单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 20701 - 20720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20701 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of fractional CO2 laser efficiency in treating a mouse model of alopecia
2022-10, Lasers in surgery and medicine
IF:2.2Q2
DOI:10.1002/lsm.23590
PMID:35916125
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了分次二氧化碳激光治疗小鼠模型脱发的分子和细胞机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了激光照射后皮肤中细胞群及其基因表达的变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证其效果 | 探究分次二氧化碳激光治疗脱发的有效条件及其分子和细胞机制 | 小鼠模型的脱发治疗 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型的皮肤样本 |
| 20702 | 2024-08-08 |
GLOBE: a contrastive learning-based framework for integrating single-cell transcriptome datasets
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac311
PMID:35901449
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的单细胞转录组数据集整合框架GLOBE，该框架通过定义自适应平移变换和使用硬度感知与一致性感知的损失函数来去除批次效应，并支持多样化的下游分析 | GLOBE框架通过自适应平移变换和硬度感知与一致性感知的损失函数，提高了批次效应去除的稳定性和表示对齐的一致性 | NA | 开发一种改进的基于对比学习的批次效应校正框架，以整合来自多个来源的单细胞转录组数据集 | 单细胞转录组数据集的批次效应去除 | 生物信息学 | NA | 对比学习 | 对比学习框架 | 转录组数据 | 广泛的数据集，包括两个发育中的小鼠新皮质数据集 |
| 20703 | 2024-08-08 |
GE-Impute: graph embedding-based imputation for single-cell RNA-seq data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac313
PMID:35901457
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研究论文 | 提出了一种基于图嵌入的神经网络模型GE-Impute，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | GE-Impute通过学习每个细胞的神经图表示并重建细胞间相似性网络，从而更准确地填补缺失值 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据的可靠性和生物学解释性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图嵌入神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 20704 | 2024-08-08 |
Learning discriminative and structural samples for rare cell types with deep generative model
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac317
PMID:35914950
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研究论文 | 本文提出了一种新的深度生成模型scLDS2，用于利用少量细胞样本准确估计不同细胞的分布，通过对抗学习区分稀有和非稀有细胞类型 | scLDS2模型通过生成稀疏的假样本并学习细胞间的关系，增强了样本的可解释性，并将细胞类型的识别问题转化为分类问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型识别的挑战 | 稀有细胞类型的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成模型 | 基因表达数据 | 20个数据集 |
| 20705 | 2024-08-08 |
SECEDO: SNV-based subclone detection using ultra-low coverage single-cell DNA sequencing
2022-09-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac510
PMID:35900151
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单核苷酸变异（SNV）的超低覆盖率单细胞DNA测序数据进行亚克隆检测的新方法SECEDO | SECEDO利用贝叶斯过滤方法和读取重叠与相位技术，有效地对肿瘤细胞进行聚类，相较于现有技术，在超低覆盖率数据上显著提高了SNV检测的敏感性和准确性 | NA | 开发一种新的方法来基于SNV对肿瘤细胞进行聚类，以更全面地了解肿瘤内异质性 | 肿瘤细胞的亚克隆结构 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序 | 贝叶斯过滤方法 | DNA序列数据 | 合成数据集包含7250个细胞和八个肿瘤亚克隆，真实数据集每个包含约2000个细胞 |
| 20706 | 2024-08-08 |
Lysosomal acid lipase, CSF1R, and PD-L1 determine functions of CD11c+ myeloid-derived suppressor cells
2022-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156623
PMID:35917184
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研究论文 | 研究探讨了溶酶体酸性脂肪酶（LAL）、集落刺激因子1受体（CSF1R）和程序性死亡配体1（PD-L1）在CD11c+髓源性抑制细胞中的作用 | 通过单细胞RNA测序和药理学阻断方法，揭示了LAL缺陷小鼠中CD11c+细胞的代谢转变及其对T细胞抑制和肿瘤生长的影响 | NA | 探究LAL、CSF1R和PD-L1在CD11c+髓源性抑制细胞功能中的作用及其对免疫抑制和肿瘤生长的影响 | CD11c+髓源性抑制细胞、LAL缺陷小鼠、非小细胞肺癌患者 | NA | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LAL缺陷小鼠和非小细胞肺癌患者的样本 |
| 20707 | 2024-08-08 |
Function of normal oral mucosa revealed by single-cell RNA sequencing
2022-09, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.30307
PMID:35894175
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了正常口腔黏膜细胞的功能和相互作用 | 首次通过单细胞转录组测序技术绘制了正常口腔黏膜细胞的全面图谱，并发现了具有高表达主要组织相容性复合体II类分子的上皮细胞亚群、CD8 GZMK T细胞亚群和两种活化的巨噬细胞 | NA | 探讨正常口腔黏膜细胞的功能和相互作用 | 正常口腔黏膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 26,398个细胞来自三例正常口腔黏膜 |
| 20708 | 2024-08-08 |
Schwann cell precursors: a hub of neural crest development
2022-09-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2022111955
PMID:35894449
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研究论文 | 本文通过综合单细胞RNA测序分析，揭示了施万细胞前体（SCPs）与神经嵴细胞（NCCs）之间的临时“枢纽”状态，这种状态在SCPs和NCCs中普遍存在 | 发现了SCPs与晚期迁移的NCCs之间显著的相似性，并提出了这种状态在成年组织再生和肿瘤发生中的潜在作用 | SCPs的异质性和发育潜能仍不完全清楚 | 探讨SCPs在神经嵴发育中的作用及其潜在的生物学意义 | 施万细胞前体（SCPs）及其在神经嵴发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 20709 | 2024-08-08 |
Circular RNAs: novel regulators of resistance to systemic treatments in breast cancer
2022-Sep, Neoplasma
IF:2.0Q3
DOI:10.4149/neo_2022_220611N619
PMID:35900318
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综述 | 本文综述了循环RNA（circRNAs）在乳腺癌系统治疗耐药性中的作用机制 | 探讨了circRNAs作为乳腺癌耐药性的主要调节因子的作用，并提出了circRNAs作为潜在的生物标志物和治疗靶点的可能性 | 目前关于circRNAs在乳腺癌耐药性中作用的研究报告较少 | 探讨circRNAs在乳腺癌系统治疗耐药性中的作用机制，以改善乳腺癌患者的预后 | 乳腺癌的系统治疗耐药性及其相关机制 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序 | NA | 细胞 | 涉及乳腺癌患者的循环肿瘤细胞和肿瘤活检样本 |
| 20710 | 2024-08-08 |
Bone marrow-confined IL-6 signaling mediates the progression of myelodysplastic syndromes to acute myeloid leukemia
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152673
PMID:35900794
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研究论文 | 研究通过mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型，探讨了骨髓中IL-6信号传导在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的作用 | 首次揭示了IL-6在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的关键作用，并证明了阻断IL-6信号传导对治疗高风险骨髓增生异常综合征的临床意义 | NA | 探讨骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的机制，特别是与衰老微环境相关的机制 | mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型及高风险骨髓增生异常综合征患者 | NA | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | mDia1/miR-146a双敲除小鼠及高风险骨髓增生异常综合征患者 |
| 20711 | 2024-08-08 |
Neutrophils, functions beyond host defense
2022-09, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2022.104579
PMID:35901576
|
综述 | 本文综述了中性粒细胞在宿主防御之外的多功能性 | 利用单细胞测序等前沿技术揭示了中性粒细胞在稳态和炎症条件下的复杂性和可塑性 | NA | 探讨中性粒细胞在疾病和稳态环境下的异质性和功能 | 中性粒细胞及其与其他免疫细胞的相互作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 20712 | 2024-08-08 |
Impact of single-cell RNA sequencing on understanding immune regulation
2022-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17493
PMID:35906816
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在免疫相关生理状态、调控机制和疾病中的应用 | scRNA-seq技术揭示了以前未报告的细胞类型或状态，为疾病治疗和生物过程提供了新的启示 | 讨论了scRNA-seq在免疫调控中的机遇和挑战 | 深入理解细胞异质性及其对细胞发育和功能的重要性 | 单细胞RNA测序技术及其在免疫细胞异质性和疾病发病机制中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 20713 | 2024-08-08 |
SMGR: a joint statistical method for integrative analysis of single-cell multi-omics data
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac056
PMID:35910046
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研究论文 | 本文开发了一种名为SMGR的新方法，用于从不同样本的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）数据中检测一致的功能性调控信号和目标基因 | SMGR方法利用广义线性回归模型识别一致表达基因和峰的潜在表示，从而识别共调控程序并阐明调控机制 | NA | 旨在解决单细胞多组学数据整合分析中的挑战，提高分析的准确性 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序数据 | 基因组学 | 急性混合表型白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | 广义线性回归模型 | 单细胞多组学数据 | 不同样本的数据 |
| 20714 | 2024-08-08 |
Gruffi: an algorithm for computational removal of stressed cells from brain organoid transcriptomic datasets
2022-09-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2022111118
PMID:35919947
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Gruffi的算法，用于从脑类器官转录组数据集中计算去除应激细胞 | 开发了一种新的计算算法Gruffi，通过粒度功能过滤来无偏地识别和去除应激细胞 | NA | 研究脑类器官中的细胞应激问题，并开发方法去除这些应激细胞以改善发育轨迹的划分 | 脑类器官和胎儿的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约190,000个细胞 |
| 20715 | 2024-08-08 |
Intratracheally administered LNA gapmer antisense oligonucleotides induce robust gene silencing in mouse lung fibroblasts
2022-08-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac630
PMID:35920332
|
研究论文 | 研究通过三种不同方法评估了LNA gapmer反义寡核苷酸在肺纤维细胞中的基因沉默效果 | 首次应用单细胞RNA测序（scRNA-seq）评估寡核苷酸治疗药物的疗效 | 缺乏适当的分析方法来确定反义寡核苷酸在每种细胞类型中的有效性 | 研究反义寡核苷酸在肺部不同细胞类型中的基因沉默效果 | 肺纤维细胞和内皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 20716 | 2024-08-08 |
SUMO Modification of Histone Demethylase KDM4A in Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus-Induced Primary Effusion Lymphoma
2022-08-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00755-22
PMID:35914074
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研究论文 | 本文研究了Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）感染引起的原发性渗出性淋巴瘤（PEL）中组蛋白去甲基酶KDM4A的SUMO化修饰及其对细胞存活、迁移和血管生成的影响 | 发现KDM4A的SUMO化修饰在KSHV激活和PEL细胞存活中起关键作用，并确定了IL-10作为KDM4A的新下游靶点 | 需要进一步研究KDM4A作为治疗PEL的潜在靶点的具体机制和疗效 | 探讨KDM4A的SUMO化修饰在KSHV诱导的PEL中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | KDM4A的SUMO化修饰及其对PEL细胞存活、迁移和血管生成的影响 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | ChIP-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个PEL细胞样本 |
| 20717 | 2024-08-08 |
Biogeographic and disease-specific alterations in epidermal lipid composition and single-cell analysis of acral keratinocytes
2022-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159762
PMID:35900871
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研究论文 | 本文通过靶向脂质组学分析和单细胞RNA测序，研究了人体表皮脂质在12个不同解剖部位的生物地理变化以及肢端角质形成细胞的基因表达。 | 首次揭示了肢端皮肤中EOS酰基神经酰胺及其合成相关基因的低表达，以及与角质细胞保留增加相关的基因表达变化，并构建了用于银屑病诊断的2-分析物模型。 | NA | 探讨表皮脂质组成在不同身体部位的生物地理变化及其与疾病特异性改变的关系。 | 人体表皮脂质和肢端角质形成细胞的基因表达。 | 数字病理学 | 银屑病 | 靶向脂质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 脂质组学数据，基因表达数据 | 12个不同解剖部位的表皮脂质样本，肢端和非肢端部位的角质形成细胞 |
| 20718 | 2024-08-08 |
Systematic exploration of dynamic splicing networks reveals conserved multistage regulators of neurogenesis
2022-08-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.06.036
PMID:35914530
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研究论文 | 本文通过筛选策略识别控制哺乳动物神经发生中动态剪接事件的因子，揭示了神经发生过程中剪接程序的调控机制 | 发现了先前未知的神经发生调控因子Rbm38和Puf60，并阐明了它们通过特定外显子调控剪接模式的机制 | NA | 探索神经发生过程中动态剪接网络的调控因子 | 哺乳动物神经发生中的动态剪接事件及其调控因子 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及胚胎干细胞和不同阶段的鼠神经发生 |
| 20719 | 2024-08-08 |
Elevated Myl9 reflects the Myl9-containing microthrombi in SARS-CoV-2-induced lung exudative vasculitis and predicts COVID-19 severity
2022-08-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2203437119
PMID:35895716
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研究论文 | 本研究通过结合场发射扫描电子显微镜和能量色散X射线光谱分析法对尸检肺样本进行组织学分析，以及对外周血单个核细胞进行单细胞RNA测序，探讨了COVID-19中血管炎和免疫血栓形成的病理机制 | 发现SARS-CoV-2在肺血管中积累，导致渗出性血管炎，并伴随出现表达血小板反应蛋白-1的非典型单核细胞和形成含有肌球蛋白轻链9（Myl9）的微血栓 | NA | 探讨COVID-19中血管炎和免疫血栓形成的病理机制 | COVID-19患者的肺部病理和免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和血液样本 | NA |
| 20720 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing depicts the local cell landscape in thyroid-associated ophthalmopathy
2022-08-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100699
PMID:35896115
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了甲状腺相关眼病（TAO）患者眼眶结缔组织中细胞成分的转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了TAO中局部细胞景观，包括RASD1表达的脂纤维母细胞、ACKR1内皮细胞和脂肪组织巨噬细胞在炎症和脂肪生成中的作用，以及CD8CD57细胞毒性T淋巴细胞在干扰素-γ产生中的作用 | NA | 旨在识别甲状腺相关眼病（TAO）中导致病理过程的局部细胞变化 | 甲状腺相关眼病（TAO）患者眼眶结缔组织中的细胞成分 | 数字病理学 | 甲状腺相关眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 未具体说明样本数量 |