单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
20701	2024-08-08	The Crosstalk Between Immune Infiltration, Circulating Tumor Cells, and Metastasis in Pancreatic Cancer: Identification of HMGB3 From a Multiple Omics Analysis 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.892177 PMID:35754798	研究论文	本研究通过多组学分析，探讨了胰腺癌中免疫浸润、循环肿瘤细胞与转移之间的关系，并识别出HMGB3作为关键基因	首次基于循环肿瘤细胞的bulk RNA测序和单细胞测序数据，揭示了胰腺癌转移的机制，并识别出HMGB3作为与转移相关的重要基因	研究依赖于公开数据库中的现有数据，可能存在样本选择偏倚	探讨胰腺癌中免疫浸润、循环肿瘤细胞与转移之间的关系，并识别关键基因	胰腺癌中的循环肿瘤细胞及其与转移的关系	数字病理学	胰腺癌	RNA测序	WGCNA	RNA	多个数据集中的循环肿瘤细胞样本
20702	2024-08-08	Relationship Between CNVs and Immune Cells Infiltration in Gastric Tumor Microenvironment 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.869967 PMID:35754804	研究论文	本研究探讨了胃癌肿瘤微环境中拷贝数变异（CNVs）与免疫细胞浸润之间的关系	首次通过单细胞测序数据分析，识别并验证了胃癌中与CNVs高度相关的基因，并探讨了这些基因与免疫细胞浸润的关联	NA	旨在识别和验证胃癌的潜在治疗和预后靶点	胃癌中的拷贝数变异（CNVs）与免疫细胞浸润	数字病理学	胃癌	单细胞测序	LASSO	RNA-seq数据	使用了来自GEO和TCGA的胃癌及正常上皮细胞的RNA-seq数据
20703	2024-08-08	Identification of a Recurrence Gene Signature for Ovarian Cancer Prognosis by Integrating Single-Cell RNA Sequencing and Bulk Expression Datasets 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.823082 PMID:35754835	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和批量表达数据集，识别出卵巢癌复发相关的基因特征，用于预测卵巢癌的预后	首次在单细胞水平上探索肿瘤复发的内在生物学机制，并从复发事件中衍生出新的预后标志物	NA	识别卵巢癌复发相关的基因特征，以提高对卵巢癌预后的理解并辅助治疗决策	卵巢癌患者的单细胞RNA测序和批量表达数据	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	基因风险模型	基因表达数据	524个卵巢癌样本
20704	2024-08-08	Aged Callus Skeletal Stem/Progenitor Cells Contain an Inflammatory Osteogenic Population With Increased IRF and NF-κB Pathways and Reduced Osteogenic Potential 2022, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2022.806528 PMID:35755815	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠骨痂中的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs），揭示了老年骨痂中炎症性成骨细胞群的增加及其成骨潜能的降低	首次揭示了老年骨痂中骨骼干细胞/祖细胞的分子特征，特别是炎症性成骨细胞群的增加及其成骨潜能的降低	NA	研究老年骨痂中骨骼干细胞/祖细胞的分子特征	年轻和老年小鼠骨痂中的骨骼干细胞/祖细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	11,957个CD45CD31Ter119骨骼干细胞/祖细胞
20705	2024-08-08	Single Cell Meta-Analysis of Endothelial to Mesenchymal Transition (EndMT) in Glucose Metabolism of the Digestive Diseases 2022, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2022.866408 PMID:35755820	meta-分析	本研究旨在阐明内皮细胞向间质细胞转化（EndMT）在消化系统疾病中的作用及其代谢状态	首次发现EndMT在消化系统疾病中的作用及其在葡萄糖代谢中的关键作用	NA	阐明EndMT在消化系统疾病中的作用及其代谢状态	消化系统疾病中的EndMT及其代谢状态	数字病理学	消化系统疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞数据	涉及多种消化器官的组织样本，包括胃、肠和胰腺的癌前病变和癌症
20706	2024-08-08	Identification of Five Hub Genes Based on Single-Cell RNA Sequencing Data and Network Pharmacology in Patients With Acute Myocardial Infarction 2022, Frontiers in public health IF:3.0Q2 DOI:10.3389/fpubh.2022.894129 PMID:35757636	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序数据和网络药理学方法，在急性心肌梗死患者中识别了五个关键基因	首次通过单细胞RNA测序和网络药理学分析，识别了与急性心肌梗死进展相关的五个关键基因，并预测了一种潜在的抑制剂	研究主要基于数据库中的现有数据，未进行实验验证	旨在通过单细胞RNA测序和网络药理学方法，识别急性心肌梗死的关键基因及其潜在药物	急性心肌梗死患者的单细胞RNA测序数据和相关基因	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	7个细胞集群，标记为5种细胞类型
20707	2024-08-08	Single-Cell Landscape of Mouse Islet Allograft and Syngeneic Graft 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.853349 PMID:35757709	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠胰岛移植模型中的免疫异质性	首次全面分析了胰岛同种异体移植和同基因移植中免疫微环境的复杂性，并揭示了同种异体胰岛细胞向抗原呈递细胞样细胞的转变	NA	研究胰岛移植中的免疫排斥机制及其对移植功能的影响	小鼠胰岛同种异体移植和同基因移植中的免疫细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠胰岛移植模型
20708	2024-08-08	Heterogeneity of ILC2s in the Lungs 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.918458 PMID:35757740	综述	本文综述了肺部第2组先天淋巴细胞（ILC2s）的异质性及其在免疫学中的新领域	探讨了ILC2s在不同组织环境中的多样性及其对免疫记忆和衰竭的影响	需要更全面的理解ILC2s的多样性，而不仅仅是单一截面的快照	阐明ILC2s如何影响人类疾病	肺部的第2组先天淋巴细胞（ILC2s）	免疫学	NA	单细胞RNA测序技术	NA	RNA	NA
20709	2024-08-08	Tissue-Specific Diversity of Group 2 Innate Lymphoid Cells in the Skin 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.885642 PMID:35757747	综述	本文综述了皮肤中第2组先天淋巴细胞（ILC2s）的组织特异性特征	讨论了皮肤ILC2s在细胞表面标记物表达模式、对组织衍生细胞因子的反应以及在稳态和炎症中的功能方面的不同特点	NA	探讨皮肤中ILC2s的表型和功能异质性，并强调ILC生物学领域的未来方向	皮肤中的第2组先天淋巴细胞（ILC2s）	免疫学	NA	单细胞RNA测序技术	NA	RNA	NA
20710	2024-08-08	Discovering Immune-Mediated Mechanisms of Gastric Carcinogenesis Through Single-Cell RNA Sequencing 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.902017 PMID:35757757	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在胃癌免疫学领域的应用，揭示了免疫细胞在胃癌发生中的作用	单细胞RNA测序技术提供了前所未有的肿瘤内和肿瘤间异质性的免疫学、细胞和分子水平见解	当前研究识别了肿瘤微环境中多种巨噬细胞和肥大细胞亚群，但需要进一步研究确定它们促进癌症生长的作用	探讨单细胞RNA测序技术在胃癌免疫机制研究中的应用和发现	胃癌组织、胃癌患者腹水及实验室胃病模型	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及胃癌组织、腹水及实验室模型数据
20711	2024-08-08	Intestinal accumulation of microbiota-produced succinate caused by loss of microRNAs leads to diarrhea in weanling piglets 2022 Jan-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1 DOI:10.1080/19490976.2022.2091369 PMID:35758253	研究论文	本研究通过猪模型探讨了断奶应激诱导腹泻的机制，发现肠道微生物产生的琥珀酸在微小RNA缺失情况下积累，导致腹泻。	首次揭示了微小RNA缺失导致肠道微生物产生的琥珀酸积累，进而引发断奶仔猪腹泻的机制。	研究仅限于猪模型，需要进一步在其他动物模型或人类中验证。	阐明和丰富断奶应激诱导腹泻的机制基础。	断奶仔猪的腹泻及其与肠道微生物和代谢物的关系。	NA	腹泻	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及断奶仔猪的粪便微生物组、代谢物和微小RNA水平。
20712	2024-08-08	Single-Cell Sequencing Analysis and Multiple Machine Learning Methods Identified G0S2 and HPSE as Novel Biomarkers for Abdominal Aortic Aneurysm 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.907309 PMID:35769488	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、加权共表达网络分析和差异表达分析，结合多种机器学习方法，从公共数据库中识别出腹主动脉瘤的新型生物标志物G0S2和HPSE，并验证了它们在不同数据集中的表现。	首次通过单细胞测序和机器学习方法识别出腹主动脉瘤的新型生物标志物G0S2和HPSE，并探讨了它们与免疫细胞浸润的关系。	研究主要依赖公共数据库数据，未涉及临床样本的直接验证。	识别腹主动脉瘤的新型生物标志物，以促进其病理机制的理解和治疗策略的发展。	腹主动脉瘤的生物标志物及其与免疫细胞浸润的关系。	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	机器学习	基因表达数据	288个差异表达基因（DEGs）用于腹主动脉瘤和正常样本，17个DEGs用于大和小腹主动脉瘤样本。
20713	2024-08-08	Single-Cell Sequencing Reveals that DBI is the Key Gene and Potential Therapeutic Target in Quiescent Bladder Cancer Stem Cells 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.904536 PMID:35769986	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，在肌肉侵袭性膀胱癌（MIBC）中识别癌症干细胞（CSCs），并评估其分子特征，以发现可能的治疗措施	本研究首次识别出DBI作为静止期膀胱癌干细胞的关键基因，并预测了乙酰氨基酚作为潜在的治疗药物	研究主要基于GEO数据库和TCGA数据集进行分析，未来需要进一步的实验验证	旨在通过单细胞RNA测序技术识别膀胱癌干细胞并探索其治疗策略	肌肉侵袭性膀胱癌中的癌症干细胞	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了GEO数据集GSE130001和GSE146137以及TCGA数据集
20714	2024-08-05	Modulation of Atg genes expression in aged rat liver, brain, and kidney by caloric restriction analyzed via single-nucleus/cell RNA sequencing 2023-02, Autophagy IF:14.6Q1 DOI:10.1080/15548627.2022.2091903 PMID:35737739	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析卡路里限制对老龄大鼠肝脏、大脑和肾脏中自噬相关基因表达的调节	首次提供了哺乳动物在衰老过程中不同器官中特定细胞类型中基因表达的综合信息，并提供了自噬和卡路里限制在单细胞分辨率下的保护作用的新见解	在单细胞水平尚未阐明衰老过程中自噬相关基因的转录网络	探讨卡路里限制如何在衰老过程中调节自噬相关基因的表达	老龄大鼠的肝脏、大脑和肾脏中的单个细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	大鼠的多个细胞类型
20715	2024-08-08	A 3-Gene Random Forest Model to Diagnose Non-obstructive Azoospermia Based on Transcription Factor-Related Henes 2023-01, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.) DOI:10.1007/s43032-022-01008-8 PMID:35715550	研究论文	本研究通过机器学习算法，基于转录因子相关基因，建立了一个用于诊断非阻塞性无精症的3基因随机森林模型	本研究首次筛选并验证了ETV2、TBX2和ZNF689三个转录因子在非阻塞性无精症诊断中的高诊断能力，并成功建立了随机森林诊断模型	NA	旨在通过机器学习算法识别具有高诊断能力的转录因子，用于非阻塞性无精症的诊断	非阻塞性无精症的诊断标志物	机器学习	男性不育症	RT-qPCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序	随机森林	转录组数据	训练数据集包括11个对照组和47个非阻塞性无精症患者，外部验证集包括31个和20个样本，本地验证集包括20个对照组和20个非阻塞性无精症患者，单细胞RNA测序分析基于432个睾丸细胞样本
20716	2024-08-08	Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma 2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-022-04073-3 PMID:35713707	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序揭示了尤文肉瘤的异质性和发育轨迹	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了尤文肉瘤的细胞起源和发育轨迹，并发现了JAK1基因在肿瘤发生中的重要作用	研究仅使用了4个尤文肉瘤肿瘤组织样本，样本量较小可能影响结果的普遍性	探究尤文肉瘤的异质性和发育轨迹，并寻找潜在的治疗靶点	尤文肉瘤肿瘤细胞的起源和发育过程	数字病理学	尤文肉瘤	单细胞RNA测序	K-最近邻算法	转录组数据	4个尤文肉瘤肿瘤组织样本
20717	2024-08-08	Single-cell RNA-seq dissecting heterogeneity of tumor cells and comprehensive dynamics in tumor microenvironment during lymph nodes metastasis in gastric cancer 2022-10-15, International journal of cancer IF:5.7Q1 DOI:10.1002/ijc.34172 PMID:35716132	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胃癌原发肿瘤和转移淋巴结中的肿瘤细胞异质性及肿瘤微环境动态变化	首次全面揭示了胃癌原发肿瘤和转移淋巴结中肿瘤细胞和肿瘤微环境的异质性，并识别出具有淋巴结转移潜力的胃癌细胞亚型	NA	揭示胃癌淋巴结转移过程中肿瘤细胞的动态变化及潜在机制	胃癌原发肿瘤和转移淋巴结的肿瘤细胞及肿瘤微环境	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	转录组	胃癌原发肿瘤和转移淋巴结的组织样本
20718	2024-08-08	A map of the spatial distribution and tumour-associated macrophage states in glioblastoma and grade 4 IDH-mutant astrocytoma 2022-10, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.5984 PMID:35723032	研究论文	本研究旨在解析高级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的转录状态、空间分布及临床病理意义	首次揭示了IDH突变型4级星形细胞瘤中TAMs的多样性及其功能状态，并探讨了其在肿瘤微环境中的空间分布和临床相关性	研究样本量较小，仅包括四例人类胶质母细胞瘤和三例IDH突变型4级星形细胞瘤	探讨高级别胶质瘤中TAMs的多样性及其在肿瘤微环境中的作用和临床意义	高级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其在IDH突变型4级星形细胞瘤中的多样性	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	24,227个髓系细胞
20719	2024-08-08	Development of a novel signature derived from single cell RNA-sequencing for preoperative prediction of lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma 2022-10, Head & neck DOI:10.1002/hed.27126 PMID:35726502	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据开发并验证了一种用于头颈部鳞状细胞癌患者术前预测淋巴结转移的LNM特征	首次利用单细胞RNA测序数据开发了一种新的LNM特征，用于术前预测头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移	NA	开发并验证一种用于术前预测头颈部鳞状细胞癌患者淋巴结转移的LNM特征	头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	LASSO	RNA测序数据	NA
20720	2024-08-08	Regional and age-related diversity of human mature oligodendrocytes 2022-10, Glia IF:5.4Q1 DOI:10.1002/glia.24230 PMID:35735919	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了人成熟少突胶质细胞（MOLs）在不同脑区和年龄段的异质性	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人成熟少突胶质细胞在不同脑区和年龄段的转录异质性	研究仅限于特定脑区和脊髓样本，可能无法全面代表所有脑区的少突胶质细胞异质性	探讨人成熟少突胶质细胞在不同脑区和年龄段的异质性	人成熟少突胶质细胞（MOLs）	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自皮质/皮质下、室下带脑组织样本和胸腰椎脊髓样本的细胞