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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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20641 | 2024-08-08 |
Bridging Glycomics and Genomics: New Uses of Functional Genetics in the Study of Cellular Glycosylation
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.934584
PMID:35782863
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综述 | 本文综述了功能基因组学技术在细胞糖基化研究中的应用 | 介绍了ChIP-seq、RNA-seq、CRISPR基因组筛选和scRNA-seq等新技术在糖基化状态基因组基础研究中的应用 | NA | 深入理解糖基化调控机制及其在疾病中的变化 | 细胞表面的糖蛋白和糖脂抗原 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, RNA-seq, CRISPR, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
20642 | 2024-08-08 |
Holliday Cross-Recognition Protein HJURP: Association With the Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma and With Patient Prognosis
2022, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2022.1610506
PMID:35783358
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研究论文 | 本文探讨了Holliday交叉识别蛋白HJURP与肝细胞癌肿瘤微环境及患者预后的关系 | 使用单细胞RNA测序和IOBR软件包分析HJURP在肿瘤微环境中的潜在作用,并建立了基于HJURP表达的预后预测模型 | NA | 研究HJURP与肝细胞癌肿瘤微环境的关系及对患者预后的影响 | HJURP蛋白及其在肝细胞癌中的表达与作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及正常肝脏组织和肝细胞癌组织的单细胞RNA测序数据 |
20643 | 2024-08-08 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
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研究论文 | 本文报道了一例通过恢复期血浆输注实现严重COVID-19完全缓解的病例,并通过纵向无偏蛋白组学和单细胞转录组学分析,揭示了从严重疾病到无病状态转变的关键生物学过程。 | 首次通过纵向无偏蛋白组学和单细胞转录组学分析,揭示了COVID-19恢复过程中的关键生物学动态变化。 | 仅基于单一病例的研究,可能缺乏更广泛的适用性和代表性。 | 探讨COVID-19恢复过程中的生物标志物和关键生物学动态。 | 严重COVID-19患者的恢复过程及其生物学机制。 | NA | COVID-19 | 蛋白组学分析、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质、RNA | 单一病例 |
20644 | 2024-08-08 |
Dynamic Changes in Uterine NK Cell Subset Frequency and Function Over the Menstrual Cycle and Pregnancy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.880438
PMID:35784314
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研究论文 | 本文通过整合先前发表的单细胞RNA测序数据和新的流式细胞术数据,研究了子宫自然杀伤细胞(uNK)在月经周期和妊娠不同阶段的频率、表型和功能变化 | 首次揭示了uNK细胞在健康生殖周期中频率和功能的动态变化,为研究不孕、反复流产、先兆子痫和早产等问题提供了平台 | NA | 探讨uNK细胞在月经周期和妊娠中的动态变化及其对妊娠成功的影响 | 子宫自然杀伤细胞(uNK)及其在不同生殖周期阶段的频率和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 七个生殖周期阶段的数据 |
20645 | 2024-08-08 |
Identification of Genes Related to 5-Fluorouracil Based Chemotherapy for Colorectal Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.887048
PMID:35784334
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研究论文 | 本研究旨在识别与结直肠癌5-氟尿嘧啶(5-FU)化疗相关的基因,以预测化疗反应和改善患者预后 | 本研究首次识别出与5-FU化疗抵抗相关的免疫相关基因,并开发了预测模型 | 研究依赖于公共数据库的数据,可能存在样本选择偏倚 | 识别新的生物标志物以预测结直肠癌患者对5-FU化疗的反应 | 结直肠癌样本及5-FU化疗抵抗相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | CRC样本来自GEO和TCGA数据库,具体数量未详述 |
20646 | 2024-08-08 |
Subsets of Tissue CD4 T Cells Display Different Susceptibilities to HIV Infection and Death: Analysis by CyTOF and Single Cell RNA-seq
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.883420
PMID:35784348
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research paper | 本研究通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析了人类扁桃体淋巴细胞中不同CD4 T细胞亚群对HIV感染和死亡的敏感性差异 | 研究发现,被HIV优先杀死的CD4 T细胞亚群在表型上与对HIV相关细胞死亡有抵抗力的亚群不同,且这种差异不完全由其对生产性感染的敏感性解释 | NA | 旨在定义不同CD4 T淋巴细胞亚群对HIV相关杀伤的敏感性或抵抗力 | 人类扁桃体中的淋巴细胞 | NA | HIV感染 | 质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
20647 | 2024-08-08 |
Long Intergenic Noncoding RNA MIAT as a Regulator of Human Th17 Cell Differentiation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.856762
PMID:35784351
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研究论文 | 研究了长链非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化中的调控作用 | 首次详细描述了MIAT在早期人类Th17细胞分化中的作用及其对关键Th17基因表达的调控机制 | NA | 探究长链非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化中的功能 | 长链非编码RNA MIAT及其在Th17细胞分化中的作用 | NA | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自类风湿性关节炎患者滑膜的T细胞 |
20648 | 2024-08-08 |
Comprehensive Evaluation of the m6A Regulator Prognostic Risk Score in the Prediction of Immunotherapy Response in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.818120
PMID:35784363
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研究论文 | 本研究通过综合分析m6A修饰,构建了一个m6A调控因子预后风险评分(MRPRS),用于预测透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者的生存和免疫治疗反应 | 本研究构建的MRPRS与免疫治疗反应呈正相关,并能区分高风险和低风险组的临床病理特征和免疫浸润特征 | NA | 旨在开发一种新的生物标志物,用于预测ccRCC患者的临床结果和治疗反应 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者的m6A修饰和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | TCGA-ccRC队列及13个外部验证队列的数据 |
20649 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Characterization of Human Post-implantation Embryos Cultured In Vitro Delineates Morphogenesis in Primary Syncytialization
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.835445
PMID:35784461
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了体外培养的人类植入后胚胎,建立了分层模型,并详细描述了滋养层细胞的形态发生和功能。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类植入后胚胎中滋养层细胞的形态发生和功能,为理解早期妊娠中的病理过程提供了宝贵的资源。 | NA | 研究人类植入后胚胎中滋养层细胞的形态发生和功能,以及其在早期妊娠病理中的作用。 | 人类植入后胚胎的滋养层细胞。 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 分层模型 | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
20650 | 2024-08-08 |
Research Progress of Cell Lineage Tracing and Single-Cell Sequencing Technology in Malignant Skin Tumors
2022, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2022.934828
PMID:35784923
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综述 | 本文综述了细胞谱系追踪和单细胞测序技术在恶性皮肤肿瘤研究中的进展 | 提供了深入理解肿瘤起源、肿瘤细胞异质性和肿瘤耐药机制的新方法 | NA | 总结细胞谱系追踪和单细胞测序技术在恶性黑色素瘤和皮肤鳞状细胞癌研究中的进展,激发皮肤肿瘤进一步研究的新思路 | 恶性黑色素瘤和皮肤鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
20651 | 2024-08-08 |
Integrated Single-Cell RNA-Sequencing Analysis of Gastric Cancer Identifies FABP1 as a Novel Prognostic Biomarker
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/4761403
PMID:35799608
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌样本,发现并验证了脂肪酸结合蛋白1(FABP1)作为胃癌的新型预后生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出FABP1作为胃癌进展的关键调控基因,并验证了其在胃癌预后评估中的作用 | 研究仅基于TCGA数据库和有限的组织微阵列样本进行验证,需要更多临床样本进一步验证FABP1的预后价值 | 开发具有高敏感性和特异性的新型生物标志物,以准确评估胃癌患者的预后 | 胃癌样本中的单细胞RNA测序数据和FABP1的表达水平 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3385个差异表达基因,胃癌组织微阵列样本 |
20652 | 2024-08-08 |
Gpx3 and Egr1 Are Involved in Regulating the Differentiation Fate of Cardiac Fibroblasts under Pressure Overload
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/3235250
PMID:35799890
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析心脏压力超载模型中成纤维细胞的分化命运和基因表达动态变化 | 首次揭示了Gpx3和Egr1在心脏压力超载条件下调控成纤维细胞分化命运中的作用 | 研究基于小鼠模型和公共数据集,未来需在人类样本中验证 | 阐明心脏压力超载下成纤维细胞的分化命运及其分子调控机制 | 心脏成纤维细胞及其在压力超载条件下的分化命运 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO数据库的GSE155882数据集,涉及小鼠横膈膜主动脉缩窄模型 |
20653 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals immune cellular components in odontogenic keratocysts
2023-Nov, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14293
PMID:35765210
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了牙源性角化囊肿中的免疫细胞成分及其潜在的趋化作用 | 首次详细描述了牙源性角化囊肿中的免疫细胞类型,并揭示了化学因子富集的肌成纤维细胞在免疫细胞迁移中的潜在作用 | 研究样本数量有限,可能影响结果的普遍性 | 旨在表征牙源性角化囊肿的免疫生态系统,并理解囊肿成纤维细胞在免疫细胞迁移中的潜在趋化作用 | 牙源性角化囊肿中的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 6个牙源性角化囊肿样本 |
20654 | 2024-08-08 |
Dynamic immune ecosystem of dengue infection revealed by single-cell sequencing
2022-12, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MA0622-738RR
PMID:35766188
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了登革热感染患者的免疫细胞类型及其动态变化 | 首次揭示了登革热感染过程中免疫生态系统的动态变化,并发现了关键的转录因子和信号通路 | NA | 深入理解登革热感染的发病机制并开发有效的治疗策略 | 登革热感染患者的免疫细胞及其动态变化 | 数字病理学 | 登革热 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 13127个细胞,来自10名登革热感染患者 |
20655 | 2024-08-08 |
Soluble TREM2 levels reflect the recruitment and expansion of TREM2+ macrophages that localize to fibrotic areas and limit NASH
2022-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.06.004
PMID:35750138
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研究论文 | 本研究探讨了骨髓来源的TREM2表达巨噬细胞在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)中的功能作用 | 发现系统性可溶性TREM2水平在NASH中的临床相关性,并揭示了TREM2+巨噬细胞在肝纤维化区域的定位及其对NASH的限制作用 | NA | 功能性地表征骨髓来源的TREM2表达巨噬细胞在NASH中的作用 | TREM2表达的巨噬细胞及其在NASH中的功能 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类临床队列 |
20656 | 2024-08-08 |
Complement C1QC as a potential prognostic marker and therapeutic target in colon carcinoma based on single-cell RNA sequencing and immunohistochemical analysis
2022-Oct-23, Bosnian journal of basic medical sciences
IF:3.1Q2
DOI:10.17305/bjbms.2022.7309
PMID:35765947
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组化分析,探讨了C1QC作为结肠癌的潜在预后标志物和治疗靶点 | 首次揭示了C1QC在结肠癌中的关键调控作用,并验证了其作为潜在免疫治疗靶点的可能性 | 研究主要基于数据库数据和分子对接分析,需要进一步的临床试验验证 | 探索结肠癌中免疫细胞浸润及其基因调控,为诊断和治疗提供新视角 | 结肠癌中的免疫细胞浸润及其基因调控 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的单细胞RNA测序表达谱和TCGA结肠癌数据集 |
20657 | 2024-08-08 |
Distinct Transcriptional Programs in Ascitic and Solid Cancer Cells Induce Different Responses to Chemotherapy in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2022-10-04, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-21-0565
PMID:35749080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)患者在不同疾病阶段的细胞,揭示了腹水和实体癌细胞在转录组水平上的显著差异及其对化疗的不同反应 | 发现了新的癌症相关成纤维细胞亚型,该亚型在化疗后显著富集,并提出了基于肿瘤异质性的新型治疗策略 | NA | 探究高级别浆液性卵巢癌治疗抵抗的机制,并寻找新的治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌患者的腹水和实体癌细胞及其对化疗的反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过十万细胞 |
20658 | 2024-08-08 |
Immune mechanisms linking metabolic injury to inflammation and fibrosis in fatty liver disease - novel insights into cellular communication circuits
2022-10, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.06.012
PMID:35750137
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中免疫机制与代谢损伤、炎症和纤维化的关联,并探讨了细胞通信电路的新见解。 | 近年来,单细胞RNA测序和高维多组学(蛋白质组学、脂质组学)以及空间转录组学的应用,极大地推进了对健康和疾病中肝脏免疫细胞亚群复杂异质性的理解。 | NA | 旨在强调NAFLD中与炎症相关的最新发现,讨论免疫细胞亚群在疾病不同阶段(包括疾病消退期)的作用,并整合驱动炎症的多系统。 | NAFLD中的免疫机制和细胞通信电路。 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序、高维多组学(蛋白质组学、脂质组学)、空间转录组学 | NA | RNA | NA |
20659 | 2024-08-08 |
A Survey of the Metabolic Landscape of the Developing Cerebellum at Single-Cell Resolution
2022-Oct, Cerebellum (London, England)
DOI:10.1007/s12311-022-01415-2
PMID:35767214
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综述 | 本文探讨并比较了从发育中的人类小脑及其体外合成对应物(干细胞衍生的cerebellar organoids)获得的单细胞RNA测序数据,重点关注关键代谢途径基因的表达 | 利用单细胞RNA测序技术,可视化组织中亚群的关键转录特征,并比较了体外模型与原生组织的代谢状态 | 体外模型与原生组织之间存在差异,这些差异可能影响对分化后代谢状态的理解 | 理解体外小脑模型的状态,这对于模拟各种细胞类型对小脑疾病的易感性至关重要 | 发育中的人类小脑及其体外合成对应物(干细胞衍生的cerebellar organoids) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
20660 | 2024-08-08 |
Processing human skin samples for single-cell assays
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101470
PMID:35769924
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研究论文 | 本文描述了一种优化的协议,用于从6毫米皮肤穿刺活检中快速分离出可存活的细胞,并结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)来研究皮肤常驻和外周循环记忆及效应T细胞的转录组和克隆型 | 该协议基于Saluzzo等人(2021)的改进,提供了更快速的皮肤细胞分离方法 | NA | 研究皮肤常驻免疫细胞在感染、炎症和癌症中的作用 | 人类皮肤样本中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq) | NA | 细胞 | 6毫米皮肤穿刺活检样本 |