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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2061 | 2025-10-06 |
Single-cell epigenomic and transcriptomic analysis unveils the pivotal role of GATA5/ISL1+ fibroblasts in cardiac repair post-myocardial infarction
2025-Aug-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf101
PMID:40460294
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研究论文 | 通过单细胞表观基因组和转录组分析揭示GATA5/ISL1+成纤维细胞在心肌梗死后心脏修复中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,在心肌梗死小鼠心脏中发现并鉴定GATA5/ISL1+成纤维细胞新亚群 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明心肌梗死后心脏组织的全基因组调控景观和修复机制 | 心肌梗死小鼠模型和人类心肌梗死患者的心脏组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 蛋白质组数据 | 心肌梗死小鼠在1、3、7、14天时间点的心脏组织,以及人类心肌梗死患者心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
2062 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of ovarian myeloid cells identifies age-associated changes in macrophages and signaling dynamics†
2025-Aug-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf122
PMID:40459236
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析年轻与年老小鼠卵巢髓系细胞,揭示年龄相关的巨噬细胞亚群和信号通路变化 | 首次在年老小鼠卵巢中发现独特的Cx3cr1lowCd81hi巨噬细胞亚群,并揭示ANNEXIN和TGFβ信号通路在卵巢衰老中的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究卵巢衰老过程中髓系细胞的功能特征和分子机制 | 年轻(3个月)和年老(14-17个月)小鼠卵巢中的CD45+ CD11b+髓系细胞 | 单细胞生物学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 年轻和年老小鼠卵巢髓系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2063 | 2025-10-06 |
CXCR4-LASP1-G9a-SNAIL axis drives NEPC transdifferentiation via induction of EMT and downregulation of REST
2025-Aug-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100916
PMID:40499539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CXCR4-LASP1-G9a-SNAIL轴驱动前列腺癌神经内分泌分化的分子机制 | 首次发现CXCR4-LASP1-G9a-SNAIL信号轴通过诱导EMT和下调REST调控神经内分泌前列腺癌转分化 | 研究主要基于LTL331 PDX模型,需要更多临床样本验证 | 探索前列腺癌神经内分泌分化的早期调控信号 | LTL331前列腺腺癌患者来源异种移植模型 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | PDX模型 | 单细胞转录组数据 | LTL331前列腺癌PDX模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2064 | 2025-10-06 |
Gene print-based cell subtypes annotation of human disease across heterogeneous datasets with gPRINT
2025-Aug-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf001
PMID:40083145
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研究论文 | 开发gPRINT算法用于跨异构单细胞数据集的疾病特异性细胞亚型统一注释 | 受语音识别原理启发,将基因位置和表达信息转化为声纹模式,结合神经网络减少背景噪声影响 | NA | 实现跨异构单细胞数据集的疾病特异性细胞亚型统一注释 | 人类疾病细胞亚型 | 生物信息学 | 纤维化相关疾病 | 单细胞测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2065 | 2025-10-06 |
Human Dermal Microvascular Arterial and Venous Blood Endothelial Cells and Their Use in Bioengineered Dermo-Epidermal Skin Substitutes
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401588
PMID:39871784
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析人类皮肤内皮细胞标记物,并成功在三维水凝胶中构建了功能性动脉和静脉毛细血管网络 | 首次在生物工程组织中同时构建动脉、静脉丛和淋巴毛细血管网络,并证明其能与宿主血管快速吻合 | 研究主要基于胎儿和青少年皮肤样本,未涉及成年或老年组织 | 开发具有完整血管网络的组织工程皮肤替代物用于再生医学 | 人类胎儿和青少年皮肤中的真皮微血管动脉和静脉血内皮细胞 | 再生医学 | 皮肤组织缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类胎儿和青少年皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2066 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of PSMB8 Expression and Its Potential Roles in Hepatocellular Carcinoma
2025-Aug, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-09040-9
PMID:40261568
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研究论文 | 通过多组学分析探讨PSMB8在肝细胞癌中的表达特征及其临床意义 | 首次系统揭示PSMB8在肝细胞癌中的免疫调节功能及其与免疫检查点分子的关联 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证其分子机制 | 阐明PSMB8在肝细胞癌中的功能作用和临床意义 | 肝细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据,临床病理数据,单细胞测序数据,组织芯片图像 | TCGA和GSE76427数据集中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,组织芯片 | NA | NA |
2067 | 2025-10-06 |
The Genomics of Aging at the Single-Cell Scale
2025-Aug, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 总结单细胞测序技术在研究哺乳动物衰老过程中细胞类型特异性变化的应用 | 首次系统整合跨器官衰老相关细胞状态变化,并分析性别差异和抗衰老干预的影响 | 基于现有研究数据的整合分析,缺乏原始实验验证 | 阐明衰老对哺乳动物细胞群体动态影响的细胞基础 | 哺乳动物多种器官的细胞群体 | 单细胞基因组学 | 老年疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2068 | 2025-10-06 |
Identification of Multi-Landscape and Cell Interactions in the Tumor Microenvironment Through High-Coverage Single-Cell Sequencing
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202500241
PMID:40320868
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研究论文 | 开发了一种新型单细胞RNA测序技术Chigene,能够同时分析基因表达、突变和RNA剪接景观 | 结合oligo-dT引物和随机桥接共标记测序技术,首次实现单细胞水平的多重RNA景观分析 | 未明确说明样本数量的具体限制和平台应用的广泛性验证 | 开发高覆盖度的单细胞测序技术以探索肿瘤微环境中的多景观和细胞相互作用 | 尿路上皮癌临床样本中的细胞亚群 | 单细胞测序 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序,随机桥接共标记测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | Chigene | 单细胞RNA-seq | Chigene V1, Chigene V2 | Chigene单细胞RNA测序平台,结合oligo-dT引物和RBCL测序技术 |
2069 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics reveal NSUN2 facilitates glycolysis and histone lactylation-driven immune evasion in renal carcinoma
2025-Aug, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00336-4
PMID:40413354
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析发现NSUN2通过促进糖酵解和组蛋白乳酸化驱动肾癌免疫逃逸 | 首次揭示NSUN2通过m5C依赖性方式调控糖酵解和组蛋白乳酸化,进而介导PD-L1依赖的免疫逃逸机制 | 研究主要基于临床队列数据分析,需要更多实验验证机制细节 | 探索肾透明细胞癌中线粒体代谢基因的预后和治疗潜力 | 肾透明细胞癌临床队列和细胞模型 | 多组学分析 | 肾癌 | 批量RNA测序,单细胞测序,机器学习 | 10种机器学习算法构建的117个预测模型 | 转录组数据,单细胞数据 | 多个肾透明细胞癌临床队列 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
2070 | 2025-10-06 |
Epithelial cell dynamics: Key drivers of type 2 inflammation in eosinophilic chronic rhinosinusitis
2025-Aug, Auris, nasus, larynx
DOI:10.1016/j.anl.2025.05.009
PMID:40424830
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综述 | 本文探讨了上皮细胞在嗜酸性慢性鼻窦炎中通过释放细胞因子驱动2型炎症的关键作用 | 强调了上皮细胞(而非传统认为的免疫细胞)在疾病发病机制中的核心地位,并提出了针对上皮-免疫细胞异常串扰的新型治疗策略 | 疾病发病机制存在患者群体异质性,通用疗法开发困难 | 探索上皮细胞在嗜酸性慢性鼻窦炎2型炎症中的驱动机制 | 鼻窦黏膜上皮细胞及其亚群(基底细胞、簇细胞) | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
2071 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals that Vitamin C Inhibits Bone Metastasis of Renal Cancer via Cell Cycle Arrest and Microenvironment Remodeling
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501011
PMID:40433925
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了维生素C通过诱导细胞周期阻滞和重塑肿瘤微环境抑制肾癌骨转移的机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统揭示维生素C在骨转移微环境中的抗肿瘤作用机制,并发现与CXCR2拮抗剂的协同治疗效果 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究维生素C抑制肾癌骨转移的分子机制和治疗潜力 | 肾癌细胞、骨转移微环境中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 单细胞分析 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨转移模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2072 | 2025-10-06 |
PROS1-MERTK Axis Drives Tumor Microenvironment Crosstalk and Progression in Papillary Thyroid Microcarcinoma
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413474
PMID:40433916
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了甲状腺微小乳头状癌进展中PROS1-MERTK信号轴的关键调控作用 | 首次发现PROS1-MERTK信号轴通过旁分泌和自分泌机制驱动甲状腺微小乳头状癌进展,并鉴定NFYB和FOXP2为PROS1转录激活因子 | 样本量相对有限(15例患者19个组织标本),需要更大规模研究验证 | 探索甲状腺微小乳头状癌进展的分子机制和生物标志物 | 甲状腺微小乳头状癌患者手术组织标本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体外实验, 体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 15例患者的19个手术组织标本(4个癌旁组织、4个非进展性PTMC、5个进展性PTMC、6个进展性PTC) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2073 | 2025-10-06 |
Comprehensive Characterization of Bihormonal Cells and Endocrine Cell Lineages in Mammalian Pancreatic Islets
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416326
PMID:40439685
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研究论文 | 本研究通过多技术手段全面表征哺乳动物胰岛中的双激素细胞和内分泌细胞谱系 | 首次系统证明双激素细胞并非独特谱系或过渡状态,并重新定义了内分泌细胞分类体系 | 人类胰岛生物学在小鼠模型中的转化存在挑战,物种间存在特异性差异 | 阐明双激素细胞在胰岛中的作用及其在β细胞恢复中的潜力 | 哺乳动物胰腺胰岛细胞,包括小鼠和人类胰岛 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 成像流式细胞术, 双重组酶谱系追踪, 基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 遗传工程小鼠品系和糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2074 | 2025-10-06 |
HLA-DR⁺ Tumor Cells Show an Association with a Distinct Immune Microenvironment and CD8⁺ T-Cell Exhaustion in HBV-Associated Hepatocellular Carcinoma
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502979
PMID:40464412
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和蛋白质水平验证,发现HLA-DR⁺肿瘤细胞是HBV相关肝细胞癌的独特特征,并与免疫抑制微环境和CD8⁺ T细胞耗竭相关 | 首次在HBV相关肝癌中鉴定出HLA-DR⁺肿瘤细胞这一独特亚群,揭示了其与免疫检查点激活和T细胞耗竭的特异性关联 | 研究主要基于回顾性数据分析,需要进一步功能实验验证HLA-DR⁺肿瘤细胞的具体免疫调节机制 | 探究HBV相关肝细胞癌肿瘤微环境的特异性免疫特征和免疫抑制机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和免疫细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 组织芯片 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 160个样本来自124名患者(scRNA-seq), 198个HCC标本(组织验证) | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
2075 | 2025-10-06 |
Real-Time Evolutionary Landscape of the Bronchial Epithelium and Corresponding Dynamic Immune Cell Alterations in Lung Squamous Cell Carcinogenesis
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413256
PMID:40470646
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺鳞状细胞癌发生过程中支气管上皮细胞的实时进化轨迹及相应免疫微环境的动态变化 | 首次在动物模型中系统描绘了从正常肺上皮到浸润性鳞癌的完整进化路径,并发现典型拷贝数变异在增生/化生阶段就已大量出现 | 研究基于大鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明肺鳞状细胞癌发生过程中肿瘤细胞与微环境的共同进化机制 | 大鼠肺组织样本(包括正常肺上皮、增生、化生、异型增生、原位癌和浸润性鳞癌) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育阶段的肺组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2076 | 2025-10-06 |
Mapping the role of cytokine signaling at single-cell and structural resolution in uveal melanoma
2025-Aug, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00337-3
PMID:40490526
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和结构生物学方法揭示了葡萄膜黑色素瘤中细胞因子信号传导的分子复杂性 | 首次结合单细胞RNA测序与AlphaFold 2结构预测技术,系统分析葡萄膜黑色素瘤中细胞因子信号传导相关基因的作用机制 | 样本量相对有限(8个原发肿瘤和3个转移瘤),需要更大规模验证 | 探索葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的复杂性并识别新的治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, AlphaFold 2结构预测, 分子对接分析 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 结构预测数据 | 8个原发葡萄膜黑色素瘤眼组织 + 3个肝转移瘤 + TCGA-UVM和GSE84976队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
2077 | 2025-10-06 |
DNA damage repair (DDR) related prognostic risk model in multiple myeloma based on single-cell and bulk sequencing
2025-Aug, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2025.103857
PMID:40527059
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研究论文 | 基于单细胞和批量测序构建多发性骨髓瘤DNA损伤修复相关预后风险模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据筛选DDR基因,构建多发性骨髓瘤预后风险模型并验证其预测性能 | 未明确说明样本来源和队列规模,缺乏外部验证数据 | 研究DNA损伤修复基因在多发性骨髓瘤中的预后价值并构建风险预测模型 | 多发性骨髓瘤患者及其基因表达数据 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, 差异表达分析 | 预后风险模型, 列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
2078 | 2025-10-06 |
Morphodynamics of human early brain organoid development
2025-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09151-3
PMID:40533563
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研究论文 | 本研究通过长期活体光片显微镜技术结合单细胞转录组分析,揭示人类早期脑类器官发育过程中的形态动力学特征 | 开发了双通道多蛋白标记策略与计算解复用方法,首次实现脑类器官发育过程中不同亚细胞特征的同步量化跟踪 | 研究基于无引导脑类器官模型,可能与实际体内大脑发育存在差异 | 探索人类大脑发育的形态动力学机制和自组织过程 | 人类诱导多能干细胞衍生的脑类器官 | 发育生物学 | NA | 光片显微镜,单细胞RNA测序,荧光标记 | NA | 图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2079 | 2025-10-06 |
[Research advances in perineural invasion of pancreatic cancer]
2025-Aug-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
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综述 | 系统回顾胰腺癌神经侵袭领域的最新研究进展 | 整合了单细胞空间转录组学手术导航策略和靶向神经丛切除联合分子靶向探针的精准技术 | 未涉及具体临床转化中跨学科技术整合的挑战解决方案 | 探索胰腺癌神经侵袭的多维机制及治疗策略 | 胰腺癌神经侵袭的病理特征和生物学过程 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2080 | 2025-10-06 |
Identifying Causal Brain Structures, Genes, and Proteins for Osteoarthritis: A Large-Scale Genetic Correlation Study Based on Brain Imaging-Derived Phenotypes, Transcriptomes, and Proteomes
2025-Jun-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf083
PMID:40247738
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研究论文 | 通过整合脑影像、转录组和蛋白质组数据,识别与骨关节炎风险相关的因果性脑结构、基因和蛋白质 | 首次大规模整合脑影像表型、转录组和蛋白质组数据,系统研究脑-关节轴在骨关节炎遗传机制中的作用 | 研究基于欧洲人群数据,结果在其他种族中的普适性需要验证 | 验证脑结构与骨关节炎风险的遗传相关性,识别关键因果基因和蛋白质 | 826,690名参与者的骨关节炎GWAS数据、5,138个脑转录组和152个人脑蛋白质组 | 生物信息学 | 骨关节炎 | LDSC, Mendelian randomization, TWAS, PWAS, 单细胞RNA-seq eQTL分析 | 遗传相关性分析模型 | 基因组、转录组、蛋白质组数据 | 826,690名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 转录组关联分析, 蛋白质组关联分析 | NA | NA |