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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2041 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of pig lung transplantation reveals macrophage ferroptosis in lung ischemia-reperfusion injury
2025-Sep, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2025.04.011
PMID:40262727
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研究论文 | 通过猪肺移植模型的单细胞RNA测序研究巨噬细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用 | 首次建立猪原位单肺移植模型模拟长时间冷缺血再灌注损伤,并通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞铁死亡的关键作用 | 研究样本量有限,需要进一步验证巨噬细胞铁死亡的具体分子机制 | 研究肺缺血再灌注损伤的病理机制并建立大型动物模型 | 猪肺移植模型中的肺组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序,透射电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | 猪肺移植模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2042 | 2025-10-06 |
Association Between T2DM, TyG Index, Multiple Sclerosis, and Rheumatoid Arthritis: Insights into Potential Mechanisms
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04961-y
PMID:40279037
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析探索2型糖尿病、胰岛素抵抗与自身免疫疾病的因果关系及潜在机制 | 首次结合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序综合分析T2DM、TyG指数与自身免疫疾病的因果关系及免疫细胞介导机制 | 研究基于汇总级GWAS数据,无法完全排除潜在混杂因素的影响 | 探索2型糖尿病和胰岛素抵抗与自身免疫疾病的因果关系及免疫机制 | 2型糖尿病、TyG指数、多发性硬化症、类风湿关节炎及特定标志免疫细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 孟德尔随机化分析, 贝叶斯共定位, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 多个GWAS研究的汇总数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2043 | 2025-10-06 |
eIF3f promotes tumour malignancy by remodelling fatty acid biosynthesis in hepatocellular carcinoma
2025-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.02.045
PMID:40154622
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研究论文 | 本研究揭示了eIF3f通过稳定ACSL4促进肝细胞癌脂肪酸生物合成和肿瘤恶性进展的分子机制 | 首次发现eIF3f通过K48连接的去泛素化稳定ACSL4,促进脂肪酸生物合成,并阐明其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 需要进一步的临床研究来确认eIF3f靶向治疗在人类患者中的疗效 | 确定肝细胞癌中脂肪酸代谢的特征及其分子机制 | 肝细胞癌组织、类器官模型、多物种肿瘤模型 | 肿瘤代谢 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,代谢流分析,透射电子显微镜,飞行时间质谱流式细胞术,多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,代谢物数据,蛋白质数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
2044 | 2025-10-06 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的新机制 | 首次在收集淋巴管中表征TRPV4表达谱,发现TRPV4+髓系细胞与淋巴管细胞间的相互作用新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本数量有限 | 探究TRPV4通道在淋巴管收缩功能调控中的作用机制 | 小鼠收集淋巴管和乳腺癌相关淋巴水肿患者活检组织 | 单细胞生物学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 细胞内钙活性测量 | Trpv4fx/fx转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据, 功能实验数据 | 小鼠收集淋巴管单细胞数据集和患者淋巴水肿活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2045 | 2025-10-06 |
Harnessing Calmodulin-Related Genes to Build a Prognostic Model in Esophageal Squamous Cell Carcinoma for a Comprehensive Analysis of Single-Cell Immune Characteristics and Drug Efficacy
2025-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000561
PMID:40375794
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研究论文 | 基于钙调蛋白相关基因构建食管鳞状细胞癌预后模型,并分析单细胞免疫特征和药物疗效 | 首次利用钙调蛋白相关基因构建ESCC预后模型,结合单细胞测序分析基因表达模式,并通过CETSA实验验证药物与靶点的结合稳定性 | 研究基于TCGA数据库,样本量有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发食管鳞状细胞癌的预后预测模型并探索潜在治疗药物 | 食管鳞状细胞癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞测序,qPCR,LASSO Cox回归,多变量Cox回归,GSEA富集分析,分子对接,CETSA | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | TCGA-ESCC数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2046 | 2025-10-06 |
Identifying Key Plasma Proteins in the Onset of Parkinson's Disease: Proteome-Wide Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05041-x
PMID:40380075
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研究论文 | 通过蛋白质组范围孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析识别帕金森病发病关键血浆蛋白 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序技术系统筛选帕金森病相关血浆蛋白,并揭示其在脑细胞类型中的差异表达模式 | 需要大量实验验证来确认这些蛋白质作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 识别帕金森病发病机制中的关键血浆蛋白,探索诊断标志物和治疗靶点 | 2923种血浆蛋白与帕金森病的因果关系 | 生物信息学 | 帕金森病 | 孟德尔随机化分析、共定位分析、SMR分析、HEIDI检验、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 英国生物银行数据库中的2923种血浆蛋白 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2047 | 2025-10-06 |
The Role of HbA1c in Parkinson's Disease: An Integrative Analysis by Single-Cell, Bulk Transcriptome and Mendelian Randomization
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05063-5
PMID:40397357
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组、批量转录组和孟德尔随机化分析,探讨HbA1c与帕金森病的关系并识别潜在诊断标志物 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和孟德尔随机化方法系统研究HbA1c与帕金森病的因果关系 | 研究依赖于公开数据库数据,样本来源和数量可能受限 | 探索HbA1c与帕金森病预后的因果关系并识别诊断生物标志物 | 帕金森病患者与对照组的基因表达数据和遗传变异数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 机器学习 | 逆方差加权法, 诺莫图, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单核苷酸多态性数据 | 使用GSE20292和GSE157783数据集,包含223个独立SNPs | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
2048 | 2025-10-06 |
SEC61G promotes colorectal cancer progression by regulating cytosolic Ca2+ concentration
2025-Sep, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02259-3
PMID:40413702
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研究论文 | 本研究揭示了SEC61G通过调节胞质钙离子浓度促进结直肠癌进展的机制 | 首次阐明SEC61G通过调节胞质Ca2+浓度激活EGFR通路促进结直肠癌进展的具体分子机制 | 机制研究仍待深入,临床转化价值需要进一步验证 | 探究SEC61G在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌细胞系、肿瘤组织及患者样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、RT-qPCR、免疫组化、单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 基因组数据、基因表达数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | TCGA数据集中的结直肠癌样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组测序 | NA | NA |
2049 | 2025-10-06 |
Spatial omics technology potentially promotes the progress of tumor immunotherapy
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03075-5
PMID:40456924
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综述 | 本文全面概述了空间组学技术的起源、分类和特点,并探讨其在肿瘤免疫治疗中的应用前景 | 强调空间组学技术相比单细胞测序在保留空间背景和整合多模态分析方面的优势,提出结合其他技术可发现被忽视的治疗靶点 | 临床转化面临挑战,技术应用仍存在局限性 | 探讨空间组学技术如何促进肿瘤免疫治疗的进展 | 肿瘤微环境、B细胞和T细胞、三级淋巴结构 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间组学分析 | NA | 空间多模态数据 | NA | NA | 空间组学 | NA | NA |
2050 | 2025-10-06 |
Using proteomics and single-cell sequencing to analyze the pathogenesis of recurrent implantation failure associated with uterine natural killer cells
2025-Sep, Archives of gynecology and obstetrics
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00404-025-08074-8
PMID:40514455
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞测序技术分析了复发性种植失败与子宫自然杀伤细胞的关联机制 | 首次整合蛋白质组学和单细胞测序数据,鉴定出与RIF相关的三个关键基因(AMPD3、H6PD、PAK2)及其调控机制 | 样本量较小(6例RIF患者和6例对照),需要更大规模研究验证 | 探索复发性种植失败的分子机制,特别关注子宫自然杀伤细胞的作用 | 复发性种植失败患者的子宫内膜组织和自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 12例子宫内膜组织样本(6例RIF患者和6例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2051 | 2025-10-06 |
Multi-omics reveals the polyethylene terephthalate carcinogenicity: Cancer progression and immune microenvironment
2025-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118522
PMID:40532600
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研究论文 | 通过多组学方法系统研究聚乙烯 terephthalate (PET) 的致癌机制及其对肿瘤微环境的影响 | 首次整合网络毒理学、机器学习、分子对接、单细胞RNA测序和空间转录omics 系统揭示PET的致癌机制 | 未明确说明样本来源和具体样本数量 | 探究PET塑料的致癌机制及其在肿瘤发生发展中的作用 | PET相关致癌靶点、肿瘤细胞、免疫细胞 | 计算生物学 | 癌症 | 网络毒理学, 机器学习, 分子对接, 单细胞RNA测序, 空间转录omics, 克隆形成实验, western blotting | 机器学习算法 | 组学数据, 分子对接数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录omics | NA | NA |
2052 | 2025-10-06 |
Insights into tissue- and cell type-specific effects of Grb10 on pig skeletal muscle growth by multi-omics analysis
2025-Sep, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2910-7
PMID:40545505
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研究论文 | 通过多组学分析揭示Grb10基因在猪骨骼肌生长中的组织和细胞类型特异性效应 | 首次结合基因组学、转录组学、表观基因组学和单细胞转录组学系统分析GRB10在肥胖型和瘦肉型猪肌肉组织中的特异性调控机制 | 研究主要聚焦于猪模型,人类中的保守性验证仍需进一步研究 | 探索GRB10基因调控肌肉生长的分子机制及其在肥胖与瘦肉型猪中的差异 | 肥胖型和瘦肉型家猪的骨骼肌组织及细胞 | 多组学整合分析 | 肥胖相关肌肉发育异常 | 基因组学, 转录组学, 表观基因组学, 单细胞转录组学, 双荧光素酶报告实验, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因组序列, 转录组数据, 表观基因组数据, 单细胞RNA测序数据 | 肥胖型和瘦肉型猪品种的肌肉组织样本 | NA | 单核RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
2053 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of IGF2BP2 and PRMT5 in gallbladder cancer progression: insights from multi-omics analysis
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03062-w
PMID:40555776
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示IGF2BP2-PRMT5轴在胆囊癌进展中的关键作用 | 首次发现IGF2BP2通过m6A修饰稳定PRMT5表达,并阐明其通过AKT/mTOR通路调控脂质代谢重编程和免疫逃避的新机制 | NA | 阐明驱动胆囊癌进展的分子机制并确定新的治疗靶点 | 胆囊癌细胞和人类化小鼠模型 | 多组学分析 | 胆囊癌 | 单细胞转录组学、高通量测序、蛋白质组学、m6A修饰分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2054 | 2025-10-06 |
CD8+GZMK+CD27+CCR7+ T cells mobilized by splenic sympathetic nerves aggravate brain ischemia‒reperfusion injury via CCL19-positive endothelial cells
2025-Sep, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01311-9
PMID:40659887
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研究论文 | 本研究揭示了脾交感神经通过动员GZMK+CD8+CD27+CCR7+ T细胞亚群经CCL19-CCR7轴加重脑缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现并命名了脑卒中相关的Tsa细胞亚群,阐明了脾交感神经-ADRB2信号通路和CCL19-CCR7趋化轴在脑缺血损伤中的新作用机制 | 研究主要基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究脾交感神经在脑缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗策略 | 急性缺血性脑卒中患者和短暂性大脑中动脉闭塞小鼠模型 | 免疫神经科学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 急性缺血性脑卒中患者和tMCAO小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
2055 | 2025-10-06 |
Methyl-CpG-binding domain as a protein interaction partner in promoter regulation and neurodevelopment through evolutionary expanded entanglement
2025-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00749.2024
PMID:40712661
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研究论文 | 本文探讨甲基结合域(MBD)作为蛋白质相互作用基序在启动子调控和神经发育中的作用 | 发现MBD可作为独立于甲基化DNA结合的蛋白质相互作用基序,并揭示其在脊椎动物中的进化扩展纠缠机制 | MBD3和GATAD2B亚复合物的非DNA结合生物学特性可能使其研究不够充分 | 研究MBD结构域在基因调控和神经发育中的进化保守功能 | MBD蛋白家族成员及其相互作用的NuRD复合物 | 表观遗传学 | 智力障碍综合征 | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, 批量组织分析 | NA | 基因组学数据, 转录组数据 | 超过1.15亿个单细胞和数千个批量组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
2056 | 2025-10-06 |
Expression profile of the ADHD risk gene ADGRL3 during human neurodevelopment and the effects of genetic variation
2025-Sep, The world journal of biological psychiatry : the official journal of the World Federation of Societies of Biological Psychiatry
DOI:10.1080/15622975.2025.2520518
PMID:40552428
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研究论文 | 本研究通过人诱导多能干细胞分化的皮质神经元,探究ADHD风险基因ADGRL3在人类神经发育过程中的表达谱及其遗传变异的影响 | 首次在人类神经发育过程中系统研究ADGRL3基因的表达模式,并揭示rs1397547 SNP对基因转录的调控作用 | 研究基于体外hiPSC分化模型,可能与体内神经发育存在差异 | 阐明ADGRL3基因在人类神经发育过程中的作用及其与ADHD发病机制的关系 | 人诱导多能干细胞分化的皮质神经元 | 神经发育生物学 | 注意缺陷多动障碍 | 单细胞RNA测序,hiPSC分化技术 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2057 | 2025-10-06 |
Mast Cells Drive Ferroptosis in Gastric Tumors as Key Players in the Tumor Immune Microenvironment
2025-Sep, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251366980
PMID:40831393
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研究论文 | 本研究通过整合转录组分析揭示了肥大细胞在胃癌肿瘤微环境中通过旁分泌信号促进铁死亡的关键作用 | 首次发现肥大细胞通过膜联蛋白和亲环素A等旁分泌信号在肿瘤微环境中促进铁死亡的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认机制 | 探究铁死亡与特定免疫细胞类型在胃癌中的功能联系 | 胃癌组织和相关免疫细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单样本基因集富集分析 | NA | 转录组数据 | TCGA-STAD数据集412例,GSE66229数据集300例,GSE223179共培养数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2058 | 2025-10-06 |
Mitochondrial One-Carbon Metabolism Drives CD34-Lineage Cells to Differentiate Into T Follicular Helper Cells to Form Tertiary Lymphoid Organs in Transplant Arteriosclerosis
2025-Aug-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体一碳代谢通过调控CD34谱系细胞向滤泡辅助T细胞分化,促进移植动脉粥样硬化中三级淋巴器官形成的机制 | 首次发现CD34谱系细胞是移植动脉中T细胞群的主要来源,并阐明线粒体一碳代谢关键酶MTHFD2在Tfh细胞分化中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究移植动脉粥样硬化中T滤泡辅助细胞的起源和调控机制 | 小鼠移植动脉模型中的CD34谱系细胞和T滤泡辅助细胞 | 免疫学 | 移植动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光染色, 超高效液相色谱, 高分辨率质谱代谢组学 | 谱系追踪小鼠模型, CD4+ T细胞特异性MTHFD2敲除小鼠 | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 流式细胞数据, 免疫组织化学数据 | 移植后2周和4周的小鼠动脉组织 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
2059 | 2025-10-06 |
Perturb-Multimodal: A platform for pooled genetic screens with imaging and sequencing in intact mammalian tissue
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.022
PMID:40513557
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研究论文 | 开发了一种结合成像和测序的多模态平台,用于在完整哺乳动物组织中进行大规模遗传筛选 | 首次实现了在完整组织中同时进行成像和测序的配对多模态遗传筛选方法 | 目前仅在小鼠肝脏中进行了应用验证 | 构建大规模多模态基因型-表型图谱,解析组织功能的遗传调控基础 | 小鼠肝脏组织中的数百种遗传扰动 | 机器学习 | NA | 单细胞测序,成像技术 | NA | 图像,基因表达数据 | 数百种遗传扰动的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | Perturb-Multimodal(Perturb-Multi)平台 |
2060 | 2025-10-06 |
Cholinergic neuronal activity promotes diffuse midline glioma growth through muscarinic signaling
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.031
PMID:40541184
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研究论文 | 本研究揭示了中脑胆碱能神经元通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现中脑胆碱能神经元活动通过M1/M3受体依赖方式促进弥漫性中线胶质瘤增殖,揭示了不同脑区特异性神经环路对肿瘤生长的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者中的临床相关性需要进一步验证 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、少突胶质前体细胞、中脑胆碱能神经元 | 神经肿瘤学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、药理学阻断、遗传学阻断 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据、神经活动记录 | DMG荷瘤小鼠模型及原代DMG样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |