单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 20721 - 20740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20721 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics identifies enriched gene expression and cell types in human liver fibrosis
2022-09, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.2001
PMID:35726350
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学结合单细胞RNA测序和基因解卷积分析，探索了纤维化肝脏区域中细胞类型的定位。 | 首次使用空间转录组学与单细胞RNA测序相结合的方法，精确地定位了纤维化肝脏中的细胞类型及其基因表达。 | 研究样本量较小，且仅限于特定类型的肝病患者。 | 评估纤维化肝脏区域是否特异性地富集某些细胞类型，并探索这些细胞类型的空间定位。 | 纤维化肝脏组织中的细胞类型及其基因表达。 | 数字病理学 | 肝病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 基因解卷积分析 | 基因表达数据 | 8例终末期肝病患者样本 |
| 20722 | 2024-08-08 |
Isolation of Leydig cells from adult rat testes by magnetic-activated cell sorting protocol based on prolactin receptor expression
2022-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13211
PMID:35735181
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研究论文 | 本文介绍了一种基于催乳素受体表达的磁激活细胞分选方法，用于从成年大鼠睾丸中大量分离高纯度和活性的莱迪细胞。 | 本文提出了一种新的方法，通过磁激活细胞分选技术，基于催乳素受体表达，成功从成年大鼠睾丸中分离出高产量、高纯度和高活性的莱迪细胞。 | NA | 研究莱迪细胞的分离方法，以提高细胞的产量、纯度和活性，进而用于体外研究细胞的生理学、药理学和毒理学。 | 成年大鼠睾丸中的莱迪细胞。 | NA | NA | 磁激活细胞分选（MACS） | NA | 细胞 | 每个睾丸约10^6个细胞 |
| 20723 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies Col1a1 and Col1a2 as hub genes in obesity-induced cardiac fibrosis
2022-08-27, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.06.018
PMID:35714568
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，筛选肥胖诱导的心脏纤维化的关键标志物 | 首次通过单细胞转录组学技术识别出Col1a1和Col1a2作为肥胖诱导心脏纤维化的枢纽基因 | 研究仅在肥胖小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 旨在早期检测和治疗肥胖相关的心脏疾病，以限制其进展 | 肥胖诱导的心脏纤维化及其关键标志物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及15种不同细胞类型，包括纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞，共33个差异表达基因 |
| 20724 | 2024-08-08 |
Accounting for Errors in Data Improves Divergence Time Estimates in Single-cell Cancer Evolution
2022-08-03, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msac143
PMID:35733333
|
研究论文 | 本文提出了一种在单细胞癌症进化分析中考虑数据误差的方法，通过在成熟的贝叶斯框架BEAST2中引入错误和突变模型，提高了相对分歧时间和替代参数的准确性。 | 本文的创新点在于开发了一种能够在单细胞数据进化推断中考虑误差的贝叶斯框架，并展示了这种模型在提高分歧时间估计准确性方面的效果。 | NA | 研究目的是改进单细胞癌症进化分析中分歧时间的估计，通过考虑数据误差来提高分析的准确性。 | 研究对象包括单细胞DNA测序数据，特别是结直肠癌患者和健康患者的细胞进化历史。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 贝叶斯框架 | DNA序列数据 | 包括结直肠癌患者和健康患者的单细胞DNA测序数据 |
| 20725 | 2024-08-08 |
Astrocyte ethanol exposure reveals persistent and defined calcium response subtypes and associated gene signatures
2022-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102147
PMID:35716779
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研究论文 | 本研究结合钙信号测量和基因表达分析，定义了乙醇诱导的星形胶质细胞亚型 | 首次揭示了乙醇诱导的星形胶质细胞钙响应的亚型及其相关的基因特征 | NA | 研究乙醇暴露下星形胶质细胞的功能及其对大脑生理和病理的影响 | 星形胶质细胞在乙醇暴露下的钙信号响应和基因表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 钙信号数据和基因表达数据 | 不同响应类型的星形胶质细胞 |
| 20726 | 2024-08-08 |
Dichotomous Roles of Smooth Muscle Cell-Derived MCP1 (Monocyte Chemoattractant Protein 1) in Development of Atherosclerosis
2022-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.317882
PMID:35735018
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研究论文 | 本研究探讨了平滑肌细胞衍生的MCP1在动脉粥样硬化发展中的双重作用 | 首次确定了Lgals3过渡型炎症性平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的功能 | NA | 探索平滑肌细胞在动脉粥样硬化斑块稳定性中的作用机制 | 平滑肌细胞衍生的MCP1在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | 使用平滑肌细胞系追踪小鼠和双系追踪系统进行研究 |
| 20727 | 2024-08-08 |
Very-low-density lipoprotein receptor-enhanced lipid metabolism in pancreatic stellate cells promotes pancreatic fibrosis
2022-07-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.06.001
PMID:35738281
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研究论文 | 研究探讨了低密度脂蛋白受体增强的脂质代谢在胰腺星状细胞中促进胰腺纤维化的发生和机制 | 首次揭示了低密度脂蛋白受体在胰腺星状细胞中的脂质代谢增强与胰腺纤维化的关系，并强调了IL-33在此过程中的主导作用 | NA | 研究脂蛋白代谢紊乱与胰腺纤维化环境之间的关系 | 胰腺星状细胞的激活机制及其在慢性胰腺炎中纤维化加剧的作用 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20728 | 2024-08-08 |
Lymphatics act as a signaling hub to regulate intestinal stem cell activity
2022-07-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.05.007
PMID:35728595
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研究论文 | 本文报道了小肠和大肠的隐窝基部存在一个淋巴网络，该网络与肠道干细胞（ISCs）紧密相关，并通过体内功能丧失和淋巴器官共培养实验，揭示了淋巴系统维持ISCs并抑制其过早分化的作用。 | 首次揭示了淋巴系统在小肠和大肠隐窝中作为信号中枢，直接影响ISCs的再生能力，并通过单细胞和空间转录组学技术，使用BayesPrism和SpaceFold工具，高分辨率地绘制了隐窝微环境的信号图谱。 | NA | 研究淋巴系统在肠道干细胞微环境中的作用及其对干细胞行为的调控机制。 | 肠道干细胞（ISCs）及其微环境中的淋巴系统。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20729 | 2024-08-08 |
A probabilistic Boolean model on hair follicle cell fate regulation by TGF-β
2022-07-05, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2022.05.035
PMID:35714600
|
研究论文 | 本文开发了一种新的概率布尔网络（pBN）模型，用于理解头发 follicle（HF）细胞命运调控的机制，特别是TGF-β在HF细胞命运调控中的双重作用 | 首次采用概率布尔网络模型来模拟HF上皮细胞基因调控动力学，并结合单细胞RNA测序数据进行模型优化 | 模型主要基于文献和单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的实验验证 | 理解HF细胞命运调控的机制，特别是TGF-β的双重作用 | 头发 follicle（HF）细胞命运调控 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率布尔网络（pBN） | 基因调控网络 | NA |
| 20730 | 2024-08-08 |
Maternal DDB1 regulates apoptosis and lineage differentiation in porcine preimplantation embryos
2022-Jul, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD22028
PMID:35724990
|
研究论文 | 研究探讨了母源性基因DDB1在猪早期胚胎发育中的表达模式、基因组遗产及其潜在分子机制 | 首次详细研究了DDB1在猪早期胚胎发育中的作用，发现DDB1缺乏会导致胚胎细胞数量减少、细胞凋亡增加及细胞分化异常 | NA | 探索DDB1在猪早期胚胎发育中的表达模式、基因组遗产及其潜在分子机制 | 猪早期胚胎 | NA | NA | RNA干扰、显微注射、RT-qPCR、免疫荧光染色和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及GV和MII卵母细胞及早期胚胎 |
| 20731 | 2024-08-08 |
Hyaluronic acid-GPRC5C signalling promotes dormancy in haematopoietic stem cells
2022-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00931-x
PMID:35725769
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人骨髓造血干细胞（HSCs）的休眠状态，并揭示了透明质酸-GPRC5C信号轴在维持HSC休眠中的作用 | 首次揭示了透明质酸通过GPRC5C受体在人造血干细胞中维持休眠状态的作用机制 | NA | 探讨人造血干细胞的休眠状态及其调控机制 | 人骨髓造血干细胞及其休眠状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20732 | 2024-08-08 |
Identification of early neurodegenerative pathways in progressive multiple sclerosis
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01097-3
PMID:35726057
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术，分析了多发性硬化症（MS）患者脑组织样本，揭示了MS进展中的多细胞机制及其与神经退行性变的空间分布关系 | 通过解析局部微环境中的配体-受体相互作用，发现了早期神经元衰退区域内的失效营养和抗炎细胞间通讯，为MS治疗药物开发提供了新的框架 | NA | 旨在揭示多发性硬化症进展中的复杂发病机制，并为药物开发提供新的策略 | 多发性硬化症患者的脑组织 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学，蛋白质组学 | NA | 组织样本 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20733 | 2024-08-08 |
Deciphering the Spatial Modular Patterns of Tissues by Integrating Spatial and Single-Cell Transcriptomic Data
2022-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0617
PMID:35727094
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研究论文 | 本文通过结合空间转录组学和单细胞转录组学数据，采用基于偏最小二乘法的方法（SpaMOD）来解析组织的空间模块模式 | 提出了一种新的方法SpaMOD，能够同时整合两种数据模式以及相关的细胞和斑点网络，以识别细胞-斑点共模块 | 新兴的空间转录组技术在单细胞分辨率和读取充分性方面仍存在不足 | 解析组织中细胞的空间组织结构 | 小鼠大脑、肉芽肿和胰腺导管腺癌的组织 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | 偏最小二乘法（PLS） | 转录组数据 | 三组配对的scRNA-seq和ST数据集 |
| 20734 | 2024-08-08 |
The metastatic spread of breast cancer accelerates during sleep
2022-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04875-y
PMID:35732738
|
研究论文 | 本文研究了乳腺癌转移扩散在睡眠期间加速的现象 | 发现大多数自发性循环肿瘤细胞（CTCs）进入血管的事件发生在睡眠期间，且休息阶段的CTCs更易转移 | NA | 探讨乳腺癌转移的时间动态特性 | 乳腺癌患者和鼠模型的循环肿瘤细胞（CTCs） | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及乳腺癌患者和鼠模型 |
| 20735 | 2024-08-08 |
Corrigendum to "Muscle-Derived Beige Adipose Precursors Secrete Promyogenic Exosomes That Treat Rotator Cuff Muscle Degeneration in Mice and Are Identified in Humans by Single-Cell RNA Sequencing"
2022-Jul, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465221111167
PMID:35736510
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20736 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics and surface epitope detection in human brain epileptic lesions identifies pro-inflammatory signaling
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01095-5
PMID:35739273
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组和表面表位检测技术，揭示了人脑癫痫病变中的促炎信号传导机制 | 首次使用单细胞细胞索引转录组和表位测序（CITE-seq）技术，揭示了癫痫病变组织中的免疫转录组特征 | NA | 探究不适当的促炎机制是否在难治性癫痫的发病机制中起作用 | 人脑癫痫病变组织中的免疫微环境 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞细胞索引转录组和表位测序（CITE-seq） | NA | 转录组数据 | 手术切除的癫痫病变组织样本 |
| 20737 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals immune dysregulation mediated by IL-17A in initiation of chronic lung injuries upon real-ambient particulate matter exposure
2022-06-23, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-022-00483-w
PMID:35739565
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了IL-17A介导的免疫失调在真实环境颗粒物暴露下慢性肺损伤启动中的作用 | 首次详细描述了IL-17A信号通路在亚慢性颗粒物暴露下肺纤维化进展中的作用 | NA | 阐明不同细胞集群和关键通路在颗粒物暴露后触发小鼠慢性肺损伤中的相互作用 | C57BL/6J雄性小鼠 | 数字病理学 | 慢性呼吸疾病 | 单细胞转录组学 | IL-17A敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 六周龄C57BL/6J雄性小鼠，暴露于颗粒物或过滤空气16周 |
| 20738 | 2024-08-08 |
Decoding lymphomyeloid divergence and immune hyporesponsiveness in G-CSF-primed human bone marrow by single-cell RNA-seq
2022-Jun-22, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00417-y
PMID:35732626
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了G-CSF处理后人骨髓中造血细胞的转录组变化 | 首次全面、无偏和高分辨率地调查了G-CSF处理后人骨髓的细胞和分子生态系统，揭示了G-CSF诱导的髓系偏向分化和T细胞及自然杀伤细胞的低反应性的细胞和分子基础 | 研究样本仅来自两名健康捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 探究G-CSF处理后人骨髓中淋巴髓系分化和免疫低反应性的机制 | G-CSF处理后人骨髓中的造血细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名健康捐赠者的骨髓样本 |
| 20739 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of subcutaneous adipose tissues identifies therapeutic targets for cancer-associated lymphedema
2022-Jun-21, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00402-5
PMID:35725971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了淋巴水肿患者皮下脂肪组织的细胞变化，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术深入解析了淋巴水肿患者皮下脂肪组织的细胞变化，并发现了PRG4/CLEC3B ASC亚群c3的显著扩张与脂肪组织纤维化的关联 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，尚未进行临床试验验证 | 旨在发现癌症相关淋巴水肿的有效治疗靶点 | 淋巴水肿患者的皮下脂肪组织 | 数字病理学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 70,209个细胞 |
| 20740 | 2024-08-08 |
Mycobacterium tuberculosis infection drives a type I IFN signature in lung lymphocytes
2022-06-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110983
PMID:35732116
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康和结核分枝杆菌（Mtb）感染小鼠的肺淋巴细胞，发现Mtb感染导致淋巴细胞中I型IFN信号特征的富集 | 首次在单细胞层面揭示了Mtb感染后肺淋巴细胞中I型IFN信号特征的富集，并验证了Ly6A作为淋巴细胞活化标记物的上调 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 旨在深入理解结核分枝杆菌感染后免疫反应的细胞水平动态，以设计更好的结核病控制策略 | 健康和结核分枝杆菌感染小鼠的肺淋巴细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康和结核分枝杆菌感染小鼠的肺淋巴细胞样本 |