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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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20661 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics reveal cellular-specific responses and microenvironment remodeling in aristolochic acid nephropathy
2022-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157360
PMID:35852860
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研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组学、批量转录组学和基于质谱的蛋白质组学分析,揭示了马兜铃酸肾病中细胞特异性反应和微环境重塑的机制。 | 首次综合运用单细胞RNA测序、批量RNA测序和蛋白质组学技术,详细阐明了马兜铃酸I引起的肾脏损伤的分子机制。 | 研究仅限于小鼠模型,可能限制了结果在人类中的直接应用。 | 旨在阐明马兜铃酸I引起的肾脏损伤的分子机制,并探索潜在的治疗干预途径。 | 研究对象为急性暴露于马兜铃酸I的小鼠肾脏。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、质谱蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 小鼠肾脏样本 |
20662 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Range of Transcriptional States of Circulating Human Neutrophils
2022-08-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200154
PMID:35858733
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了循环中人类中性粒细胞的转录状态多样性 | 本文通过改进数据分析流程,显著提高了单细胞RNA测序中人类中性粒细胞的检测率,并发现了中性粒细胞的四种可重复的转录簇 | NA | 研究人类中性粒细胞的转录异质性及其在健康和疾病中的潜在影响 | 人类循环中的中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 健康人类个体的样本 |
20663 | 2024-08-08 |
Effective enrichment of stem cells in regenerating Xenopus laevis tadpole tails using the side population method
2022-Aug, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12797
PMID:35839785
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研究论文 | 本文研究了使用侧群方法在再生非洲爪蟾蝌蚪尾巴中有效富集干细胞的方法 | 首次评估了侧群方法在非洲爪蟾蝌蚪尾巴再生中富集干细胞的有效性,并结合单细胞RNA测序进行分析 | 由于组织干细胞的稀有性,揭示其在尾巴再生过程中的行为动态较为困难 | 研究并分析在尾巴再生过程中稀有组织干细胞的行为动态 | 非洲爪蟾蝌蚪尾巴再生中的组织干细胞 | NA | NA | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从再生芽中提取的侧群细胞 |
20664 | 2024-08-08 |
Panoramic comparison between NK cells in healthy and cancerous liver through single-cell RNA sequencing
2022-Jul-21, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了健康和癌症肝脏中的NK细胞,揭示了NK细胞在肝细胞癌环境中的生物学特征和潜在的预后标志物 | 首次详细描述了健康人肝脏中NK细胞的5个特定亚群,并发现肝细胞癌和癌旁组织中缺失某些具有强抗癌活性的NK细胞亚群 | 样本量较小,仅包括1个血液样本和3个健康肝脏组织样本,4个肝细胞癌肿瘤组织样本及1个癌旁肝脏组织样本 | 确定NK细胞在肝细胞癌发生和预后中的作用 | NK细胞在健康和肝细胞癌环境中的发育进程、转录组景观和功能亚型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1个血液样本,3个健康肝脏组织样本,4个肝细胞癌肿瘤组织样本,1个癌旁肝脏组织样本 |
20665 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome of the mouse retinal pigment epithelium in response to a low-dose of doxorubicin
2022-07-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03676-3
PMID:35859009
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研究论文 | 研究分析了正常小鼠和低剂量多柔比星诱导的视网膜色素上皮细胞衰老小鼠的单细胞转录组 | 首次详细描述了正常视网膜色素上皮细胞和衰老视网膜色素上皮细胞的单细胞RNA图谱,并发现了与衰老相关的新的基因表达变化 | NA | 探讨视网膜色素上皮细胞在衰老过程中的单细胞转录组变化 | 小鼠视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 正常小鼠和低剂量多柔比星处理的小鼠 |
20666 | 2024-08-08 |
Single-cell multiomics analysis reveals regulatory programs in clear cell renal cell carcinoma
2022-Jul-19, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00415-0
PMID:35853872
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)技术,分析了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的转录和表观基因组图谱,揭示了肿瘤细胞特异性的调控程序及其潜在的治疗靶点。 | 本文首次综合应用单细胞多组学技术,揭示了ccRCC细胞异质性和细胞间通讯的详细机制,并识别了具有预后意义的转录因子。 | NA | 旨在深入理解透明细胞肾细胞癌的细胞结构和基因调控特征,并探索潜在的治疗策略。 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的微环境及其细胞和基因调控特征。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | NA | 转录组,表观基因组 | 未具体说明样本数量 |
20667 | 2024-08-08 |
FAM69C, a kinase critical for synaptic function and memory, is defective in neurodegenerative dementia
2022-07-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111101
PMID:35858575
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研究论文 | 本文报道了FAM69C激酶在神经退行性痴呆中的关键作用,并通过多种实验方法验证了其在记忆和突触功能中的保护作用。 | 首次揭示FAM69C激酶在神经退行性痴呆中的作用,并提出其作为治疗记忆丧失的潜在靶点。 | NA | 探讨FAM69C激酶在神经退行性痴呆中的分子机制及其作为治疗靶点的可能性。 | FAM69C激酶及其在神经退行性痴呆中的作用。 | NA | 神经退行性痴呆 | 单细胞RNA测序、电生理学、形态学和行为学实验、磷酸蛋白质组学 | NA | RNA、蛋白质 | Fam69c敲除小鼠及阿尔茨海默病患者的死后脑组织样本 |
20668 | 2024-08-08 |
Monocytic myeloid-derived suppressive cells mitigate over-adipogenesis of bone marrow microenvironment in aplastic anemia by inhibiting CD8+ T cells
2022-07-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-05080-5
PMID:35851002
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研究论文 | 本研究探讨了单核细胞来源的抑制细胞(mMDSCs)在再生障碍性贫血(AA)中通过抑制CD8+ T细胞减轻骨髓微环境过度脂肪生成的作用 | 首次揭示了mMDSCs通过抑制T细胞增殖和IFN-γ产生,减少骨髓中未成熟的Adipo-Cxcl12-丰富的网状细胞,从而重建骨髓造血前体细胞,恢复骨髓免疫平衡 | NA | 研究mMDSCs在AA中对骨髓微环境的影响及其免疫调节机制 | 骨髓间充质基质细胞(BM-MSCs)和单核细胞来源的抑制细胞(mMDSCs) | NA | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | AA小鼠模型中的骨髓细胞 |
20669 | 2024-08-08 |
Heparanase is a prognostic biomarker independent of tumor purity and hypoxia based on bioinformatics and immunohistochemistry analysis of esophageal squamous cell carcinoma
2022-Jul-16, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-022-02698-9
PMID:35840985
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和免疫组化分析,探讨了肝素酶(HPSE)作为食管鳞状细胞癌(ESCC)独立于肿瘤纯度和缺氧状态的预后生物标志物的潜力 | 发现肝素酶(HPSE)是食管鳞状细胞癌中独立于肿瘤纯度和缺氧状态的新型预后生物标志物 | NA | 研究肝素酶(HPSE)在食管鳞状细胞癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的关系 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 生物信息学分析、免疫组化、单细胞测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI) | 组织微阵列 | 使用公共ESCC队列数据进行分析,具体样本数量未详述 |
20670 | 2024-08-08 |
ZnT8 loss-of-function accelerates functional maturation of hESC-derived β cells and resists metabolic stress in diabetes
2022-07-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31829-9
PMID:35842441
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,发现ZnT8功能丧失(LOF)能加速人胚胎干细胞衍生的β细胞(SC-β细胞)的功能成熟,并增强其对代谢应激的抵抗力。 | 首次揭示了ZnT8 LOF通过解除锌对胰岛素分泌的负反馈抑制,促进SC-β细胞的葡萄糖刺激胰岛素分泌(GSIS),并通过调节锌水平减轻内质网(ER)压力,赋予SC-β细胞对脂毒性和糖毒性引起的细胞死亡的抵抗力。 | NA | 探索ZnT8 LOF对SC-β细胞功能成熟和代谢应激抵抗的影响,以期为糖尿病治疗提供新的细胞替代疗法。 | 人胚胎干细胞衍生的β细胞(SC-β细胞)及其在糖尿病治疗中的应用。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
20671 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell analyses decode the developmental landscape of the human fetal spine
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104679
PMID:35832888
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研究论文 | 本研究利用综合单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序分析,揭示了发育中的人类脊柱的细胞异质性、谱系和转录调控网络 | 发现具有干细胞特性的成纤维细胞可以通过高表达软骨生成标记物分化为软骨细胞;神经元可能起源于神经内分泌细胞,MEIS2可能是促进脊髓神经前体细胞在早期妊娠中选择性分化为神经元的关键转录因子;NRP2_SEMA3C和CD74_APP在巨噬细胞和神经元之间的相互作用可能对脊髓发育至关重要 | NA | 揭示人类胎儿脊柱发育的细胞层面特征 | 人类胎儿脊柱的细胞异质性、谱系和转录调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
20672 | 2024-08-08 |
Clinical assessment and molecular mechanism of the upregulation of Toll-like receptor 2 (TLR2) in myocardial infarction
2022-07-15, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-022-02754-y
PMID:35840880
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研究论文 | 本文研究了 Toll 样受体 2 (TLR2) 在心肌梗死 (MI) 中的临床评估和分子机制 | 首次阐明了 TLR2 在 MI 中的临床价值和分子机制 | TLR2 的机制仍不完全清楚,需要进一步研究 | 阐明 TLR2 在 MI 中的临床价值和分子机制 | TLR2 在 MI 中的表达和作用机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 基因表达数据 | 包括 325 例 MI 和 306 例对照 |
20673 | 2024-08-08 |
Human umbilical cord blood-derived MSCs trans-differentiate into endometrial cells and regulate Th17/Treg balance through NF-κB signaling in rabbit intrauterine adhesions endometrium
2022-07-15, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02990-1
PMID:35841027
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研究论文 | 本研究探讨了人脐带血来源的间充质干细胞(hUCB-MSCs)在移植后对兔子宫内膜粘连(IUA)后子宫内膜重建的影响及其潜在机制 | 本研究首次展示了hUCB-MSCs能够通过跨分化、免疫调节能力和NF-κB信号传导修复受损的子宫内膜 | NA | 研究hUCB-MSCs对子宫内膜重建的影响及其潜在机制 | 人脐带血来源的间充质干细胞(hUCB-MSCs)和兔子宫内膜粘连模型 | NA | 子宫内膜粘连 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA测序、qRT-PCR和Western blot | NA | 细胞 | 六个IUA样本 |
20674 | 2024-08-08 |
Recombinant DTβ4-inspired porous 3D vascular graft enhanced antithrombogenicity and recruited circulating CD93+/CD34+ cells for endothelialization
2022-07-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn1958
PMID:35857526
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研究论文 | 本文研究了一种基于重组DTβ4启发的多孔3D血管移植物,该移植物具有调节聚合物成分、孔隙度、机械强度和降解速率的能力,并能通过高度多孔结构实现肝素结合肽和二聚体胸腺素β4(DTβ4)的三维图案化,从而增强抗血栓形成和招募循环中的CD93+/CD34+细胞以促进内皮化。 | 本文创新性地利用DTβ4启发的多孔3D血管移植物,通过单细胞RNA测序分析和细胞追踪研究,识别出髓源性CD93/CD34细胞作为主要贡献者,促进了小口径动脉的再生。 | NA | 研究匹配材料降解与宿主重塑(包括内皮化和肌肉重塑)的血管再生方法。 | 基于重组DTβ4启发的多孔3D血管移植物及其在血管再生中的应用。 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 兔子模型 |
20675 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of immune cells after neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in IIIA non-small cell lung cancer (NSCLC)
2022-07-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-05057-4
PMID:35831283
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序,分析了非小细胞肺癌患者在接受新辅助化疗联合免疫检查点抑制剂治疗前后的免疫细胞变化 | 发现了B细胞和CD4 T细胞的协同增加与新辅助化疗联合免疫治疗的积极治疗反应相关,并揭示了B细胞IgG亚类IgG1和IgG3在抗肿瘤免疫反应中的关键作用 | NA | 探究非小细胞肺癌患者在接受新辅助化疗联合免疫检查点抑制剂治疗后的免疫细胞变化及其机制 | 非小细胞肺癌患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,TCR测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 186,477个免疫细胞来自48个样本,包括26个未治疗和30个接受新辅助化疗联合免疫治疗的IIIA/IIIB非小细胞肺癌患者 |
20676 | 2024-08-08 |
Integrated single cell and spatial transcriptomics reveal autoreactive differentiated B cells in joints of early rheumatoid arthritis
2022-07-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-15293-5
PMID:35831338
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,探讨了早期类风湿性关节炎关节组织中分化B细胞的存在及其特性 | 首次揭示了早期类风湿性关节炎关节组织中存在自身反应性分化B细胞,并展示了局部B细胞成熟和浆细胞生存的组织结构 | 样本量较小,仅包括8个滑膜活检样本 | 探究早期类风湿性关节炎关节组织中分化B细胞的存在及其在疾病发展中的作用 | 类风湿性关节炎患者的滑膜组织中的B细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA序列 | 8个滑膜活检样本,3414个B细胞 |
20677 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional pharmacodynamics of trifluridine in a tumor-immune model
2022-07-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-16077-7
PMID:35831404
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术评估三氟胸苷在肿瘤-免疫共培养模型中的转录药效学效应 | 首次在肿瘤和免疫细胞的共培养模型中使用单细胞RNA测序技术评估三氟胸苷的药效学效应,并提供了对T细胞介导的抗肿瘤反应的治疗诱导效应的新见解 | NA | 理解化疗的免疫学效应,特别是在化疗和免疫治疗结合的时代 | 人结直肠癌细胞和外周血单个核细胞的共培养模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 数千个单独的癌症和免疫细胞 |
20678 | 2024-08-08 |
A functional reference map of the RNF8 interactome in cancer
2022-07-13, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-022-00331-z
PMID:35831895
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研究论文 | 本研究通过LC-MS技术构建了RNF8在癌症中的互作组参考图谱,并发现了新的互作蛋白和生物学功能 | 首次构建了RNF8的互作组参考图谱,并揭示了RNF8与神经退行性疾病及肿瘤浸润免疫细胞的关联 | NA | 探索RNF8在癌症中的生物学功能及其作为治疗靶点的潜力 | RNF8互作蛋白及其在癌症中的作用 | NA | 癌症 | LC-MS | NA | RNA-seq数据 | NA |
20679 | 2024-08-08 |
SH3GLB1-related autophagy mediates mitochondrial metabolism to acquire resistance against temozolomide in glioblastoma
2022-Jul-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02429-8
PMID:35831908
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研究论文 | 研究SH3GLB1基因在胶质母细胞瘤中通过自噬调节线粒体代谢,从而获得对替莫唑胺(TMZ)的耐药性的机制 | 首次揭示了SH3GLB1通过调节自噬影响线粒体功能,从而在胶质母细胞瘤中产生对TMZ的耐药性 | 研究主要集中在体外和动物模型中,需要进一步的临床验证 | 探讨胶质母细胞瘤如何逃避替莫唑胺诱导的细胞毒性,特别是线粒体在此过程中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞、SH3GLB1基因、线粒体代谢 | NA | 脑肿瘤 | RNA干扰、基因扩增、单细胞转录组分析 | NA | RNA转录组 | 临床样本和肿瘤细胞 |
20680 | 2024-08-08 |
Targeted inducible delivery of immunoactivating cytokines reprograms glioblastoma microenvironment and inhibits growth in mouse models
2022-07-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl4106
PMID:35857642
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研究论文 | 本文利用基于慢病毒载体的平台,体外改造造血干细胞,使其肿瘤浸润的单核/巨噬细胞后代在空间和时间上选择性释放干扰素-α(IFN-α)或白细胞介素-12(IL-12),以重编程胶质母细胞瘤的微环境并抑制其在小鼠模型中的生长。 | 本文创新性地利用慢病毒载体改造造血干细胞,实现免疫激活细胞因子在肿瘤微环境中的选择性释放,从而克服了系统性给药的严重毒性问题。 | NA | 研究旨在开发一种新的治疗胶质母细胞瘤的方法,通过重编程肿瘤微环境来提高免疫疗法的疗效。 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其免疫抑制性肿瘤微环境(TME)。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 慢病毒载体 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用同基因GBM小鼠模型进行实验 |