单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 2041 - 2060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2041 | 2025-03-21 |
De novo TANC2 variants caused developmental and epileptic encephalopathy and epilepsy
2025-Mar-20, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/epi.18358
PMID:40110879
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研究论文 | 本研究探讨了TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异的机制 | 首次将TANC2基因与癫痫和发育性癫痫性脑病（DEE）关联起来，并通过果蝇模型和单细胞RNA测序验证了其功能 | 样本量较小，仅包括六例不相关的病例 | 探索TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异的机制 | 癫痫患者和果蝇模型 | 遗传学 | 癫痫 | 外显子测序、单细胞RNA测序 | 果蝇模型 | 基因序列数据、RNA表达数据 | 六例不相关的癫痫患者 |
| 2042 | 2025-03-21 |
NKG2D-mediated cytotoxicity of CD4 cytotoxic T cells in multiple myeloma
2025-Mar-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025875
PMID:40106762
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，研究了多发性骨髓瘤患者骨髓中CD4+ T细胞的细胞毒性作用及其与NKG2D的关系 | 发现了CD4+细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）在多发性骨髓瘤患者中的显著增加和克隆扩展，并揭示了其通过NKG2D介导的细胞毒性作用 | 研究局限于多发性骨髓瘤患者，未涉及其他类型的癌症 | 探讨CD4+ T细胞在多发性骨髓瘤中的抗肿瘤免疫作用 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD4+ T细胞 | 免疫学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | RNA序列数据 | 多发性骨髓瘤患者骨髓样本 |
| 2043 | 2025-03-21 |
Identification of NETs-related genes as diagnostic biomarkers in ischemic stroke using RNA sequencing and single-cell analysis
2025-Mar-19, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10117-z
PMID:40107980
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞分析，识别了与缺血性中风相关的NETs相关基因，并评估了其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次结合RNA测序和单细胞RNA测序技术，系统地研究了NETs在缺血性中风中的作用，并识别了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明NETs在缺血性中风进展中的作用，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 小鼠脑组织样本 | 生物信息学 | 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | 小鼠脑组织样本 |
| 2044 | 2025-03-21 |
Single-cell transcriptomics reveals a compartmentalized antiviral interferon response in the nasal epithelium of mice
2025-Mar-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01413-24
PMID:39902863
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，揭示了小鼠鼻上皮中抗病毒干扰素反应的区室化特征 | 首次揭示了上呼吸道不同上皮细胞亚型对III型和I型干扰素的依赖差异，特别是在嗅觉上皮细胞中III型干扰素的优势作用 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究上呼吸道不同上皮细胞亚型在抗病毒保护中对III型和I型干扰素的依赖差异 | 小鼠鼻上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠鼻上皮细胞 |
| 2045 | 2025-03-21 |
Conventional and antibody-enhanced DENV infection of human macrophages induces differential immunotranscriptomic profiles
2025-Mar-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01962-24
PMID:39902963
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了在抗体依赖性增强（ADE）条件下与传统感染条件下，登革病毒（DENV-2）感染人类单核细胞衍生巨噬细胞的转录组差异 | 首次在单细胞水平上揭示了ADE条件下DENV感染的转录组特征，并发现这些变化与细胞内病毒RNA量无关，而是反映了细胞内在的免疫反应 | 研究仅针对DENV-2感染，未涵盖其他DENV血清型，且样本来源为体外培养的单核细胞衍生巨噬细胞，可能与体内情况存在差异 | 探究抗体依赖性增强（ADE）条件下DENV感染的细胞内在机制及其对疾病严重性的影响 | 人类单核细胞衍生巨噬细胞 | 生物信息学 | 登革热 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及体外培养的人类单核细胞衍生巨噬细胞 |
| 2046 | 2025-03-21 |
BubR1 Controls Heart Development by Promoting Expression of Cardiogenesis Regulators
2025-Mar-18, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.038286
PMID:40055864
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研究论文 | 本文研究了BubR1在心脏发育中的作用，揭示了其通过促进心脏生成调节因子的表达来调控心脏发育的机制 | 首次揭示了BubR1在心脏发育中的关键作用，特别是其在心脏成熟和形态发生中的调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探讨BubR1在心脏发育中的分子机制及其对先天性心脏缺陷的影响 | 小鼠胚胎心脏 | 发育生物学 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序，轨迹分析，CellChat分析 | NA | RNA测序数据 | 小鼠胚胎心脏样本 |
| 2047 | 2025-03-21 |
Spatial transcriptomics in the adult Drosophila brain and body
2025-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92618
PMID:40100257
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研究论文 | 本文介绍了在成年果蝇大脑和身体中应用空间转录组学的研究，旨在解决单核测序中丢失的空间信息问题 | 首次在成年果蝇中应用空间转录组学，成功定位了150种mRNA的空间位置，并发现了肌肉细胞中mRNA定位和转录多样性的新原则 | 研究中使用的基因面板是有限的，可能无法覆盖所有感兴趣的mRNA | 解决单核测序中丢失的空间信息问题，并探索mRNA在细胞中的空间定位和转录多样性 | 成年果蝇的大脑和身体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单核测序 | NA | mRNA空间定位数据 | 成年果蝇的大脑和身体样本 |
| 2048 | 2025-03-21 |
Targeting HIF-2α in glioblastoma reshapes the immune infiltrate and enhances response to immune checkpoint blockade
2025-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05642-8
PMID:40095115
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研究论文 | 本文研究了HIF-2α在胶质母细胞瘤（GBM）中的免疫抑制作用，并探讨了HIF-2α抑制剂PT2385在调节肿瘤微环境（TME）中的应用 | 首次揭示了HIF-2α在GBM免疫抑制中的关键作用，并展示了HIF-2α抑制剂PT2385与免疫检查点阻断（ICB）联合使用的协同效应 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索HIF-2α在GBM免疫抑制中的作用及其抑制剂PT2385的潜在治疗效果 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其肿瘤微环境（TME） | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | GL261小鼠GBM模型 | RNA测序数据、流式细胞数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了GL261小鼠模型 |
| 2049 | 2025-03-21 |
Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast
2025-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57911-6
PMID:40097446
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了酵母在渗透适应过程中的转录动态，揭示了渗透响应程序的高度异质性及其对细胞适应策略的影响 | 首次系统地研究了酵母在渗透适应过程中转录异质性的分子机制及其对细胞适应策略的影响，并通过RNA条形码删除突变体分析确定了影响转录异质性的遗传因素 | 研究仅限于酵母模型，未涉及其他生物或更复杂的多细胞系统 | 揭示酵母在渗透适应过程中转录异质性的分子机制及其对细胞适应策略的影响 | 酵母细胞 | 分子生物学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 超过300个RNA条形码删除突变体 |
| 2050 | 2025-03-21 |
Unraveling shared diagnostic genes and cellular microenvironmental changes in endometriosis and recurrent implantation failure through multi-omics analysis
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93146-7
PMID:40097519
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞测序数据，识别了子宫内膜异位症（EMs）和反复植入失败（RIF）之间的共享诊断基因和细胞微环境变化 | 首次通过多组学分析揭示了EMs和RIF之间的共享诊断基因和细胞微环境变化，并利用机器学习算法筛选出PDIA4和PGBD5作为共享诊断生物标志物 | 研究结果需要在更大的队列中进行验证，并进一步探索其治疗潜力 | 探索EMs和RIF之间的共享诊断基因和细胞微环境变化，以提供早期诊断和靶向治疗的新途径 | 子宫内膜异位症（EMs）和反复植入失败（RIF） | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 转录组测序、单细胞测序、机器学习算法（RF和XGBoost）、基因集富集分析（GSEA）、竞争性内源RNA（ceRNA）网络分析 | Random Forest (RF)、XGBoost | 转录组数据、单细胞测序数据 | NA |
| 2051 | 2025-03-21 |
Exploring mitochondrial and ferroptotic mechanisms for systemic lupus erythematosus biomarker identification and therapy
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93872-y
PMID:40097571
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研究论文 | 本研究通过分析系统性红斑狼疮（SLE）的线粒体和铁死亡相关机制，探索了SLE的生物标志物识别和治疗方法 | 结合单细胞RNA测序、高维加权相关网络分析和机器学习算法，开发了高预测准确性的诊断模型，并提出了Doxorubicin可能通过影响诊断生物标志物发挥治疗作用的新见解 | 研究主要依赖于公开的微阵列数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 探索系统性红斑狼疮的分子机制，开发有效的治疗策略 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权相关网络分析（hdWGNCA）、机器学习算法、分子对接研究 | 预测诊断模型 | 基因表达数据 | 从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载的微阵列数据集 |
| 2052 | 2025-03-21 |
Neutrophil extracellular trap-derived double-stranded RNA aggravates PANoptosis in renal ischemia reperfusion injury
2025-Mar-17, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02145-8
PMID:40098148
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）衍生的双链RNA在肾缺血再灌注损伤（IRI）中加剧PANoptosis的机制 | 首次揭示了NETs通过其衍生的双链RNA和TLR3受体在肾IRI中加剧PANoptosis的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探索肾缺血再灌注损伤中PANoptosis的具体机制及其调控因素 | 肾缺血再灌注损伤模型小鼠的近端肾小管上皮细胞（PTs） | 生物医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 使用NETs缺失的Pad4小鼠模型 |
| 2053 | 2025-03-21 |
Metabolic state uncovers prognosis insights of esophageal squamous cell carcinoma patients
2025-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06087-0
PMID:40098145
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研究论文 | 本研究通过整合代谢物-蛋白质相互作用网络和多尺度转录组数据，首次全面绘制了食管鳞状细胞癌（ESCC）微环境的代谢景观 | 首次全面绘制ESCC微环境的代谢景观，并重新定义了ESCC的预后亚型，识别了关键的代谢物-蛋白质相互作用途径 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 探索ESCC微环境中的代谢状态及其与预后的关系 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 癌症代谢 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 64个ESCC样本中的208,659个细胞，以及两个独立队列中的79和119个样本 |
| 2054 | 2025-03-21 |
Exploring and mitigating shortcomings in single-cell differential expression analysis with a new statistical paradigm
2025-Mar-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03525-6
PMID:40098192
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研究论文 | 本文提出了一种新的统计框架GLIMES，用于改进单细胞转录组学中的差异表达分析，解决了现有方法在零值过多、标准化、供体效应和累积偏差方面的主要挑战 | 提出了GLIMES框架，利用UMI计数和零比例在广义泊松/二项混合效应模型中考虑批次效应和样本内变异，显著改进了差异表达分析的性能 | 尽管GLIMES在多个实验场景中表现出色，但其在不同单细胞数据集上的通用性和计算效率仍需进一步验证 | 改进单细胞转录组学中的差异表达分析方法，解决现有方法的局限性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 广义泊松/二项混合效应模型 | 单细胞RNA测序数据 | 三个案例研究和模拟实验，涉及不同细胞类型、组织区域和细胞状态的比较 |
| 2055 | 2025-03-21 |
New insights into cancer immune checkpoints landscape from single-cell RNA sequencing
2025-Mar-13, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189298
PMID:40088992
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review | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示癌症免疫检查点景观中的新见解，特别是在免疫检查点阻断治疗前后的免疫浸润模式 | 利用单细胞RNA测序技术高分辨率描绘了免疫检查点之间的功能相互作用，揭示了免疫检查点阻断治疗中肿瘤微环境的异质性 | 未提及具体的研究样本量或实验数据，可能缺乏定量分析 | 探讨免疫检查点阻断治疗在肿瘤免疫治疗中的效果及其失败的原因 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | digital pathology | cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA sequencing data | NA |
| 2056 | 2025-03-21 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing identifies APOC1 as a biomarker and therapeutic target for G0/G1 cell cycle arrest in cholangiocarcinoma
2025-Mar-08, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111028
PMID:40064358
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序技术，识别出APOC1作为胆管癌G0/G1细胞周期阻滞的生物标志物和治疗靶点 | 首次将APOC1识别为胆管癌G0/G1期细胞的特征基因，并通过实验验证其通过抑制Wnt/β-catenin信号通路诱导G0/G1期阻滞的机制 | 未明确APOC1在胆管癌G0/G1期细胞中的具体分子机制 | 探索胆管癌G0/G1期细胞的生物标志物及其分子机制 | 胆管癌细胞 | 生物信息学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulkRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量 |
| 2057 | 2025-03-21 |
Independent signaling pathways provide a fail-safe mechanism to prevent tumorigenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640798
PMID:40093137
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了促增殖信号对上皮细胞稳态的影响，揭示了EGFR-Ras和Hh信号通路在肿瘤发生中的独立作用 | 揭示了非相互作用的信号通路在转录水平上如何汇聚以防止恶性细胞行为的新机制 | 研究主要基于果蝇滤泡细胞系，可能需要在哺乳动物系统中进一步验证 | 研究促增殖信号对上皮细胞稳态的影响及其在肿瘤发生中的作用 | 果蝇滤泡细胞系 | 分子生物学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2058 | 2025-03-21 |
A Phase I Clinical Trial Adding OX40 Agonism to In Situ Therapeutic Cancer Vaccination in Patients with Low-Grade B-cell Lymphoma Highlights Challenges in Translation from Mouse to Human Studies
2025-Mar-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2770
PMID:39745391
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研究论文 | 本文报告了一项I期临床试验，评估将OX40激动剂加入原位治疗性癌症疫苗对低级别B细胞淋巴瘤患者的效果 | 首次在临床试验中将OX40激动剂与TLR9激动剂SD101联合使用，探索其在人类中的效果 | 临床结果未达到预期的临床前效果，可能由于临床前和临床试剂的差异以及T细胞亚群的复杂生物学特性 | 测试OX40激动剂与TLR9激动剂SD101联合治疗低级别B细胞淋巴瘤的安全性和有效性 | 低级别B细胞淋巴瘤患者 | 癌症免疫治疗 | B细胞淋巴瘤 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 临床数据 | 14名患者 |
| 2059 | 2025-03-21 |
The trabecular and compact myocardium of adult vertebrate ventricles are transcriptionally similar despite morphological differences
2025-Mar, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15296
PMID:39934982
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研究论文 | 本研究通过转录组学方法探讨了成年脊椎动物心室中致密心肌和小梁心肌的转录相似性，尽管它们在形态上存在差异 | 揭示了成年心脏中致密心肌和小梁心肌在转录水平上的相似性，挑战了传统观点 | 研究主要基于转录组数据，未涉及功能验证实验 | 探讨成年脊椎动物心室中致密心肌和小梁心肌的转录相似性 | 小鼠、人类、斑马雀、斑马鱼和金枪鱼的心脏组织 | 生物信息学 | NA | 转录组学、空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种脊椎动物的心脏组织样本 |
| 2060 | 2025-03-21 |
Comprehensive biomarker profiles in hematological malignancies: improving diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Mar, Biomarkers in medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/17520363.2025.2471745
PMID:40015744
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综述 | 本文综述了血液系统恶性肿瘤中的生物标志物，及其在诊断、预后和治疗中的应用 | 介绍了新兴的生物标志物，如PCR和NGS等先进分子技术，以及质谱和单细胞RNA测序技术，这些技术显著提高了诊断准确性并推动了靶向治疗的发展 | NA | 提供血液系统恶性肿瘤中生物标志物的全面概述，探讨其诊断和治疗应用及未来发展方向 | 血液系统恶性肿瘤 | 数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | PCR, NGS, 质谱, 单细胞RNA测序 | NA | 分子数据 | NA |