果网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |