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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2041 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines injury specific microenvironments and cellular interactions in kidney regeneration and disease
2024-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51186-z
PMID:39237549
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析小鼠肾脏缺血再灌注损伤中特定微环境的基因表达模式和细胞相互作用 | 首次应用空间转录组学揭示肾脏损伤中空间依赖的基因表达模式,并预测Clcf1-Crfl1在持续损伤的近端小管细胞与成纤维细胞间的分子相互作用 | 研究仅针对小鼠肾脏缺血再灌注损伤模型,未涉及其他类型肾脏损伤或人类样本 | 解析肾脏损伤修复过程中的分子通路和细胞相互作用机制 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2042 | 2025-10-06 |
Targeting Liver Epsins Ameliorates Dyslipidemia in Atherosclerosis
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609742
PMID:39253478
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型证明肝脏epsins通过介导PCSK9触发的LDLR降解促进动脉粥样硬化 | 首次揭示肝脏epsins在PCSK9介导的LDLR降解中的关键作用,并开发纳米颗粒包裹siRNA靶向治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 阐明肝脏epsins在促进动脉粥样硬化中的作用机制 | ApoE-/-基因背景的肝特异性epsin双敲除小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,纳米颗粒递送 | NA | 基因表达数据,蛋白质水平数据 | ApoE-/-和ApoE-/-/Liver-DKO小鼠肝脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2043 | 2025-10-06 |
SMARCA4 Loss and Mutated β-Catenin Induce Proliferative Lesions in the Murine Embryonic Cerebellum
2024-04-10, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1605-23.2024
PMID:38383496
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探究SMARCA4缺失和β-连环蛋白突变在小鼠胚胎小脑中诱导增殖性病变的机制 | 首次揭示β-连环蛋白突变单独可导致严重发育表型,并与SMARCA4缺失协同诱导小脑早期祖细胞增殖性病变 | 体外培养中双突变细胞未显示致瘤潜力,提示胚胎微环境对病变发展具有重要作用 | 解析异常WNT信号和SMARCA4缺陷诱导肿瘤发生机制 | 基因工程小鼠模型(BLBP-Cre小鼠) | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | DNA甲基化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 胚胎期E13.5至E16.5的小鼠小脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2044 | 2025-10-06 |
Decoding meningioma prognosis with multi-omics: macrophage diversity, immune-CNV interplay, and novel SPP1-targeted strategies
2025-Oct, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-05116-8
PMID:40522564
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研究论文 | 通过整合多组学数据对脑膜瘤进行预后分层,揭示巨噬细胞功能异质性和CNV驱动的免疫微环境差异 | 首次在脑膜瘤中整合DNA甲基化和单细胞转录组数据,识别SPP1作为巨噬细胞功能的关键调节因子 | 样本量相对有限,需要进一步验证SPP1靶向治疗的有效性 | 开发脑膜瘤预后分层系统并探索治疗靶点 | 302对配对脑膜瘤样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | DNA甲基化测序, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SCISSOR, scRank | 基因组数据, 转录组数据 | 302对配对脑膜瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
2045 | 2025-10-06 |
A prognostic gene signature and subtype-specific drug sensitivity in TNBC revealed by single-cell and bulk RNA sequencing: Insights into stemness and tumor heterogeneity
2025-Oct, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.06.007
PMID:40541706
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研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序揭示TNBC的预后基因特征和亚型特异性药物敏感性,深入了解干性和肿瘤异质性 | 整合多组学方法识别出具有高度可塑性的癌症上皮亚群,建立了四基因预后特征,并发现与染色质重塑相关的独特分子亚型 | 研究依赖于现有数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究三阴性乳腺癌的细胞异质性和耐药机制 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk转录组学,表观基因组学,突变分析 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | GSE176078数据集和TCGA-BRCA数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
2046 | 2025-09-03 |
Corrigendum to "Identification and validation of synergistic drug strategies targeting macrophage polarization in triple-negative breast cancer via single-cell transcriptomics and deep learning" [Translational Oncology 2025 Jun 26;59:102457]
2025-Oct, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102474
PMID:40818872
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2047 | 2025-10-06 |
Fine particulate matter exacerbates asthma by activating STC2-mediated mitophagy through METTL3/YTHDF2-dependent m6A methylation
2025-Sep-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138854
PMID:40499413
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研究论文 | 本研究揭示了细颗粒物通过METTL3/YTHDF2依赖的m6A甲基化激活STC2介导的线粒体自噬加剧哮喘的分子机制 | 首次发现PM通过m6A甲基化调控STC2表达激活线粒体自噬的新机制,并验证了季节性PM暴露与METTL3/STC2血清浓度的关联 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅检测了血清标志物,缺乏直接机制验证 | 探究细颗粒物加剧哮喘的分子机制 | 哮喘小鼠模型和哮喘患者外周血样本 | 分子生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,分子机制研究 | NA | 基因表达数据,血清浓度数据 | 哮喘小鼠和季节性采集的哮喘患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2048 | 2025-10-06 |
TRAF3IP2-AS1 Deficiency Induces Necroptosis to Promote Pancreatic Cancer Liver Metastasis
2025-Sep-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4784
PMID:40586914
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研究论文 | 本研究揭示长链非编码RNA TRAF3IP2-AS1通过调控坏死性凋亡和免疫抑制微环境促进胰腺癌肝转移的机制 | 首次发现TRAF3IP2-AS1缺失通过双重机制诱导坏死性凋亡:通过竞争性结合IGF2BP2降低MLKL mRNA稳定性,同时干扰PPM1B泛素化促进RIPK3磷酸化 | 研究主要基于患者来源类器官和动物模型,临床样本验证仍需扩展 | 探究胰腺癌肝转移的分子机制和潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本、患者来源类器官、TGFβ1条件性基因敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、3D体外模型 | 动物模型、类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | PDAC患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2049 | 2025-10-06 |
EML4-ALK Rearrangement Creates a Distinctive Myeloid Cell-Dominant Immunosuppressive Microenvironment in Lung Cancer
2025-Sep-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0532
PMID:40627846
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研究论文 | 本研究揭示了EML4-ALK重排通过创建髓系细胞主导的免疫抑制微环境导致肺癌对免疫治疗不响应的机制 | 首次发现ALK+肺腺癌具有独特的髓系细胞主导免疫抑制微环境,并证实IL6R抑制剂可逆转该免疫抑制状态 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索ALK+肺腺癌对免疫治疗不响应的免疫学机制 | ALK阳性和阴性肺腺癌患者的肿瘤组织及小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,肿瘤浸润白细胞分析 | 小鼠ALK+肺腺癌模型 | 基因表达数据,细胞计数数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2050 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of pig lung transplantation reveals macrophage ferroptosis in lung ischemia-reperfusion injury
2025-Sep, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2025.04.011
PMID:40262727
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研究论文 | 通过猪肺移植模型的单细胞RNA测序研究巨噬细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用 | 首次建立猪原位单肺移植模型模拟长时间冷缺血再灌注损伤,并通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞铁死亡的关键作用 | 研究样本量有限,需要进一步验证巨噬细胞铁死亡的具体分子机制 | 研究肺缺血再灌注损伤的病理机制并建立大型动物模型 | 猪肺移植模型中的肺组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序,透射电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | 猪肺移植模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2051 | 2025-10-06 |
Association Between T2DM, TyG Index, Multiple Sclerosis, and Rheumatoid Arthritis: Insights into Potential Mechanisms
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04961-y
PMID:40279037
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析探索2型糖尿病、胰岛素抵抗与自身免疫疾病的因果关系及潜在机制 | 首次结合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序综合分析T2DM、TyG指数与自身免疫疾病的因果关系及免疫细胞介导机制 | 研究基于汇总级GWAS数据,无法完全排除潜在混杂因素的影响 | 探索2型糖尿病和胰岛素抵抗与自身免疫疾病的因果关系及免疫机制 | 2型糖尿病、TyG指数、多发性硬化症、类风湿关节炎及特定标志免疫细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 孟德尔随机化分析, 贝叶斯共定位, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 多个GWAS研究的汇总数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2052 | 2025-10-06 |
eIF3f promotes tumour malignancy by remodelling fatty acid biosynthesis in hepatocellular carcinoma
2025-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.02.045
PMID:40154622
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研究论文 | 本研究揭示了eIF3f通过稳定ACSL4促进肝细胞癌脂肪酸生物合成和肿瘤恶性进展的分子机制 | 首次发现eIF3f通过K48连接的去泛素化稳定ACSL4,促进脂肪酸生物合成,并阐明其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 需要进一步的临床研究来确认eIF3f靶向治疗在人类患者中的疗效 | 确定肝细胞癌中脂肪酸代谢的特征及其分子机制 | 肝细胞癌组织、类器官模型、多物种肿瘤模型 | 肿瘤代谢 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,代谢流分析,透射电子显微镜,飞行时间质谱流式细胞术,多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,代谢物数据,蛋白质数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
2053 | 2025-10-06 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的新机制 | 首次在收集淋巴管中表征TRPV4表达谱,发现TRPV4+髓系细胞与淋巴管细胞间的相互作用新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本数量有限 | 探究TRPV4通道在淋巴管收缩功能调控中的作用机制 | 小鼠收集淋巴管和乳腺癌相关淋巴水肿患者活检组织 | 单细胞生物学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 细胞内钙活性测量 | Trpv4fx/fx转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据, 功能实验数据 | 小鼠收集淋巴管单细胞数据集和患者淋巴水肿活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2054 | 2025-10-06 |
Harnessing Calmodulin-Related Genes to Build a Prognostic Model in Esophageal Squamous Cell Carcinoma for a Comprehensive Analysis of Single-Cell Immune Characteristics and Drug Efficacy
2025-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000561
PMID:40375794
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研究论文 | 基于钙调蛋白相关基因构建食管鳞状细胞癌预后模型,并分析单细胞免疫特征和药物疗效 | 首次利用钙调蛋白相关基因构建ESCC预后模型,结合单细胞测序分析基因表达模式,并通过CETSA实验验证药物与靶点的结合稳定性 | 研究基于TCGA数据库,样本量有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发食管鳞状细胞癌的预后预测模型并探索潜在治疗药物 | 食管鳞状细胞癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞测序,qPCR,LASSO Cox回归,多变量Cox回归,GSEA富集分析,分子对接,CETSA | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | TCGA-ESCC数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2055 | 2025-10-06 |
Identifying Key Plasma Proteins in the Onset of Parkinson's Disease: Proteome-Wide Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05041-x
PMID:40380075
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研究论文 | 通过蛋白质组范围孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析识别帕金森病发病关键血浆蛋白 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序技术系统筛选帕金森病相关血浆蛋白,并揭示其在脑细胞类型中的差异表达模式 | 需要大量实验验证来确认这些蛋白质作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 识别帕金森病发病机制中的关键血浆蛋白,探索诊断标志物和治疗靶点 | 2923种血浆蛋白与帕金森病的因果关系 | 生物信息学 | 帕金森病 | 孟德尔随机化分析、共定位分析、SMR分析、HEIDI检验、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 英国生物银行数据库中的2923种血浆蛋白 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2056 | 2025-10-06 |
The Role of HbA1c in Parkinson's Disease: An Integrative Analysis by Single-Cell, Bulk Transcriptome and Mendelian Randomization
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05063-5
PMID:40397357
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组、批量转录组和孟德尔随机化分析,探讨HbA1c与帕金森病的关系并识别潜在诊断标志物 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和孟德尔随机化方法系统研究HbA1c与帕金森病的因果关系 | 研究依赖于公开数据库数据,样本来源和数量可能受限 | 探索HbA1c与帕金森病预后的因果关系并识别诊断生物标志物 | 帕金森病患者与对照组的基因表达数据和遗传变异数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 机器学习 | 逆方差加权法, 诺莫图, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单核苷酸多态性数据 | 使用GSE20292和GSE157783数据集,包含223个独立SNPs | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
2057 | 2025-10-06 |
SEC61G promotes colorectal cancer progression by regulating cytosolic Ca2+ concentration
2025-Sep, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02259-3
PMID:40413702
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研究论文 | 本研究揭示了SEC61G通过调节胞质钙离子浓度促进结直肠癌进展的机制 | 首次阐明SEC61G通过调节胞质Ca2+浓度激活EGFR通路促进结直肠癌进展的具体分子机制 | 机制研究仍待深入,临床转化价值需要进一步验证 | 探究SEC61G在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌细胞系、肿瘤组织及患者样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、RT-qPCR、免疫组化、单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 基因组数据、基因表达数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | TCGA数据集中的结直肠癌样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组测序 | NA | NA |
2058 | 2025-10-06 |
Spatial omics technology potentially promotes the progress of tumor immunotherapy
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03075-5
PMID:40456924
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综述 | 本文全面概述了空间组学技术的起源、分类和特点,并探讨其在肿瘤免疫治疗中的应用前景 | 强调空间组学技术相比单细胞测序在保留空间背景和整合多模态分析方面的优势,提出结合其他技术可发现被忽视的治疗靶点 | 临床转化面临挑战,技术应用仍存在局限性 | 探讨空间组学技术如何促进肿瘤免疫治疗的进展 | 肿瘤微环境、B细胞和T细胞、三级淋巴结构 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间组学分析 | NA | 空间多模态数据 | NA | NA | 空间组学 | NA | NA |
2059 | 2025-10-06 |
Using proteomics and single-cell sequencing to analyze the pathogenesis of recurrent implantation failure associated with uterine natural killer cells
2025-Sep, Archives of gynecology and obstetrics
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00404-025-08074-8
PMID:40514455
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞测序技术分析了复发性种植失败与子宫自然杀伤细胞的关联机制 | 首次整合蛋白质组学和单细胞测序数据,鉴定出与RIF相关的三个关键基因(AMPD3、H6PD、PAK2)及其调控机制 | 样本量较小(6例RIF患者和6例对照),需要更大规模研究验证 | 探索复发性种植失败的分子机制,特别关注子宫自然杀伤细胞的作用 | 复发性种植失败患者的子宫内膜组织和自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 12例子宫内膜组织样本(6例RIF患者和6例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2060 | 2025-10-06 |
Multi-omics reveals the polyethylene terephthalate carcinogenicity: Cancer progression and immune microenvironment
2025-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118522
PMID:40532600
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研究论文 | 通过多组学方法系统研究聚乙烯 terephthalate (PET) 的致癌机制及其对肿瘤微环境的影响 | 首次整合网络毒理学、机器学习、分子对接、单细胞RNA测序和空间转录omics 系统揭示PET的致癌机制 | 未明确说明样本来源和具体样本数量 | 探究PET塑料的致癌机制及其在肿瘤发生发展中的作用 | PET相关致癌靶点、肿瘤细胞、免疫细胞 | 计算生物学 | 癌症 | 网络毒理学, 机器学习, 分子对接, 单细胞RNA测序, 空间转录omics, 克隆形成实验, western blotting | 机器学习算法 | 组学数据, 分子对接数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录omics | NA | NA |