单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 20661 - 20680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20661 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Heterogeneity of Cell Communications between Schwann Cells and Fibroblasts within Vestibular Schwannoma Microenvironment
2022-09, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2022.06.006
PMID:35750260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了前庭神经鞘瘤中的细胞组成和细胞间通信的异质性 | 首次揭示了前庭神经鞘瘤微环境中施万细胞和成纤维细胞之间通过整合素和生长因子信号的紧密细胞间通信 | NA | 探讨前庭神经鞘瘤肿瘤进展的细胞成分和机制 | 前庭神经鞘瘤样本中的施万细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 临床手术分离的前庭神经鞘瘤样本 |
| 20662 | 2024-08-08 |
A single-cell survey unveils cellular heterogeneity and sensitive responses in mouse cortices induced by oral exposure to triphenyl phosphate
2022-09, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-022-03301-6
PMID:35752650
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了三苯基磷酸酯（TPhP）对小鼠皮质细胞异质性和敏感反应的影响 | 首次揭示了TPhP暴露下神经发育毒性的特异性细胞过程，并发现神经发生障碍、血管屏障破坏和伴随的神经炎症是其敏感反应 | NA | 研究TPhP暴露对小鼠皮质细胞的影响及其机制 | 小鼠皮质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 共检测了17,229个细胞和26,338个基因 |
| 20663 | 2024-08-08 |
Regulatory Programs of B-cell Activation and Germinal Center Reaction Allow B-ALL Escape from CD19 CAR T-cell Therapy
2022-09-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0626
PMID:35759797
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研究论文 | 本文研究了B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）细胞如何通过减少CD19表达来逃避CD19 CAR T细胞疗法 | 首次揭示了B-ALL细胞通过转录重编程和生理性B细胞激活及生发中心反应维持低水平CD19表达的机制 | NA | 探讨B-ALL细胞逃避CD19 CAR T细胞疗法的机制 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞及CD19 CAR T细胞 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | RNA | NA |
| 20664 | 2024-08-08 |
Machine-learning-optimized Cas12a barcoding enables the recovery of single-cell lineages and transcriptional profiles
2022-08-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.06.001
PMID:35752172
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAISY的高容量Cas12a条形码系统，结合高通量筛选和机器学习优化条形码序列，用于恢复单细胞谱系和转录组信息 | DAISY条形码系统具有高容量和可靠性，能够在小尺寸下实现高效条形码生成，并成功应用于单细胞RNA测序 | NA | 开发一种高效的CRISPR-based条形码方法，以理解细胞谱系和转录组信息 | 人类黑色素瘤细胞的单细胞谱系和基因表达谱 | 机器学习 | NA | CRISPR-based条形码技术 | 机器学习模型 | 文本 | 约47,000个人类黑色素瘤细胞 |
| 20665 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling reveals roles of intercellular Fgf9 signaling in astrocyte maturation and synaptic refinement during brainstem development
2022-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102176
PMID:35753346
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了脑干中斜方体内侧核（MNTB）细胞类型的转录组特征，并探讨了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路在星形胶质细胞成熟和突触细化中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了MNTB中主要细胞类型的转录组特征，并阐明了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路的功能 | NA | 研究神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路在脑干发育中的作用 | 脑干中斜方体内侧核（MNTB）的细胞类型及其转录组特征 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20666 | 2024-08-08 |
The role of specialized cell cycles during erythroid lineage development: insights from single-cell RNA sequencing
2022-Aug, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-022-03406-9
PMID:35759181
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综述 | 本文综述了通过流式细胞术和单细胞RNA测序研究，对红细胞系发育中CFU-e到红细胞终末分化（ETD）过渡的调控机制的新见解 | 发现CFU-e/ETD过渡是一个快速依赖于S期的转录开关，且与细胞周期和S期重塑事件直接相关 | NA | 探讨红细胞系发育中细胞周期在CFU-e到ETD过渡中的调控作用 | 红细胞系发育中的CFU-e细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20667 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: expansion, integration and translation
2022-07-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac011
PMID:35753690
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术的发展及其在多组学研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术已扩展到基因组学、蛋白质组学和代谢组学等领域，并与其他技术如空间数据和CRISPR筛选技术集成，以增强对复杂细胞行为的理解 | NA | 旨在全面理解复杂的细胞行为，并通过集成多组学数据和其他技术层信息来获得新的知识或功能 | 单细胞测序技术及其在多组学研究中的应用 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 20668 | 2024-08-08 |
Identification of Pathogenic Immune Cell Subsets Associated With Checkpoint Inhibitor-Induced Myocarditis
2022-07-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过时间飞行质谱技术和多组学单细胞技术，识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 | 发现了一种在免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者中显著增加的克隆性细胞毒性Temra CD8+细胞，并揭示了其独特的转录变化 | NA | 识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 | 免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者的外周血单个核细胞和Pdcd1-/-小鼠 | 免疫学 | 心肌炎 | 时间飞行质谱技术，单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序，细胞转录组和表位索引测序 | NA | 细胞 | 52名个体（29名患者和23名健康对照），30名患者/对照，Pdcd1-/-小鼠 |
| 20669 | 2024-08-08 |
Mapping developmental paths of monkey primordial germ-like cells differentiation from pluripotent stem cells by single cell ribonucleic acid sequencing analysis†
2022-07-25, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac133
PMID:35766401
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了猕猴多能干细胞向原始生殖样细胞的分化路径 | 首次在猕猴中利用胚胎体分化系统诱导原始生殖样细胞的形成，并揭示了关键生长因子在分化过程中的作用 | 研究仅限于猕猴，尚未扩展到其他非人类灵长类动物 | 探讨多能干细胞向原始生殖样细胞分化的细胞和分子机制 | 猕猴的多能干细胞及其分化形成的原始生殖样细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约40,000个多能干细胞及胚胎体内的细胞 |
| 20670 | 2024-08-08 |
Cell-cell communication inference and analysis in the tumour microenvironments from single-cell transcriptomics: data resources and computational strategies
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac234
PMID:35753695
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研究论文 | 本文介绍了从单细胞转录组数据中推断和分析肿瘤微环境中细胞间通讯的流程，并列举了相关的数据库和可视化工具 | 本文提出了七种经典的细胞间通讯评分策略，并强调了四种代表性的细胞间通讯推断方法，包括基于网络的方法、基于机器学习的方法、基于空间信息的方法和其他方法 | 本文分析了上述四种细胞间通讯方法的优势和局限性，并指出了在肿瘤微环境中进行细胞间通讯分析时面临的主要挑战 | 旨在改进癌症治疗，通过量化肿瘤微环境中不同细胞类型之间的交叉对话 | 肿瘤微环境中的细胞间通讯 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20671 | 2024-08-08 |
A comprehensive comparison on cell-type composition inference for spatial transcriptomics data
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac245
PMID:35753702
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研究论文 | 本文综述了空间转录组学数据中细胞类型组成推断的先进方法，并比较了它们的优缺点 | 构建了来自单细胞水平的空间转录组数据点，评估了10种方法的性能，并比较了它们在不同组织和技术平台上的表现 | 空间转录组技术尚未达到单细胞分辨率 | 评估和比较空间转录组学数据中细胞类型组成推断方法的性能 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 10种方法在不同组织和技术平台上的表现被评估 |
| 20672 | 2024-08-08 |
Fast and accurate matching of cellular barcodes across short-reads and long-reads of single-cell RNA-seq experiments
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104530
PMID:35747387
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scTagger的计算方法，用于匹配单细胞RNA测序实验中的长读和短读细胞条码数据 | scTagger在准确性和时间效率上显著优于现有先进工具 | NA | 克服利用长读和短读技术进行单细胞测序时匹配细胞条码的挑战 | 单细胞RNA测序实验中的长读和短读细胞条码数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 使用了真实和模拟数据集进行测试 |
| 20673 | 2024-08-08 |
ICOS-Deficient Regulatory T Cells Can Prevent Spontaneous Autoimmunity but Are Impaired in Controlling Acute Inflammation
2022-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100897
PMID:35760518
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研究论文 | 研究探讨了ICOS缺陷的调节性T细胞在预防自发性自身免疫和控制急性炎症中的作用 | 通过条件性敲除系统，选择性地在表达Foxp3的细胞中消除ICOS表达，揭示了ICOS在调节性T细胞中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究ICOS在调节性T细胞中的功能及其在自身免疫和炎症控制中的作用 | ICOS缺陷的调节性T细胞及其在自身免疫和炎症中的作用 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 条件性敲除技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用ICOS FC小鼠和Foxp3-Cre控制小鼠进行比较研究 |
| 20674 | 2024-08-08 |
Conjunctival epithelial cells resist productive SARS-CoV-2 infection
2022-07-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.017
PMID:35750043
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研究论文 | 研究通过构建一种类器官的气液界面模型，探讨结膜上皮细胞对SARS-CoV-2感染的抵抗性 | 首次使用单细胞RNA测序结合成像和病毒学检测方法，揭示了结膜上皮细胞对SARS-CoV-2的早期固有免疫反应 | NA | 探讨结膜上皮细胞对SARS-CoV-2感染的抵抗性及其免疫反应机制 | 结膜上皮细胞及其对SARS-CoV-2的感染反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 结膜上皮细胞包括基底层、超基底层和表层上皮细胞及成纤维细胞 |
| 20675 | 2024-08-08 |
Nephrin expression in human epidermal keratinocytes and its implication in poor wound closure
2022-07, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100455RR
PMID:35747929
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研究论文 | 本研究首次证实了nephrin在人类表皮角质形成细胞中的表达，并探讨了其在伤口愈合中的作用 | 首次报道了nephrin在人类皮肤中的表达及其在细胞粘附、增殖和迁移中的功能 | NA | 探讨nephrin在人类皮肤中的表达及其在伤口愈合中的作用 | 人类表皮角质形成细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫组织化学和免疫电子显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 20676 | 2024-08-08 |
CDSImpute: An ensemble similarity imputation method for single-cell RNA sequence dropouts
2022-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105658
PMID:35751187
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CDSImpute的新型单细胞RNA测序数据填补方法，用于恢复因技术限制导致的基因表达缺失 | CDSImpute通过考虑细胞间的相关性和负距离，创建相似细胞列表，并从相似细胞中借用基因表达来检测和纠正缺失事件 | NA | 开发一种高效准确的方法来恢复单细胞RNA测序中的真实基因表达 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达缺失事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了Kolod、Pollen和Usoskin等多个公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 20677 | 2024-08-08 |
A shared disease-associated oligodendrocyte signature among multiple CNS pathologies
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01104-7
PMID:35760863
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在野生型和阿尔茨海默病模型（5xFAD）小鼠脑中绘制了所有非免疫、非神经元细胞群体，并识别出一种与脑病理相关的寡突胶质细胞状态，称为疾病相关寡突胶质细胞（DOLs） | 本研究揭示了在中枢神经系统病理中共享的寡突胶质细胞特征，并发现DOLs在多种神经退行性和自身免疫炎症条件下均可被识别 | NA | 探索阿尔茨海默病及其他中枢神经系统病理中寡突胶质细胞的共同反应 | 野生型和阿尔茨海默病模型小鼠的脑组织，以及人类死后脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多种小鼠模型和人类死后脑组织样本 |
| 20678 | 2024-08-08 |
Clonal structure, stability and dynamics of human memory B cells and circulating plasmablasts
2022-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01230-1
PMID:35761085
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合特定抗体的分离，探讨了人类记忆B细胞和循环浆母细胞的克隆结构、稳定性和动态变化 | 首次系统描述了人类记忆B细胞池的结构、稳定性和动态变化，并提出记忆B细胞可能在任何时间点参与浆母细胞的生成 | NA | 研究记忆B细胞和循环浆母细胞的克隆关系及其进化 | 人类记忆B细胞和循环浆母细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 两名健康捐赠者的多年样本 |
| 20679 | 2024-08-08 |
Dicer deficiency impairs proliferation but potentiates anti-tumoral effect of macrophages in glioblastoma
2022-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-022-02393-9
PMID:35764885
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研究论文 | 本文研究了Dicer酶在巨噬细胞中的遗传缺失对胶质母细胞瘤的影响，发现这种缺失抑制了肿瘤生长并延长了携带肿瘤小鼠的生存期 | 首次报道了Dicer酶在巨噬细胞中的缺失能够减少免疫抑制性胶质母细胞瘤相关巨噬细胞的比例，并将其重编程为促炎激活状态，增强其吞噬活性和IFN产生能力 | NA | 探讨Dicer酶在巨噬细胞中的缺失对胶质母细胞瘤的免疫治疗潜力 | Dicer酶在巨噬细胞中的作用及其对胶质母细胞瘤的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及GL261小鼠胶质母细胞瘤异种移植模型和携带肿瘤的小鼠 |
| 20680 | 2024-08-08 |
Identification of a differentiation-related prognostic nomogram based on single-cell RNA sequencing in clear cell renal cell carcinoma
2022-06-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-15206-6
PMID:35768519
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研究论文 | 本研究通过回顾性分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，结合TCGA数据库中的批量RNA-seq数据，构建了基于分化相关基因（DRG）的预后风险签名（PRS）和预测透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者预后的诺模图 | 本研究首次构建了基于DRG的PRS和诺模图，用于预测ccRCC患者的预后，并揭示了细胞分化轨迹和肿瘤微环境（TME）演变在预测临床结果和潜在免疫治疗反应中的重要性 | NA | 旨在通过分析scRNA-seq数据和TCGA数据库中的批量RNA-seq数据，构建预测ccRCC患者预后的诺模图 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |