单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20681 - 20700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20681 | 2024-08-08 |
Detection of cell markers from single cell RNA-seq with sc2marker
2022-Jul-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04817-5
PMID:35831796
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research paper | 本文提出了一种基于最大边缘指数和抗体蛋白数据库的sc2marker方法，用于从单细胞RNA测序数据中选择流式细胞术或成像的标记物 | sc2marker方法在准确性上优于竞争方法，同时具有竞争性的运行时间 | NA | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据中选择特定标记基因 | 单细胞RNA测序数据中的免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最大边缘指数 | RNA测序数据 | NA |
| 20682 | 2024-08-08 |
scDLC: a deep learning framework to classify large sample single-cell RNA-seq data
2022-Jul-12, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08715-1
PMID:35831808
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDLC的深度学习框架，用于分类大型样本的单细胞RNA测序数据 | scDLC基于长短期记忆循环神经网络（LSTMs），不需要对数据分布有先验知识，而是考虑了最显著特征基因的依赖性 | NA | 开发一种新的深度学习方法，用于处理大型样本的单细胞RNA测序数据分类问题 | 大型样本的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 长短期记忆循环神经网络（LSTMs） | 单细胞RNA测序数据 | 大型样本 |
| 20683 | 2024-08-08 |
Neoantigens in precision cancer immunotherapy: from identification to clinical applications
2022-Jun-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002181
PMID:35838545
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综述 | 本文综述了癌症免疫治疗中基于新抗原的疗法，从识别到临床应用的进展 | 新抗原相关疗法在临床实践中的广泛应用，包括新抗原疫苗、新抗原特异性CD8+和CD4+ T细胞以及新抗原脉冲树突状细胞 | 需要不断努力揭示新抗原在抗肿瘤免疫中的全面作用并扩展其临床应用 | 总结新抗原研究的进展，并讨论其在精准癌症免疫治疗中的机遇和挑战 | 新抗原在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | NA | 下一代测序、高通量单细胞测序、质谱分析 | NA | 测序数据、质谱数据 | NA |
| 20684 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of lower mitochondrial complex I expression is associated with cell metastasis of clear cell renal cell carcinoma
2022-Jun, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-242
PMID:35836523
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研究论文 | 本研究分析了线粒体复合物I（CI）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞转移中的作用 | 首次揭示了线粒体复合物I在ccRCC转移中的关键作用，并提出了CI和PPARG作为潜在的转移性ccRCC生物标志物 | NA | 探讨ccRCC转移的机制并开发有效的治疗方法 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的细胞转移机制 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络 | 基因表达数据 | 使用了GSE73121和TCGA-KIRC数据库中的数据 |
| 20685 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the immune space-time landscape reveals dendritic cell regulatory program in polymicrobial sepsis
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72760
PMID:35832091
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研究论文 | 本研究利用多隔室单细胞RNA测序技术，分析了脓毒症进展过程中免疫细胞亚群的异质性，并揭示了树突状细胞在脓毒症中的免疫调节程序。 | 首次全面描绘了多微生物脓毒症的单细胞免疫时空景观，并发现了树突状细胞中与超炎症和器官功能障碍相关的保守且可靶向的免疫调节程序。 | NA | 揭示脓毒症中宿主免疫反应的全面视图，并探索树突状细胞在脓毒症中的免疫调节功能。 | 小鼠脓毒症模型中的免疫细胞亚群，特别是树突状细胞。 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的多个免疫相关组织部位 |
| 20686 | 2024-08-08 |
Concordant and Heterogeneity of Single-Cell Transcriptome in Cardiac Development of Human and Mouse
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.892766
PMID:35832197
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研究论文 | 本研究基于人类和小鼠胚胎心脏的单细胞转录组数据，鉴定了几种主要类型的心脏细胞，并比较了这些细胞在两个物种中的发育阶段相似性 | 首次详细比较了人类和小鼠心脏细胞在发育过程中的转录组异同，并确定了物种共享和物种特异的标记基因 | NA | 揭示哺乳动物心脏发育的异同，为研究心脏细胞类型和发育轨迹提供资源 | 人类和小鼠的胚胎心脏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的胚胎心脏细胞 |
| 20687 | 2024-08-08 |
Bulk RNA Sequencing With Integrated Single-Cell RNA Sequencing Identifies BCL2A1 as a Potential Diagnostic and Prognostic Biomarker for Sepsis
2022, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2022.937303
PMID:35832273
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研究论文 | 本研究通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，识别出BCL2A1作为脓毒症潜在的诊断和预后生物标志物 | 首次通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，识别出BCL2A1作为脓毒症的潜在生物标志物 | NA | 旨在发现新的脓毒症相关生物标志物，并验证其诊断和预后价值 | 脓毒症及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | 随机森林回归分析 | RNA序列 | 141个候选基因，17个预后基因 |
| 20688 | 2024-08-08 |
Revealing the Key MSCs Niches and Pathogenic Genes in Influencing CEP Homeostasis: A Conjoint Analysis of Single-Cell and WGCNA
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.933721
PMID:35833124
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和加权基因共表达网络分析（WGCNA），系统分析了软骨终板（CEP）中的感兴趣模块、免疫浸润情况和细胞微环境，揭示了CEP中间充质干细胞群体的复杂性和表型特征。 | 首次结合scRNA-seq和WGCNA技术，全面分析了CEP中的细胞异质性和基因共表达网络，揭示了CEP中关键的间充质干细胞微环境和致病基因。 | NA | 揭示软骨终板（CEP）中的间充质干细胞群体复杂性和表型特征，以及这些细胞在维持CEP稳态中的作用。 | 软骨终板（CEP）中的间充质干细胞和其他细胞成分。 | 数字病理学 | 退行性椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | RNA | 8个不同的细胞亚群 |
| 20689 | 2024-08-08 |
Checkpoint Inhibitors Modulate Plasticity of Innate Lymphoid Cells in Peripheral Blood of Patients With Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.849958
PMID:35833139
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研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点抑制剂对肝细胞癌患者外周血中固有淋巴细胞（ILC）可塑性的影响 | 首次探索了ILC在外周血中的存在及其在免疫检查点抑制剂治疗中的作用和功能 | NA | 研究免疫检查点抑制剂对肝细胞癌患者外周血中ILC组成和可塑性的影响 | 肝细胞癌患者外周血中的固有淋巴细胞（ILC） | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 细胞 | 大型肝细胞癌队列 |
| 20690 | 2024-08-08 |
Overexpression of LIMA1 Indicates Poor Prognosis and Promotes Epithelial-Mesenchymal Transition in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2022, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549221109493
PMID:35837368
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研究论文 | 本文研究了LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其对患者预后的影响 | 首次全面探讨了LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的恶性行为及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其对患者预后的影响 | LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤细胞功能状态的影响 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 多组学研究 | NA | 基因组数据 | 基于The Cancer Genome Atlas数据 |
| 20691 | 2024-08-08 |
Response: Commentary: Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted CoExpression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923283
PMID:35837392
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20692 | 2024-08-08 |
Vascular Regulation by Super Enhancer-Derived LINC00607
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.881916
PMID:35837599
|
研究论文 | 研究探讨了超级增强子衍生的长非编码RNA LINC00607在人动脉内皮细胞中的表达及其对糖尿病条件下血管细胞基因调控网络的影响 | 首次展示了LINC00607在糖尿病患者动脉中的高表达，并证明了其通过c-Myc转录因子调控内皮细胞和血管平滑肌细胞的转录组 | NA | 研究LINC00607在血管细胞中的功能及其在糖尿病等疾病中的作用 | 人动脉内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康和糖尿病捐赠者的人动脉样本 |
| 20693 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Between Immune Cells and Altered Vascular Smooth Muscle Cell Phenotypes in Aortic Aneurysm From Single-Cell Transcriptome Data
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.936287
PMID:35837612
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据分析，揭示了主动脉瘤中免疫细胞与血管平滑肌细胞（VSMC）之间的细胞间通讯及其在主动脉瘤发展中的作用 | 首次详细分析了主动脉瘤中免疫细胞与VSMC之间的细胞间通讯网络，并识别了关键的信号通路和配体-受体对 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及实验验证所有识别的信号通路和配体-受体对 | 探讨主动脉瘤中VSMC表型转换的驱动因素及其在疾病中的作用 | 主动脉瘤中的免疫细胞和VSMC | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8个主动脉瘤样本和3个正常主动脉样本，共42,611个细胞 |
| 20694 | 2024-08-08 |
T Cells With Activated STAT4 Drive the High-Risk Rejection State to Renal Allograft Failure After Kidney Transplantation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.895762
PMID:35844542
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研究论文 | 本研究利用统一流形近似和投影及莱顿算法分析2611个公开的肾移植微阵列数据集，揭示了六种排斥状态及其特征基因，并识别出与高风险排斥状态相关的T细胞群，通过构建基因调控网络，发现激活的STAT4作为核心转录因子与移植肾功能和预后密切相关。 | 本研究首次揭示了肾移植后的六种排斥状态及其特征基因，并识别出与高风险排斥状态相关的T细胞群，为精确诊断肾移植排斥进展提供了新策略。 | NA | 研究肾移植后排斥状态的分子机制，以提高排斥反应的诊断和治疗水平。 | 肾移植排斥状态及其相关基因和细胞群。 | NA | 肾移植 | 微阵列数据分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2611个微阵列数据集 |
| 20695 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Upregulation of Immune Cell Crosstalk in Relapsed Pediatric Ependymoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.903246
PMID:35844565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了儿童复发性室管膜瘤中免疫细胞间相互作用的增强 | 采用了一种新的轨迹评分方法来揭示与不良生存结果相关的细胞组成，并识别了复发和原发样本之间的潜在细胞间通信特征 | NA | 研究儿童室管膜瘤的肿瘤内异质性及其对生存结果的影响 | 儿童室管膜瘤的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20696 | 2024-08-08 |
Mapping the Tumor Microenvironment in TNBC and Deep Exploration for M1 Macrophages-Associated Prognostic Genes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923481
PMID:35844580
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，探索了三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境和M1巨噬细胞相关的预后基因 | 发现了与M1巨噬细胞密切相关的三个标记基因IFI35、PSMB9和SAMD9L，其中IFI35与巨噬细胞激活、趋化性和迁移正相关，且高表达IFI35的患者预后更好 | NA | 研究TNBC的肿瘤微环境和M1巨噬细胞相关的预后基因 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境和M1巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 使用了公共数据库和本研究队列的数据 |
| 20697 | 2024-08-08 |
Ferroptosis and Autophagy-Related Genes in the Pathogenesis of Ischemic Cardiomyopathy
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.906753
PMID:35845045
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研究论文 | 研究探讨了铁死亡和自噬相关基因在缺血性心肌病发病机制中的作用 | 通过分析GSE116250数据集，识别了与铁死亡和自噬相关的差异表达基因（DEGs），并预测了这些基因与关键miRNAs、转录因子和药物的相互作用 | 研究仅在MI小鼠模型中验证了部分关键基因，未来需在更多样本和临床试验中进一步验证 | 旨在探索可能影响心肌梗死进展的铁死亡和自噬相关差异表达基因 | 铁死亡和自噬相关基因在心肌梗死中的作用及其潜在治疗靶点 | NA | 心血管疾病 | qPCR分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | MI小鼠模型 |
| 20698 | 2024-08-08 |
D3K: The Dissimilarity-Density-Dynamic Radius K-means Clustering Algorithm for scRNA-Seq Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.912711
PMID:35846121
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研究论文 | 本文提出了一种名为D3K的新型聚类算法，用于处理单细胞RNA测序数据 | D3K算法引入了动态半径参数，根据数据特性灵活调整有效半径，并通过数据集的相异密度、候选簇的平均对比度和相异度计算权重，以获取高质量的初始中心点 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的聚类效果 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | K-means | 数据集 | NA |
| 20699 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular and Transcriptional Changes Associated With Traumatic Brain Injury
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.861428
PMID:35846152
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研究论文 | 本研究通过重新分析小鼠海马体的单细胞RNA测序数据，揭示了创伤性脑损伤（TBI）相关的细胞和转录变化 | 首次在单细胞水平上详细描述了TBI后的细胞和转录变化，包括发现TBI特异性的ependymal亚群C0和神经元系统的变化 | 研究基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 揭示创伤性脑损伤后的细胞和转录变化，探索潜在的治疗靶点 | 小鼠海马体的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20700 | 2024-08-08 |
Genetic and Epigenetic Regulation of Brain Organoids
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.948818
PMID:35846370
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综述 | 本文综述了脑类器官领域的最新知识和技术，以及其在疾病模型和临床前研究中的当前和潜在应用 | 脑类器官模拟人类大脑的发育、成熟、信号生成和功能，为神经学研究提供了独特的优势 | NA | 揭示神经发育机制和神经疾病发病机制 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因转录数据 | NA |