单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 20601 - 20620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20601 | 2024-08-08 |
A deep matrix factorization based approach for single-cell RNA-seq data clustering
2022-09, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2022.06.010
PMID:35777719
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research paper | 本文介绍了一种基于深度矩阵分解的单细胞RNA测序数据聚类方法DeepCI | DeepCI使用两个自编码器来获取细胞嵌入和基因嵌入，能够同时学习细胞的低维表示和聚类，并通过细胞和基因嵌入的矩阵乘法恢复基因表达矩阵 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | autoencoder | 基因表达数据 | 多个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 20602 | 2024-08-08 |
New insights from the single-cell level: Tumor associated macrophages heterogeneity and personalized therapy
2022-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113343
PMID:35785706
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综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性及其在个性化治疗中的应用 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术揭示TAMs的RNA表达谱，为TAMs相关研究提供更高效的检测方法和更准确的信息 | NA | 探讨肿瘤进展和药物干预的机制，为针对巨噬细胞的个性化治疗策略提供新视角 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA表达数据 | NA |
| 20603 | 2024-08-08 |
The role of single-cell genomics in human genetics
2022-09, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2022-108588
PMID:35790352
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类遗传学中的应用及其在疾病检测、诊断和治疗中的潜力 | 单细胞测序技术能够以细胞分辨率检测遗传变异及其表型后果，保留细胞异质性，允许检测正常组织中的小病变亚群细胞 | 目前单细胞测序技术主要用于基础研究，临床应用仍面临实验和分析流程的挑战 | 旨在帮助临床医生理解和解释单细胞测序数据和分析，并探讨其在人类遗传学中的前沿应用 | 单细胞测序技术在人类遗传学中的应用，特别是非编码基因组的注释和单细胞测序数据在虚拟变异优先级中的应用 | 基因组学 | 遗传性疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 20604 | 2024-08-08 |
Maternal exome analysis for the diagnosis of oocyte maturation defects and early embryonic developmental arrest
2022-09, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2022.05.009
PMID:35798635
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研究论文 | 本文通过全外显子测序分析，开发了一种方法来选择和分析因卵母细胞成熟障碍和胚胎早期发育停滞而导致不孕的女性 | 本文开发了一种统计方法来识别不孕的内表型，并通过全外显子测序和生物信息学分析，识别了与卵母细胞成熟障碍和胚胎早期发育停滞相关的新基因 | 本文的研究样本量较小，且仅限于特定医院的数据，可能影响结果的普遍性 | 开发一种方法来诊断因卵母细胞成熟障碍和胚胎早期发育停滞导致的不孕症 | 因卵母细胞成熟障碍和胚胎早期发育停滞导致不孕的女性 | NA | 不孕症 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 28名不孕女性 |
| 20605 | 2024-08-08 |
Characterization of Aldosterone-producing Cell Cluster (APCC) at Single-cell Resolution
2022-08-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgac394
PMID:35796577
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞分辨率分析醛固酮产生细胞簇（APCC）的转录组，并推断其发育轨迹 | 首次在单细胞分辨率下揭示了APCC的基因表达特征，并展示了部分ZG细胞重塑为APCC的过程 | NA | 分析APCC的转录组特征并推断其发育轨迹 | 成人肾上腺中的醛固酮产生细胞簇（APCC） | NA | 原发性醛固酮增多症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 2个成人肾上腺中的2928个肾上腺细胞 |
| 20606 | 2024-08-08 |
ResPAN: a powerful batch correction model for scRNA-seq data through residual adversarial networks
2022-08-10, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac427
PMID:35771600
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研究论文 | 本文提出了一种名为ResPAN的轻量级深度学习框架，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的整合，通过残差对抗网络减少批次效应 | ResPAN结合了Wasserstein生成对抗网络（WGAN）、随机游走互最近邻配对和完全跳跃连接的自编码器，以减少批次间的差异 | NA | 解决多个scRNA-seq数据集整合分析中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 残差对抗网络（WGAN） | 基因组数据 | 超过五十万细胞的数据集 |
| 20607 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals a senescence-associated IL-6/CCR6 axis driving radiodermatitis
2022-08-08, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202115653
PMID:35785521
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序分析受照射的皮肤细胞与基因敲除和分子抑制研究，揭示了衰老相关IL-6和IL-1信号以及IL-17上调和CCR6介导的免疫细胞迁移是放射性皮炎的关键驱动因素 | 首次揭示了衰老相关IL-6/CCR6轴在放射性皮炎中的作用，并证明了靶向治疗策略的有效性 | NA | 探究放射治疗引起的脱发和皮炎的分子和细胞基础 | 放射治疗引起的脱发和皮炎 | 数字病理学 | 放射性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及受照射的皮肤细胞、IL-6或IL-1R小鼠、CCR6小鼠等样本 |
| 20608 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of the Circle of Willis in a Mouse Cerebral Aneurysm Model
2022-08, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.122.038776
PMID:35770669
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研究论文 | 本文首次对健康和动脉瘤小鼠Willis环的血管细胞进行了单细胞RNA测序分析，揭示了细胞谱系异质性和转录组特征的变化 | 首次全面分析了健康和动脉瘤小鼠Willis环血管细胞的谱系异质性和转录组变化 | NA | 研究Willis环在健康和动脉瘤状态下的细胞异质性和转录组特征 | 小鼠Willis环的血管细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过3900个Willis环细胞样本 |
| 20609 | 2024-08-08 |
Zedoarondiol inhibits atherosclerosis by regulating monocyte migration and adhesion via CXCL12/CXCR4 pathway
2022-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106328
PMID:35772647
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研究论文 | 本研究探讨了zedoarondiol通过调节CXCL12/CXCR4通路抑制单核细胞迁移和粘附，从而减轻动脉粥样硬化的效果 | 首次揭示了zedoarondiol通过调节CXCL12/CXCR4通路抑制单核细胞迁移和粘附，从而减轻动脉粥样硬化的机制 | NA | 探究zedoarondiol在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | zedoarondiol对动脉粥样硬化斑块的影响及对单核细胞迁移和粘附的调节作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序分析（scRNA-seq） | NA | NA | apoE基因敲除小鼠 |
| 20610 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the antifibrotic effects of YAP/TAZ in systemic sclerosis
2022-08, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2022.106257
PMID:35772663
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研究论文 | 本研究使用单细胞测序技术探讨了YAP/TAZ在系统性硬化症中的抗纤维化作用及其机制 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了YAP/TAZ信号通路在系统性硬化症患者纤维细胞中的表达差异，并验证了YAP/TAZ敲低对系统性硬化症小鼠模型的抗纤维化效果 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人体中验证YAP/TAZ的治疗潜力 | 探究YAP/TAZ在系统性硬化症中的作用机制及其作为治疗靶点的可能性 | 系统性硬化症患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括系统性硬化症患者和健康志愿者的样本，以及系统性硬化症小鼠模型 |
| 20611 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals CD133+CD44--originating evolution and novel stemness related variants in human colorectal cancer
2022-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104125
PMID:35785618
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研究论文 | 本文通过单细胞全外显子测序和批量细胞目标外显子测序，研究了人类结直肠癌起始细胞中的干细胞特异性体细胞变异或克隆进化 | 揭示了CD133+CD44-结直肠癌起始细胞可能是结直肠癌的原始来源，并发现了与干细胞特性相关的新变异基因 | NA | 高分辨率检测结直肠癌起始细胞的异质性 | 结直肠癌起始细胞、结直肠癌细胞和对照细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞全外显子测序（scWES）、目标外显子测序（TES） | NA | 基因组数据 | 从一名结直肠癌患者的组织中分离出单细胞，并对96个样本（20名患者）进行了验证 |
| 20612 | 2024-08-08 |
Shared Differential Expression-Based Distance Reflects Global Cell Type Relationships in Single-Cell RNA Sequencing Data
2022-08, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0652
PMID:35793527
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研究论文 | 本文修改了一种生物学驱动的距离度量SIDEseq，用于大规模单细胞RNA测序（scRNA seq）数据中细胞类型的聚合比较，并展示了该修改后的距离度量SIDEREF在模拟和真实数据中能更一致地保留细胞类型的全局关系 | 提出了修改后的距离度量SIDEREF，该度量在保留单细胞RNA测序数据的全局细胞类型关系方面优于常用的距离度量 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类的距离度量，以更好地反映细胞类型的全局关系 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及12种组织的单细胞RNA测序数据集 |
| 20613 | 2024-08-08 |
Consensus draft of the native mouse podocyte-ome
2022-08-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00058.2022
PMID:35796460
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研究论文 | 本文通过整合批量RNA测序、批量蛋白质组学和单细胞转录组学数据，建立了一个关于小鼠足细胞组（podocyte-ome）的共识草图，并开发了一个名为“PodIdent”的网络应用程序，用于探索性分析和查询足细胞特征。 | 本文首次整合了多种组学技术（包括批量RNA测序、批量蛋白质组学和单细胞转录组学）的数据，为足细胞的分子特征提供了一个统一的定义，并开发了一个新的知识库应用程序“PodIdent”。 | 目前，不同组学技术和研究之间的数据整合还不够完善。 | 旨在建立一个关于小鼠足细胞组（podocyte-ome）的共识草图，并开发一个网络应用程序，以便于探索性分析和查询足细胞特征。 | 小鼠足细胞（podocyte）及其分子特征。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 批量RNA测序、批量蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | RNA、蛋白质 | 三个公开可用的每种组学技术数据集 |
| 20614 | 2024-08-08 |
Dissecting the process of human neutrophil lineage determination by using alpha-lipoic acid inducing neutrophil deficiency model
2022-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2022.102392
PMID:35797799
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研究论文 | 本研究利用α-硫辛酸诱导的中性粒细胞缺乏模型，探讨了人类中性粒细胞谱系决定的过程及其调控机制 | 发现了α-硫辛酸在调控中性粒细胞谱系特化中的新功能，并揭示了SF3B1-ELK轴在中性粒细胞前体细胞从CD371 CD115 GMPs向中性粒细胞前体细胞承诺过程中的作用 | NA | 阐明人类GMPs如何承诺为中性粒细胞前体细胞及其命运决定的调控机制 | 人类中性粒细胞谱系决定及其调控机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20615 | 2024-08-08 |
TCF7 is highly expressed in immune cells on the atherosclerotic plaques, and regulating inflammatory signaling via NFκB/AKT/STAT1 signaling
2022-07-29, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212064
PMID:35792753
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，探讨了动脉粥样硬化斑块中T细胞和巨噬细胞的活化状态及其相关基因表达 | 发现了TCF7和XCL1在动脉粥样硬化中的调控机制，并通过蛋白-蛋白网络分析揭示了潜在的基因和新的机制 | NA | 旨在阐明和发现与动脉粥样硬化相关的潜在基因和新机制，为药物开发提供依据 | 动脉粥样硬化斑块中的T细胞、巨噬细胞及其他免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 动脉粥样硬化小鼠及患者斑块样本 |
| 20616 | 2024-08-08 |
Hedgehog signaling reprograms hair follicle niche fibroblasts to a hyper-activated state
2022-07-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.06.005
PMID:35777353
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研究论文 | 本文研究了Hedgehog信号通路在毛囊微环境中对成纤维细胞的调控作用，以及这种调控如何影响毛发生长和毛囊增殖。 | 首次揭示了Hedgehog信号通路通过调节SCUBE3/TGF-β机制，影响毛囊微环境中成纤维细胞的状态，从而促进毛发生长和毛囊增殖。 | NA | 探讨Hedgehog信号通路在毛囊微环境中对成纤维细胞的调控作用及其对毛发生长和毛囊增殖的影响。 | 毛囊干细胞、真皮乳头成纤维细胞、Hedgehog信号通路、SCUBE3/TGF-β机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类头皮毛囊样本 |
| 20617 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional regulation and genetic evolution of neuroendocrine prostate cancer
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104576
PMID:35789834
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了7名前列腺肿瘤患者的ADPC和NEPC，揭示了NEPC的基因表达特征、分化路径及转录因子网络 | 首次识别出两种NEPC基因表达特征，并揭示了NEPC从ADPC分化的不同路径及转录因子网络 | 研究样本数量有限，可能影响结果的普遍性 | 探究神经内分泌前列腺癌（NEPC）的起源及其发生机制 | 前列腺肿瘤中的ADPC和NEPC | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7名患者的前列腺肿瘤样本 |
| 20618 | 2024-08-08 |
Impaired interferon-γ signaling promotes the development of silicosis
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104647
PMID:35800765
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析矿工和未发展为矽肺的同事的支气管肺泡灌洗液细胞，发现髓系细胞中干扰素（IFN）-γ信号受损与矽肺的发生密切相关 | 首次揭示了髓系细胞中IFN-γ信号受损与矽肺发生之间的关联，并阐明了IFN-γ预处理巨噬细胞通过形成空间较大的吞噬体来抑制晶体二氧化硅诱导的NLRP3炎症小体激活的机制 | NA | 探究矽肺发生过程中内在因素的作用机制 | 矿工和未发展为矽肺的同事的支气管肺泡灌洗液细胞 | NA | 职业病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 矿工和未发展为矽肺的同事的支气管肺泡灌洗液细胞 |
| 20619 | 2024-08-08 |
Genetic association and single-cell transcriptome analyses reveal distinct features connecting autoimmunity with cancers
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104631
PMID:35800769
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研究论文 | 本研究通过分析GWAS目录数据库和Medline，收集了五种常见自身免疫疾病的易感基因，并与癌症驱动基因进行重叠分析。同时，通过单细胞转录组分析比较了系统性红斑狼疮（SLE）及相关癌症的特征。 | 本研究首次识别了45个致癌性自身免疫疾病风险（CAD）基因，并发现这些基因主要富集在T细胞和B细胞信号通路中。此外，通过综合单细胞分析揭示了肾癌与SLE在免疫细胞信号和干细胞特征上的显著差异。 | NA | 探讨自身免疫疾病与癌症之间的关联机制，并寻找新的治疗靶点。 | 五种常见自身免疫疾病（系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、干燥综合征、系统性硬化症和特发性炎症性肌病）及其相关癌症。 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因数据 | 涉及五种自身免疫疾病的易感基因和癌症驱动基因 |
| 20620 | 2024-08-08 |
Using the Kriging Correlation for unsupervised feature selection problems
2022-07-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-15529-4
PMID:35798813
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研究论文 | 本文提出了一种KC Score来衡量高维数据聚类分析中的特征重要性 | 基于原始特征与低维潜在空间中重建特征之间的相关性，开发了一种基于KC Score的特征选择策略 | NA | 研究高维数据聚类分析中的特征选择问题 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据 | 四个单细胞RNA测序数据集 |