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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2061 | 2025-10-06 |
Spatial omics technology potentially promotes the progress of tumor immunotherapy
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03075-5
PMID:40456924
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综述 | 本文全面概述了空间组学技术的起源、分类和特点,并探讨其在肿瘤免疫治疗中的应用前景 | 强调空间组学技术相比单细胞测序在保留空间背景和整合多模态分析方面的优势,提出结合其他技术可发现被忽视的治疗靶点 | 临床转化面临挑战,技术应用仍存在局限性 | 探讨空间组学技术如何促进肿瘤免疫治疗的进展 | 肿瘤微环境、B细胞和T细胞、三级淋巴结构 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间组学分析 | NA | 空间多模态数据 | NA | NA | 空间组学 | NA | NA |
2062 | 2025-10-06 |
Using proteomics and single-cell sequencing to analyze the pathogenesis of recurrent implantation failure associated with uterine natural killer cells
2025-Sep, Archives of gynecology and obstetrics
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00404-025-08074-8
PMID:40514455
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞测序技术分析了复发性种植失败与子宫自然杀伤细胞的关联机制 | 首次整合蛋白质组学和单细胞测序数据,鉴定出与RIF相关的三个关键基因(AMPD3、H6PD、PAK2)及其调控机制 | 样本量较小(6例RIF患者和6例对照),需要更大规模研究验证 | 探索复发性种植失败的分子机制,特别关注子宫自然杀伤细胞的作用 | 复发性种植失败患者的子宫内膜组织和自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 12例子宫内膜组织样本(6例RIF患者和6例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2063 | 2025-10-06 |
Multi-omics reveals the polyethylene terephthalate carcinogenicity: Cancer progression and immune microenvironment
2025-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118522
PMID:40532600
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研究论文 | 通过多组学方法系统研究聚乙烯 terephthalate (PET) 的致癌机制及其对肿瘤微环境的影响 | 首次整合网络毒理学、机器学习、分子对接、单细胞RNA测序和空间转录omics 系统揭示PET的致癌机制 | 未明确说明样本来源和具体样本数量 | 探究PET塑料的致癌机制及其在肿瘤发生发展中的作用 | PET相关致癌靶点、肿瘤细胞、免疫细胞 | 计算生物学 | 癌症 | 网络毒理学, 机器学习, 分子对接, 单细胞RNA测序, 空间转录omics, 克隆形成实验, western blotting | 机器学习算法 | 组学数据, 分子对接数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录omics | NA | NA |
2064 | 2025-10-06 |
Insights into tissue- and cell type-specific effects of Grb10 on pig skeletal muscle growth by multi-omics analysis
2025-Sep, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2910-7
PMID:40545505
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研究论文 | 通过多组学分析揭示Grb10基因在猪骨骼肌生长中的组织和细胞类型特异性效应 | 首次结合基因组学、转录组学、表观基因组学和单细胞转录组学系统分析GRB10在肥胖型和瘦肉型猪肌肉组织中的特异性调控机制 | 研究主要聚焦于猪模型,人类中的保守性验证仍需进一步研究 | 探索GRB10基因调控肌肉生长的分子机制及其在肥胖与瘦肉型猪中的差异 | 肥胖型和瘦肉型家猪的骨骼肌组织及细胞 | 多组学整合分析 | 肥胖相关肌肉发育异常 | 基因组学, 转录组学, 表观基因组学, 单细胞转录组学, 双荧光素酶报告实验, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因组序列, 转录组数据, 表观基因组数据, 单细胞RNA测序数据 | 肥胖型和瘦肉型猪品种的肌肉组织样本 | NA | 单核RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
2065 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of IGF2BP2 and PRMT5 in gallbladder cancer progression: insights from multi-omics analysis
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03062-w
PMID:40555776
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示IGF2BP2-PRMT5轴在胆囊癌进展中的关键作用 | 首次发现IGF2BP2通过m6A修饰稳定PRMT5表达,并阐明其通过AKT/mTOR通路调控脂质代谢重编程和免疫逃避的新机制 | NA | 阐明驱动胆囊癌进展的分子机制并确定新的治疗靶点 | 胆囊癌细胞和人类化小鼠模型 | 多组学分析 | 胆囊癌 | 单细胞转录组学、高通量测序、蛋白质组学、m6A修饰分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2066 | 2025-10-06 |
CD8+GZMK+CD27+CCR7+ T cells mobilized by splenic sympathetic nerves aggravate brain ischemia‒reperfusion injury via CCL19-positive endothelial cells
2025-Sep, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01311-9
PMID:40659887
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研究论文 | 本研究揭示了脾交感神经通过动员GZMK+CD8+CD27+CCR7+ T细胞亚群经CCL19-CCR7轴加重脑缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现并命名了脑卒中相关的Tsa细胞亚群,阐明了脾交感神经-ADRB2信号通路和CCL19-CCR7趋化轴在脑缺血损伤中的新作用机制 | 研究主要基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究脾交感神经在脑缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗策略 | 急性缺血性脑卒中患者和短暂性大脑中动脉闭塞小鼠模型 | 免疫神经科学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 急性缺血性脑卒中患者和tMCAO小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
2067 | 2025-10-06 |
Methyl-CpG-binding domain as a protein interaction partner in promoter regulation and neurodevelopment through evolutionary expanded entanglement
2025-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00749.2024
PMID:40712661
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研究论文 | 本文探讨甲基结合域(MBD)作为蛋白质相互作用基序在启动子调控和神经发育中的作用 | 发现MBD可作为独立于甲基化DNA结合的蛋白质相互作用基序,并揭示其在脊椎动物中的进化扩展纠缠机制 | MBD3和GATAD2B亚复合物的非DNA结合生物学特性可能使其研究不够充分 | 研究MBD结构域在基因调控和神经发育中的进化保守功能 | MBD蛋白家族成员及其相互作用的NuRD复合物 | 表观遗传学 | 智力障碍综合征 | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, 批量组织分析 | NA | 基因组学数据, 转录组数据 | 超过1.15亿个单细胞和数千个批量组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
2068 | 2025-10-06 |
Expression profile of the ADHD risk gene ADGRL3 during human neurodevelopment and the effects of genetic variation
2025-Sep, The world journal of biological psychiatry : the official journal of the World Federation of Societies of Biological Psychiatry
DOI:10.1080/15622975.2025.2520518
PMID:40552428
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研究论文 | 本研究通过人诱导多能干细胞分化的皮质神经元,探究ADHD风险基因ADGRL3在人类神经发育过程中的表达谱及其遗传变异的影响 | 首次在人类神经发育过程中系统研究ADGRL3基因的表达模式,并揭示rs1397547 SNP对基因转录的调控作用 | 研究基于体外hiPSC分化模型,可能与体内神经发育存在差异 | 阐明ADGRL3基因在人类神经发育过程中的作用及其与ADHD发病机制的关系 | 人诱导多能干细胞分化的皮质神经元 | 神经发育生物学 | 注意缺陷多动障碍 | 单细胞RNA测序,hiPSC分化技术 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2069 | 2025-10-06 |
Mast Cells Drive Ferroptosis in Gastric Tumors as Key Players in the Tumor Immune Microenvironment
2025-Sep, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251366980
PMID:40831393
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研究论文 | 本研究通过整合转录组分析揭示了肥大细胞在胃癌肿瘤微环境中通过旁分泌信号促进铁死亡的关键作用 | 首次发现肥大细胞通过膜联蛋白和亲环素A等旁分泌信号在肿瘤微环境中促进铁死亡的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认机制 | 探究铁死亡与特定免疫细胞类型在胃癌中的功能联系 | 胃癌组织和相关免疫细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单样本基因集富集分析 | NA | 转录组数据 | TCGA-STAD数据集412例,GSE66229数据集300例,GSE223179共培养数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2070 | 2025-10-06 |
Mitochondrial One-Carbon Metabolism Drives CD34-Lineage Cells to Differentiate Into T Follicular Helper Cells to Form Tertiary Lymphoid Organs in Transplant Arteriosclerosis
2025-Aug-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体一碳代谢通过调控CD34谱系细胞向滤泡辅助T细胞分化,促进移植动脉粥样硬化中三级淋巴器官形成的机制 | 首次发现CD34谱系细胞是移植动脉中T细胞群的主要来源,并阐明线粒体一碳代谢关键酶MTHFD2在Tfh细胞分化中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究移植动脉粥样硬化中T滤泡辅助细胞的起源和调控机制 | 小鼠移植动脉模型中的CD34谱系细胞和T滤泡辅助细胞 | 免疫学 | 移植动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光染色, 超高效液相色谱, 高分辨率质谱代谢组学 | 谱系追踪小鼠模型, CD4+ T细胞特异性MTHFD2敲除小鼠 | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 流式细胞数据, 免疫组织化学数据 | 移植后2周和4周的小鼠动脉组织 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
2071 | 2025-10-06 |
Perturb-Multimodal: A platform for pooled genetic screens with imaging and sequencing in intact mammalian tissue
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.022
PMID:40513557
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研究论文 | 开发了一种结合成像和测序的多模态平台,用于在完整哺乳动物组织中进行大规模遗传筛选 | 首次实现了在完整组织中同时进行成像和测序的配对多模态遗传筛选方法 | 目前仅在小鼠肝脏中进行了应用验证 | 构建大规模多模态基因型-表型图谱,解析组织功能的遗传调控基础 | 小鼠肝脏组织中的数百种遗传扰动 | 机器学习 | NA | 单细胞测序,成像技术 | NA | 图像,基因表达数据 | 数百种遗传扰动的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | Perturb-Multimodal(Perturb-Multi)平台 |
2072 | 2025-10-06 |
Cholinergic neuronal activity promotes diffuse midline glioma growth through muscarinic signaling
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.031
PMID:40541184
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研究论文 | 本研究揭示了中脑胆碱能神经元通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现中脑胆碱能神经元活动通过M1/M3受体依赖方式促进弥漫性中线胶质瘤增殖,揭示了不同脑区特异性神经环路对肿瘤生长的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者中的临床相关性需要进一步验证 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、少突胶质前体细胞、中脑胆碱能神经元 | 神经肿瘤学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、药理学阻断、遗传学阻断 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据、神经活动记录 | DMG荷瘤小鼠模型及原代DMG样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2073 | 2025-10-06 |
Single-cell epigenomic and transcriptomic analysis unveils the pivotal role of GATA5/ISL1+ fibroblasts in cardiac repair post-myocardial infarction
2025-Aug-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf101
PMID:40460294
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研究论文 | 通过单细胞表观基因组和转录组分析揭示GATA5/ISL1+成纤维细胞在心肌梗死后心脏修复中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,在心肌梗死小鼠心脏中发现并鉴定GATA5/ISL1+成纤维细胞新亚群 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明心肌梗死后心脏组织的全基因组调控景观和修复机制 | 心肌梗死小鼠模型和人类心肌梗死患者的心脏组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 蛋白质组数据 | 心肌梗死小鼠在1、3、7、14天时间点的心脏组织,以及人类心肌梗死患者心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
2074 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of ovarian myeloid cells identifies age-associated changes in macrophages and signaling dynamics†
2025-Aug-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf122
PMID:40459236
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析年轻与年老小鼠卵巢髓系细胞,揭示年龄相关的巨噬细胞亚群和信号通路变化 | 首次在年老小鼠卵巢中发现独特的Cx3cr1lowCd81hi巨噬细胞亚群,并揭示ANNEXIN和TGFβ信号通路在卵巢衰老中的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究卵巢衰老过程中髓系细胞的功能特征和分子机制 | 年轻(3个月)和年老(14-17个月)小鼠卵巢中的CD45+ CD11b+髓系细胞 | 单细胞生物学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 年轻和年老小鼠卵巢髓系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2075 | 2025-10-06 |
CXCR4-LASP1-G9a-SNAIL axis drives NEPC transdifferentiation via induction of EMT and downregulation of REST
2025-Aug-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100916
PMID:40499539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CXCR4-LASP1-G9a-SNAIL轴驱动前列腺癌神经内分泌分化的分子机制 | 首次发现CXCR4-LASP1-G9a-SNAIL信号轴通过诱导EMT和下调REST调控神经内分泌前列腺癌转分化 | 研究主要基于LTL331 PDX模型,需要更多临床样本验证 | 探索前列腺癌神经内分泌分化的早期调控信号 | LTL331前列腺腺癌患者来源异种移植模型 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | PDX模型 | 单细胞转录组数据 | LTL331前列腺癌PDX模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2076 | 2025-10-06 |
Gene print-based cell subtypes annotation of human disease across heterogeneous datasets with gPRINT
2025-Aug-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf001
PMID:40083145
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研究论文 | 开发gPRINT算法用于跨异构单细胞数据集的疾病特异性细胞亚型统一注释 | 受语音识别原理启发,将基因位置和表达信息转化为声纹模式,结合神经网络减少背景噪声影响 | NA | 实现跨异构单细胞数据集的疾病特异性细胞亚型统一注释 | 人类疾病细胞亚型 | 生物信息学 | 纤维化相关疾病 | 单细胞测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2077 | 2025-10-06 |
Human Dermal Microvascular Arterial and Venous Blood Endothelial Cells and Their Use in Bioengineered Dermo-Epidermal Skin Substitutes
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401588
PMID:39871784
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析人类皮肤内皮细胞标记物,并成功在三维水凝胶中构建了功能性动脉和静脉毛细血管网络 | 首次在生物工程组织中同时构建动脉、静脉丛和淋巴毛细血管网络,并证明其能与宿主血管快速吻合 | 研究主要基于胎儿和青少年皮肤样本,未涉及成年或老年组织 | 开发具有完整血管网络的组织工程皮肤替代物用于再生医学 | 人类胎儿和青少年皮肤中的真皮微血管动脉和静脉血内皮细胞 | 再生医学 | 皮肤组织缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类胎儿和青少年皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2078 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of PSMB8 Expression and Its Potential Roles in Hepatocellular Carcinoma
2025-Aug, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-09040-9
PMID:40261568
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研究论文 | 通过多组学分析探讨PSMB8在肝细胞癌中的表达特征及其临床意义 | 首次系统揭示PSMB8在肝细胞癌中的免疫调节功能及其与免疫检查点分子的关联 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证其分子机制 | 阐明PSMB8在肝细胞癌中的功能作用和临床意义 | 肝细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据,临床病理数据,单细胞测序数据,组织芯片图像 | TCGA和GSE76427数据集中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,组织芯片 | NA | NA |
2079 | 2025-10-06 |
The Genomics of Aging at the Single-Cell Scale
2025-Aug, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 总结单细胞测序技术在研究哺乳动物衰老过程中细胞类型特异性变化的应用 | 首次系统整合跨器官衰老相关细胞状态变化,并分析性别差异和抗衰老干预的影响 | 基于现有研究数据的整合分析,缺乏原始实验验证 | 阐明衰老对哺乳动物细胞群体动态影响的细胞基础 | 哺乳动物多种器官的细胞群体 | 单细胞基因组学 | 老年疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2080 | 2025-10-06 |
Identification of Multi-Landscape and Cell Interactions in the Tumor Microenvironment Through High-Coverage Single-Cell Sequencing
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202500241
PMID:40320868
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研究论文 | 开发了一种新型单细胞RNA测序技术Chigene,能够同时分析基因表达、突变和RNA剪接景观 | 结合oligo-dT引物和随机桥接共标记测序技术,首次实现单细胞水平的多重RNA景观分析 | 未明确说明样本数量的具体限制和平台应用的广泛性验证 | 开发高覆盖度的单细胞测序技术以探索肿瘤微环境中的多景观和细胞相互作用 | 尿路上皮癌临床样本中的细胞亚群 | 单细胞测序 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序,随机桥接共标记测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | Chigene | 单细胞RNA-seq | Chigene V1, Chigene V2 | Chigene单细胞RNA测序平台,结合oligo-dT引物和RBCL测序技术 |