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当前共找到 40969 篇文献，本页显示第 2041 - 2060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2041 | 2026-06-07 |
Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004
PMID:33862275
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学阐明小鼠结肠炎模型中炎症消退的动态机制，发现Serpina3n在基质细胞中特异性表达并促进炎症消退 | 首次通过单细胞转录组学揭示基质细胞在结肠炎症消退中的关键作用，并发现Serpina3n作为丝氨酸蛋白酶抑制剂能通过靶向弹性蛋白酶促进炎症消退，提供了新的治疗靶点 | 研究基于化学诱导小鼠模型，可能无法完全代表人类炎症性肠病的复杂性；仅验证了Serpina3n的短期作用，长期效果尚需进一步研究 | 阐明结肠炎症过程中不同细胞类型及其相互作用的动态变化，探索炎症消退的潜在机制 | 化学诱导结肠炎小鼠模型的结肠组织细胞（包括基质细胞、免疫细胞等） | 生物信息学, 单细胞基因组学 | 炎症性肠病（结肠炎） | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA表达数据 | 小鼠结肠炎模型样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2042 | 2026-06-07 |
Jointly Embedding Multiple Single-Cell Omics Measurements
2019-Sep-03, Algorithms in bioinformatics : ... International Workshop, WABI ..., proceedings. WABI (Workshop)
DOI:10.4230/LIPIcs.WABI.2019.10
PMID:34632462
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研究论文 | 提出一种无监督流形对齐算法MMD-MA，用于整合不同单细胞测序技术测量的多个数据集 | MMD-MA无需任何数据模态间的对应信息，即可对齐不同单细胞测量数据，并允许整合异质性数据类型如基因表达、DNA可及性、染色质组织、甲基化和成像数据 | 未提供具体局限性信息 | 开发一种整合不同单细胞测量数据的方法，实现跨模态单细胞分析 | 单细胞基因表达和甲基化数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 无监督流形对齐算法 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 2043 | 2026-06-06 |
T cell populations are negatively correlated with natural killer and macrophage cell populations in aspirate samples of peripheral lymphadenopathies
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2624191
PMID:41606824
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序对结核病患者肉芽肿性淋巴结进行细胞和通讯网络分析 | 首次通过细针抽吸物的单细胞RNA测序描述结核肉芽肿性淋巴结的细胞组成和通讯网络，并发现T细胞与NK细胞及巨噬细胞/树突状细胞群呈负相关关系，且可检测到结核分枝杆菌RNA并识别单个感染细胞 | NA | 描述结核病患者肉芽肿性淋巴结的细胞类型和通讯网络特征 | 结核病患者的外周淋巴结细针抽吸样本 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19名结核病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2044 | 2026-06-06 |
Identification of key driver genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension by single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-07-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153869
PMID:42068750
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序与实验验证，鉴定特发性肺动脉高压的关键驱动基因 | 整合单细胞RNA测序分析与体内外验证，首次发现COL1A1、MYL9、COL1A2和TPM2四个枢纽基因在IPAH中显著上调，并验证了其沉默可抑制PASMC增殖和迁移 | 未提及 | 鉴定特发性肺动脉高压中驱动肺动脉平滑肌细胞异常增殖和迁移的关键基因 | 特发性肺动脉高压患者及单侧气肿诱导的PAH大鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | IPAH患者样本（具体数量未提及）及MCT诱导的PAH大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE169471数据集来自Gene Expression Omnibus |
| 2045 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and in vivo investigation reveal the role of ANXA1 in intestinal barrier dysfunction during heat stroke by mediating neutrophil-monocyte interaction and regulating the TLR4/ERK/NF-κB pathway
2026-07-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153873
PMID:42070539
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学与体内实验，揭示ANXA1在中暑引起的肠屏障功能障碍中通过调控中性粒细胞-单核细胞相互作用及TLR4/ERK/NF-κB通路的作用 | 首次结合单细胞转录组学与体内实验阐明ANXA1-FPR2轴在中暑肠屏障功能障碍中的保护机制，发现中性粒细胞-单核细胞相互作用的关键角色 | 未提及研究局限性 | 探究ANXA1在中暑诱导的肠屏障功能障碍中的作用机制 | 中暑患者和炎症性肠病患者的结肠组织细胞，以及中暑小鼠模型 | 生物信息学 | 中暑 | 单细胞RNA测序, 组织染色, 流式细胞术, ELISA, 蛋白印迹, 免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 蛋白表达数据 | 中暑患者与健康对照的单细胞RNA测序数据，以及小鼠结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2046 | 2026-06-06 |
Dissecting Pirtobrutinib Resistance in Mantle Cell Lymphoma Through Single-Cell Multi-Omics
2026-Jul, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70304
PMID:41998849
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示套细胞淋巴瘤中Pirtobrutinib耐药的分子机制 | 首次通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq和DNA-seq的多组学分析，揭示了PBN耐药的遗传和非遗传双重机制，并识别出黏连蛋白复合体核心成分RAD21和SMC3作为潜在治疗靶点 | 未明确说明 | 阐明Pirtobrutinib在套细胞淋巴瘤中产生耐药的分子动态机制 | 套细胞淋巴瘤患者的纵向样本 | 单细胞多组学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, DNA测序数据 | 套细胞淋巴瘤患者纵向样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞DNA-seq | NA | NA |
| 2047 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell multi-omics analysis identifies fibroblast-like smooth muscle cells as a key driving phenotypic switching during aortic aneurysm progression
2026-Jul, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2026.05.006
PMID:42140576
|
研究论文 | 整合单细胞多组学分析发现成纤维细胞样平滑肌细胞是驱动主动脉瘤进展中表型转换的关键细胞 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，系统鉴定出成纤维细胞样平滑肌细胞作为祖细胞样群体，并通过KAT5介导的代谢-表观遗传调控轴驱动主动脉瘤中平滑肌细胞表型转换 | 研究主要基于人主动脉组织样本的体外和动物模型验证，可能无法完全模拟体内复杂微环境，且样本量有限 | 探索主动脉瘤进展中平滑肌细胞的异质性和表型转换的调控机制 | 健康和主动脉瘤患者的人主动脉组织，以及人主动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 主动脉瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光染色, 动物模型, 体外实验 | 轨迹推断模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 人主动脉组织样本（健康与患病）及多种细胞亚群 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞ATAC测序 |
| 2048 | 2026-06-06 |
Spatial transcriptomics and multi-omics approach to decipher age-related tissue microenvironments and therapeutics in neurodegeneration and aging
2026-Jul, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103189
PMID:42214504
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在解析年龄相关的神经退行性疾病组织微环境中的应用 | 强调空间转录组学作为连接分子发现与临床应用的桥梁技术，整合多组学与临床影像建立综合特征，用于早期疾病检测和患者分层 | 未明确讨论技术局限性，但提及衰老特异性挑战 | 探讨空间转录组学在揭示衰老相关病理机制和开发精准治疗干预中的应用 | 年龄相关的神经退行性病变和小胶质细胞微环境 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2049 | 2026-06-06 |
Benzene-induced myelosuppression confers a survival advantage to hematopoietic progenitors: Single-cell analysis of malignant transformation dynamics in a murine model
2026-07-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142337
PMID:42139775
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析苯诱导小鼠骨髓抑制向恶性转化的动态过程 | 首次通过单细胞分析揭示苯诱导骨髓抑制向白血病转化的关键时间窗及S100a8/S100a9相关转录程序作为早期分子特征 | 未在文献中明确提及 | 解析苯诱导骨髓抑制向快速恶性转化的演变机制 | Mll-Af9嵌合体小鼠模型及苯暴露后的造血干细胞/祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mll-Af9嵌合体小鼠经慢性苯吸入暴露，具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2050 | 2026-06-06 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Proteomics to Unravel Stem Cell Heterogeneity: Implications for Precision Regenerative Medicine
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11116-6
PMID:41951880
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2051 | 2026-06-06 |
Machine Learning-Based Identification of Molecular Signatures in PTOA Cell Subtypes via Single-Cell Transcriptomics in a Mouse Model
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11121-9
PMID:41979832
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2052 | 2026-06-06 |
Hypoplastic Left Heart Syndrome Cardiomyocytes Exhibit Intrinsic Stress Vulnerabilities and Augmented Stress Responses in vitro
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11127-3
PMID:42089915
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研究论文 | 该论文研究了左心发育不全综合征（HLHS）心肌细胞在体外表现出的内在应激脆弱性和增强的应激反应 | 首次通过单细胞RNA测序和功能分析，揭示HLHS患者诱导多能干细胞来源的心肌细胞在转录水平上的内在脆弱性和对特定应激源的敏感性增强，为理解基因-环境相互作用在HLHS发病机制中的角色提供了新见解 | 研究仅基于体外模型（hiPSC-CMs），可能无法完全复制体内复杂的微环境；且样本量有限，可能限制结果的普遍性 | 识别HLHS患者与健康对照者心肌细胞之间的分子和功能差异，以揭示可能导致HLHS表型的潜在脆弱性 | 来自HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞（hiPSC-CMs） | 数字病理学 | 先天性心脏病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2053 | 2026-06-06 |
TREM1+ Neutrophils Determine Immunosuppressive Microenvironment and Immunotherapy Response in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70726
PMID:42244441
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术，揭示TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中驱动免疫抑制微环境并影响免疫治疗反应 | 首次确定TREM1+中性粒细胞亚群在肝细胞癌中作为关键免疫抑制细胞，通过CyTOF全面表征其功能表型，并证明靶向TREM1可增强抗PD-1抗体疗效 | 未在更大样本量或不同种族人群中验证，且TREM1抑制剂VJDT的具体作用机制需进一步阐明 | 识别驱动肝细胞癌进展的关键中性粒细胞亚群并探索其免疫治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的中性粒细胞亚群，特别是TREM1+中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质组学数据 | 肝细胞癌患者队列（具体数量未在摘要中提及） | Fluidigm, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | 10x Chromium, CyTOF | 10x Chromium用于scRNA-seq, CyTOF用于质谱流式分析 |
| 2054 | 2026-06-06 |
Integrative transcriptomics and single-cell analysis unravel the senescence-reversing mechanism of quercetin in osteoarthritic chondrocytes
2026-06-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153831
PMID:42030882
|
研究论文 | 整合转录组学和单细胞分析揭示槲皮素在骨关节炎软骨细胞中逆转衰老的机制 | 首次整合转录组学和单细胞测序，分析p53介导的细胞周期阻滞和SASP驱动的炎症在骨关节炎软骨细胞衰老中的核心作用，并揭示槲皮素通过靶向p53信号通路调节氧化应激/炎症微环境从而发挥抗衰老效果 | 缺乏体内实验验证，尚不能断言槲皮素能延缓软骨退化或进行临床应用 | 研究槲皮素逆转骨关节炎软骨细胞衰老的机制 | 骨关节炎软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 转录组学, 单细胞测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | GSE98918和GSE117999数据集中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2055 | 2026-06-06 |
The exploration to identify key molecules in the interaction between endothelial cells and mono-macrophages in atherosclerosis based on the single cell transcriptome
2026-Jun-05, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-026-06031-0
PMID:42243679
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研究论文 | 基于单细胞转录组数据探究动脉粥样硬化中内皮细胞与单核巨噬细胞相互作用的关键分子 | 通过单细胞RNA测序分析钙化动脉粥样硬化核心斑块与邻近正常组织，识别出MK、GALECTIN和SPP1等信号通路在动脉粥样硬化中显著改变，其中MDK-NCL配体-受体对在疾病相关细胞亚群中上调，并通过体外共培养实验验证 | 初步验证仅使用体外Transwell共培养实验，缺乏体内动物实验或临床样本验证 | 识别动脉粥样硬化中内皮细胞与单核巨噬细胞相互作用的关键信号通路和分子，为冠心病防治提供候选靶点 | 钙化动脉粥样硬化核心斑块和患者匹配的近端相邻颈动脉组织中的内皮细胞和单核巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 动脉粥样硬化、冠心病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 已发表的钙化动脉粥样硬化核心斑块和邻近颈动脉组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2056 | 2026-06-06 |
Pan-cancer single-cell and spatial transcriptomics analyses delineate response-associated heterogeneity and therapeutic targets of tumor-infiltrating B cells following immune checkpoint blockade
2026-Jun-05, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04449-1
PMID:42247075
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研究论文 | 建立了泛癌种免疫检查点阻断反应B细胞图谱，揭示了肿瘤浸润B细胞的异质性和治疗靶点 | 首次构建了泛癌种免疫检查点阻断反应B细胞图谱，覆盖24种癌症类型，识别24个B细胞亚群并揭示其比例动态和转录组特征 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 探究肿瘤浸润B细胞在不同癌症类型中的生物学功能、空间微环境及其与免疫检查点阻断反应的关系 | 肿瘤浸润B细胞及其亚群 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | Geneformer模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 688个单细胞转录组（241,645个细胞，来自24种癌症类型） | NA | 单细胞RNA-seq， 空间转录组学 | NA | NA |
| 2057 | 2026-06-06 |
Human PSC-derived sinoatrial node-cardiac plexus assembloids model innervation-associated maturation of pacemaker systems
2026-Jun-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.04.018
PMID:42143017
|
研究论文 | 通过整合人类多能干细胞来源的窦房结类器官与心脏神经节丛类器官，构建SAN-plexus组装体模型，研究起搏器系统的神经支配相关成熟过程 | 首次构建人类SAN-plexus组装体模型，整合空间转录组学与功能性分析，发现prosaposin-GPR37信号通路促进起搏器成熟 | NA | 建立体外模拟神经-窦房结相互作用的平台，研究起搏器发育和疾病的神经调控机制 | 人类多能干细胞衍生的窦房结类器官和心脏神经节丛类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | 类器官组装体 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2058 | 2026-06-06 |
3D chromatin architecture-related genes orchestrate LUAD evolution and therapy resistance: insights from integrative machine learning and spatial single-cell mapping
2026-Jun-04, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01914-z
PMID:42240917
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研究论文 | 整合机器学习和空间单细胞测序揭示3D染色质结构相关基因在肺腺癌进展和治疗耐药中的调控作用 | 首次系统鉴定并验证5个3D染色质结构相关基因（SMC3、RAD21、FOXM1、MYBL2和MTA3）在肺腺癌术后复发、索拉非尼治疗反应及肿瘤进展中的关键调控作用，并利用空间转录组学和虚拟单基因扰动分析揭示其在肿瘤增殖细胞中的功能机制 | 研究主要基于公开数据集和生物信息学分析，缺乏临床样本的独立大规模验证，且未深入探讨这些基因在染色质三维结构中的具体调控机制 | 探索3D染色质结构相关基因在肺腺癌术后复发、索拉非尼治疗反应、肿瘤进展及肿瘤微环境调控中的作用 | 肺腺癌（LUAD）患者肿瘤组织及周边正常组织 | 机器学习 | 肺腺癌（lung cancer） | 转录组测序（RNA-seq）、空间转录组测序、单细胞测序、集成机器学习 | 集成机器学习模型 | 基因表达数据（转录组）、单细胞数据、空间转录组数据 | TCGA-LUAD队列及7个GEO数据集（GSE31210、GSE30219、GSE33072、GSE27389、GSE115002、GSE83836、GSE31428），含独立验证队列 | NA | 单细胞转录组测序（single-cell RNA-seq）、空间转录组测序（spatial transcriptomics） | 10x Chromium、10x Visium（推断，基于单细胞和空间测序常用平台） | NA |
| 2059 | 2026-06-06 |
Culture-specific transcriptional drifts limit the fidelity of organoid infection models
2026-Jun-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014321
PMID:42241455
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研究论文 | 通过时间序列转录组分析揭示培养诱导的转录漂移影响了患者源回肠类器官在分枝杆菌感染模型中的保真度 | 首次使用人类肠道类器官模拟副结核分枝杆菌感染并表征上皮转录组反应，发现培养相关转录漂移是基因表达变化的主要驱动因素，并通过空间转录组学揭示感染可选择性抵消培养诱导的基因表达变化 | 培养诱导的转录漂移和福斯克林处理均对类器官感染模型产生显著干扰，可能掩盖病原体特异性响应 | 探究培养诱导的人工产物对肠道类器官感染模型的影响 | 患者源回肠类器官 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 患者源回肠类器官，包含MAP感染、FSK处理和未处理对照组的48小时时间序列样本 | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2060 | 2026-06-06 |
DEHP-induced male reproductive toxicity: Evidence from population studies, animal experiments, and multi-omics profiling
2026-Jun-04, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120320
PMID:42241798
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研究论文 | 通过人群研究、动物实验和多组学分析评估DEHP暴露与男性生殖毒性的关联 | 采用多层次整合策略，结合NHANES人群数据、大鼠实验、转录组机器学习和单细胞RNA-seq网络推断，系统揭示DEHP生殖毒性机制并预测候选化合物 | 熊果酸的验证仅基于计算模拟，缺乏实验验证 | 探究DEHP暴露与男性睾酮缺乏的关联及分子机制 | 成年男性（NHANES 2013-2016）和雄性SD大鼠 | 机器学习 | 男性生殖毒性 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 | 逻辑回归, 集成机器学习 | 文本, 基因表达数据 | NHANES 2013-2016成年男性（具体数量未提及）；Sprague-Dawley大鼠（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |