单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 20581 - 20600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20581 | 2024-08-08 |
Identification of Up-Regulated ANXA3 Resulting in Fracture Non-Union in Patients With T2DM
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.890941
PMID:35813617
|
研究论文 | 本研究使用加权共表达网络分析（WGCNA）方法，识别与T2DM和骨折愈合相关的易感模块和枢纽基因，并通过单细胞RNA测序和qRT-PCR验证其在临床样本中的表达。 | 本研究首次进行了关于T2DM对骨折愈合影响的基因组学研究，并识别了一些特征模块和枢纽基因，这些发现有助于进一步探究分子机制。 | NA | 探究T2DM与骨折不愈合之间的分子机制，并寻找潜在的生物标志物和治疗靶点。 | T2DM患者的骨折愈合过程及相关的枢纽基因。 | NA | 糖尿病 | 加权共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 涉及多个GEO数据库的数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 20582 | 2024-08-08 |
Mass Cytometry and Single-Cell Transcriptome Analyses Reveal the Immune Cell Characteristics of Ulcerative Colitis
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.859645
PMID:35813827
|
研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞转录组测序分析了活动性溃疡性结肠炎（UCa）、非活动性溃疡性结肠炎（UCin）和健康对照（HC）的免疫细胞特征 | 发现了新的免疫细胞亚群，这些亚群可以区分UCa、UCin和HC，有助于区分UCa和UCin患者 | NA | 研究活动性和非活动性溃疡性结肠炎的免疫细胞特征差异 | 活动性溃疡性结肠炎（UCa）、非活动性溃疡性结肠炎（UCin）和健康对照（HC）的免疫细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 质谱流式细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | UCa、UCin和HC的多个样本 |
| 20583 | 2024-08-08 |
WormBase single-cell tools
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac018
PMID:35814290
|
研究论文 | 本文介绍了两个用于单细胞RNA测序数据交互式处理的网络应用：scdefg用于差异表达分析，wormcells-viz用于基因表达可视化 | 开发了两个新的网络应用工具，专门用于单细胞RNA测序数据的差异表达分析和基因表达可视化 | NA | 提供工具以促进单细胞RNA测序数据在Caenorhabditis elegans研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用WormBase策划的公共Caenorhabditis elegans数据集 |
| 20584 | 2024-08-08 |
Plac1 Remodels the Tumor Immune Evasion Microenvironment and Predicts Therapeutic Response in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.919436
PMID:35814442
|
研究论文 | 本文研究了Plac1在头颈鳞状细胞癌中的生物学功能和预后价值 | 发现Plac1在肿瘤微环境中具有双重免疫抑制功能，并构建了一个15基因的预后标志物 | NA | 探讨Plac1在头颈鳞状细胞癌中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | Plac1在头颈鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了TCGA和GEO数据库的大量RNA测序数据以及单细胞测序数据 |
| 20585 | 2024-08-08 |
Identification of Somatic Mutations From Bulk and Single-Cell Sequencing Data
2021, Frontiers in aging
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/fragi.2021.800380
PMID:35822012
|
综述 | 本文综述了从批量和单细胞测序数据中识别体细胞突变的方法及其面临的挑战 | 介绍了最新的体细胞突变识别方法，并讨论了当前技术在排除全基因组扩增过程中产生的技术伪影方面的挑战 | 需要进一步解决在全基因组扩增过程中产生的技术伪影问题 | 总结体细胞突变识别方法的最新进展并探讨未来需要解决的挑战 | 体细胞突变及其在癌症和非癌症疾病中的作用 | 基因组学 | NA | 下一代测序 | NA | DNA序列数据 | NA |
| 20586 | 2024-08-05 |
Gene regulatory network study of rheumatoid arthritis in single-cell chromatin landscapes of peripheral blood mononuclear cells
2023-Jul-04, Modern rheumatology
IF:1.8Q3
DOI:10.1093/mr/roac072
PMID:35796437
|
研究论文 | 本文旨在通过单细胞色谱技术研究类风湿关节炎的转录因子 | 首次在单细胞分辨率下揭示了与类风湿关节炎发病机制相关的转录因子 | 样本数量较少，仅包含七名类风湿关节炎患者和七名对照者 | 探索与类风湿关节炎相关的转录因子及其作用机制 | 七名类风湿关节炎患者和七名健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转座酶可接近的染色质测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 14个样本，其中7个类风湿关节炎患者和7个健康对照者 |
| 20587 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal Dynamics of the Molecular Expression Pattern and Intercellular Interactions in the Glial Scar Response to Spinal Cord Injury
2023-Feb, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-022-00897-8
PMID:35788904
|
研究论文 | 本文研究了脊髓损伤后胶质瘢痕反应中的分子表达模式和细胞间相互作用的时空动态 | 利用空间转录组技术系统性解码瘢痕形成过程中的基因表达模式，并揭示了胶质瘢痕微环境的异质性 | 尚未详细探讨胶质瘢痕反应中的所有潜在机制 | 旨在理解胶质瘢痕在脊髓损伤修复中的作用及其分子机制 | 使用小鼠脊髓的样本研究瘢痕形成中的基因表达和细胞状态 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 空间转录组技术 | NA | 样本基因表达数据 | 32个小鼠脊髓样本 |
| 20588 | 2024-08-08 |
Epg5 deficiency leads to primary ovarian insufficiency due to WT1 accumulation in mouse granulosa cells
2023-02, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2022.2094671
PMID:35786405
|
研究论文 | 本研究探讨了Epg5基因缺失导致小鼠颗粒细胞中WT1积累，从而引起原发性卵巢功能不全的机制 | 首次揭示了Epg5基因在颗粒细胞中的作用，及其通过影响WT1的降解途径参与原发性卵巢功能不全的病理过程 | NA | 研究Epg5基因缺失如何影响颗粒细胞分化及WT1的降解，进而导致原发性卵巢功能不全 | 小鼠颗粒细胞及Epg5基因的功能 | NA | 原发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20589 | 2024-08-08 |
Frequent aneuploidy in primary human T cells after CRISPR-Cas9 cleavage
2022-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01377-0
PMID:35773341
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，研究了在转染CRISPR-Cas9和指导RNA的人类原代T细胞中，针对T细胞受体（TCR）链和其他基因的基因编辑结果 | 发现CRISPR-Cas9切割后，人类原代T细胞中染色体14的丢失和染色体7的截断是常见现象 | 文章指出，染色体异常与细胞增殖减少、p53激活和细胞死亡有关，需要在临床方案中进行监测和最小化 | 研究CRISPR-Cas9在人类原代T细胞中的基因编辑效果及其对染色体结构的影响 | 人类原代T细胞中的T细胞受体（TCR）链和其他基因 | 基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，数字滴液PCR | CRISPR-Cas9 | RNA | 涉及的细胞数量未在摘要中明确提及 |
| 20590 | 2024-08-08 |
Mediators of Capillary-to-Venule Conversion in the Chronic Inflammatory Skin Disease Psoriasis
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.05.1089
PMID:35777499
|
研究论文 | 本研究利用5'单细胞RNA测序技术，研究了慢性炎症性皮肤病银屑病中直接从患者和健康人皮肤中分离出的不同亚群的血液血管和淋巴管内皮细胞的转录组改变 | 本研究首次详细描绘了银屑病中重塑的真皮血管结构，并揭示了内皮细胞特定的分子重编程以及与细胞粘附和细胞外基质组织相关的基因调控网络的失调 | NA | 深入了解银屑病中血管正常化作为管理策略的潜力 | 银屑病患者的血液血管和淋巴管内皮细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 5'单细胞RNA测序 | NA | RNA | 直接从银屑病患者和健康人皮肤中分离出的不同亚群的血液血管和淋巴管内皮细胞 |
| 20591 | 2024-08-08 |
Deconvolution analysis of cell-type expression from bulk tissues by integrating with single-cell expression reference
2022-12, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22494
PMID:35788983
|
研究论文 | 本文开发了固定和混合模型，通过整合单细胞RNA测序参考数据，从大量组织样本中重建细胞表达分数 | 提出了混合效应模型，该模型在估计细胞表达分数的基准评估中与CIBERSORTx算法表现相似，并在实际数据分析中表现更优 | NA | 解析细胞类型组织组成，以理解表型变异和影响复杂特征疾病易感性的关键因素 | 大量组织样本的细胞组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 转录组数据 | NA |
| 20592 | 2024-08-08 |
Inflammatory type 2 conventional dendritic cells contribute to murine and human cholangitis
2022-12, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.06.025
PMID:35798133
|
研究论文 | 本文研究了2型常规树突状细胞在鼠和人类胆管炎中的作用 | 首次揭示了2型常规树突状细胞在胆管炎中的选择性肝内扩张及其促炎作用 | NA | 探讨树突状细胞在胆管损伤免疫反应中的作用 | 鼠和人类胆管炎中的树突状细胞 | NA | 胆管炎 | 流式细胞术，免疫荧光显微镜，单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 鼠模型和人类PSC患者的肝脏样本 |
| 20593 | 2024-08-08 |
Comparison of human skin- and nerve-derived Schwann cells reveals many similarities and subtle genomic and functional differences
2022-11, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24242
PMID:35796321
|
研究论文 | 比较人皮肤来源和神经来源的施万细胞，揭示了许多相似之处和细微的基因组及功能差异 | 使用单细胞RNA测序和一系列体外及体内实验，探索了皮肤来源和神经来源施万细胞的功能差异 | 文章未提及具体的局限性 | 提高从小块皮肤样本中获取施万细胞的可靠性和特异性，并探索皮肤来源和神经来源施万细胞的功能差异 | 皮肤来源的施万细胞和神经来源的施万细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 20594 | 2024-08-08 |
A probabilistic gene expression barcode for annotation of cell types from single-cell RNA-seq data
2022-10-14, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac021
PMID:35770795
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型注释的概率基因表达条形码方法 | 提出了一种统计方法，该方法利用公共数据集结合数千个基因信息，使用潜在变量模型定义细胞类型特异性条形码并考虑批次效应，从而概率性地注释细胞类型身份 | 当前方法依赖已知标记基因或因研究间系统差异（批次效应）导致的过拟合问题 | 开发一种数据驱动的细胞类型注释方法，以克服大规模细胞注释的实验技术限制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在变量模型 | 基因表达数据 | 涉及数千个基因和多个数据集 |
| 20595 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of T helper cell differentiation and heterogeneity
2022-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2022.119321
PMID:35779629
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法分析了人类外周血中分离的T辅助细胞在体外细胞因子介导分化下的表型多样性 | 本文采用了结合Seurat、Nebulosa、GGplot等多种生物信息学工具的综合分析方法，揭示了T辅助细胞表型的高表达相似性和特定标记基因的表达 | 单细胞分析的通用流程通常不足以适用于所有细胞类型 | 分析T辅助细胞的多样性和分化 | 人类外周血中的T辅助细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类外周血中的T细胞 |
| 20596 | 2024-08-08 |
Isolation of macrophages from mouse skin wounds for single-cell RNA sequencing
2022-Sep-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101488
PMID:35779263
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20597 | 2024-08-08 |
Physioxia-induced downregulation of Tet2 in hematopoietic stem cells contributes to enhanced self-renewal
2022-09-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015499
PMID:35772013
|
研究论文 | 研究探讨了生理性缺氧条件下，造血干细胞（HSCs）中Tet2下调对自我更新能力的影响及其分子机制 | 首次定义了Tet2在生理性缺氧条件下调控HSCs的分子程序 | NA | 探究生理性缺氧对HSCs自我更新和分化的影响及其分子机制 | 造血干细胞（HSCs）和造血祖细胞（HPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20598 | 2024-08-08 |
P2Y12 inhibitor clopidogrel inhibits renal fibrosis by blocking macrophage-to-myofibroblast transition
2022-09-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.06.019
PMID:35791881
|
研究论文 | 研究P2Y12抑制剂氯吡格雷通过阻断巨噬细胞向肌成纤维细胞转化抑制肾脏纤维化的机制 | 首次揭示了P2Y12在慢性肾脏病中通过促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转化介导肾脏纤维化的机制 | 研究主要在动物模型和小规模患者样本中进行，需要进一步在更大规模的人体研究中验证 | 探究P2Y12抑制剂氯吡格雷在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 慢性肾脏病患者及单侧输尿管梗阻（UUO）小鼠模型 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小规模患者样本及UUO小鼠模型 |
| 20599 | 2024-08-08 |
Heterogeneous Development of β-Cell Populations in Diabetes-Resistant and -Susceptible Mice
2022-09-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db21-1030
PMID:35771990
|
研究论文 | 研究了两种肥胖小鼠品系在糖尿病易感性不同的情况下，β细胞群的异质性发展 | 通过胰岛单细胞RNA测序，揭示了糖尿病抵抗和易感小鼠β细胞群在糖尿病饮食诱导下的不同发展模式 | 研究仅限于两种小鼠品系，且仅在特定饮食条件下进行 | 探讨β细胞在2型糖尿病中的损失机制 | 肥胖小鼠的胰岛β细胞 | NA | 2型糖尿病 | 胰岛单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 两种肥胖小鼠品系 |
| 20600 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals the natural product Shi-Bi-Man promotes hair regeneration by activating the FGF pathway in dermal papilla cells
2022-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2022.154260
PMID:35777117
|
研究论文 | 本研究探讨了中药补充剂Shi-Bi-Man（SBM）通过激活成纤维细胞生长因子（FGF）信号通路促进毛发生长的机制 | 首次通过单细胞转录组测序揭示SBM通过激活FGF信号通路促进毛发生长的机制 | NA | 寻找SBM中潜在的有效单体成分以促进毛发生长，并探索SBM促进毛发生长的机制 | SBM中的主要成分及其对毛发生长的影响 | NA | NA | UPLC/MS, UPLC/LTQ-Orbitrap-MS, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6小鼠 |