单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20741 - 20760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20741 | 2024-08-08 |
Differentiation Trajectory of Limbal Stem and Progenitor Cells under Normal Homeostasis and upon Corneal Wounding
2022-06-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11131983
PMID:35805068
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序在小鼠模型中识别正常稳态和角膜损伤情况下角膜缘干细胞及其前体细胞的异质细胞群及其分化轨迹 | 本研究首次识别出两种潜在的角膜缘干细胞类型，并揭示了它们在正常稳态和伤口愈合过程中的分化轨迹 | NA | 旨在识别正常稳态和角膜损伤情况下角膜缘干细胞及其前体细胞的异质细胞群 | 角膜缘干细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 20742 | 2024-08-08 |
Comparison of cell state models derived from single-cell RNA sequencing data: graph versus multi-dimensional space
2022-06-10, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022395
PMID:35801475
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研究论文 | 本文比较了两种基于单细胞RNA测序数据的细胞状态模型：图模型和多维空间模型 | 首次对比了图模型和多维空间模型在构建细胞状态转换数学模型中的应用 | 主要集中在图模型和多维空间模型的优缺点比较，未涉及其他可能的模型 | 探讨和比较两种不同的细胞状态几何模型在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据和造血系统 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 图模型和多维空间模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 20743 | 2024-08-08 |
Telomerase positive CTCs with PSMA high expression associated with prostate cancer metastasis
2022-Jun, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-21-1140
PMID:35812202
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺特异性膜抗原（PSMA）高表达的循环肿瘤细胞（CTCs）与前列腺癌转移进展的关系 | 采用基于端粒酶逆转录酶（TERT）的CTC检测方法，并通过基因本体（GO）功能分类和富集分析，证实了PSMA高表达组中增殖相关术语的富集 | NA | 旨在提供证据阐明PSMA高表达的CTCs与前列腺癌转移进展的关系 | 前列腺癌患者及其循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 基于端粒酶逆转录酶（TERT）的CTC检测方法 | NA | 单细胞测序数据 | 共71名患者，分为局部前列腺癌组（44名）和转移性前列腺癌组（27名） |
| 20744 | 2024-08-08 |
Recent advances in single-cell sequencing technologies
2022-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbac002
PMID:35821681
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综述 | 本文综述了单细胞组学测序技术在四个领域的最新进展 | 介绍了单细胞表观基因组测序、单细胞基因组测序用于谱系追踪、空间分辨的单细胞转录组学以及基于第三代测序平台的单细胞组学测序等新技术 | NA | 探讨单细胞组学测序技术在不同生物医学系统中的潜在应用和未来方向 | 单细胞组学测序技术及其在人类干细胞领域的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 单个细胞 |
| 20745 | 2024-08-08 |
Tracing the cell-type-specific modules of immune responses during COVID-19 progression using scDisProcema
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.06.066
PMID:35811838
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scDisProcema的基因共表达网络构建流程，用于追踪COVID-19进展过程中免疫系统响应的动态变化 | scDisProcema能够更方便地利用scRNA-seq数据提供的异质性信息，并有助于探索疾病进展和器官发育过程中的分子变化 | NA | 深入研究COVID-19免疫响应的分子机制 | COVID-19进展过程中细胞类型特异性分子网络的动态变化 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | 基因共表达网络 | 单细胞数据 | NA |
| 20746 | 2024-08-08 |
A Novel Prognostic Signature Revealed the Interaction of Immune Cells in Tumor Microenvironment Based on Single-Cell RNA Sequencing for Lung Adenocarcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/6555810
PMID:35812244
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了肺腺癌肿瘤微环境中免疫细胞的相互作用，并构建了一个新的预后标志物。 | 本文创新性地利用单细胞RNA测序数据，结合WGCNA和LASSO分析，构建了一个包含5个基因的风险模型，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应。 | NA | 研究肺腺癌中浸润性免疫细胞的作用，并寻找潜在的治疗靶点。 | 肺腺癌患者的肿瘤微环境中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | WGCNA, LASSO | 基因表达数据 | 使用了来自FDZSH和两个公共数据集的单细胞RNA测序数据，以及来自TCGA的肺腺癌患者生物信息学数据。 |
| 20747 | 2024-08-08 |
DDOST Correlated with Malignancies and Immune Microenvironment in Gliomas
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.917014
PMID:35812432
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研究论文 | 本文研究了DDOST在胶质瘤中的表达及其与恶性程度和免疫微环境的关系 | 首次探讨了DDOST在胶质瘤中的作用及其对患者预后的影响 | NA | 探究DDOST在胶质瘤中的作用及其对患者预后的影响 | DDOST在胶质瘤中的表达及其与恶性程度和免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序分析, GSEA, 免疫浸润分析, 突变分析 | NA | 组织微阵列 | 使用了CGGA 325和CGGA 693数据集进行分析 |
| 20748 | 2024-08-08 |
Tumor-Infiltrated CD8+ T Cell 10-Gene Signature Related to Clear Cell Renal Cell Carcinoma Prognosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.930921
PMID:35812454
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研究论文 | 本研究探讨了浸润性CD8+ T细胞表达的十个基因与透明细胞肾细胞癌（ccRCC）预后的关系 | 首次提出浸润性CD8+ T细胞的十个基因作为潜在的ccRCC预后生物标志物 | NA | 阐明浸润性CD8+ T细胞在ccRCC中的保护作用并识别与预后改善相关的候选基因 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾癌 | 下一代测序（bulk sequencing和single-cell sequencing） | NA | 基因表达数据 | ccRCC、papillary renal cell carcinoma（papRCC）及对照肾脏活检样本 |
| 20749 | 2024-08-08 |
Dissecting Immunosuppressive Cell Communication Patterns Reveals JunB Proto-Oncogene (JUNB) Shaping a Non-Inflamed Tumor Microenvironment
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.883583
PMID:35812726
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研究论文 | 本文通过整合两个单细胞RNA测序数据集，分析免疫抑制细胞在肿瘤微环境中的通信模式，并识别出关键基因JUNB。 | 首次构建了免疫抑制细胞与肿瘤细胞间的细胞间通信特征，揭示了JUNB在非炎症性肿瘤微环境中的作用。 | NA | 探究免疫抑制细胞在肿瘤微环境中的通信模式及其对肿瘤发展的影响。 | 免疫抑制细胞、肿瘤细胞及其相互作用。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及两个不同肿瘤类型的数据集 |
| 20750 | 2024-08-08 |
Arginine Regulates Zygotic Genome Activation in Porcine Embryos Under Nutrition Restriction
2022, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2022.921406
PMID:35812864
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研究论文 | 本研究探讨了精氨酸在营养限制条件下对猪胚胎合子基因组激活（ZGA）的调控作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了精氨酸代谢相关基因与ZGA关键基因的显著相关性，并证实了精氨酸通过促进多胺合成调控ZGA的作用 | 研究仅限于体外培养的猪胚胎，未涉及体内环境的影响 | 探究精氨酸在营养限制条件下对猪胚胎发育的影响及其分子机制 | 猪胚胎从合子到桑葚胚阶段的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个猪胚胎样本 |
| 20751 | 2024-08-08 |
Significance of Liver Zonation in Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.806408
PMID:35813194
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色技术，探讨了肝分区在肝细胞癌中的重要性 | 首次通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色技术，揭示了肝分区相关基因在肝细胞癌中的作用 | 仅限于对肝细胞癌的研究，未涉及其他类型的肝癌 | 探讨肝分区在肝细胞癌中的重要性及其对预后的影响 | 肝细胞癌中的肝分区特征 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 三基因模型 | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 20752 | 2024-08-08 |
Identification of Up-Regulated ANXA3 Resulting in Fracture Non-Union in Patients With T2DM
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.890941
PMID:35813617
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研究论文 | 本研究使用加权共表达网络分析（WGCNA）方法，识别与T2DM和骨折愈合相关的易感模块和枢纽基因，并通过单细胞RNA测序和qRT-PCR验证其在临床样本中的表达。 | 本研究首次进行了关于T2DM对骨折愈合影响的基因组学研究，并识别了一些特征模块和枢纽基因，这些发现有助于进一步探究分子机制。 | NA | 探究T2DM与骨折不愈合之间的分子机制，并寻找潜在的生物标志物和治疗靶点。 | T2DM患者的骨折愈合过程及相关的枢纽基因。 | NA | 糖尿病 | 加权共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 涉及多个GEO数据库的数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 20753 | 2024-08-08 |
Mass Cytometry and Single-Cell Transcriptome Analyses Reveal the Immune Cell Characteristics of Ulcerative Colitis
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.859645
PMID:35813827
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研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞转录组测序分析了活动性溃疡性结肠炎（UCa）、非活动性溃疡性结肠炎（UCin）和健康对照（HC）的免疫细胞特征 | 发现了新的免疫细胞亚群，这些亚群可以区分UCa、UCin和HC，有助于区分UCa和UCin患者 | NA | 研究活动性和非活动性溃疡性结肠炎的免疫细胞特征差异 | 活动性溃疡性结肠炎（UCa）、非活动性溃疡性结肠炎（UCin）和健康对照（HC）的免疫细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 质谱流式细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | UCa、UCin和HC的多个样本 |
| 20754 | 2024-08-08 |
WormBase single-cell tools
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac018
PMID:35814290
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研究论文 | 本文介绍了两个用于单细胞RNA测序数据交互式处理的网络应用：scdefg用于差异表达分析，wormcells-viz用于基因表达可视化 | 开发了两个新的网络应用工具，专门用于单细胞RNA测序数据的差异表达分析和基因表达可视化 | NA | 提供工具以促进单细胞RNA测序数据在Caenorhabditis elegans研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用WormBase策划的公共Caenorhabditis elegans数据集 |
| 20755 | 2024-08-08 |
Plac1 Remodels the Tumor Immune Evasion Microenvironment and Predicts Therapeutic Response in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.919436
PMID:35814442
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研究论文 | 本文研究了Plac1在头颈鳞状细胞癌中的生物学功能和预后价值 | 发现Plac1在肿瘤微环境中具有双重免疫抑制功能，并构建了一个15基因的预后标志物 | NA | 探讨Plac1在头颈鳞状细胞癌中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | Plac1在头颈鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了TCGA和GEO数据库的大量RNA测序数据以及单细胞测序数据 |
| 20756 | 2024-08-08 |
Identification of Somatic Mutations From Bulk and Single-Cell Sequencing Data
2021, Frontiers in aging
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/fragi.2021.800380
PMID:35822012
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综述 | 本文综述了从批量和单细胞测序数据中识别体细胞突变的方法及其面临的挑战 | 介绍了最新的体细胞突变识别方法，并讨论了当前技术在排除全基因组扩增过程中产生的技术伪影方面的挑战 | 需要进一步解决在全基因组扩增过程中产生的技术伪影问题 | 总结体细胞突变识别方法的最新进展并探讨未来需要解决的挑战 | 体细胞突变及其在癌症和非癌症疾病中的作用 | 基因组学 | NA | 下一代测序 | NA | DNA序列数据 | NA |
| 20757 | 2024-08-05 |
Gene regulatory network study of rheumatoid arthritis in single-cell chromatin landscapes of peripheral blood mononuclear cells
2023-Jul-04, Modern rheumatology
IF:1.8Q3
DOI:10.1093/mr/roac072
PMID:35796437
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研究论文 | 本文旨在通过单细胞色谱技术研究类风湿关节炎的转录因子 | 首次在单细胞分辨率下揭示了与类风湿关节炎发病机制相关的转录因子 | 样本数量较少，仅包含七名类风湿关节炎患者和七名对照者 | 探索与类风湿关节炎相关的转录因子及其作用机制 | 七名类风湿关节炎患者和七名健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转座酶可接近的染色质测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 14个样本，其中7个类风湿关节炎患者和7个健康对照者 |
| 20758 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal Dynamics of the Molecular Expression Pattern and Intercellular Interactions in the Glial Scar Response to Spinal Cord Injury
2023-Feb, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-022-00897-8
PMID:35788904
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研究论文 | 本文研究了脊髓损伤后胶质瘢痕反应中的分子表达模式和细胞间相互作用的时空动态 | 利用空间转录组技术系统性解码瘢痕形成过程中的基因表达模式，并揭示了胶质瘢痕微环境的异质性 | 尚未详细探讨胶质瘢痕反应中的所有潜在机制 | 旨在理解胶质瘢痕在脊髓损伤修复中的作用及其分子机制 | 使用小鼠脊髓的样本研究瘢痕形成中的基因表达和细胞状态 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 空间转录组技术 | NA | 样本基因表达数据 | 32个小鼠脊髓样本 |
| 20759 | 2024-08-08 |
Epg5 deficiency leads to primary ovarian insufficiency due to WT1 accumulation in mouse granulosa cells
2023-02, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2022.2094671
PMID:35786405
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研究论文 | 本研究探讨了Epg5基因缺失导致小鼠颗粒细胞中WT1积累，从而引起原发性卵巢功能不全的机制 | 首次揭示了Epg5基因在颗粒细胞中的作用，及其通过影响WT1的降解途径参与原发性卵巢功能不全的病理过程 | NA | 研究Epg5基因缺失如何影响颗粒细胞分化及WT1的降解，进而导致原发性卵巢功能不全 | 小鼠颗粒细胞及Epg5基因的功能 | NA | 原发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20760 | 2024-08-08 |
Frequent aneuploidy in primary human T cells after CRISPR-Cas9 cleavage
2022-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01377-0
PMID:35773341
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，研究了在转染CRISPR-Cas9和指导RNA的人类原代T细胞中，针对T细胞受体（TCR）链和其他基因的基因编辑结果 | 发现CRISPR-Cas9切割后，人类原代T细胞中染色体14的丢失和染色体7的截断是常见现象 | 文章指出，染色体异常与细胞增殖减少、p53激活和细胞死亡有关，需要在临床方案中进行监测和最小化 | 研究CRISPR-Cas9在人类原代T细胞中的基因编辑效果及其对染色体结构的影响 | 人类原代T细胞中的T细胞受体（TCR）链和其他基因 | 基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，数字滴液PCR | CRISPR-Cas9 | RNA | 涉及的细胞数量未在摘要中明确提及 |