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当前共找到 38610 篇文献，本页显示第 2041 - 2060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2041 | 2026-03-24 |
CLEAR: coverage-based limiting-cell experiment analysis for RNA-seq
2020-02-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-020-02247-6
PMID:32039730
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CLEAR的工作流程，用于在限制细胞RNA测序数据中识别可靠可定量的转录本，以进行差异表达基因分析 | CLEAR是首个专门为lcRNA-seq数据设计的定制化算法，用于选择稳健/低噪声转录本进行组间比较，填补了该领域预处理工具的空白 | 未明确说明CLEAR算法在处理极低细胞数样本时的性能极限或与其他方法的全面比较 | 开发并验证一种工作流程，以改善限制细胞RNA测序数据的分析质量，特别是用于差异表达基因分析 | 慢性淋巴细胞白血病CD5+和CD5-细胞、小鼠齿状回富集细胞以及公开可用的lcRNA-seq数据集 | 单细胞转录组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 限制细胞RNA测序、直接cDNA预扩增协议 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及人类CLL样本、小鼠DG样本及两个公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2042 | 2026-03-24 |
Association of Urine sCD163 With Proliferative Lupus Nephritis, Fibrinoid Necrosis, Cellular Crescents and Intrarenal M2 Macrophages
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00671
PMID:32351512
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研究论文 | 本研究探讨了尿液可溶性CD163（sCD163）作为狼疮性肾炎（LN）生物标志物的潜力，特别是在区分活动性LN、增殖性LN及与肾脏病理特征的相关性方面 | 首次通过多队列研究验证尿液sCD163在区分活动性狼疮性肾炎、增殖性病变中的诊断价值，并结合单细胞RNA测序分析揭示其与肾内M2巨噬细胞的关联 | 研究为观察性设计，未进行前瞻性验证或干预性试验，样本来自多个队列可能存在异质性，且未评估尿液sCD163的动态变化对治疗反应的预测能力 | 评估尿液sCD163作为狼疮性肾炎生物标志物的临床价值，及其与肾脏病理特征的关联 | 系统性红斑狼疮患者（包括活动性狼疮性肾炎、活动性非肾脏狼疮、非活动性狼疮）及健康对照 | NA | 狼疮性肾炎 | ELISA、单细胞RNA测序 | NA | 尿液蛋白质检测数据、临床参数、肾脏病理学数据 | 284名参与者（228名SLE患者，56名健康对照），来自三个队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2043 | 2026-03-23 |
Early CD201-high cancer-associated fibroblasts shape immunosuppression and suggest a therapeutic opportunity in triple-negative breast cancer
2026-May-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116437
PMID:41831248
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了早期CD201高表达的癌症相关成纤维细胞（CAFs）在三阴性乳腺癌（TNBC）中的免疫调节作用，并提出了一个九基因预后标志物及潜在治疗策略 | 首次将CD201（PROCR）作为早期CAF状态的标志物，揭示了其在CAF分化连续体起始点的作用，并开发了一个跨队列验证的九基因预后标志物，同时通过计算和实验验证了槲皮素作为潜在治疗配体 | 研究样本量较小（10名TNBC患者），预后标志物在不同癌症类型中表现不一，且靶点结合的生物物理和多模型确认仍需前瞻性验证 | 探究早期癌症相关成纤维细胞在三阴性乳腺癌免疫微环境形成中的作用，并寻找治疗机会 | 三阴性乳腺癌患者样本及小鼠4T1原位模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，跨物种分析，伪时间分析，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10名三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2044 | 2026-03-23 |
Exosomal Rspondin3 serves as a master regulator of immunometabolic repair in sepsis: synergistic activation of macrophage M2 polarization and endothelial BMP10 signaling
2026-May-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116372
PMID:41839470
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研究论文 | 本研究揭示了内皮祖细胞来源的外泌体中的Rspondin3（Rspo3）作为脓毒症中免疫代谢修复的关键调控因子，通过协同激活巨噬细胞M2极化和内皮细胞BMP10信号通路来促进修复 | 首次发现Rspo3是内皮祖细胞外泌体中的关键介质，能同时协调调控巨噬细胞M2极化（通过Wnt/β-catenin通路）和内皮修复（通过BMP10/ACVRL1通路），揭示了脓毒症中巨噬细胞-内皮轴的新型调控机制 | 研究主要基于LPS诱导的脓毒症模型，在临床患者样本中的验证尚需进一步研究；外泌体治疗的具体给药方案和长期安全性仍需探索 | 探究脓毒症诱导的急性肺损伤中免疫细胞与血管细胞间相互作用的分子机制，并寻找新的治疗靶点 | 脓毒症模型、内皮祖细胞来源的外泌体、巨噬细胞、内皮细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症/急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2045 | 2026-03-23 |
Resveratrol ameliorates sepsis-induced immune dysfunction by targeting GADD45A to maintain hematopoietic stem cell homeostasis: A predictive study integrating ensemble machine learning, single-cell transcriptomics, and molecular dynamics simulation
2026-May-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116470
PMID:41806693
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研究论文 | 本研究整合了网络药理学、集成机器学习、单细胞转录组学和分子动力学模拟，预测并验证了白藜芦醇通过靶向GADD45A调节造血干细胞稳态，从而改善脓毒症免疫功能障碍的潜在药理机制 | 首次整合了113种算法组合的集成机器学习框架、单细胞转录组学虚拟敲除技术以及分子动力学模拟，系统性地预测和验证了白藜芦醇在脓毒症中通过GADD45A调节造血干细胞分化的新机制 | 本研究主要基于计算预测和体外模拟，缺乏体内实验验证；分子动力学模拟时间（100 ns）相对较短；单细胞数据来源未明确说明 | 探究白藜芦醇改善脓毒症相关免疫功能障碍的潜在药理机制 | 脓毒症免疫功能障碍、造血干细胞、GADD45A基因、白藜芦醇 | 计算生物学、生物信息学 | 脓毒症 | 网络药理学、集成机器学习、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 集成机器学习、SHAP可解释性分析、CIBERSORT、scTenifoldKnk虚拟敲除算法 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2046 | 2026-03-02 |
Functional validation gaps in single-cell RNA sequencing-defined neuronal subtypes
2026-Apr-16, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2047 | 2026-03-23 |
Genomic and Transcriptomic Profiling of High-risk Bladder Cancer Reveals Diverse Molecular and Microenvironment Ecosystems
2026-Apr, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2025.09.4138
PMID:41058365
|
研究论文 | 本研究通过基因组和转录组分析，识别了高风险膀胱癌的分子亚型，并开发了一个机器学习模型来预测复发风险 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学验证，首次揭示了具有高内源性逆转录元件表达和共生细菌存在的炎症肿瘤亚型对BCG治疗反应最佳 | 样本量有限，需要在更大队列中进行验证 | 识别高风险膀胱癌的分子亚型，并开发预测复发风险的精准框架以指导治疗 | 高风险膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 靶向基因组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 未明确指定样本数量，但提及样本量有限 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2048 | 2026-03-23 |
CD4+ T cells in Type 1 Diabetes: Inferring Stage-specific Dysregulation from scRNA-seq
2026-Mar-21, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag027
PMID:41863331
|
研究论文 | 本研究通过对1型糖尿病儿童、一级亲属及健康对照的外周血单个核细胞进行大规模单细胞转录组分析，揭示了疾病不同阶段的特异性免疫失调特征 | 首次通过大规模单细胞转录组分析系统描绘了1型糖尿病不同疾病阶段的系统性免疫重塑图谱，并识别出阶段特异性的免疫特征和细胞间通讯变化 | 研究样本仅来自儿童外周血，未涉及胰腺组织或其他器官；观察性研究无法确定因果关系；样本量虽大但仍需进一步验证 | 阐明1型糖尿病的细胞和分子机制，识别疾病阶段的特异性免疫失调特征 | 1型糖尿病儿童患者、一级亲属及健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大规模样本（具体数量未明确说明），包括儿童T1D患者、一级亲属和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2049 | 2026-03-23 |
crocketa: an automated Snakemake framework for integrated single-cell transcriptome and immune-repertoire analysis
2026-Mar-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12767-y
PMID:41864892
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2050 | 2026-03-23 |
RARRES1 marks an immune-cold, chemoresistance-associated malignant epithelial subpopulation enriched in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Mar-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04361-8
PMID:41854891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别了胰腺导管腺癌中一个与化疗耐药和免疫抑制相关的恶性上皮亚群，并确定RARRES1为其核心上调基因及新的泛癌预后生物标志物 | 首次在PDAC中鉴定出一个富含于进展性疾病和肝转移样本的恶性上皮亚群，该亚群具有免疫冷表型，并发现RARRES1作为其核心调控基因及新的泛癌预后生物标志物 | 样本量相对较小（27个样本），功能验证主要基于吉西他滨耐药细胞，需进一步在更大队列和体内模型中验证 | 探究胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫逃逸的细胞机制，识别关键恶性上皮亚群及其分子驱动因素 | 胰腺导管腺癌患者样本（包括初治、化疗暴露的原发肿瘤和肝转移样本）及吉西他滨耐药细胞 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、拷贝数变异推断、基因集富集分析、细胞间通讯分析、非负矩阵分解分析、药物敏感性预测、Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据、TCGA/ICGC泛癌生存数据 | 27个样本（包括初治和化疗暴露的原发肿瘤及肝转移样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2051 | 2026-03-23 |
Unraveling the mechanism of tripterygium glycosides tablets-induced liver injury and the protective role of total glucosides of peony from immune-metabolic dysregulation to multi-cellular cascade
2026-Mar-19, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-026-01373-5
PMID:41857612
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和病理学验证，阐明了雷公藤多苷片诱导肝损伤的致病性铁-脂轴及其多细胞级联机制，并揭示了白芍总苷的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统揭示了雷公藤多苷片肝损伤的致病性铁-脂轴及其多细胞级联机制，并明确了白芍总苷作为多靶点解毒剂的作用 | 研究基于小鼠模型，其结论在人体中的适用性有待进一步验证 | 探究雷公藤多苷片诱导肝损伤的机制及白芍总苷的保护作用 | 小鼠模型（雷公藤多苷片组、对照组、雷公藤多苷片+白芍总苷组） | 单细胞组学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、病理学图像 | 对照小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2052 | 2026-03-23 |
Cellular and molecular landscapes of human tendons across the lifespan revealed by spatial and single-cell transcriptomics
2026-Mar-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117085
PMID:41863796
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研究论文 | 本研究结合组织学、单核、单细胞和空间转录组分析，揭示了人类肌腱在胚胎、胎儿和成年阶段（包括断裂肌腱）的细胞和分子景观 | 首次系统整合单细胞和空间转录组学，全面描绘人类肌腱生命周期中的细胞动态变化，并识别出胚胎祖细胞状态及其在发育中的分化 | 研究主要基于人类样本，可能受样本数量或个体差异影响，且未深入探讨治疗靶点的功能验证 | 探究人类肌腱在发育和衰老过程中的细胞结构和分子机制，以理解肌腱修复能力随年龄下降的原因 | 人类跟腱和股四头肌腱，涵盖胚胎、胎儿和成年阶段（包括断裂肌腱） | 数字病理学 | 肌腱损伤 | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类肌腱样本，包括胚胎、胎儿和成年阶段（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2053 | 2026-03-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and intercellular communication of endothelial cells and Schwann cells during keloid formation
2026-Mar-16, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2026.107973
PMID:41864161
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了瘢痕疙瘩形成过程中内皮细胞和施万细胞的异质性及细胞间通讯 | 首次在瘢痕疙瘩中识别出具有肿瘤样特征的内皮细胞亚群，并发现PLPP3作为关键调控因子 | 样本量较小（仅6个样本），且仅基于公开数据集GSE163973进行分析 | 探究瘢痕疙瘩形成过程中细胞异质性和细胞间通讯的机制 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织中的细胞群体 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个样本（3个瘢痕疙瘩和3个正常瘢痕组织） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2054 | 2026-03-23 |
Adolescent exposure to environmental silver nanoparticles induces spermatogenic impairment and Sertoli cell dysfunction: Integrative single-cell transcriptomics, metabolomics and mechanistic dissection
2026-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119984
PMID:41797105
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、代谢组学和功能实验，系统揭示了银纳米颗粒（AgNPs）暴露对青春期大鼠睾丸的细胞重塑和生殖毒性机制 | 首次整合单细胞转录组学、代谢组学和体外功能实验，在单细胞分辨率下系统解析AgNPs诱导的睾丸细胞类型特异性毒性及分子机制 | 研究主要基于动物模型和细胞系，人类样本仅使用原代支持细胞，需进一步验证在人类体内的直接相关性 | 探究银纳米颗粒（AgNPs）暴露对男性生殖系统的毒性作用及其细胞与分子机制 | 青春期大鼠睾丸组织、C18-4、GC-2、TM4细胞系以及人原代支持细胞 | 单细胞组学 | 男性不育 | 单细胞转录组学、代谢组学、功能实验 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 青春期大鼠（具体数量未明确）及多种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2055 | 2026-03-23 |
Single-cell RNA sequencing provides insights into the potential cellular origins and microenvironment of Extramammary Paget's disease
2026-Mar-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110698
PMID:41831584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探索了乳房外佩吉特病的潜在细胞起源和肿瘤微环境 | 首次在单细胞水平上描绘了EMPD的全面细胞图谱，并识别出表达NY-BR-1的基底角质形成细胞群，该细胞群显示出向佩吉特样表型的转录轨迹，同时揭示了成纤维细胞在细胞间通讯中的核心作用 | 样本量相对有限，且研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证 | 探索EMPD的潜在细胞起源并描绘其肿瘤微环境的细胞组成 | EMPD患者的肿瘤组织细胞 | 单细胞组学 | 乳房外佩吉特病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从患者中收集了50,180个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2056 | 2026-03-23 |
A novel ZIC1-BMP4 axis identified in photoaged dermal fibroblasts regulates melanogenesis
2026-Mar-10, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2026.03.003
PMID:41864822
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据与实验验证，揭示了光老化皮肤中成纤维细胞通过ZIC1-BMP4轴调控黑色素生成的新机制 | 首次在光老化皮肤中鉴定出成纤维细胞特异性转录因子ZIC1与BMP4之间的调控轴，并阐明其通过影响黑色素生成关键因子MITF来参与色素沉着过程 | 研究主要基于转录组数据分析和初步实验验证，ZIC1-BMP4轴在体内光老化相关色素沉着中的具体功能机制仍需进一步深入探究 | 识别光老化相关色素沉着的关键调控因子 | 人皮肤组织（光暴露与光保护部位）、成纤维细胞、黑色素细胞 | 数字病理学 | 皮肤光老化与色素性疾病（如黄褐斑） | RNA-seq、单细胞RNA-seq、免疫组织化学、免疫荧光、ChIP-PCR、离体皮肤培养 | NA | 转录组数据、单细胞数据、图像数据 | 利用GTEx数据集中的批量RNA-seq数据及公共单细胞RNA-seq数据进行验证，涉及超过19,000个基因 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2057 | 2026-03-23 |
Chenodeoxycholic acid redirects the bile acid synthetic pathway to limit pro-inflammatory neutrophil infiltration and alleviate colitis
2026-Mar-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.004
PMID:41792997
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研究论文 | 本研究探讨了鹅去氧胆酸通过重编程胆汁酸合成途径，减少促炎性中性粒细胞浸润，从而缓解结肠炎的机制 | 揭示了结肠炎通过增强经典胆汁酸合成途径并抑制替代途径来影响肝脏胆汁酸合成，首次证明CDCA通过激活肠道上皮维生素D受体抑制CXCL2表达，为IBD治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析，人类临床试验尚未进行，且CDCA的具体给药方案和长期安全性需进一步评估 | 探究胆汁酸合成途径在炎症性肠病发病机制中的作用，并评估CDCA作为治疗候选药物的潜力 | 炎症性肠病患者样本、小鼠结肠炎模型、肠道上皮细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、过继转移实验、体外实验、转基因小鼠模型 | NA | 基因表达数据、临床样本数据 | 公共数据集、内部患者样本、动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2058 | 2026-03-23 |
Alk-Fam150b (augmentor α) expression in the paraventricular nucleus of the mouse hypothalamus at molecular resolution, and its sensitivity to acute stress
2026-Mar, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70159
PMID:41856795
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重原位杂交技术，揭示了小鼠下丘脑室旁核中Fam150b和Alk的表达模式及其对急性应激的敏感性 | 首次在分子分辨率水平上证实了Fam150b和Alk在小鼠下丘脑室旁核中的表达，并发现Fam150b在炎症相关应激下表达上调且受糖皮质激素反馈调节 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证；机制研究尚不完整，信号通路的具体作用有待进一步阐明 | 探究Fam150b-Alk信号通路在下丘脑室旁核中的表达及其对急性应激的响应，以理解应激诱导摄食和体重变化的潜在机制 | 成年小鼠的下丘脑室旁核组织及其中包含促肾上腺皮质激素释放激素的神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序，多重原位杂交 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用成年小鼠的下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2059 | 2026-03-23 |
CEMUSA: a graph-based integrative metric for evaluating clusters in spatial transcriptomics
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag056
PMID:41663910
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研究论文 | 本文提出了一种名为CEMUSA的基于图的新型评估指标，用于评估空间转录组学中的聚类结果 | CEMUSA首次将标签一致性、空间组织和错误严重性三个因素整合到一个统一的评估框架中，克服了现有指标只关注单一因素的局限性 | NA | 开发一个有效的评估指标来评估空间转录组学中聚类方法的性能 | 空间转录组学数据中的聚类结果 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基于图的指标 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2060 | 2026-03-23 |
Macrophages in human atherosclerotic plaques in the era of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-17, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlaf089
PMID:41702598
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术如何重新定义人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的生物学特性，超越了传统的M1/M2极化模型 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多模态组学数据，揭示了人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞亚群的多样性、空间分布和代谢功能，并建立了其与微环境信号、血管位置和疾病阶段的动态联系 | NA | 总结单细胞和空间转录组学时代对人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞生物学的新认识，并探讨其对疾病机制模型和靶向治疗的启示 | 人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多模态组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |